任秀美奧,姚旭東,蒙亞琦,郭延華,唐 紅,張譯元,趙興旺,王立民,周 平
(1.石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,石河子 832000;2.新疆農(nóng)墾科學(xué)院,省部共建綿羊遺傳改良與健康養(yǎng)殖國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,石河子 832000;3.石河子總場(chǎng)農(nóng)業(yè)服務(wù)發(fā)展中心,石河子 832000)
在自然受精過(guò)程中,精子除提供單倍體基因組外,還提供精源性RNA(核糖核酸)并參與早期胚胎的發(fā)育調(diào)控[1],精源性RNA的含量很少,但對(duì)受精、早期胚胎發(fā)育以及表觀遺傳等均發(fā)揮重要調(diào)控作用[2]。微小核糖核酸(miRNA)是大小為20~25 nt的單鏈非編碼 RNA,占脊椎動(dòng)物基因的1%~3%,約超過(guò)30%的基因被其調(diào)控[3]。精源性信使核糖核酸(mRNA)和miRNA對(duì)胚胎轉(zhuǎn)錄和基因表達(dá)有重要作用[4]。Wang等[5]發(fā)現(xiàn)miR-449b在牛精子中高表達(dá),提示miR-449b進(jìn)入卵母細(xì)胞中參與受精后胚胎的發(fā)育,同時(shí)miR-449b在受精卵重編程過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。對(duì)小鼠生殖細(xì)胞研究發(fā)現(xiàn),miR-449簇與miR-34b/c在調(diào)節(jié)小鼠睪丸組織發(fā)育過(guò)程中具有協(xié)同作用[6]。對(duì)牛體細(xì)胞核移植的供體細(xì)胞轉(zhuǎn)染精源性miR-449b,通過(guò)靶向組蛋白去乙?;?(HDAC1)的表達(dá),提高核移植2-細(xì)胞和8-細(xì)胞胚胎的組蛋白H3K9乙?;?,促進(jìn)表觀重編程[5]。以上研究表明,在胚胎發(fā)育過(guò)程中精源性miR-449b調(diào)節(jié)因子具有重要作用。羊睪丸組織高通量測(cè)序顯示,miR-449b在羊睪丸組組中表達(dá)[7]。H3K9三甲基化(H3K9me3)依賴性異染色質(zhì)是早期胚胎發(fā)育過(guò)程中的主要障礙之一[8],參與早期胚胎基因調(diào)控和印跡X失活過(guò)程[9-11]。編碼H3K9me3相關(guān)染色質(zhì)因子的基因缺失會(huì)導(dǎo)致基因無(wú)法正常表達(dá)和胚胎致死[12-13]。Yuan等[14]和Conine等[15]在缺乏精子RNA的早期胚胎中未發(fā)現(xiàn)基因組甲基化異常,但Wang等[8]對(duì)小鼠早期胚胎中H3K9me3修飾的全基因組研究發(fā)現(xiàn),H3K9me3在啟動(dòng)子和長(zhǎng)末端重復(fù)序列(LTR)中表現(xiàn)出明顯的動(dòng)態(tài)特征,受精后母系基因組與父系基因組都進(jìn)行大規(guī)模的H3K9me3重建,且H3K9me3能在原核期胚胎的雌原核和2-細(xì)胞期胚胎中檢測(cè)到。目前關(guān)于miR-449b對(duì)早期胚胎組蛋白H3K9me3影響的研究鮮見(jiàn)報(bào)道。本試驗(yàn)通過(guò)比較綿羊成纖維細(xì)胞、成熟卵母細(xì)胞與精子中miR-449b的含量,探索miR-449b的表達(dá)情況,通過(guò)顯微注射法為孤雌胚胎補(bǔ)充正常受精過(guò)程中帶入的miR-449b,同時(shí)使用免疫熒光染色觀察補(bǔ)充miR-449b對(duì)綿羊2-細(xì)胞期孤雌胚胎組蛋白H3K9me3的影響,研究miR-449b對(duì)綿羊早期胚胎組蛋白甲基化的影響,為綿羊早期胚胎發(fā)育機(jī)制的研究提供參考。
1.1.1 樣品 于石河子屠宰場(chǎng)采集綿羊卵巢;在新疆農(nóng)墾科學(xué)院綿羊新種質(zhì)資源培育基地采集1月齡純種薩??斯?3只)的耳組織,以及3歲左右純種薩??斯?5只)的精液。綿羊卵巢保存于加雙抗的37 ℃生理鹽水中2 h內(nèi)運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室。采集的耳組織放入含雙抗的0.9%生理鹽水中,與采集的新鮮精液一起,常溫下2 h內(nèi)運(yùn)送回實(shí)驗(yàn)室。
