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應(yīng)用MALDI-TOF-MS快速鑒定從雞胴體中分離的一株空腸彎曲菌

2022-06-27 02:14吳福平朱宏鍇吳瑜凡邵景東
工業(yè)微生物 2022年2期
關(guān)鍵詞:空腸菌落圖譜

吳福平, 朱宏鍇, 陳 瑩, 吳瑜凡, 邵景東

1.張家港檢驗(yàn)認(rèn)證有限公司,張家港 215600;

2.華東理工大學(xué)分析測(cè)試中心 200237;

3.張家港海關(guān)綜合技術(shù)中心,張家港 215600

空腸彎曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)是主要食源性病原菌之一,可引起人及動(dòng)物多種疾病,主要癥狀為腹瀉性腸炎[1-3]。

目前,在空腸彎曲菌檢測(cè)鑒定中,實(shí)驗(yàn)室主要采用傳統(tǒng)生化鑒定和分子生物學(xué)鑒定方法。傳統(tǒng)生化鑒定方法主要包含革蘭氏染色鏡檢,動(dòng)力觀察,25℃微需氧、42℃有氧生長(zhǎng)試驗(yàn),馬尿酸鹽、吲哚乙酸酯水解等試驗(yàn),有條件的實(shí)驗(yàn)室或使用全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)來進(jìn)行鑒定,鑒定周期較長(zhǎng),操作相對(duì)繁瑣,同時(shí)鑒定結(jié)果也受培養(yǎng)基、試劑質(zhì)量、培養(yǎng)條件、生長(zhǎng)狀態(tài)等外部因素影響。近年來,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,熒光定量PCR、16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)、多重PCR法等技術(shù)也越來越多的應(yīng)用于空腸彎曲菌的檢測(cè),有效填充了空腸彎曲菌的快速檢測(cè)鑒定技術(shù)空白[4-6]。

基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrixassisted laser desorption/ionization time of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)主要以細(xì)菌表面蛋白為檢測(cè)對(duì)象,依據(jù)數(shù)據(jù)庫中標(biāo)準(zhǔn)蛋白指紋圖譜與待測(cè)樣品的指紋圖譜分析比對(duì),從而實(shí)現(xiàn)微生物的快速鑒定。本文對(duì)從雞胴體中分離到的一株病原菌,通過MALDI-TOF-MS技術(shù)將其快速鑒定。

1 材料與方法

1.1 試劑與設(shè)備

標(biāo)準(zhǔn)菌株:空腸彎曲菌Campylobacter jejuni NCTC11168;Bolton肉湯、mCCDA瓊脂、Skirrow血瓊脂平板、哥倫比亞血瓊脂平板,購自北京陸橋技術(shù)股份有限公司;α-氰基-4-羥基肉桂酸(CHCA)、BTS標(biāo)準(zhǔn)品,購自德國Bruker公司;VITEK2 NH鑒定卡,購自法國生物梅里埃公司;乙腈,無水乙醇,甲酸,三氟乙酸(TFA)。

基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(Microflex),德國Bruker公司生產(chǎn);全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)VITEK2 Compact,法國生物梅里埃公司生產(chǎn);微生物實(shí)驗(yàn)室常規(guī)滅菌及培養(yǎng)設(shè)備,微需氧培養(yǎng)裝置:提供微需氧條件(5%氧氣、10%二氧化碳和85%氮?dú)猓?/p>

1.2 方法

1.2.1 細(xì)菌分離與純化

參照GB 4789.9-2014《食品安全國家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)空腸彎曲菌檢驗(yàn)》[7]操作。

1.2.2 彎曲菌屬的鑒定,挑取可疑菌落進(jìn)行革蘭氏染色鏡檢,動(dòng)力觀察,氧化酶試驗(yàn),25℃微需氧生長(zhǎng)試驗(yàn),42℃有氧生長(zhǎng)試驗(yàn)。

