陳雪冰,劉 聰,程 赫,姜廷波,夏德安,魏志剛
(1. 東北林業(yè)大學(xué) 林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江 哈爾濱 150000;2. 中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 國(guó)家林業(yè)和草原局鹽堿地研究中心,北京 100091)
植物在生長(zhǎng)發(fā)育過程中會(huì)通過不斷調(diào)整基因的表達(dá)來適應(yīng)各種逆境,而轉(zhuǎn)錄因子(TFs)是其調(diào)控過程的關(guān)鍵因子[1]。研究表明:鋅指同源結(jié)構(gòu)域(ZF-HD)轉(zhuǎn)錄因子作為一種同源異形盒(HB)蛋白在調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育以及響應(yīng)多種生物和非生物脅迫方面發(fā)揮著重要作用[2-3]。ZF-HD不僅具有同源結(jié)構(gòu)域(HD),還包括1個(gè)高度保守的鋅指結(jié)構(gòu)域(ZF)[4],ZF是由2對(duì)保守的半胱氨酸(Cys)和/或組氨酸(His)殘基結(jié)合單個(gè)鋅離子組成的指環(huán)狀結(jié)構(gòu)蛋白,可特異性與DNA/RNA序列結(jié)合,并參與蛋白質(zhì)互作[2,5];HD是1個(gè)約60個(gè)氨基酸的DNA結(jié)合域(DBD),這段序列折疊成一個(gè)識(shí)別螺旋附著在DNA的大溝上,特異性地結(jié)合DNA來激活或抑制靶基因的表達(dá)[6]。為了方便研究該家族的進(jìn)化史,HU等[7]將ZFHD重新命名為ZHD。
ZHD蛋白可分ZHD和小鋅指(MIF)兩類,兩者都含有ZF結(jié)構(gòu)域,但MIF缺少HD結(jié)構(gòu)域[8]。2001年ZHD首次在黃花菊Flaveria trinervia中被鑒定出來[9],隨后擬南芥Arabidopsis thaliana[10]、水稻Oryza sativa[11]、葡萄 Vitis vinifera[8]、大白菜 Brassica rapa ssp. pekinensis[2]、番茄 Solanum lycopersicum[3]、茶樹Camellia sinensis[5]和黃瓜Cucumis sativus[12]等的ZHD被陸續(xù)發(fā)現(xiàn)。研究表明:ZHD能夠調(diào)控植物的抗逆性,如過表達(dá)AtZHD1可以提高擬南芥的耐旱性[13];OsZHD1基因過表達(dá)導(dǎo)致水稻葉片卷曲下垂,降低水稻的耐旱性[14];在大豆Glycine max中,過表達(dá)GmZF-HD1和GmZF-HD2會(huì)與編碼鈣調(diào)蛋白的GmGaM4基因啟動(dòng)子結(jié)合增強(qiáng)大豆的抗病能力[15];TaZFHD1參與小麥Triticum aestivum生長(zhǎng)發(fā)育過程中茉莉酸(JA)、脫落酸(ABA)和乙烯(ET)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,調(diào)節(jié)小麥對(duì)脅迫的抗性[16];大白菜中的BraZF-HD受光、低溫等非生物脅迫誘導(dǎo)表達(dá)[2];此外,水稻ZHDs與OsDREB1B基因的啟動(dòng)子結(jié)合調(diào)節(jié)水稻對(duì)低溫、干旱和機(jī)械損傷的抗性[17]。ZHD廣泛存在于植物中,在植物對(duì)環(huán)境脅迫響應(yīng)過程中起著重要的作用。
毛果楊Populus trichocarpa是研究木本植物生長(zhǎng)發(fā)育、材質(zhì)材性以及抗逆性狀的重要模式植物,但是目前毛果楊ZHD (PtrZHD)家族及非生物脅迫響應(yīng)特性的研究尚無報(bào)道。本研究通過生物信息學(xué)手段鑒定了毛果楊全基因組內(nèi)的PtrZHDs基因,并對(duì)其編碼蛋白特征、系統(tǒng)發(fā)育、基因擴(kuò)張、基因結(jié)構(gòu)與保守基序、啟動(dòng)子順式作用元件和表達(dá)特性進(jìn)行分析,為研究該家族基因的功能提供科學(xué)依據(jù)。
