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兒童碳青霉烯類耐藥腸桿菌目細(xì)菌感染的臨床特征及分子流行研究

2022-08-23 00:57葉龍張莉滟趙越顧兵吳渚彭永正
中國當(dāng)代兒科雜志 2022年8期
關(guān)鍵詞:青霉菌株耐藥

葉龍 張莉滟 趙越 顧兵 吳渚 彭永正,4

(1.南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)部,廣東廣州 510280;2.廣東省人民醫(yī)院檢驗(yàn)科/廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院,廣東廣州 510080;3.南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院兒科重癥監(jiān)護(hù)室,廣東廣州 510280;4.南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院輸血科,廣東廣州 510280)

近年來,隨著各種抗菌藥物的廣泛應(yīng)用,碳青霉烯類耐藥腸桿菌目細(xì)菌(carbapenem-resistantEnterobacterales,CRE)的檢出不斷上升,給臨床抗感染治療與醫(yī)院感染防控帶來巨大挑戰(zhàn),在世界范圍內(nèi)造成嚴(yán)重后果,2019年美國疾病預(yù)防控制中心最新的抗生素耐藥性報(bào)告中,CRE仍是最緊迫問題[1-2]。兒童和新生兒因免疫力低下、用藥局限等原因,更易導(dǎo)致CRE暴發(fā)流行,但目前現(xiàn)有研究多以成人為主,兒童群體相關(guān)數(shù)據(jù)尚不充分[3]。本研究旨在對(duì)廣東省人民醫(yī)院2018年1月至2021年6月兒童CRE感染情況進(jìn)行分析,明確其耐藥特性與分子流行特征,為對(duì)其有效防控及科學(xué)預(yù)判流行趨勢(shì)提供依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 菌株來源

參照中國兒童細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)組標(biāo)準(zhǔn)[4],本文將≤14歲患兒納入研究范圍?;仡櫺苑治鰪V東省人民醫(yī)院2018年1月至2021年6月住院患兒的相關(guān)臨床資料及感染情況,共獲得非重復(fù)菌株腸桿菌目細(xì)菌1 098株。按照全國臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程[5],對(duì)菌株進(jìn)行相關(guān)實(shí)驗(yàn)。

1.2 試劑與儀器

哥倫比亞血瓊脂與M-H瓊脂培養(yǎng)基購自廣州迪景公司;藥敏紙片購自英國OXOID公司;PCR引物由TaKaRa公司合成,1×T3 Super PCR Mix及DNA Marker(DL-2000)購自擎科生物科技有限公司。VITEK MS微生物質(zhì)譜檢測(cè)系統(tǒng)與VITEK 2 Compact微生物鑒定儀及相關(guān)試劑購自法國梅里埃公司;PCR擴(kuò)增儀購自美國ABI公司;電泳儀購自上海天能科技有限公司;凝膠成像系統(tǒng)購自美國Bi o-Rad公司。

1.3 質(zhì)控菌株

大腸埃希菌ATCC 8739與ATCC 25922、陰溝腸桿菌ATCC 700323由廣東省臨床檢驗(yàn)中心提供。

1.4 菌株鑒定與藥敏試驗(yàn)

用配套儀器對(duì)部分細(xì)菌進(jìn)行鑒定及藥敏復(fù)核試驗(yàn),采用M-H瓊脂培養(yǎng)基行紙片擴(kuò)散法驗(yàn)證厄他培南、亞胺培南、美羅培南的藥敏情況,其中任何1種藥物耐藥,即可確定為CRE菌株。紙片擴(kuò)散法操作及相關(guān)藥敏結(jié)果的判讀參照美國臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)M100-S32標(biāo)準(zhǔn)[6],頭孢哌酮/舒巴坦藥敏結(jié)果的判讀參照美國臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)M100-S32腸桿菌目細(xì)菌對(duì)頭孢哌酮的折點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)[6]。

1.5 CRE初篩與確證試驗(yàn)

對(duì)CRE菌株采用改良碳青霉烯滅活試驗(yàn)(modified carbapenem inactivation method,mCIM)檢測(cè)碳青霉烯酶,并聯(lián)合EDTA改良碳青霉烯滅活試 驗(yàn) (EDTA-modified carbapenem inactivation method,eCIM)檢測(cè)金屬酶,進(jìn)行初篩試驗(yàn)。隨后提取菌株基因組DNA,采用PCR法檢測(cè)菌株所攜帶碳青霉烯酶耐藥基因情況(引物設(shè)計(jì)參照相關(guān)文獻(xiàn)[7-8],引物序列見表1),PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2.0%瓊脂糖凝膠電泳,用凝膠成像系統(tǒng)顯像并觀察結(jié)果。再將PCR擴(kuò)增后產(chǎn)物送擎科生物科技有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果經(jīng)基本局部比對(duì)搜索工具BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)比對(duì)分析,確定所測(cè)菌株攜帶的的耐藥基因。

表1 碳青霉烯酶主要檢測(cè)的耐藥基因引物序列

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

采用WHONET 5.6及SPSS 26.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。計(jì)數(shù)資料采用例數(shù)或百分率(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 患兒一般資料

