章琦,李寶珍,鄭雪梅,平寶華,王曉艷,李倩,2*
近一個世紀(jì)以來,抗菌藥物的應(yīng)用極大地降低了多種感染性疾病的發(fā)生率和致死率,開啟了抗菌治療的“黃金時代”,但進(jìn)入21世紀(jì)以來,細(xì)菌耐藥問題凸顯,并逐漸成為全球性重大公共衛(wèi)生難題之一。多重耐藥菌(multidrug resistance bacteriaorganism,MDRO)指對通常敏感的常用的3類或3類以上抗菌藥物同時不敏感的細(xì)菌,是現(xiàn)階段我國醫(yī)院感染防控面臨的主要問題之一[1]。研究表明,多重耐藥菌可增加多種感染發(fā)生風(fēng)險、患者痛苦及死亡率,延長患者住院時間,給患者及其家屬造成巨大經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),極大地消耗醫(yī)療和社會資源[2]。因此,分析我國多重耐藥菌研究熱點(diǎn)對于深入開展細(xì)菌耐藥性研究具有十分重要的意義。
文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的研究對象是文獻(xiàn)系統(tǒng)和文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)特征,主要通過運(yùn)用數(shù)理統(tǒng)計(jì)方法對文獻(xiàn)信息的分布結(jié)構(gòu)、數(shù)量關(guān)系和變化規(guī)律進(jìn)行科學(xué)分析[3]。本研究以近20年來在中國知網(wǎng)上發(fā)布的與多重耐藥菌相關(guān)的文獻(xiàn)為研究對象,通過Citespace軟件、文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法從變化趨勢、關(guān)鍵詞共現(xiàn)、聚類等維度進(jìn)行可視化分析,以了解我國多重耐藥菌研究熱點(diǎn)等。
本研究價值:
目前,我國尚無針對多重耐藥菌研究熱點(diǎn)的可視化研究。本研究在文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的基礎(chǔ)上融入大數(shù)據(jù)理念,借助通過Citespace軟件、文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法對多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析,利于相關(guān)領(lǐng)域研究者了解多重耐藥菌領(lǐng)域研究熱點(diǎn)、前沿進(jìn)展等。
1.1 數(shù)據(jù)來源 以中國知網(wǎng)為數(shù)據(jù)源,采用高級檢索方式,以“主題”為檢索項(xiàng)、“多重耐藥菌”為檢索詞進(jìn)行檢索,發(fā)表時間限定為2000-01-01至2020-11-17,共檢索出5 414篇文獻(xiàn),剔除重復(fù)文獻(xiàn)、會議論文、摘要匯編、培訓(xùn)通知、新聞報(bào)道等后共獲得有效文獻(xiàn)3 808篇。
1.2 方法 Citespace軟件是基于共引理論和尋徑算法、采用Java語言開發(fā)的用于計(jì)量特定研究領(lǐng)域文獻(xiàn)的可視化軟件,在尋找某一研究領(lǐng)域的研究進(jìn)展、研究前沿及與其相對應(yīng)的基礎(chǔ)知識等方面具有較高的應(yīng)用價值[4-5]。共詞分析法是一種文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法,可通過對某研究領(lǐng)域關(guān)鍵詞在文獻(xiàn)中出現(xiàn)的總頻次進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析而對該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)和今后的發(fā)展態(tài)勢進(jìn)行展示[6]。本研究采用Citespace V5.7.R1軟件完成對所獲得文獻(xiàn)高頻關(guān)鍵詞的提取,并進(jìn)行共現(xiàn)及聚類分析,具體步驟如下:(1)采用Excel軟件導(dǎo)出所獲得的有效文獻(xiàn)的基本信息,包括文題、作者、來源期刊、出版年、期等,以分析文獻(xiàn)增長規(guī)律和來源。(2)將所獲得有效文獻(xiàn)的基本信息以Refworks格式導(dǎo)出,采用Citespace軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換,分析時間跨度設(shè)置為2000—2020年,時間區(qū)分設(shè)置為1年,節(jié)點(diǎn)類型中選擇“Keyword”進(jìn)行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析,節(jié)點(diǎn)閾值選擇 Top 50 per slice。