1.2.3 空腸彎曲菌的鑒定,將符合上述彎曲菌屬反應(yīng)的細(xì)菌進(jìn)行過氧化氫酶試驗(yàn),馬尿酸鹽水解試驗(yàn),吲哚乙酸酯水解試驗(yàn)。同時(shí)使用VITEK2 NH鑒定卡,麥?zhǔn)蠞舛日{(diào)節(jié)至2.70~3.30之間,通過VITEK2 compact全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)進(jìn)行生化鑒定。

1.3 MALDI-TOF MS鑒定

1.3.1 溶液配制

溶劑I:按水∶乙腈∶三氟乙酸為47.5∶50∶2.5(v/v)的比例配制,現(xiàn)配現(xiàn)用;BTS標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制:用50μL溶劑I溶解BTS標(biāo)準(zhǔn)品。用移液器反復(fù)吹吸溶解BTS粉末,室溫放置5 min,再次溶解,待BTS全部溶解后,瞬時(shí)離心,用200μL PCR管進(jìn)行分裝,每管5μL,-20℃保存?zhèn)溆茫?/p>

CHCA基質(zhì)溶液的配制:在CHCA粉末中加入溶劑I,使CHCA終濃度為10 mg/mL。振蕩混勻,直至溶液澄清。用1.5 mL離心管進(jìn)行分裝,每管50 μL,用封口膜密封管口,室溫放置備用。

1.3.2 樣品前處理

采用甲酸提取法前處理,在EP管中加入300 μL去離子水,挑取單個(gè)菌落,混勻后加入900μL無水乙醇,13 000 r/min離心2 min,吸棄上清,必要時(shí)可再次離心,以便去除乙醇;室溫干燥3~4 min,沉淀中加入30μL 70%甲酸溶液,混勻,加入30μL乙腈13 000 r/min離心2 min;吸取1μL上清至靶盤點(diǎn)樣,待晾干以后,立即覆蓋1μL基質(zhì)溶液,干燥以后上機(jī)。

1.3.3 數(shù)據(jù)采集分析與判定

用標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)儀器校準(zhǔn)后,應(yīng)用FlexControl、Bio-Typer軟件對(duì)樣品圖譜信息采集和分析。以待檢樣品與數(shù)據(jù)庫中標(biāo)準(zhǔn)菌株譜圖的符合度為判斷標(biāo)準(zhǔn),分值越高表示鑒定準(zhǔn)確性的可信度越高。分值在2.300~3.000之間,可完全確認(rèn)鑒定結(jié)果;2.000~2.299,可基本確認(rèn)鑒定結(jié)果;1.700~1.999,為不確定結(jié)果;0.000-1.699,表示鑒定結(jié)果不可信。

1.3.4 MALDI-TOF-MS空腸彎曲菌數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充

運(yùn)用MALDI-TOF-MS對(duì)空腸彎曲菌標(biāo)準(zhǔn)菌株NCTC11168進(jìn)行圖譜數(shù)據(jù)采集,并將有效譜圖添加至鑒定數(shù)據(jù)庫。

2 結(jié)果

2.1 細(xì)菌傳統(tǒng)生化鑒定

觀察菌落形態(tài)特征,mCCD平板,淡灰色菌落,有金屬光澤,扁平;Skirrow血瓊脂平板,灰色扁平菌落,濕潤(rùn)有光澤。鏡檢為革蘭氏陰性菌,菌體彎曲如小逗點(diǎn);動(dòng)力觀察呈現(xiàn)螺旋狀運(yùn)動(dòng);氧化酶試驗(yàn)陽性,25℃微需氧、42℃有氧生長(zhǎng)試驗(yàn)均未生長(zhǎng);過氧化氫酶試驗(yàn)陽性;馬尿酸鹽水解試驗(yàn)陽性;吲哚乙酸酯水解試驗(yàn)陽性。

2.2 VITEK2 NH鑒定

根據(jù)全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)NH卡生化反應(yīng)結(jié)果,該分離菌株鑒定為空腸彎曲菌。

