薛東煒,李明山,劉嘉,祝興旺
(中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院泌尿外科,沈陽 110032)
腎細(xì)胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是泌尿生殖系統(tǒng)的常見惡性腫瘤,占腎臟惡性腫瘤的80%~90%,占全身惡性腫瘤的2%~3%。自1975年以來,RCC的發(fā)病率以每年2%~4%的速度增長[1]。RCC的組織學(xué)亞型包括透明細(xì)胞RCC(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)、乳頭狀RCC和嫌色RCC,其中ccRCC是腎癌的最常見亞型[2],其進(jìn)展和預(yù)后受多種復(fù)雜基因的控制[3]。外科手術(shù)切除腫瘤是治療ccRCC的有效方法,盡管如此,仍有20%~38%的ccRCC患者術(shù)后發(fā)生進(jìn)展和轉(zhuǎn)移[4]。因此,對ccRCC發(fā)生發(fā)展過程中基因表達(dá)變化的研究至關(guān)重要,有助于識別腎癌新的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物,提供新的治療靶點[5]。近年來研究發(fā)現(xiàn),腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)蛋白(tumor necrosis factor-α-induced protein,TNFAIPs)家族參與了細(xì)胞凋亡和分化、信號傳導(dǎo)等多種生物學(xué)過程[6],而TNFAIP2作為該家族中的重要一員,可能在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用[7]。
1.1.1 細(xì)胞:正常腎小管上皮細(xì)胞系HK-2和人RCC細(xì)胞系786-O、ACHN(上海素爾生物科技有限公司)用含10%胎牛血清(美國Invitrogen公司)、10 U/mL青霉素和100 U/mL 鏈霉素(美國Invitrogen公司)的DMEM培養(yǎng)基(美國Invitrogen公司),培養(yǎng)于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱。
1.1.2 組織:正常腎臟組織和ccRCC組織(24對)來自中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院泌尿外科手術(shù)切除的標(biāo)本。
1.2.1 數(shù)據(jù)庫分析:應(yīng)用TIMER2.0數(shù)據(jù)庫(http://timer.comp-genomics.org/)分析TNFAIP2在泛癌中的表達(dá)情況及其與免疫細(xì)胞表達(dá)的相關(guān)性[8];應(yīng)用UALCAN數(shù)據(jù)集(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)下載癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中ccRCC組織的TNFAIP2mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)庫,對TNFAIP2mRNA的表達(dá)與臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性進(jìn)行分析,應(yīng)用京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)進(jìn)行ccRCC差異基因的富集分析。應(yīng)用Kaplan-Meier曲線(Kaplan-Meier Plotter,http://www.kmplot.com)數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站分析TNFAIP2表達(dá)與ccRCC數(shù)據(jù)庫中患者預(yù)后的關(guān)系。
1.2.2 Western blotting:用裂解緩沖液裂解細(xì)胞,裂解物上樣(40 μg/泳道)行SDS-PAGE電泳,蛋白轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯膜,5%脫脂牛奶中室溫封閉1 h,加入1:2 000稀釋抗TNFAIP2抗體(美國Santa Cruz Biotechnology公司)、抗 GAPDH 抗體(美國Santa Cruz Biotechnology公司)4℃孵育過夜。TBST洗膜3次,5 min/次,加入二抗孵育90 min,TBST洗膜3次。用增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光可視化系統(tǒng)(BeyoECL Plus,中國上海Beyotime 生物技術(shù)研究所)進(jìn)行檢測。
1.2.3 實時PCR檢測:用TRIzol試劑(美國Invitrogen公司)從組織中分離總RNA。按照The master mix reagent(美國Applied Biosystems公司)說明書行實時 PCR,反應(yīng)體系15 μL,包括TB Green 7.5 μL,ROX 0.3 μL,引物各0.3 μL,ddH2O 5.6 μL,cDNA 1 μL。反應(yīng)條件:95 ℃30 s,95 ℃5 s,60 ℃34 s,40個周期。TNFAIP2正向引物序列為5’-CCCCAATGACATCATCAACA-3’,反向引物序列為5’-GCCTCACTGGACAGGAATG T-3’[9];GAPDH作內(nèi)參照,正向引物序列為5’-GAAG GTGAAGGTCGGAGTC-3’,反向引物序列為5’-GAAG ATGGTGATGGGATTTC-3’。用2-ΔΔCt法計算mRNA的相對表達(dá)量。
采用SPSS 13.0和Graphpad Prism 7.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。用 Pearson χ2檢驗分析TNFAIP2表達(dá)水平與ccRCC 的臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性。用Kaplan-Meier曲線分析TNFAIP2表達(dá)水平與ccRCC患者預(yù)后之間的相關(guān)性。用TNFAIP2表達(dá)的受試者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線評估TNFAIP2對ccRCC的診斷效能,并計算曲線下面積(area under curve,AUC)。P< 0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
