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TRPV5基因多態(tài)性與腎含鈣結(jié)石疾病的相關(guān)性研究

2022-08-06 05:14范先明林劍鋒涂建平梁福律葉志彬張明芽李亞楠郭昭建胡力仁
中國醫(yī)藥指南 2022年20期
關(guān)鍵詞:含鈣泌尿系腎結(jié)石

范先明 林劍鋒 涂建平 梁福律 葉志彬 張明芽 李亞楠 郭昭建 胡力仁

(福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬廈門市第三醫(yī)院泌尿外科,福建 廈門 361100)

泌尿系結(jié)石在我國乃至全世界都是常見的疾病,其發(fā)病率仍持續(xù)增加,我國發(fā)病率高達(dá)6.06%,但呈不均衡分布,男性多于女性,農(nóng)村高于城市,南方高于北方[1];而含鈣結(jié)石是最常見的泌尿系結(jié)石的類型[2]。泌尿系結(jié)石病因涉及環(huán)境和遺傳因素等方面[3]。研究發(fā)現(xiàn)泌尿系結(jié)石患者其親屬50%~70%患有泌尿系結(jié)石[4]。而Curhan等[5]對泌尿系結(jié)石患者的家庭成員限制鈣攝入量后,結(jié)石風(fēng)險(xiǎn)增加,導(dǎo)致人們對遺傳因素、環(huán)境因素及混雜因素增加泌尿系結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)存有疑惑。目前有基因的作用研究支持有泌尿系結(jié)石病史的家庭中有常染色體顯性遺傳可能[6]。全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study wide association,GWAS)是在全基因組范圍內(nèi)常見遺傳變異(單核苷酸多態(tài)性和拷貝數(shù))與疾病進(jìn)行輪廓性的整體性的關(guān)聯(lián)分析方法,篩選出與疾病相關(guān)的SNPs。目前僅有少量來自歐洲和日本關(guān)于泌尿系結(jié)石形成中調(diào)節(jié)鈣和磷酸鹽代謝的各種基因位點(diǎn)的GWAS,認(rèn)為常見遺傳變異的尿液轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和大分子是尿路結(jié)石病相關(guān)的危險(xiǎn)因素[7-8]。GWAS研究易于實(shí)施并呈上升的趨勢,是評估復(fù)雜疾病(如腎結(jié)石)的遺傳決定因素,實(shí)用且經(jīng)濟(jì)高效的方式,在資源有限的研究環(huán)境中有明顯的優(yōu)勢[9]。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)許多與增加腎結(jié)石風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的SNP位點(diǎn)[10-14]。但能夠減少腎結(jié)石風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的SNP位點(diǎn)較少報(bào)道。本研究旨在確定TRPV5、UMOD基因中常見遺傳變異與泌尿系結(jié)石患者易感性之間的潛在關(guān)聯(lián)。此外,我們還通過收集和分析與含鈣腎結(jié)石易感性相關(guān)的TRPV5、UMOD基因多態(tài)性的現(xiàn)有數(shù)據(jù),采用了系統(tǒng)的方法,這是通過使用含鈣腎結(jié)石病患者和健康對照的候選基因關(guān)聯(lián)研究確定的,通過Logistic回歸分析影響含鈣腎結(jié)石發(fā)病的危險(xiǎn)因素,報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料 研究組:隨機(jī)選擇在廈門市第三醫(yī)院確診的腎含鈣腎結(jié)石共237例為研究對象,時(shí)間為2017年10月至2020年7月,年齡52~73歲,平均(64.78±3.93)歲;對照組:選擇我院同期的無泌尿系結(jié)石病史的健康者149名,年齡55~74歲,平均(65.31±3.87)歲。兩組一般資料比較,P>0.05,具有可比性。采用相同方法分析血清中的鈣、尿素和肌酐,并分析尿液以研究尿鈣排泄[15]。通過問卷調(diào)查獲得研究組與對照組年齡、性別、BMI、腎結(jié)石家族史的詳細(xì)信息。對所有的參與研究的結(jié)石患者進(jìn)行隨訪,以了解結(jié)石的復(fù)發(fā)情況。本研究已經(jīng)獲得倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

1.2 納入和排除標(biāo)準(zhǔn)