將來自中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心的野生型毛果楊‘Nisqually-1’通過組織培養(yǎng)擴(kuò)繁后,選取長(zhǎng)勢(shì)一致的4周齡組培苗隨機(jī)分成6組,用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為8%的聚乙二醇(PEG 6 000,來自邢臺(tái)鑫藍(lán)星科技有限公司)水溶液處理0、3、12、24、48和72 h,分別采集各處理組植株的根、莖和葉部組織,經(jīng)液氮速凍后保存于-80 ℃冰箱,每組處理重復(fù)3次。
利用擬南芥ZHD家族成員的氨基酸序列比對(duì)Phytozome (https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)網(wǎng)站中毛果楊基因組數(shù)據(jù)庫(kù)獲得候選序列,將得到的序列上傳到Pfam (http://pfam.xfam.org/)和SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)數(shù)據(jù)庫(kù),去除不含ZF-HD_dimer (PF04770)結(jié)構(gòu)域的序列得到全部的PtrZHDs[12]。從Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取PtrZHD家族基因的染色體位置、基因序列以及開放閱讀框長(zhǎng)度等信息,并根據(jù)基因所在染色體號(hào)及位置對(duì)其進(jìn)行命名。在ExPasy (https://web.expasy.org/protparam/)網(wǎng)站預(yù)測(cè)PtrZHD家族分子質(zhì)量、等電點(diǎn)和氨基酸序列長(zhǎng)度。
將鑒定出的毛果楊ZHD氨基酸序列與已知的擬南芥[10]、水稻[11]和大白菜[2]的ZHD氨基酸序列在MEGA X軟件的ClustaW程序中進(jìn)行多重序列比對(duì),采用鄰近法(NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,步長(zhǎng)設(shè)為10 000次,得到系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹數(shù)據(jù)[18],經(jīng)EvolView(https://www.evolgenius.info/ evolview/)網(wǎng)站可視化。
將PtrZHD家族基因的蛋白質(zhì)編碼序列(CDs)在美國(guó)國(guó)家生物信息中心(NCBI)網(wǎng)站(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進(jìn)行BLAST比對(duì),以超過300 bp且同源性超過80%為標(biāo)準(zhǔn)鑒定同源基因?qū)19],同源關(guān)系經(jīng)TBtools[20]軟件可視化。利用TBtools計(jì)算同源基因的Ks、Ka以及Ka/Ks[20-21]。
從毛果楊數(shù)據(jù)庫(kù)(https://genome.jgi.doe.gov/portal/pages/dynamicOrganismDownload.jsf?organism=Ptrichocarpa)獲得PtrZHD外顯子和內(nèi)含子長(zhǎng)度及位置信息,并通過TBtools軟件可視化。使用MEME(https://meme-suite.org/meme/tools/meme)網(wǎng)站對(duì)PtrZHD家族進(jìn)行保守基序分析,保守域數(shù)目設(shè)置為15,結(jié)果由TBtools軟件可視化。
利用TBtools軟件從毛果楊基因組數(shù)據(jù)中提取PtrZHD家族起始密碼子前2 000 bp的序列作為啟動(dòng)子區(qū)域,上傳至PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html)網(wǎng)站進(jìn)行順式作用元件分析[22],獲得的數(shù)據(jù)通過TBtools軟件可視化。
