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基于臨床及CT影像組學(xué)特征預(yù)測肺腺癌結(jié)節(jié)

2022-09-21 06:52:46李曉鳳周代全
關(guān)鍵詞:組學(xué)腺癌結(jié)節(jié)

劉 巧 曾 燕 劉 博 王 毅 李曉鳳 周代全

肺癌具有較高的發(fā)病率和死亡率,肺腺癌在肺癌中占據(jù)最大比例。2021年WHO肺部腫瘤組織學(xué)分類[1]將非典型腺瘤樣增生(atypical adenomatous hyperplasia,AAH)、原位腺癌(adenocarcinoma in situ,AIS)定義為腺體前驅(qū)病變,其具有向微浸潤性腺癌 (minimally invasive adenocarcinoma,MIA)及浸潤性腺癌(invasive adenocarcinoma,IAC)發(fā)展的趨勢,但生長速度較緩慢,一般只需定期隨訪觀察即可,即使行手術(shù)治療,AIS手術(shù)完全切除后患者5年無病生存率達(dá)100%或接近100%。而MIA及IAC根據(jù)病情發(fā)展嚴(yán)重程度一般需行手術(shù)治療,研究指出ⅠA期肺腺癌患者手術(shù)切除后5年無病生存率為74.6%[2-4]。因此早期鑒別腺體前驅(qū)病變與肺腺癌不僅可幫助臨床制訂合適的治療方案,還可提高患者的生存率。目前臨床中主要依靠手術(shù)或穿刺組織病理學(xué)檢查等有創(chuàng)方式來明確病變的病理類型,近年來隨著人工智能及影像組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,通過從CT和MRI等影像中高通量提取反映組織微觀變化的定量信息并構(gòu)建模型,有望以無創(chuàng)的方式實現(xiàn)疾病的早期診斷和預(yù)后預(yù)測[5]。因此,本研究采用影像組學(xué)技術(shù)高通量挖掘CT影像中的信息,獲取影像組學(xué)特征,結(jié)合臨床信息構(gòu)建機(jī)器學(xué)習(xí)模型,以期實現(xiàn)對肺腺癌的早期、準(zhǔn)確預(yù)測。

方 法

1. 數(shù)據(jù)來源

收集重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院2017年1月—2020年12月收治的186例病理類型明確的肺結(jié)節(jié)患者,其中男性59例,女性127例,年齡20~88歲。肺結(jié)節(jié)病理亞型包括AAH(12例)、AIS(35例)、MIA(48例)和IAC(91例),根據(jù)2021年WHO肺部腫瘤組織學(xué)分類標(biāo)準(zhǔn)將所有病例劃分為腺體前驅(qū)病變組(AAH和AIS)與腺癌組(MIA和IAC),再按照7∶3比例將數(shù)據(jù)分為訓(xùn)練集(130例)和測試集(56例)。納入標(biāo)準(zhǔn):①肺結(jié)節(jié)病理亞型經(jīng)手術(shù)或穿刺活檢證實;②肺結(jié)節(jié)最大直徑≤3 cm。排除標(biāo)準(zhǔn):①臨床及影像學(xué)資料不完整;②伴有胸腔積液或肺不張;③圖像有嚴(yán)重偽影?;诨颊唠娮硬v收集以下臨床特征。人口統(tǒng)計學(xué)特征:包括患者性別、年齡、吸煙史、家族腫瘤史;臨床癥狀:包括咳嗽、咳痰、咯血、胸痛、胸悶;腫瘤標(biāo)志物:包括癌胚抗原(CEA)、神經(jīng)元特異性烯醇化酶(NSE)、胃泌素釋放肽前體(ProGRP)、細(xì)胞角蛋白19片段(CyFRA21-1);CT影像學(xué)語義特征:包括結(jié)節(jié)位置、結(jié)節(jié)成分、結(jié)節(jié)最大徑、邊界清晰、邊緣規(guī)則、分葉征、毛刺征、胸膜凹陷征、與胸膜寬基底相連、空泡征、鈣化、肺門或縱隔淋巴結(jié)腫大。