2.3 MALDI-TOF-MS檢測(cè)

通過檢測(cè)及軟件分析,以檢測(cè)到的離子峰強(qiáng)度(intens)為縱坐標(biāo),離子質(zhì)荷比(m/z)為橫坐標(biāo),獲得的分離菌蛋白指紋圖譜具體如圖1所示。與Bruker數(shù)據(jù)庫比對(duì),分離菌被鑒定為空腸彎曲菌,匹配分值為2.208,可基本確認(rèn)鑒定結(jié)果。

2.4 MALDI-TOF-MS空腸彎曲菌數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充

本次試驗(yàn)共采集24張空腸彎曲菌NCTC11168有效譜圖(見圖2),并將譜圖添加到細(xì)菌鑒定數(shù)據(jù)庫中。

圖2 24張空腸彎曲菌NCTC11168有效譜圖譜疊加結(jié)果

2.5 MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充后驗(yàn)證

經(jīng)數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充后,分離菌株鑒定為空腸彎曲菌,匹配分值由2.208提升至2.538,完全確認(rèn)菌株鑒定結(jié)果。經(jīng)數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充后,有效提高了MALDITOF-MS在鑒定空腸彎曲菌的可信度。

3 討論

MALDI-TOF-MS作為一種新型快速鑒定技術(shù),在臨床和疾控系統(tǒng)病原微生物的檢測(cè)得到了廣泛應(yīng)用[8-14]。該技術(shù)針對(duì)細(xì)菌蛋白特征圖譜進(jìn)行鑒定,具備良好的穩(wěn)定性和重復(fù)性,受培養(yǎng)基、培養(yǎng)時(shí)間以及其他培養(yǎng)條件等外部因素的影響較?。?5],可快速鑒別區(qū)分不同微生物。本文通過MALDI-TOF-MS技術(shù)將雞胴體中分離到的一株病原菌進(jìn)行快速鑒定,結(jié)果顯示,MALDI-TOF-MS法鑒定結(jié)果與傳統(tǒng)法一致,鑒定為空腸彎曲菌,且可信度較高。

MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫中標(biāo)準(zhǔn)蛋白指紋圖譜完整、準(zhǔn)確性決定了該項(xiàng)鑒定技術(shù)的準(zhǔn)確率,數(shù)據(jù)庫中標(biāo)準(zhǔn)菌株的數(shù)量和種類越豐富、蛋白指紋圖譜越完善,所鑒定的結(jié)果越準(zhǔn)確。此文通過對(duì)NCTC11168空腸彎曲菌24張有效圖譜數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充后,野生菌株鑒定的分值由2.208提升至2.538,由可基本確認(rèn)提升為可完全確認(rèn)鑒定結(jié)果。數(shù)據(jù)庫補(bǔ)充后,有效提高了MALDI-TOF-MS菌株鑒定的可信度。

在檢測(cè)時(shí)間上,從獲得純菌落到出鑒定結(jié)果,MALDI-TOF-MS法整個(gè)過程大約需要30 min,上機(jī)后僅需約30 s即可實(shí)現(xiàn)對(duì)1株待測(cè)菌的有效鑒定。成本方面僅需少量基質(zhì),靶塊清洗后可重復(fù)使用,耗材使用成本低,同時(shí)1塊靶塊1次可實(shí)現(xiàn)384株待測(cè)樣品的高通量檢測(cè)。MALDI-TOF-MS技術(shù)在空腸彎曲菌檢測(cè)鑒定方面可部分替代傳統(tǒng)生化鑒定和分子生物學(xué)鑒別方法,可以廣泛應(yīng)用于微生物實(shí)驗(yàn)室的日常檢驗(yàn)中,尤其適用于醫(yī)院的臨床樣本及食物中毒樣本快速診斷鑒定檢測(cè)。

綜上所述,MALDI-TOF-MS作為新型快速檢測(cè)技術(shù)在檢測(cè)空腸彎曲菌具備快速、準(zhǔn)確、高通量、低成本等檢測(cè)優(yōu)勢(shì),可用于食品中空腸彎曲菌的快速篩檢,也為其它食源性致病菌快速鑒定方法的建立提供參考。

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