1 098株腸桿菌目細(xì)菌中共檢出CRE 66株,檢出率為6.01%。66株CRE來自66例患兒,其中男37例(56%),女29例(44%)。年齡2 d至14歲,其中<1月齡16例(24%),1月齡~28例(42%),12月齡~11例(17%),>36月齡11例(17%)。住院中位時(shí)間32 d,CRE分離中位時(shí)間為入院后第12天。伴有基礎(chǔ)疾病主要為呼吸道疾?。?7例,86%)、心血管疾?。?6例,70%)、消化道疾病(12例,18%)及腎臟疾?。?0例,15%)等。多數(shù)患兒伴侵襲性操作,如氣管插管(56例,85%)、手術(shù)(48例,73%)、靜脈插管(41例,62%)、尿道插管(37例,56%)及穿刺引流(31例,47%)等。預(yù)后情況:治愈45例(68%),好轉(zhuǎn)回所在地繼續(xù)治療14例(21%),死亡7例(11%),其中兒科重癥監(jiān)護(hù)室5例,新生兒科和兒童血液科各1例。死亡患兒患有急性胃腸炎、肺膿腫伴有肺炎、白血病、梗阻性腦積水、先天性心臟畸形等不同程度基礎(chǔ)疾病,死因包括感染性休克2例、先天性心臟病2例、重癥肺炎1例、血液病1例、腦腫瘤1例。

2.2 標(biāo)本與科室分布

66株CRE主要在呼吸道、中段尿、血液標(biāo)本中被檢出;被檢出CRE的患兒主要來自新生兒科、兒科重癥監(jiān)護(hù)室、兒童血液科、心外科重癥監(jiān)護(hù)室等科室。見圖1。

圖1 CRE的標(biāo)本類型和科室分布 左圖為標(biāo)本類型分布(n=66);右圖為科室分布(n=66)。

2.3 致病菌分布

66株CRE中,肺炎克雷伯菌45株(68%)、大腸埃希菌12株(18%)、陰溝腸桿菌6株(9%)、黏質(zhì)沙雷菌2株(3%)、產(chǎn)氣腸桿菌1株(2%)。其中,新型冠狀病毒肺炎(簡(jiǎn)稱新冠)疫情發(fā)生前(2018~2019年)檢出CRE 47株,檢出率為6.5%(47/723);新冠疫情發(fā)生后(2020~2021年)檢出CRE 19株,檢出率為5.1%(19/375)。雖然新冠疫情后住院患兒CRE的檢出率低于新冠疫情前,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.899,P=0.343)。

2.4 主要CRE菌株藥敏情況

66株CRE菌株對(duì)碳青霉烯類(亞胺培南、厄他培南)、青霉素復(fù)方制劑(氨芐西林/舒巴坦)、部分頭孢類(頭孢唑啉、頭孢他啶、頭孢曲松、頭孢哌酮/舒巴坦)抗菌藥物高度耐藥,對(duì)常見抗菌藥物(氨曲南、頭孢吡肟、哌拉西林/他唑巴坦、慶大霉素)耐藥性普遍偏高,僅對(duì)阿米卡星(14%)、左旋氧氟沙星(23%)、妥布霉素(33%)等耐藥率相對(duì)較低,見表2。

表2 CRE感染患兒主要致病菌的耐藥率 [株(%)]

2.5 主要CRE的碳青霉烯酶耐藥基因分析

PCR結(jié)果顯示,45株肺炎克雷伯菌的碳青霉烯酶基因型以blaNDM(20株,44%)、blaIMP(10株,22%)及blaKPC(5株,11%)為主;12株大腸埃希菌的碳青霉烯酶基因型以blaNDM為主(10株,83%)。測(cè)序結(jié)果經(jīng)BLAST比對(duì),blaNDM-124株,blaNDM-56株,blaIMP-45株,blaKPC-23株,仍有尚未明確基因型,有待進(jìn)一步研究。

3 討論

CRE感染給公共衛(wèi)生防控帶來嚴(yán)峻挑戰(zhàn),據(jù)中國細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)數(shù)據(jù)顯示[9]:肺炎克雷伯菌對(duì)亞胺培南與美羅培南的耐藥率從2005年的3.0%、2.9%持續(xù)上升至2018年的25.0%、26.3%,雖然2019年和2020年呈下降趨勢(shì),但2021年又有回升。兒童尤其新生兒因免疫力低下、用藥局限等原因,CRE的檢出率高于成人,且易引起流行。多項(xiàng)研究表明,臨床分離的肺炎克雷伯菌在兒科病房有顯著增高趨勢(shì),且兒童醫(yī)院CRE的分離率要高于綜合性醫(yī)院[10-12]。

本研究中CRE菌株的檢出率為6.01%,與報(bào)道[13]一致。據(jù)中國兒童細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)組數(shù)據(jù)[13-14],2020年兒童CRE總體檢出率為4.9%,低于2019年的8.2%,均低于同時(shí)期以成人為主的相關(guān)數(shù)據(jù)[15-16]。本研究試著分析新冠疫情發(fā)生前后腸桿菌目細(xì)菌檢出情況,結(jié)果差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,這表明疫情防控可能對(duì)我院兒童CRE檢出影響不大,需要長(zhǎng)期關(guān)注。