納入標(biāo)準(zhǔn):年齡18~85歲;確診泌尿系結(jié)石患者;患者屬于中國國籍及漢族;臨床資料完整;患者經(jīng)結(jié)石成分分析為含鈣結(jié)石。

排除標(biāo)準(zhǔn):有腎結(jié)石家族史的患者;懷孕期、哺乳期的泌尿系結(jié)石患者;有骨髓自體移植和外周干細(xì)胞移植等器官移植史,及近期輸血史患者;有明顯精神障礙及中樞神經(jīng)系統(tǒng)障礙史者;伴有嚴(yán)重泌尿系感染或活動(dòng)性消化道潰瘍需要治療者;合并有長期的尿路梗阻、甲狀腺功能亢進(jìn)、慢性腸道疾病、甲狀旁腺功能亢進(jìn)、不能控制的糖尿病等疾病患者;合并惡性腫瘤患者。

1.3 方法 收集研究組血液樣本237例及對照組血液樣本149例。留取EDTA抗凝血標(biāo)本,棄去上清后留取其他的細(xì)胞成分,存放于-80 ℃冰箱,待后采用苯酚-氯仿法提取DNA,測定DNA濃度及純度,保持DNA A260/280在1.7~1.9。在第三方檢測機(jī)構(gòu)中檢測目的基因SNP。

試驗(yàn)流程:樣品質(zhì)檢—設(shè)計(jì)引物??—PCR驗(yàn)證—PCR擴(kuò)增—PCR產(chǎn)物回收純化—建庫—上機(jī)測序—數(shù)據(jù)分析。利用HapMap據(jù)庫(http://hapmap.ncbi.nlm.nil.gov/)以及相關(guān)文獻(xiàn),選擇候選基因功能性SNP位點(diǎn)位于啟動(dòng)子、5'-非翻譯區(qū)(5'-UTR)、內(nèi)含子和3'-非翻譯區(qū)(3'-UTR)等,且滿足在CHB人群中MAF>0.05。與TVRP5相關(guān)的3個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)(rs17210、rs17212和rs17262),UMOD基因相關(guān)的SNP(rs13329952、rs11648131和rs9652588)已進(jìn)行調(diào)查。對于所有SNP,樣品中的檢出率約為91%。經(jīng)χ2檢驗(yàn)驗(yàn)證了受試者符合Hardy-Weinberg平衡(HWE)。根據(jù)SNP位點(diǎn)序列信息并采用Assay Designer 3.1軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì)PCR反應(yīng)和單堿基擴(kuò)展引物,并交由有限公司合成。TRPV5、UMOD基因各個(gè)SNP位點(diǎn)引物序列詳見表1。多聚酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)在4 μL體系中進(jìn)行,每個(gè)微孔中的總體積為4 μL,包括1 μL基因組DNA,0.625 μL 10×PCR緩沖液,1 μL引物使用液,0.325 μL MgCl2,0.1 μL HotstarTaq,用雙蒸水補(bǔ)足不足體積。PCR反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 20 s、56 ℃ 30 s、72 ℃ 1 min,72 ℃ 3 min,4 ℃ forever。PCR反應(yīng)后,多余的脫氧核糖核苷三磷酸(dNTP)和引物用SAP酶清除,SAP程序:37 ℃40 min,85℃ 5 min,4 ℃ forever。延長反應(yīng),延長反應(yīng)條件:1.94 ℃ 30 s;2.94 ℃ 5 s;3.52 ℃ 5 s;4.80 ℃ 5 s;5.72 ℃ 3 min;6.4 ℃ forever。3~4步驟5個(gè)循環(huán)后,2~4步驟再40個(gè)循環(huán)。產(chǎn)物純化及構(gòu)建文庫,把檢測樣品轉(zhuǎn)移到表面覆蓋基質(zhì)的Mass ARRAY SpectroCHIP測序芯片上,即可放入質(zhì)譜儀進(jìn)行全自動(dòng)分析檢測,每個(gè)檢測點(diǎn)只需3~5 s。應(yīng)用邊合成邊測序方式進(jìn)行測序,堿基種類根據(jù)4種不同的熒光信號(hào)來確認(rèn),并保證核酸序列質(zhì)量。試驗(yàn)結(jié)果用TYPER軟件分析并獲得分型數(shù)據(jù)。