2.設(shè)備與掃描方法

采用多排螺旋CT(Revolution CT,GE)行胸部CT掃描。囑咐患者仰臥,雙臂上舉,頭先進(jìn),深吸氣后屏氣掃描。螺距0.938∶1,轉(zhuǎn)速0.6 s/r,平掃管電壓100 kV,自動管電流調(diào)制(200~350 mA),層厚5 mm,間隔5 mm,探測器排數(shù)256,矩陣512×512,重建間隔0.625 mm,重建層厚0.625 mm。

3. 影像組學(xué)分析

①圖像分割:在對肺結(jié)節(jié)病理結(jié)果未知情況下,由1名初級影像醫(yī)師(A)運用3D Slicer軟件(版本:4.11.20200930;National Institutes of Health) 在層厚為0.625 mm的肺窗圖像上對所有病灶容積感興趣區(qū)(region of interest,ROI)進(jìn)行逐層勾畫,勾畫結(jié)果經(jīng)由1名高年資影像醫(yī)師(B)審核及修改(圖1)。②圖像預(yù)處理:為降低圖像間差異對結(jié)果造成的影響,在提取影像組學(xué)特征前行圖像預(yù)處理,包括圖像歸一化和重采樣(重采樣比例:1 mm×1 mm×1 mm)。③影像組學(xué)特征提?。翰捎肞ython軟件(版本:3.7.6)中的PyRadiomics(版本:2.1)模塊對預(yù)處理后圖像進(jìn)行影像組學(xué)特征高通量提取,提取特征包括一階統(tǒng)計特征、基于形狀特征、灰度共生矩陣特征、灰度級游程長度矩陣特征、灰度級區(qū)域矩陣特征、相鄰灰度差矩陣特征、灰度級相關(guān)矩陣特征及小波特征。④可重復(fù)性分析:為提高影像組學(xué)特征可重復(fù)性,通過計算組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(intraclass correlation coefficient,ICC)對提取的影像組學(xué)特征行可重復(fù)性分析。其方法如下:在所有病例中隨機(jī)抽取60例肺結(jié)節(jié)CT圖像,A前、后兩次對該60例肺結(jié)節(jié)行ROI勾畫,兩次時間間隔為1個月,B行一次ROI勾畫,對上述勾畫完成的3組ROI提取影像組學(xué)特征,計算操作者內(nèi)和操作者間影像組學(xué)特征的ICC,ICC>0.75表明具有較好一致性。⑤特征降維:通過單因素分析、最小絕對值收縮和選擇算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)進(jìn)行特征降維,篩選出最佳影像組學(xué)特征。⑥模型構(gòu)建:在訓(xùn)練集中將篩選出的具有鑒別意義的特征作為輸入變量構(gòu)建兩個隨機(jī)森林(random forest,RF)肺腺癌結(jié)節(jié)預(yù)測模型。模型1僅包括影像組學(xué)特征,模型2包括影像組學(xué)特征及臨床特征。在訓(xùn)練集和測試集中通過繪制ROC曲線及計算曲線下面積(AUC)對模型進(jìn)行驗證。

4. 統(tǒng)計學(xué)分析

使用SPSS(版本:26.0)和R語言(版本:4.1.0)軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。符合正態(tài)分布的計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,非正態(tài)分布計量資料以中位數(shù)與四分位數(shù)間距表示,計數(shù)資料以頻數(shù)(百分比)表示。符合正態(tài)分布且方差齊性的計量資料采用獨立樣本t檢驗,否則采用Mann-WhitneyU檢驗,計數(shù)資料采用卡方檢驗或Fisher精確檢驗,采用逐步logistic回歸分析對單因素分析中具有統(tǒng)計學(xué)意義的臨床特征進(jìn)行進(jìn)一步篩選。所有統(tǒng)計學(xué)結(jié)果均以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

結(jié) 果

1.影像組學(xué)特征篩選結(jié)果

總共提取出688個影像組學(xué)特征,其中526個影像組學(xué)特征具備較強(qiáng)可重復(fù)性(ICC>0.75),將其進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化后納入單因素分析。單因素分析結(jié)果顯示,373個影像組學(xué)特征在訓(xùn)練集中組間差異顯著(P<0.05)。最后經(jīng)5折交叉驗證的LASSO回歸算法降維后選出11個具有鑒別意義的影像組學(xué)特征構(gòu)建模型(圖2A、2B),各特征權(quán)重值見圖3。