1.7.1 組織表達(dá)特異性 將野生型毛果楊通過組織培養(yǎng)擴(kuò)繁后,挑選長(zhǎng)勢(shì)一致的4周齡組培苗,分別采集根、莖和葉組織,提取RNA后反轉(zhuǎn)錄成cDNA,用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR (qRT-PCR)分析。每組處理重復(fù)3次,采用2-ΔΔCT法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量,并通過TBtools軟件可視化。
1.7.2 干旱脅迫下的響應(yīng)特性 將長(zhǎng)勢(shì)一致的1月齡組培苗隨機(jī)分成6組。用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為8%的PEG 6000處理0、6、12、24、48和72 h。分別采集各處理組植株的根、莖和葉組織,提取RNA后反轉(zhuǎn)錄成cDNA進(jìn)行qRT-PCR分析。每組處理重復(fù)3次,采用 2-ΔΔCt法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量,并通過TBtools軟件可視化。
1.7.3 RNA提取、反轉(zhuǎn)錄及qRT-PCR分析 利用植物總RNA試劑盒(TSP412,北京擎科生物科技有限公司)提取總 RNA,然后采用 PrimeScriptTMRT reagent Kit [Perfect Real Time,寶生物工程 (大連)有限公司] 試劑盒反轉(zhuǎn)錄RNA,獲得cDNA后進(jìn)行qRT-PCR分析。將PtrZHD家族蛋白質(zhì)編碼區(qū)序列上傳至上海生工定量引物設(shè)計(jì)網(wǎng)站(https://www.sangon.com/new PrimerDesign)設(shè)計(jì)定量引物,以PtrActin為內(nèi)參基因[19]。在賽默飛 ABI 7 500 熒光定量 PCR 儀上進(jìn)行試驗(yàn),體系如下:2×TransStart TOP/Tip Green qPCR Super mix 10 μL、定量引物上下游混合引物 (10 μmol·L-1) 0.4 μL、cDNA 1.5 μL,Passive Reference DyeⅡ(50×) 0.4 μL,加去離子水補(bǔ)充至 20 μL 體系。反應(yīng)程序:94 ℃ 預(yù)變性 30 s;94 ℃ 變性 5 s,60 ℃ 退火 15 s,72 ℃ 延伸 35 s,40 次循環(huán)。
將所有含ZF-HD_dimer (PF04770)結(jié)構(gòu)域的序列上傳到Pfam和SMART數(shù)據(jù)庫(kù),去除冗余序列后從毛果楊基因組中鑒定出21個(gè)PtrZHD (表1),根據(jù)基因所在染色體及染色體上的位置信息,將它們分別命名為PtrZHD1~PtrZHD21。PtrZHD家族基因編碼蛋白的基本特征分析表明:各PtrZHD所編碼蛋白的長(zhǎng)度為 73~339 個(gè)、分子量為 8.28~37.98 kDa、等電點(diǎn)為 6.39~9.31、編碼序列長(zhǎng)度為 222~1 020 bp,蛋白長(zhǎng)度、分子量、等電點(diǎn)和編碼序列長(zhǎng)度差異明顯。表明PtrZHD家族基因及其編碼蛋白特征存在較大差異,即該家族各個(gè)成員的生物學(xué)功能發(fā)生了分化。
表1 毛果楊 ZHD家族基因概況Table 1 Overview of ZHD gene family in P. trichocarpa
利用雙子葉植物(擬南芥、毛果楊和大白菜)與單子葉植物(水稻)的ZHD蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖 1),PtrZHD 家族分為 2 個(gè)種類 (ZHD 和 MIF),這 2 個(gè)種類可以分成 7 個(gè)亞族 (Ⅰ~Ⅶ)[5,8,12],PtrZHD不同亞族中即包括單子葉植物又包括雙子葉植物,表明該基因家族的分化早于單雙子葉植物的分化。
圖1 毛果楊、擬南芥、水稻和大白菜ZHD家族系統(tǒng)進(jìn)化樹Figure 1 Phylogenetic tree of ZHD protein family in P. trichocarpa, A. thaliana , O. sativa and B. rapa ssp. pekinensis