(3)關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析對象為所獲得有效文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞,得出的共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)能反映關(guān)鍵詞出現(xiàn)頻率及當(dāng)前研究熱點(diǎn),其中高頻關(guān)鍵詞指出現(xiàn)頻次較高的關(guān)鍵詞;關(guān)鍵詞中心性可反映測量節(jié)點(diǎn)在網(wǎng)絡(luò)中的重要性,通過該指標(biāo)可發(fā)現(xiàn)并衡量關(guān)鍵詞的重要性,關(guān)鍵詞中心性不低于0.1的節(jié)點(diǎn)被稱為關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)[7]。(4)設(shè)置“Burstness”(突發(fā)性節(jié)點(diǎn))以展現(xiàn)研究熱點(diǎn)的變化特征,并采用中心度測量方法,從標(biāo)題、摘要、檢索詞和文獻(xiàn)記錄標(biāo)識符中提取突現(xiàn)詞以梳理出關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)相關(guān)文獻(xiàn)的演進(jìn),進(jìn)而反映研究熱點(diǎn)隨時間變化趨勢。
2.1 多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)增長規(guī)律 根據(jù)所獲得的3 808篇有效文獻(xiàn),2000—2020年我國多重耐藥菌相關(guān)研究總體呈現(xiàn)上升趨勢,其中2000—2004年為低產(chǎn)出期,2005—2009年為緩慢增長期,2010—2015年為快速增長期,2016—2018年為相對平穩(wěn)期(增長相對平穩(wěn)),2019年發(fā)文量與2018年相比明顯增加,2020-01-01至2020-11-17發(fā)文量與2019年相比有所降低,為后續(xù)發(fā)展期。見圖1。
圖1 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)年度刊載量Figure 1 Annual publication volume of studies about multidrug-resistant organisms in China from 2000 to 2020
2.2 多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)來源期刊 所獲得的3 808篇有效文獻(xiàn)中1 791篇(占47.03%)發(fā)表在核心期刊(入編《中文核心期刊要目總覽》的期刊);發(fā)文量排在前10位的來源期刊共刊載相關(guān)文獻(xiàn)708篇(占18.59%),其中437篇(占61.72%)發(fā)表在核心期刊。詳見表1。
表1 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量排在前10位的來源期刊Table 1 Top 10 journals ranked by the number of studies about multidrugresistant organisms published in China from 2000 to 2020
2.3 多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)高頻關(guān)鍵詞分析
2.3.1 關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系 通過Citespace軟件統(tǒng)計(jì)高頻關(guān)鍵詞并繪制關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò),共識別出221個節(jié)點(diǎn)、302條連線,除多重耐藥菌、多重耐藥外,出現(xiàn)頻次排在前20位的關(guān)鍵詞中醫(yī)院感染、多重耐藥菌感染、銅綠假單胞菌、ICU、大腸桿菌、抗藥性、抗生素、肺炎克雷伯菌、藥敏試驗(yàn)、重癥監(jiān)護(hù)室的中心性均≥0.10(圖2、表2)。