表1 TRPV5、UMOD 基因SNP位點(diǎn)的合成引物序列

1.4 研究指標(biāo) 研究對象的基本情況、飲食和運(yùn)動(dòng)情況。研究對象基本情況包括:年齡、性別、基礎(chǔ)?。ㄌ悄虿 ⑿难芗膊〉龋┖腕w質(zhì)量指數(shù)(BMI)。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 收集的資料符合正態(tài)分布的用()描述。利用SPSS 25.0統(tǒng)計(jì)軟件,兩組獨(dú)立樣本采用Student's檢驗(yàn),3組樣本及以上計(jì)量資料用方差分析。統(tǒng)計(jì)所有樣本中SNP位點(diǎn)的分型情況,基因型、最小等位基因數(shù)(MAF)以及不同等位基因/基因型的比例。使用χ2檢驗(yàn)檢查受試者中每個(gè)的基因型頻率是否偏離Hardy-Weinberg平衡(HWE),P>0.05被認(rèn)為與HWE差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。使用χ2檢驗(yàn)分析不同基因型/等位基因與腎結(jié)石發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性,以P<0.05其相關(guān)性差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。通過二元Logistic回歸分析了SNP與含鈣結(jié)石患者之間的關(guān)聯(lián),確定比值比(odds ratio,OR)及其95%置信區(qū)間(confidenceInterval,CI)。

2 結(jié)果

2.1 兩組基本資料比較 研究組的BMI、血尿酸、血肌酐、收縮壓及收縮壓顯著高于對照組(P<0.05),其他指標(biāo)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表2。

表2 兩組基本資料比較()

表2 兩組基本資料比較()

2.2 兩組TRPV5和UMOD基因多態(tài)性分布比較 研究組TRPV5基因rs17212位點(diǎn)的等位基因A的頻率顯著高于對照組(P<0.05),rs17212位點(diǎn)AA、GA的基因型顯著高于對照組(P<0.05),UMOD基因rs11648131位點(diǎn)的等位基因C的頻率顯著高于對照組(P<0.05),rs11648131位點(diǎn)CC的基因型顯著高于對照組(P<0.05),其他點(diǎn)位基因多態(tài)性差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表3、表4。

表3 兩組TRPV5基因多態(tài)性分布比較

表4 兩組UMOD基因多態(tài)性分布比較

2.3 含鈣腎結(jié)石危險(xiǎn)因素Logistic回歸分析 Logistic回歸分析結(jié)果顯示年齡≤35歲、BMI和rs17212是含鈣腎結(jié)石發(fā)病的危險(xiǎn)因素(P<0.05),rs11648131是含鈣腎結(jié)石發(fā)病的保護(hù)因素(P<0.05),血尿酸與含鈣腎結(jié)石無明顯相關(guān)性。見圖1。

圖1 Logistic回歸分析泌尿結(jié)石危險(xiǎn)因素的OR值

3 討 論

目前腎結(jié)石可通過許多微創(chuàng)的方法治療,但其有較高的殘石率及復(fù)發(fā)率,腎結(jié)石仍是泌尿外科中棘手問題之一[16]。在泌尿系結(jié)石中以草酸鈣或磷酸鈣結(jié)石為主,主要成分是鈣離子[17-18]。既往研究表明,高尿鈣癥也是泌尿系結(jié)石的主要危險(xiǎn)因素之一,遺傳和環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)因素會(huì)對原尿液中鈣離子再吸收產(chǎn)生重大影響,繼而導(dǎo)致泌尿系結(jié)石[19-20]。因此,促進(jìn)尿液鈣離子再吸收和減少尿鈣排泄可能是減少腎結(jié)石形成的一種方式。