PtrZHD家族成員在毛果楊染色體上的分布(圖2)顯示:21個(gè)PtrZHD不均勻地分布在毛果楊12條染色體上;4、5號(hào)染色體上分別分布4和3個(gè)ZHD,2、3、17和19號(hào)染色體上各分布2個(gè)ZHD,7、8、10、12、13和15號(hào)染色體上只分布1個(gè)ZHD,1、6、9、11、14、16和18號(hào)染色體上無ZHD分布。PtrZHD家族編碼序列Blast結(jié)果表明:PtrZHD1和PtrZHD11、PtrZHD2和PtrZHD10、PtrZHD3和PtrZHD8、PtrZHD5和PtrZHD19、PtrZHD6和PtrZHD18、PtrZHD9和PtrZHD12、PtrZHD13和PtrZHD14以及PtrZHD15和PtrZHD17有共線性關(guān)系(圖2和表2),同源片段長(zhǎng)度大于300 bp且同源性超過80%,是進(jìn)化過程中由于全基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制而形成的同源基因[3,22],表明PtrZHD可能通過全基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制進(jìn)行家族擴(kuò)張。8對(duì)同源基因的Ka/Ks均小于1(表2),說明PtrZHD家族在進(jìn)化過程中經(jīng)歷了純化選擇,留存的基因較為保守[3]。
圖2 PtrZHD 家族基因染色體定位及同源性分析Figure 2 Chromosome localization and homology analysis of PtrZHD gene
表2 同源基因的 Ka/Ks 及同源性Table 2 Ka/Ks values and homologous status of homologous genes
PtrZHD家族21個(gè)成員中有11個(gè)成員含有內(nèi)含子(圖3B),這與之前報(bào)道的其他物種ZHD家族中有內(nèi)含子的成員數(shù)量較少的研究結(jié)果稍有不同[5,12]。PtrZHD蛋白具有2個(gè)保守性較高的基序:同源結(jié)構(gòu)域序列 (Motif 1)和鋅指結(jié)構(gòu)域序列 (Motif 2)(圖 3C)。Motif 2 與 DNA 的特異性結(jié)合有關(guān);Motif 1 與蛋白二聚體的形成有關(guān)[7]。所有的PtrZHD蛋白都具有Motif 1,而且除了PtrZHD4和亞族Ⅴ(MIF)的成員之外,其他家族成員都含Motif 2,說明該家族成員在進(jìn)化過程中比較保守。
圖3 PtrZHD 家族基因結(jié)構(gòu)和蛋白保守基序分析Figure 3 Analysis of gene structure and protein conserved motif of PtrZHD gene
PtrZHD家族啟動(dòng)子區(qū)順式作用元件可分為2個(gè)大類(圖4):第一大類為植物激素響應(yīng)元件,共有5種,分別為生長(zhǎng)素響應(yīng)元件(AuxRR-core、TGA-element),水楊酸響應(yīng)元件(TCA-element),茉莉酸甲酯響應(yīng)元件(CGTC-motif、TGACG-motif),脫落酸響應(yīng)元件(ABRE)和赤霉素響應(yīng)元件(P-box、GARE-motif);第二大類為非生物脅迫響應(yīng)元件,共有4種,分別為厭氧誘導(dǎo)元件(ARE)、干旱誘導(dǎo)性結(jié)合位點(diǎn)(MBS)、抗病和脅迫誘導(dǎo)元件(TC-rich repeats)和低溫響應(yīng)元件(LTR)。