圖2 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)Figure 2 Keywords co-occurrence network in studies related to multidrugresistant organisms published in China from 2000 to 2020
表2 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)中排在前20位的高頻關(guān)鍵詞Table 2 Top 20 ranked high-frequency keywords in studies related to multidrug-resistant organisms published in China from 2000 to 2020
2.3.2 關(guān)鍵詞共現(xiàn)聚類 通過關(guān)鍵詞聚類分析將關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)聚類為15個“簇”(圖3),其中模塊值為0.800 5,平均輪廓值為0.668 8;進(jìn)一步對15個“簇”進(jìn)行劃分發(fā)現(xiàn),多重耐藥菌研究主要圍繞以下4個主題展開:多重耐藥菌種(聚類#0、#1、#2、#12)、多重耐藥菌感染及預(yù)后(聚類#3、#6、#10、#11)、引發(fā)多重耐藥菌感染疾病(聚類#8、#9、#14)、多重耐藥菌產(chǎn)生機(jī)制及防控(聚類#4、#5、#7、#13)。
圖3 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)聚類分析Figure 3 Cluster analysis of keywords co-occurrence in studies related to multidrug-resistant organisms published in China from 2000 to 2020
2.4 多重耐藥菌研究熱點(diǎn)的演變 2000—2013年高被引突現(xiàn)詞主要集中在耐藥菌株、耐藥性、抗生素、整合子等,2013年之后沒有出現(xiàn)突現(xiàn)詞(表3)。
表3 2000—2020年中國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)中排在前10位的突現(xiàn)詞Table 3 Top 10 burst-related words in studies related to multidrugresistant organisms published in China from 2000 to 2020
2011年世界衛(wèi)生日的主題為“控制細(xì)菌耐藥:今天不采取行動,明天將無藥可用”,同年衛(wèi)生部辦公廳印發(fā)《多重耐藥菌醫(yī)院感染預(yù)防與控制技術(shù)指南(試行)》[8]以降低多重耐藥菌醫(yī)院感染發(fā)生風(fēng)險;2016年,國家衛(wèi)生計(jì)生委、國家發(fā)展改革委、教育部等14個部門聯(lián)合制定了“遏制細(xì)菌耐藥國家行動計(jì)劃(2016—2020年)”[9]。上述文件的頒布表明細(xì)菌耐藥問題已引起我國高度重視,因而分析我國多重耐藥菌研究熱點(diǎn)對于深入開展細(xì)菌耐藥性研究具有重要意義。本研究根據(jù)所獲得的有效文獻(xiàn)分析我國多重耐藥菌相關(guān)文獻(xiàn)增長規(guī)律發(fā)現(xiàn),2000—2020年我國多重耐藥菌相關(guān)研究總體呈現(xiàn)上升趨勢,大體分為5個階段:低產(chǎn)出期(2000—2004年)、緩慢增長期(2005—2009年)、快速增長期(2010—2015年)、相對平穩(wěn)期(2016—2018年)、后續(xù)發(fā)展期(2019—2020年)。
本研究結(jié)果顯示,所獲得的3 808篇有效文獻(xiàn)中發(fā)表在核心期刊者僅占47.03%,而發(fā)文量排在前10位的來源期刊所刊載的相關(guān)文獻(xiàn)僅占18.59%,提示 2000—2020年刊載我國多重耐藥菌相關(guān)研究的期刊分布比較分散,且核心期刊刊載量有限。因此,今后還應(yīng)繼續(xù)開展多重耐藥菌高水平研究,以科學(xué)、有效地延緩細(xì)菌耐藥的發(fā)生和發(fā)展。