66例CRE患兒集中在新生兒科和兒科重癥監(jiān)護(hù)室,<12月齡占比最多,與研究[17-18]一致。一方面這可能與患兒免疫系統(tǒng)不成熟、住院時(shí)間久和頻繁進(jìn)行侵入性操作有關(guān),且患兒相較于成人,需要醫(yī)生護(hù)士的協(xié)助較多,相互間接觸概率增加,進(jìn)而加大CRE院內(nèi)傳播的機(jī)會(huì)。另一方面我院碳青霉素類抗菌藥物主要用于危重癥監(jiān)護(hù)室,以及免疫力低下患者,如燒傷科、血液科等。有研究[19]表明,重癥監(jiān)護(hù)室的病原菌容易呈現(xiàn)多重耐藥的特點(diǎn),同時(shí)重癥監(jiān)護(hù)室環(huán)境中更容易出現(xiàn)耐藥菌的定植,增大CRE感染風(fēng)險(xiǎn)。再者,兒童用藥原則與成人不同,其抗感染可用的藥物選擇有限,在當(dāng)前新生兒或兒科重癥的治療中超說明書用藥現(xiàn)象常見,這也是CRE菌株檢出率高的原因之一。

CRE最主要的耐藥機(jī)制是產(chǎn)碳青霉烯酶[20],利用mCIM聯(lián)合eCIM初篩試驗(yàn)可將其初步分為金屬酶和絲氨酸酶。有研究報(bào)道,金屬酶對(duì)碳青霉烯類藥物具有較強(qiáng)水解能力,可導(dǎo)致高水平耐藥發(fā)生,會(huì)給臨床治療帶來極大困難[21-22]。本研究碳青霉烯酶的耐藥基因以NDM型、IMP型、KPC型為主,與報(bào)道[16]相一致;45株肺炎克雷伯菌中,以產(chǎn)NDM型和IMP型金屬酶為主,與報(bào)道[23-24]相符,這與成人中以產(chǎn)KPC型絲氨酸酶為主不同;另12株大腸埃希菌也以NDM型金屬酶為主。本研究66株CRE菌株對(duì)常見抗菌藥物耐藥性均普遍偏高,僅對(duì)部分氨基糖苷類和喹諾酮類藥物耐藥率相對(duì)較低。但由于氨基糖苷類和喹諾酮類藥物的不良反應(yīng),對(duì)兒童革蘭陰性多重耐藥菌感染的治療主要依賴于碳青霉烯類藥物,加之兒童免疫力低下,一旦發(fā)生CRE感染,臨床治療較成人更加嚴(yán)峻,常陷入無藥可用的境地,亟待新型抗菌藥物的研發(fā)[25]。近些年,聯(lián)合應(yīng)用多黏菌素、替加環(huán)素與磷霉素等療法;新型β-內(nèi)酰胺酶抑制劑(齊德巴坦、納庫巴坦等)及新型β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合制劑(頭孢他啶/阿維巴坦、亞胺培南/瑞巴坦、美羅培南/法硼巴坦等)正被積極開發(fā),給CRE抗感染治療帶來一線曙光[26]。新型β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合制劑的抗CRE感染作用也與碳青霉烯酶的基因型高度相關(guān),有研究報(bào)道頭孢他啶/阿維巴坦對(duì)產(chǎn)KPC或OXA-48型絲氨酸酶菌株具有療效,但其對(duì)產(chǎn)NDM金屬酶菌株的治療無明顯效果[27]。因此,兒童CRE患者在應(yīng)用此類藥物前,務(wù)必要加強(qiáng)臨床與檢驗(yàn)的溝通,及時(shí)明確碳青霉烯酶基因型,同時(shí)積極探索快速檢測(cè)碳青霉烯酶基因型的方法[28]?,F(xiàn)今關(guān)于這些新型抗菌藥物的臨床經(jīng)驗(yàn)及評(píng)估它們用于兒童人群的臨床報(bào)道都很有限,兒童CRE感染治療仍然具有挑戰(zhàn)性。本研究中有部分CRE菌株的碳青霉烯酶基因型未明確,有待深入探討,以便全面了解兒童CRE的耐藥機(jī)制與分子流行情況,為患兒臨床治療和感染防控提供更多線索。

綜上所述,兒童CRE感染發(fā)生率高,且集中于1~12月齡嬰兒。CRE對(duì)抗菌藥物的耐藥性普遍偏高,兒童感染CRE菌株的碳青霉烯酶以金屬酶為主。積極開展CRE主動(dòng)篩查,加強(qiáng)兒童病區(qū)環(huán)境衛(wèi)生學(xué)監(jiān)測(cè),提升醫(yī)護(hù)人員防控意識(shí),優(yōu)化抗菌藥物使用,從而遏制兒童CRE感染的暴發(fā)與流行。

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