1.1.2 主要試劑及儀器 TRIzol購(gòu)自Invitrogen公司;Mir-X miRNA First-Strand Synthesis Kit、無(wú)水乙醇、細(xì)胞培養(yǎng)液均購(gòu)自TaKaRa公司;PBS緩沖液購(gòu)自Biological Industries公司;卵母細(xì)胞成熟液、胚胎培養(yǎng)液、顯微操作液、受精液、氯仿、Percoll、DEPC、二甲基氨基嘌呤(6-DMAP)、4,6-二脒基-2-苯基吲哚二月桂酸酯(DAPI)、透明質(zhì)酸酶、石蠟油均購(gòu)自Sigma公司;RNase-free水購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;4%多聚甲醛、透膜液、封閉液、清洗液均購(gòu)自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;兔抗H3K9me3抗體、山羊抗兔IgG均購(gòu)自Abcam公司;實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(LightCycler 480 Ⅱ)購(gòu)自Roch公司;梯度PCR儀(Labcycler 48)購(gòu)自SensoQuest公司;超凈工作臺(tái)(VS-840垂直流)購(gòu)自上海博迅醫(yī)療生物儀器股份有限公司;CO2培養(yǎng)箱(Galaxy 48R)、顯微注射儀(Femtojet)、顯微操作系統(tǒng)(Transfer Man 4r)均購(gòu)自Eppendorf公司;拉針儀(PC-100)、斷針儀(MF-830)、生物顯微鏡(SMZ800)、激光共聚焦顯微鏡(Stellaris 5)均購(gòu)自Nikon公司。
1.1.3 miR-449b模擬物及其對(duì)照的設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)miRBase中提供的miR-449b-5p的序列(登錄號(hào):MIMAT0036232)設(shè)計(jì)miR-449b的模擬物(miR-449b mimic)及其模擬物對(duì)照(NC mimic)序列,miR-449b mimic:5′-AGGCAGUGUAUUGUU-AGCUGGC-3′,NC mimic:5′-UCACAACCUCCU-AGAAAGAGUAGA-3′。序列由上海吉熒生物技術(shù)有限公司合成。將miR-449b mimic與NC mimic粉末溶解并稀釋成20 μmol/L,―80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.1 精子 將5只羊的精液混合后,用Percoll密度梯度離心法純化精子,在10 mL尖底離心玻璃管底部加入2 mL 90% Percoll離心液,在其上方傾斜緩慢加入45% Percoll離心液,將200 μL精液緩慢加入離心管中45% Percoll密度梯度離心液表面,2 000 r/min離心10 min,離心后玻璃離心管尖底有云霧狀精子,將離心管上層與中下層的渾濁液體和死、弱精子輕輕吸走,留少量底部精子和液體,用200 μL鈍化槍頭將精子吸走,加入37 ℃預(yù)熱的1 mL PBS液中,1 500 r/min離心5 min,將上清液盡可能吸掉,留精子沉淀用于精子RNA的提取。
1.2.2 成熟卵母細(xì)胞 用剪刀除去多余結(jié)締組織,用生理鹽水清洗3次至無(wú)血液和異物。用刀片刺破直徑為2~8 mm的卵泡,體視鏡下挑選包裹2~3層顆粒細(xì)胞的卵丘-卵母細(xì)胞復(fù)合體(COCs),用采卵液清洗2遍,放入卵母細(xì)胞成熟液進(jìn)行體外培養(yǎng),38.5 ℃、5% CO2飽和濕度的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)16~18 h。將成熟卵母細(xì)胞用0.1%透明質(zhì)酸酶消化,脫去顆粒細(xì)胞,顯微鏡下挑選胞質(zhì)均勻的卵母細(xì)胞備用。
1.2.3 成纖維細(xì)胞 在培養(yǎng)皿內(nèi)將耳組織剪碎至大小約0.1 cm3的小塊,按0.5 cm間距接種于培養(yǎng)皿中,待組織貼壁后,加細(xì)胞培養(yǎng)液,置于37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每2~3 d換1次液,當(dāng)組織塊周圍爬出的細(xì)胞生長(zhǎng)至80%~90%時(shí)進(jìn)行傳代培養(yǎng)。