在腎臟中,TRPV5蛋白質(zhì)主要在腎遠(yuǎn)曲小管和連接小管的上皮中表達(dá),是鈣離子重吸收的最后門戶,在尿原液中鈣離子的重吸收和維持鈣離子的穩(wěn)態(tài)中起重要的作用[21-23]。已有研究證明,TRVP5基因敲除的小鼠表現(xiàn)出Ca2+重吸收減少,增加腸道鈣吸收和降低骨密度[24-25],用小的活化RNA(ds-320)激活TRVP5后可促進(jìn)大鼠尿鈣離子的重吸收并減少尿鈣離子的排泄,從而抑制乙二醇誘導(dǎo)的草酸鈣晶體形成[26]。TRPV5表達(dá)下調(diào)直接降低大鼠尿液中鈣離子重吸收,直接導(dǎo)致尿鈣丟失并導(dǎo)致高鈣尿癥[27]。這表明TRPV5的表達(dá)水平涉及腎結(jié)石的形成,上調(diào)TRPV5的表達(dá)可能是腎結(jié)石一個(gè)新的治療方法。

TRPV5單核苷酸多態(tài)性主要在高鈣性疾病中。首個(gè)報(bào)告在美國非洲裔中TRPV5有A8V、R154H(rs4236480)、A563T和L712F的基因多態(tài)性,僅R154H(rs4236480)與高尿鈣相關(guān)[28]。在20例高的尿鈣患者中檢測到TRPV5的SNP(A8V、R154H和A561T),盡管對TRPV5通道功能沒有受到影響[29]。與野生型TRPV5相比,TRPV5的S682P突變導(dǎo)致小鼠模型中出現(xiàn)高鈣尿癥、多尿癥、高磷尿癥和更酸性的尿液[30]。在我國臺(tái)灣地區(qū)人群中,發(fā)現(xiàn)與泌尿系結(jié)石相關(guān)TRPV5基因多態(tài)性位點(diǎn)是rs4236480,因?yàn)閿y帶TT+CT基因型的患者比CC基因型患者患結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)增加[31]。Oddsson等[32]通過全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)發(fā)現(xiàn)TRPV5與泌尿系結(jié)石的復(fù)發(fā)存在明顯相關(guān)性(OR=3.62,P=4.1×10-5)。在本研究中,所選得TRPV5的SNP(rs17210,rs17212和rs17262)僅發(fā)現(xiàn)rs17212與腎結(jié)石的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān),在腎結(jié)石的患者中rs17212的AA 純合子基因型攜帶者高于其他基因型攜帶者,rs17212是腎結(jié)石的危險(xiǎn)因素之一[OR=2.210,95%CI(1.040~4.698)]。

UMOD 基因位于染色體16p12上,編碼哺乳動(dòng)物尿液中含量最高的尿調(diào)節(jié)蛋白(Tamm-Horsfall蛋白)。GWAS發(fā)現(xiàn)UMOD單核苷酸多態(tài)性(SNPs)對含有鈣的腎結(jié)石具有保護(hù)作用[33]。UMOD通過細(xì)胞外作用和減少TRPV5的內(nèi)吞作用來上調(diào)TRPV5,刺激Ca2+重吸收有助于防止腎結(jié)石發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn),形成并具有抑制結(jié)石形成特征的巨細(xì)胞[34-35]。在本研究中UMOD 3個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(rs13329952、rs11648131和rs9652588)僅發(fā)現(xiàn)rs1164813多態(tài)性位點(diǎn)與腎結(jié)石的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著負(fù)相關(guān),在腎結(jié)石患者中CC純合子基因型攜帶者低于CG雜合子基因型攜帶者,有助于防止腎結(jié)石發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)。

這項(xiàng)研究仍然存在局限性。由于潛在的SNP是根據(jù)已發(fā)表的文章和公共數(shù)據(jù)庫選擇的,因此我們可能會(huì)錯(cuò)過其他一些潛在的功能遺傳變異性,這些變異不一定是SNPs。其次,偏差可能由本研究的樣本量相對較小引起,需要進(jìn)一步研究樣本量較大的樣本量來驗(yàn)證我們的發(fā)現(xiàn)。此外,這項(xiàng)研究的參與者都是中國人,最好將這項(xiàng)研究擴(kuò)展到不同的種族群體,并檢驗(yàn)我們發(fā)現(xiàn)的有效性。此外,雖然我們已經(jīng)揭示了SNP rs17212、rs1164813與腎結(jié)石之間的關(guān)聯(lián),但實(shí)際分子和細(xì)胞機(jī)制仍有待探索。

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