PtrZHD家族各基因啟動(dòng)子區(qū)存在不同類型的作用元件,但處于同一亞族的各基因含有相似的作用元件(圖4),亞族Ⅰ主要包含茉莉酸甲酯響應(yīng)元件、脫落酸響應(yīng)元件、赤霉素響應(yīng)元件和厭氧誘導(dǎo)元件;亞族Ⅱ主要包含水楊酸響應(yīng)元件和茉莉酸甲酯響應(yīng)元件;亞族Ⅲ主要包含厭氧誘導(dǎo)元件、MYB干旱誘導(dǎo)性結(jié)合位點(diǎn)以及抗病和脅迫誘導(dǎo)元件;亞族Ⅳ主要包含生長(zhǎng)素響應(yīng)元件,水楊酸響應(yīng)元件,茉莉酸甲酯響應(yīng)元件,脫落酸響應(yīng)元件和厭氧誘導(dǎo)元件;亞族Ⅴ主要包含水楊酸響應(yīng)元件、赤霉素響應(yīng)元件、厭氧誘導(dǎo)元件和MYB干旱誘導(dǎo)性結(jié)合位點(diǎn);亞族Ⅵ主要包含茉莉酸甲酯響應(yīng)元件、厭氧誘導(dǎo)元件、MYB干旱誘導(dǎo)性結(jié)合位點(diǎn)和低溫響應(yīng)元件;亞族Ⅶ主要包含水楊酸響應(yīng)元件、茉莉酸甲酯響應(yīng)元件和厭氧誘導(dǎo)元件。以上結(jié)果說明:PtrZHD家族可能對(duì)植物激素和逆境脅迫有響應(yīng)能力,雖然不同基因之間響應(yīng)元件種類存在差異,但是同一亞族基因啟動(dòng)子區(qū)順式作用元件種類基本相同。
圖4 PtrZHD 家族基因啟動(dòng)子區(qū)順式作用元件分析Figure 4 Analysis of cis-acting elements in promoter region of PtrZHD gene
為了了解ZHD在毛果楊生長(zhǎng)發(fā)育和環(huán)境響應(yīng)中的潛在功能,利用qRT-PCR對(duì)毛果楊ZHD家族成員在根、莖和葉組織中的表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果(圖5)表明:毛果楊21個(gè)PtrZHDs中有1、7和13個(gè)分別在根、莖和葉部組織偏好表達(dá)。亞族Ⅰ和Ⅲ的成員主要在葉中高表達(dá);亞族Ⅱ和Ⅳ的成員全都在葉中高表達(dá);亞族Ⅴ成員主要在莖中高表達(dá);亞族Ⅵ成員主要在莖和葉中高表達(dá);亞族Ⅶ成員在莖中高表達(dá)。毛果楊ZHD家族成員在根、莖和葉中有不同的表達(dá)特性,但同一亞族各成員偏好表達(dá)部位基本相同,說明ZHD在毛果楊根、莖和葉部組織中的生物學(xué)功能產(chǎn)生了分化,但同一亞族各成員功能相似。
圖5 PtrZHDs 組織表達(dá)特異性分析Figure 5 Analysis of tissue expression specificity of PtrZHDs gene
從圖6可知:在根中,隨著干旱脅迫時(shí)間的增加,部分PtrZHD的表達(dá)量顯著上調(diào),達(dá)到峰值后逐漸降低,PtrZHD3、PtrZHD8、PtrZHD9、PtrZHD10、PtrZHD11、PtrZHD5、PtrZHD13和PtrZHD14在干旱脅迫下表達(dá)量呈持續(xù)上升趨勢(shì),PtrZHD1、PtrZHD6在干旱脅迫下表達(dá)量下降;在莖中,大部分PtrZHD在干旱脅迫后顯著上調(diào)表達(dá),達(dá)到峰值后逐漸降低,而PtrZHD2、PtrZHD3、PtrZHD5、PtrZHD6和PtrZHD7在干旱脅迫下表達(dá)量呈持續(xù)上升趨勢(shì);在葉中,大部分PtrZHD在干旱脅迫后表達(dá)量同樣呈先升后降的趨勢(shì),PtrZHD5、PtrZHD7和PtrZHD20在干旱脅迫下表達(dá)量持續(xù)下降,而PtrZHD1和PtrZHD18在干旱脅迫下表達(dá)量呈持續(xù)上升趨勢(shì)。從響應(yīng)速度來看,根中大部分PtrZHD基因響應(yīng)干旱脅迫的快速上升期發(fā)生在6、12或72 h,而在莖和葉中的快速上升期發(fā)生在6或12 h。表明毛果楊ZHD家族各成員響應(yīng)干旱脅迫且在脅迫中發(fā)揮不同的作用。
圖6 不同組織中 PtrZHDs 在干旱脅迫下的表達(dá)譜分析Figure 6 Expression profile analysis of PtrZHDs gene in different tissues under drought stress
ZHD是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫響應(yīng)中起著重要作用[6,15]。本研究從全基因水平鑒定出21個(gè)PtrZHDs家族成員,進(jìn)化分析表明(圖1):21個(gè)PtrZHDs可以分為2個(gè)不同的種類(ZHD和MIF)、7個(gè)亞族(Ⅰ~Ⅶ),這與葡萄[8]、茶樹[5]和黃瓜[12]中的分類基本一致。