1.3.1 精子、成熟卵母細(xì)胞與成纖維細(xì)胞RNA的提取 按照TRIzol試劑說(shuō)明書提取綿羊精子RNA,―80 ℃保存?zhèn)溆谩R?0個(gè)胚胎為1組,使用GenEluteTM單細(xì)胞RNA純化試劑盒,按步驟提取成熟卵母細(xì)胞RNA,―80 ℃保存?zhèn)溆?。待成纖維細(xì)胞鋪滿10 cm培養(yǎng)皿的90%左右,用0.25%胰蛋白酶消化細(xì)胞,PBS清洗2~3次,加入1 mL TRIzol裂解液后按照步驟提取總RNA,―80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.2 精子、成熟卵母細(xì)胞與成纖維細(xì)胞RNA的反轉(zhuǎn)錄 將精子、成熟卵母細(xì)胞與成纖維細(xì)胞的RNA按照Mir-X miRNA First-Strand Synthesis Kit說(shuō)明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。反轉(zhuǎn)錄體系10 μL:mRQ Buffer(2×)5 μL,RNA 3.75 μL,mRQ Enzyme 1.25 μL。反應(yīng)程序:37 ℃ 1 h,85 ℃ 5 min,反轉(zhuǎn)錄所得cDNA立即進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR或―80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)miR-449b的表達(dá) 根據(jù)GenBank中綿羊miR-449b序列(登錄號(hào):MIMAT0036232)用miRNA RT Primer軟件設(shè)計(jì)miR-449b正向引物F:GGGAGGCAGTGTAT-TGTTAGCTG,反向通用引物與U6內(nèi)參引物由Mir-X miRNA First-Strand Synthesis Kit提供。PCR反應(yīng)體系20 μL:SYBR Green Ⅰ 10 μL,上、下游引物各0.5 μL,cDNA 1 μL,ddH2O 8 μL。PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性50 s;95 ℃變性5 s,60 ℃延伸20 s,共45個(gè)循環(huán)。熔解曲線:95 ℃ 60 s,55 ℃ 30 s,95 ℃ 30 s。
卵母細(xì)胞成熟后,用0.1%透明質(zhì)酸酶消化,脫去顆粒細(xì)胞,顯微鏡下挑選胞質(zhì)均勻的卵母細(xì)胞轉(zhuǎn)移至提前準(zhǔn)備好的注射微滴中,用固定針固定卵母細(xì)胞,視野下調(diào)至透明帶與注射針尖清晰可見(jiàn),將0.9%生理鹽水(對(duì)照組,Con)、NC mimic、miR-449b mimic分別注射進(jìn)胞質(zhì)中,以均勻擴(kuò)散為標(biāo)準(zhǔn),迅速撤出注射針。將注射后的卵母細(xì)胞在成熟液中恢復(fù)0.5~1 h,去除死亡的卵母細(xì)胞,剩余卵母細(xì)胞進(jìn)行孤雌激活,激活步驟如下:將注射后的卵母細(xì)胞移至7%無(wú)水乙醇中激活8 min;用發(fā)育液清洗2次,再放入6-DMAP中激活4 h,用發(fā)育液清洗2次,放入發(fā)育液微滴中,在38.5 ℃、5% CO2飽和濕度的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),觀察并拍照,收集2-細(xì)胞胚胎,第2、7天分別統(tǒng)計(jì)卵裂率和囊胚率。
將綿羊精子按照1.2.1方法處理,最后獲得活力>80%的精子,將精子稀釋成1×106~5×106/mL,在培養(yǎng)箱中平衡2 h,將帶有少量顆粒細(xì)胞的卵母細(xì)胞置于受精液滴中并加入精子,于38.5 ℃、5% CO2飽和濕度的培養(yǎng)箱中進(jìn)行IVF;受精18 h后將卵母細(xì)胞轉(zhuǎn)入胚胎發(fā)育液中,在38.5 ℃、5% CO2飽和濕度的培養(yǎng)箱中進(jìn)行體外培養(yǎng),收集2-細(xì)胞胚胎用于H3K9me3免疫熒光染色。