2. 臨床特征篩選結(jié)果

對25個臨床特征行單因素分析,結(jié)果顯示年齡、吸煙史、CEA、結(jié)節(jié)成分、結(jié)節(jié)最大徑、邊緣規(guī)則、分葉征、毛刺征、胸膜凹陷征和空泡征10個特征在訓(xùn)練集中組間差異顯著(P<0.05,表1)。將該10個特征作為輸入變量進(jìn)行逐步logistic回歸分析,結(jié)果顯示年齡、結(jié)節(jié)成分和結(jié)節(jié)最大徑差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,表2)。

表1 臨床特征的單因素分析結(jié)果

表2 臨床特征的逐步logistic回歸分析結(jié)果

3.模型構(gòu)建及驗證結(jié)果

在訓(xùn)練集中將LASSO回歸模型中篩選出的11個影像組學(xué)特征作為輸入變量構(gòu)建模型1,將逐步logistic回歸分析中篩選出的3個臨床特征結(jié)合11個影像組學(xué)特征作為輸入變量構(gòu)建模型2,并對模型1和2的診斷效能進(jìn)行ROC曲線分析。模型1和模型2評價結(jié)果如下:訓(xùn)練集中兩模型的AUC分別為0.991和0.960;測試集中兩模型的AUC分別為0.913和0.884,準(zhǔn)確率分別為0.875和0.839,精確度分別為0.872和0.824,召回率分別為0.976和1.0,F(xiàn)1分?jǐn)?shù)分別為0.921和0.903(表3,圖4A、4B)。

表3 兩模型對肺腺癌結(jié)節(jié)的預(yù)測效能

討 論

早期準(zhǔn)確診斷肺結(jié)節(jié)的病理亞型具有重要的臨床意義,目前對肺結(jié)節(jié)的檢測和診斷技術(shù)主要有CT、穿刺活檢或手術(shù)后病理學(xué)檢查。CT主要依靠醫(yī)師綜合分析病灶位置、大小、密度、形態(tài)等信息后對病變作出定性診斷,但因不同病理亞型的肺結(jié)節(jié)在影像上常出現(xiàn)某些相似的表現(xiàn),且對于同一病灶的診斷易受不同診斷醫(yī)師之間主觀差異的影響,故往往難以對早期肺癌作出準(zhǔn)確診斷。病理學(xué)檢測被認(rèn)為是診斷病變的金標(biāo)準(zhǔn),但由于其不是對整個病灶進(jìn)行評估,故根據(jù)樣本采集部位的不同也可出現(xiàn)不同的病理學(xué)結(jié)果。影像組學(xué)技術(shù)通過獲取圖像、分割ROI、提取特征、特征降維、構(gòu)建模型等步驟,目前已被廣泛用于疾病診斷、良惡性鑒別、病理學(xué)分型、腫瘤分期及預(yù)后評估等研究,且其實用價值被大量研究[6]所證實。

本研究通過提取CT影像組學(xué)特征,采用單因素分析及LASSO回歸模型降維,篩選出11個影像組學(xué)特征,并構(gòu)建了腺體前驅(qū)病變與肺腺癌預(yù)測模型。在測試集中模型AUC為0.913、準(zhǔn)確率為0.875、精確度為0.872、召回率0.976、F1值為0.921,表現(xiàn)出很高的預(yù)測效能。此外本研究共收集25個對肺腺癌診斷具有較大意義的臨床特征,為避免高通量的影像組學(xué)特征對臨床特征造成影響,未將兩者一起進(jìn)行特征篩選,而是通過單因素分析及逐步logistic回歸分析單獨對臨床特征進(jìn)行特征篩選,結(jié)果表明患者年齡、結(jié)節(jié)成分、結(jié)節(jié)最大徑在2組間有顯著差異。肺腺癌組患者年齡普遍大于腺體前驅(qū)病變組,表明隨著年齡增大,病灶為肺腺癌的可能性更大,這與先前研究[7]結(jié)果一致。大量研究[8-11]表明結(jié)節(jié)直徑及結(jié)節(jié)實性成分占比是預(yù)測肺腺癌侵襲性的危險因素,原因在于肺結(jié)節(jié)在進(jìn)展過程中,腫瘤細(xì)胞不斷增殖、堆積、填充,使得病灶體積逐漸變大,密度隨之增高,因此侵襲性高的肺結(jié)節(jié)較侵襲性低者直徑更大、實性成分占比更多,本研究也得到同樣的研究結(jié)果。本研究影像組學(xué)特征結(jié)合臨床特征共同構(gòu)建的腺體前驅(qū)病變與肺腺癌鑒別診斷模型,在測試集中AUC為0.884、準(zhǔn)確率為0.839、精確度為0.824、召回率1.0、F1值為0.903,預(yù)測性能略低于僅含影像組學(xué)特征的模型,分析其原因,可能是由于本研究模型訓(xùn)練集樣本數(shù)量較少,隨著特征維數(shù)升高減低了模型的預(yù)測性能。