TIMER2.0數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,TNFAIP2在ccRCC組織中異常高表達(dá)(P< 0.001),見圖1。ONCOMINE數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,ccRCCTNFAIP2表達(dá)轉(zhuǎn)錄水平與正常組織比較有統(tǒng)計學(xué)差異[10-11]。TCGA、UALCAN、TIMER2.0數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,TNFAIP2在ccRCC中高表達(dá),并與腫瘤的分期、分級、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、免疫細(xì)胞Th1和Treg豐度密切相關(guān),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P< 0.001),見圖2~3。KEGG通路的富集分析結(jié)果顯示,ccRCC參與包括TNF信號通路在內(nèi)的TOP20通路,見圖4。
圖1 TNFAIP2在泛癌中的表達(dá)情況Fig.1 TNFAIP2 expression in pan-cancer
圖2 TNFAIP2在ccRCC中的表達(dá)情況及其與分期、分級、淋巴轉(zhuǎn)移的關(guān)系Fig.2 The expression of TNFAIP2 in ccRCC and its relationship with staging,grade,and lymphatic metastasis
圖3 腎癌中TNFAIP2的表達(dá)與免疫Th1細(xì)胞、Treg細(xì)胞的相關(guān)性Fig.3 Correlation between the expression of TNFAIP2 and immune Th1 cells and Treg cells in renal cell carcinoma
圖4 ccRCC差異免疫基因KEGG富集途徑分析Fig.4 KEGG enrichment pathway analysis of differential immune genes in ccRCC
Kaplan-Meier曲線分析表明TNFAIP2表達(dá)水平與患者的預(yù)后顯著相關(guān),TNFAIP2mRNA高表達(dá)提示ccCRCC患者病情惡化及總生存期縮短(P< 0.001);通過ROC曲線評估TNFAIP2mRNA表達(dá)對ccRCC的診斷效能,結(jié)果顯示,AUC=0.814,95%CI:0.796~0.887(P< 0.001),見圖5。
圖5 TNFAIP2與ccRCC患者預(yù)后的關(guān)系Fig.5 Relationship between TNFAIP2 and prognosis of ccRCC patients
Western blotting結(jié)果顯示,與人腎臟正常細(xì)胞系HK-2比較,腎癌786-O、ACHN細(xì)胞中TNFAIP2蛋白表達(dá)水平均明顯升高,見圖6。實時PCR檢測結(jié)果顯示,腎癌組織中TNFAIP2mRNA的表達(dá)量明顯高于對應(yīng)的癌旁正常組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P< 0.001),見圖7。
圖6 TNFAIP2在腎癌細(xì)胞系中的表達(dá)情況Fig.6 The expression of TNFAIP2 in renal cancer cell lines
圖7 TNFAIP2 mRNA在腎癌組織和正常腎組織中的表達(dá)Fig.7 The expression of TNFAIP2 mRNA in kidney cancer tissues and normal kidney tissues
ccCRCC被認(rèn)為是免疫浸潤性腫瘤,免疫治療具有革命性的前景[12]。但腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性促進(jìn)了治療抵抗,從而導(dǎo)致ccCRCC預(yù)后不良[13]。TNFAIPs包括TNFAIP1~TNFAIP8,均為促凋亡蛋白[14],其中TNFAIP2 最初被認(rèn)為是人類內(nèi)皮細(xì)胞中的一種新的腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)基因,可能通過誘導(dǎo)TNFAIP2mRNA 表達(dá),在細(xì)胞凋亡中發(fā)揮作用[15]。王斌等[16]研究發(fā)現(xiàn),下調(diào)TNFAIP2可通過激活 Wnt/β-catenin 信號通路,抑制食管鱗狀細(xì)胞癌的增殖和轉(zhuǎn)移。但是TNFAIP2在ccRCC中的作用卻鮮為人知,因此,本研究基于公共數(shù)據(jù)庫分析TNFAIP2在ccCRCC中的表達(dá)情況及其與臨床病理特征的相關(guān)性,并通過體外實驗進(jìn)行驗證。
本研究中,利用公共數(shù)據(jù)庫TIMER2.0、TCGA、ONCOMINE和UALCAN進(jìn)行生物信息分析,發(fā)現(xiàn)TNFAIP2在ccRCC組織中異常高表達(dá),且與腫瘤的分期、分級、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)(P< 0.001),而TNFAIP2高表達(dá)亦能提示病情惡化及總生存期縮短,與其他研究[17]結(jié)果一致。
對人腎臟正常細(xì)胞系HK-2、腎癌細(xì)胞系786-O、ACHN中TNFAIP2表達(dá)水平的進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),腎癌細(xì)胞中TNFAIP2蛋白表達(dá)水平顯著增高,TNFAIP2mRNA在ccCRCC組織中的表達(dá)量顯著高于癌旁正常腎臟組織。提示TNFAIP2可能參與了腎癌的發(fā)生發(fā)展過程。雖然化療、免疫治療及靶向治療是轉(zhuǎn)移性和進(jìn)展性腎癌重要的治療手段,而ccRCC對化療卻具有高度耐藥性[18-19]。文獻(xiàn)[20]報道,TNFAIP2高表達(dá)可誘導(dǎo)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化,并導(dǎo)致尿路上皮癌細(xì)胞對化療藥物產(chǎn)生耐藥。本研究發(fā)現(xiàn)TNFAIP2表達(dá)與免疫細(xì)胞Th1和Treg豐度呈正相關(guān),這為今后腎癌的免疫治療和化療提供了新的思路,未來有待進(jìn)一步研究探討。
綜上所述,TNFAIP2在ccCRCC中的高表達(dá)與患者的預(yù)后有關(guān),因此,TNFAIP2有可能成為ccRCC早期診斷和預(yù)后評價的生物標(biāo)志物之一,可能為腎癌的靶向治療提供新的方向和策略。