收集IVF 2-細(xì)胞胚胎及Con、NC mimic和miR-449b mimic組2-細(xì)胞胚胎,用0.1% PVA洗3次,用4%多聚甲醛在室溫下固定30 min,然后將固定好的胚胎放入透膜液中,孵育30 min后用封閉液封閉1~2 h,用0.1% PVA清洗3次,將4種類型胚胎與兔抗H3K9me3抗體(1∶500 稀釋)一抗4 ℃孵育過(guò)夜,用PBS清洗3次,每次5 min,與山羊抗兔IgG(1∶100)二抗室溫共孵育2 h,用PBS清洗3次,每次5 min,再用DAPI復(fù)染5~8 min,置于激光共聚焦顯微鏡下觀察并拍照,使用ImageJ 1.48對(duì)H3K9me3進(jìn)行熒光強(qiáng)度分析。
實(shí)時(shí)熒光定量RCR結(jié)果用2-ΔΔCt法進(jìn)行計(jì)算。H3K9me3免疫熒光強(qiáng)度用ImageJ 1.48軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。用GraphPad Prism 6.0進(jìn)行單因素方差分析(One-Way ANOVA),組間差異采用Bonferroni法進(jìn)行比較。結(jié)果用平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,P<0.05表示差異顯著。
新鮮綿羊精液經(jīng)Percoll密度梯度離心純化后所得精子形態(tài)正常,活力為85%(圖1A);綿羊成熟COCs顆粒細(xì)胞擴(kuò)散良好,卵母細(xì)胞胞質(zhì)均勻(圖1B);綿羊耳組織培養(yǎng)3 d后周圍有梭形細(xì)胞爬出,體外培養(yǎng)具有貼壁生長(zhǎng)特性(圖1C)。
圖1 綿羊精子(A)、成熟卵母細(xì)胞(B)與成纖維細(xì)胞(C)形態(tài)(40×)
由圖2可知,miR-449b在精子中的表達(dá)顯著高于成熟卵母細(xì)胞和成纖維細(xì)胞(P<0.05),成熟卵母細(xì)胞與成纖維細(xì)胞中miR-449b的表達(dá)差異不顯著(P>0.05)。
肩標(biāo)不同字母表示差異顯著(P<0.05);肩標(biāo)相同字母表示差異不顯著(P>0.05)。圖4同
由表2、圖3可知,與Con組相比,miR-449b mimic和NC mimic組卵裂率均顯著降低(P<0.05),且NC mimic組卵裂率顯著低于miR-449b mimic組(P<0.05);miR-449b mimic組囊胚率提高,但差異不顯著(P>0.05)。
圖3 各組胚胎發(fā)育情況(40×)
表2 各組胚胎的卵裂率與囊胚率
由圖4A可知,IVF、Con、NC mimic與miR-449b mimic組2-細(xì)胞胚胎均表達(dá)組蛋白H3K9me3,且都在細(xì)胞核表達(dá)。由圖4B可知,與Con組相比,NC mimic組2-細(xì)胞胚胎組蛋白H3K9me3的表達(dá)水平顯著增加(P<0.05),miR-449b mimic組2-細(xì)胞胚胎組蛋白H3K9me3的表達(dá)水平顯著降低(P<0.05);miR-449b mimic組2-細(xì)胞胚胎組蛋白H3K9me3顯著低于NC mimic組(P<0.05),且與IVF組無(wú)顯著差異(P>0.05)。
A,各組2-細(xì)胞胚胎中組蛋白H3K9me3的免疫熒光檢測(cè)(40×);B,組蛋白H3K9me3的相對(duì)熒光強(qiáng)度
成熟精子是攜帶最少細(xì)胞質(zhì)、高度特化壓縮的細(xì)胞,不發(fā)生復(fù)制、轉(zhuǎn)錄或翻譯[2],且含有少量mRNA、miRNA、內(nèi)源性小干擾RNA(endo-siRNA)和piwi相互作用RNA(piRNA)[16-17]。采用單精子顯微注射(ICSI)將部分缺失miRNA和endo-siRNA的精子與正常卵母細(xì)胞受精,所得胚胎發(fā)育能力明顯降低,當(dāng)補(bǔ)充正常精子總RNA或small RNA后胚胎發(fā)育能力與卵胞漿內(nèi)ICSI胚胎移植后的出生率得到提高,表明精子miRNA和endo-siRNA對(duì)正常胚胎發(fā)育至關(guān)重要[14]。miRNA能結(jié)合靶基因mRNA的3′-UTR區(qū)域,降低靶基因mRNA轉(zhuǎn)錄后水平,調(diào)控基因表達(dá)從而影響細(xì)胞的分化、增殖、代謝等多個(gè)過(guò)程[18-19]。miR-449簇包括miR-449a、miR-449b、miR-449c、miR-449d,其中miR-449b具有組織特異性表達(dá),在睪丸中高表達(dá),其許多靶基因在生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮重要作用[20]。本試驗(yàn)對(duì)比綿羊成纖維細(xì)胞、成熟卵母細(xì)胞與精子中miR-449b的相對(duì)表達(dá),結(jié)果表明miR-449b在精子中高表達(dá),這與Wang等[5]結(jié)果一致,提示精子miR-449b參與胚胎的早期發(fā)育。