目前也有關(guān)于影像組學(xué)用于預(yù)測肺腺癌結(jié)節(jié)浸潤性的研究。Zhao等[12]篩選出15個影像組學(xué)特征構(gòu)建影像組學(xué)標(biāo)簽,結(jié)合CT平均值共同構(gòu)建亞厘米肺腺癌結(jié)節(jié)浸潤性預(yù)測列線圖,在訓(xùn)練集及驗證集中列線圖C指數(shù)分別為0.716和0.707。范麗等[13]采用類似方法構(gòu)建個體化預(yù)測模型,以預(yù)測浸潤性腺癌與非浸潤性腺癌,模型表現(xiàn)最佳診斷效能AUC=0.934。但這些研究納入的樣本僅為肺磨玻璃結(jié)節(jié),并不符合臨床實際情況。She等[14]基于5個影像組學(xué)特征構(gòu)建影像組學(xué)標(biāo)簽用于肺腺癌結(jié)節(jié)浸潤性預(yù)測,在驗證集中AUC為0.890,將影像組學(xué)標(biāo)簽與性別指標(biāo)相結(jié)合共同構(gòu)建預(yù)測模型,驗證集中模型的AUC達(dá)到0.900,但此研究未將AAH病例納入其中。

相較于與其他類似研究,本研究納入的肺結(jié)節(jié)類型及臨床特征更加全面,這不僅能挖掘出更多影像學(xué)特征,且更能反映臨床實際情況。此外本研究在提取影像組學(xué)特征之前對CT圖像進(jìn)行了標(biāo)準(zhǔn)化及重采樣預(yù)處理,降低了掃描設(shè)備差異、掃面參數(shù)不同或圖像重建算法不同導(dǎo)致影像組學(xué)特征可重復(fù)性不佳而給研究結(jié)果帶來的影響,且通過可重復(fù)性檢驗僅保留操作者內(nèi)及操作者間同時滿足ICC>0.75的特征,也進(jìn)一步保證了特征的穩(wěn)定性,使研究結(jié)果更為穩(wěn)定可信。

本研究也存在一些不足:首先,樣本量較少且屬于單中心研究,需要更多的多中心樣本數(shù)據(jù)來進(jìn)一步證實我們的研究結(jié)果;此外,臨床中CT增強(qiáng)影像對于肺結(jié)節(jié)的診斷具有重要作用,但本研究未納入CT增強(qiáng)影像組學(xué)特征,因此未來需要加入CT增強(qiáng)影像做進(jìn)一步的分析??傮w來說,本研究通過挖掘CT影像組學(xué)特征和臨床特征,構(gòu)建的肺腺癌結(jié)節(jié)預(yù)測模型,獲得了很好的預(yù)測效能,能夠?qū)崿F(xiàn)早期對腺體前驅(qū)病變與肺腺癌結(jié)節(jié)進(jìn)行無創(chuàng)性鑒別診斷,可能具有較好的臨床應(yīng)用潛能。未來應(yīng)開展多中心、大樣本、前瞻性臨床研究,并制訂更為規(guī)范的影像分析方案和數(shù)據(jù)獲取流程,以驗證和提高肺腺癌結(jié)節(jié)預(yù)測模型的診斷效能,使其真正在肺結(jié)節(jié)診斷中發(fā)揮臨床價值。

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