Citespace軟件是一款基于Java語言環(huán)境的可視化知識圖譜分析軟件,可通過對某一領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行共現(xiàn)和共被引分析而呈現(xiàn)該領(lǐng)域研究現(xiàn)狀并對其發(fā)展趨勢進(jìn)行預(yù)測[10]。隨著信息技術(shù)的發(fā)展和大數(shù)據(jù)時代的到來,Citespace軟件已成為科學(xué)研究的必備利器,已被國內(nèi)外學(xué)者應(yīng)用于多個研究領(lǐng)域[11-13]。本研究通過Citespace軟件統(tǒng)計(jì)高頻關(guān)鍵詞并繪制關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò),結(jié)果發(fā)現(xiàn),除多重耐藥菌、多重耐藥外,出現(xiàn)頻次位于前20位的關(guān)鍵詞中醫(yī)院感染、多重耐藥菌感染、銅綠假單胞菌、ICU、大腸桿菌、抗藥性、抗生素、肺炎克雷伯菌、藥敏試驗(yàn)、重癥監(jiān)護(hù)室的中心性均≥0.10;通過關(guān)鍵詞聚類分析將關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)聚類為15個“簇”并進(jìn)一步劃分為多重耐藥菌種、多重耐藥菌感染及預(yù)后、引發(fā)多重耐藥菌感染疾病、多重耐藥菌產(chǎn)生機(jī)制及防控共4個主題,且聚類結(jié)構(gòu)顯著、聚類合理,結(jié)果可信。鑒于高頻關(guān)鍵詞可能是某領(lǐng)域研究熱點(diǎn)或研究重點(diǎn)[14],通過共現(xiàn)分析得到的高頻關(guān)鍵詞可以揭示某一領(lǐng)域主題結(jié)構(gòu)和熱點(diǎn)問題,更利于對某一領(lǐng)域研究熱點(diǎn)進(jìn)行綜合分析[15-16]。因此,上述研究結(jié)果也為我國今后的多重耐藥菌研究提供了一定方向和思路。
需要指出的是,由于醫(yī)院是發(fā)生多重耐藥菌感染的主要場所,因此醫(yī)院感染自然成為我國多重耐藥菌領(lǐng)域研究熱點(diǎn)之一,相關(guān)研究內(nèi)容主要包括重點(diǎn)耐藥菌株、常見醫(yī)院感染類型、防控措施3個方面:(1)重點(diǎn)耐藥菌株以包括銅綠假單胞菌、鮑曼不動桿菌、肺炎克雷伯菌及大腸桿菌等在內(nèi)的革蘭陰性菌為主,且相關(guān)研究主要集中在ICU醫(yī)院感染患者病原菌的分布和變化上;(2)常見醫(yī)院感染類型包括手術(shù)部位感染、呼吸機(jī)相關(guān)性肺炎及中心性導(dǎo)管相關(guān)性血流感染,且研究傾向于通過流行病學(xué)調(diào)查的方法來描述和分析感染現(xiàn)狀;(3)防控措施相關(guān)研究集中于手衛(wèi)生、接觸隔離、環(huán)境清潔消毒、抗生素合理應(yīng)用與管理等的執(zhí)行效果,積極探索多學(xué)科合作的新管理模式以減少醫(yī)院感染的發(fā)生、杜絕醫(yī)院感染的暴發(fā)等。
此外,對抗菌藥物的研究也是我國多重耐藥菌領(lǐng)域研究熱點(diǎn)之一,主要涉及耐藥性、耐藥基因及藥敏試驗(yàn)等方面。根據(jù)研究對象,抗菌藥物研究可以分為兩個大類:一是以動物為研究對象,通過藥敏試驗(yàn)結(jié)果分析常見病原菌耐藥性和耐藥機(jī)制,進(jìn)而指導(dǎo)獸用抗菌藥物的合理使用,幫助農(nóng)、林、牧、漁業(yè)制定科學(xué)、合理的抗菌藥物應(yīng)用與管理策略;二是以人為研究對象,通過分析多重耐藥菌的分布及其耐藥性而掌握感染相關(guān)因素,規(guī)范抗菌藥物在臨床診療當(dāng)中的應(yīng)用。
本研究局限性:本研究以中國知網(wǎng)為數(shù)據(jù)來源,未納入其他中文數(shù)據(jù)庫及外文數(shù)據(jù)庫相關(guān)文獻(xiàn),文獻(xiàn)覆蓋不全面,存在漏檢相關(guān)文獻(xiàn)的可能性。
綜上所述,本研究在文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)基礎(chǔ)上融入大數(shù)據(jù)理念,通過Citespace軟件對我國2000—2020年多重耐藥菌相關(guān)研究進(jìn)行可視化分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)相關(guān)研究總體呈現(xiàn)上升趨勢,醫(yī)院感染、抗生素、重點(diǎn)耐藥菌株、整合子等是研究熱點(diǎn),但耐藥性監(jiān)測方面的研究較少,建議今后在分子生物學(xué)、生物信息學(xué)及微生物檢驗(yàn)學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域?qū)Χ嘀啬退幘M(jìn)行深入研究。
作者貢獻(xiàn):章琦進(jìn)行文章的構(gòu)思,研究的設(shè)計(jì)與可行性分析,文獻(xiàn)/資料收集與整理,負(fù)責(zé)撰寫論文;李寶珍、鄭雪梅、平寶華、王曉艷負(fù)責(zé)指導(dǎo)文章的撰寫與部分內(nèi)容修改;李倩負(fù)責(zé)文章的質(zhì)量控制,對文章整體負(fù)責(zé)。
本文無利益沖突。