PtrZHD家族有76%的成員涉及全基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制現(xiàn)象,說明該基因家族擴(kuò)張的主要方式是全基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制[22-23],基因復(fù)制可以提供豐富的遺傳物質(zhì)有助于毛果楊適應(yīng)外界環(huán)境。PtrZHD家族同源基因的Ka/Ks均小于1,表明純化作用在該基因家族進(jìn)化過程中存在一定的選擇壓力[3],說明PtrZHD家族基因具有較強(qiáng)的保守性。同時(shí),PtrZHD家族基因編碼蛋白保守基序分析發(fā)現(xiàn):21個(gè)PtrZHD蛋白具有2個(gè)保守性較高的基序Motif 1和Motif 2,進(jìn)一步說明PtrZHD家族在進(jìn)化過程中較為保守。
啟動(dòng)子分析發(fā)現(xiàn):雖然PtrZHD家族啟動(dòng)子區(qū)順式作用元件的種類不同,但處于同一亞族基因啟動(dòng)子區(qū)順式作用元件類型基本相同,同時(shí),同一亞族基因編碼蛋白的保守基序也基本相同,表明PtrZHD家族不同亞族的生物學(xué)功能產(chǎn)生了分化,但同一亞族各基因的生物學(xué)功能基本相同;PtrZHD家族成員在毛果楊根、莖和葉部組織中具有偏好性表達(dá)特征,但同一亞族基因的偏好表達(dá)部位基本相同。
毛果楊中具有內(nèi)含子的ZHD占比(52%)多于擬南芥(0%)[2]、水稻(33%)[24]、玉米Zea mays(13%)[24]、黃瓜(38%)[14]、苦蕎麥Fagopyrum tataricum (20%)[25]、大白菜(3%)[2]和番茄(4%)[3]等草本植物,內(nèi)含子增多可以加大轉(zhuǎn)錄本的多樣性,提高生物的抗逆能力[26]。因此,毛果楊ZHD的內(nèi)含子比草本植物多的原因可能是毛果楊生命周期長(zhǎng)、生存空間大,需要應(yīng)對(duì)更為復(fù)雜的環(huán)境挑戰(zhàn),所以進(jìn)化出了更多含有內(nèi)含子的基因以保證其正常生長(zhǎng)發(fā)育。
ZHD能夠調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育和對(duì)干旱脅迫的抗性,如過表達(dá)AtZHD1可以提高擬南芥的耐旱性[13],OsZHD1基因過表達(dá)導(dǎo)致水稻葉片卷曲下垂,降低水稻的耐旱性[14];毛果楊亞族Ⅱ中的PtrZHD2、PtrZHD10與AtZHD1、OsZHD1聚類在一起,且同時(shí)在葉部組織中高表達(dá),表明PtrZHD2和PtrZHD10可能通過調(diào)控毛果楊葉片的生長(zhǎng)發(fā)育來響應(yīng)干旱脅迫的。生物在遭受脅迫時(shí),基因的相關(guān)順勢(shì)作用元件會(huì)影響其自身的轉(zhuǎn)錄以響應(yīng)脅迫[27],PtrZHD家族基因啟動(dòng)子區(qū)含有MYB干旱誘導(dǎo)性結(jié)合位點(diǎn),而且PtrZHD家族基因在干旱脅迫下的表達(dá)量會(huì)隨著脅迫時(shí)間的增加而發(fā)生變化,進(jìn)一步說明在毛果楊干旱脅迫的響應(yīng)中,PtrZHD家族基因發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。
本研究在全基因組水平上鑒定出21個(gè)PtrZHDs,通過系統(tǒng)發(fā)育將其分為7個(gè)亞族;同源性及Ka、Ks分析表明:PtrZHD通過全基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制進(jìn)行家族擴(kuò)張且在進(jìn)化過程中經(jīng)歷了純化選擇;啟動(dòng)子順式作用元件分析表明:PtrZHD家族基因能夠響應(yīng)干旱脅迫信號(hào);基因結(jié)構(gòu)和基序分析表明:PtrZHD家族基因功能發(fā)生了分化但同一亞族基因生物學(xué)功能基本相同;組織表達(dá)特異性和干旱脅迫下的表達(dá)模式表明:毛果楊ZHD在不同組織中行使特定的生物學(xué)功能且能夠響應(yīng)干旱脅迫。