關(guān)于miRNA對(duì)早期胚胎發(fā)育的相關(guān)研究越來(lái)越多,包括在小鼠精子中高表達(dá)的miR-34c,其可以調(diào)控DNA的合成[21],說(shuō)明miR-34c對(duì)小鼠胚胎的第一次卵裂至關(guān)重要。牛體外受精胚胎桑椹胚和囊胚階段高表達(dá)miR-130b,抑制miR-130b的表達(dá)顯著降低桑椹胚和囊胚的形成[22]。牛精子攜帶的miR-202b抑制靶基因胞裂蛋白7(SEPT7)的表達(dá),調(diào)節(jié)紡錘體的形成和細(xì)胞骨架的穩(wěn)定性,從而延緩體細(xì)胞核移植胚胎的第一次分裂[23]。Wang等[5]通過(guò)制備牛體細(xì)胞核移植胚胎模型研究miR-449b的作用,結(jié)果顯示,miR-449b可延遲牛植入前克隆胚胎的第一次卵裂時(shí)間、促進(jìn)表觀遺傳重編程和降低凋亡指數(shù)。為探究miR-449b對(duì)綿羊早期胚胎的作用,本試驗(yàn)將miR-449b mimic顯微注射至綿羊成熟卵母細(xì)胞,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-449b mimic組孤雌激活胚胎卵裂率比NC mimic組明顯提高,miR-449b mimic組孤雌激活胚胎囊胚率提高但不顯著。說(shuō)明miR-449b在綿羊早期胚胎卵裂率與囊胚形成方面發(fā)揮重要作用,綿羊miRNA參與早期胚胎發(fā)育過(guò)程。
基因組在胚胎發(fā)育早期被廣泛去甲基化對(duì)胚胎正常發(fā)育至關(guān)重要,在發(fā)育過(guò)程中必須經(jīng)過(guò)調(diào)控才能保持基因組穩(wěn)定性[24]。其中組蛋白甲基化是影響核重編程效率的主要因素之一,且組蛋白甲基化比組蛋白乙?;揎椄訌?fù)雜,其中H3氨基端的K4和K9作為組蛋白甲基化的多發(fā)位點(diǎn),組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶催化H3K4和H3K9位點(diǎn)進(jìn)行單甲基化、二甲基化和三甲基化水平的改變[25]。本試驗(yàn)利用免疫熒光染色檢測(cè)對(duì)成熟卵母細(xì)胞補(bǔ)充miR-449b后組蛋白H3K9me3水平的改變,結(jié)果表明miR-449b能降低綿羊早期胚胎中組蛋白H3K9me3的表達(dá)水平。小鼠上的研究發(fā)現(xiàn),正常受精后H3K9me3異染色質(zhì)重編程清除啟動(dòng)子區(qū)域H3K9me3的障礙,為合子基因組激活建立不受限制的表觀遺傳環(huán)境,這可能是胚胎達(dá)到全能性狀態(tài)所必需的[26]。在早期胚胎發(fā)育過(guò)程中,H3K9me3標(biāo)記的基因相對(duì)較少且穩(wěn)定,而大部分LTRs逐漸被H3K9me3依賴性異染色質(zhì)標(biāo)記,2-細(xì)胞胚胎特異性LTRs的表達(dá)水平是提高細(xì)胞發(fā)育潛能的標(biāo)志[27-28],一些逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子上H3K9me3水平的增加與LTRs在2-細(xì)胞階段后的沉默有關(guān)[8]。本試驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),組蛋白H3K9me3在miR-449b mimic組2-細(xì)胞胚胎顯著低于NC mimic與對(duì)照組胚胎,其表達(dá)水平與體外受精胚胎相似,表明miR-449b參與早期胚胎發(fā)育過(guò)程中組蛋白甲基化重編程。
miR-449b在綿羊精子中高表達(dá),且能顯著提高綿羊早期胚胎的發(fā)育率,降低早期胚胎中組蛋白H3K9me3的表達(dá)水平,表明miR-449b在早期胚胎發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用,為進(jìn)一步探索早期胚胎發(fā)育的分子機(jī)制提供參考。