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吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者流行病學(xué)特征及腸道病毒71 型VP1 基因特征分析

2022-02-12 13:47:50張興國(guó)李晨光張智麗喬鳳娟王宇冰孫炳欣
關(guān)鍵詞:腸道病毒長(zhǎng)春市口病

張興國(guó), 李晨光, 張智麗, 孫 宇, 崔 薇, 初 秋, 喬鳳娟, 王宇冰, 孫炳欣

(吉林省長(zhǎng)春市疾病預(yù)防控制中心微生物檢驗(yàn)所,吉林 長(zhǎng)春 130033)

手足口病是一種常見于5 歲以下嬰幼兒及兒童的傳染性疾病,腸道病毒71 型(enterovirus 71,EV-A71)和柯薩奇病毒A組16型(Coxsackieevirus 16,Cox-A16) 是引起手足口病的主要病原體[1],其中EV-A71 更易導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)重癥甚至死亡[2]。2008 年手足口病作為丙類傳染病納入我國(guó)法定傳染病管理系統(tǒng),并按要求進(jìn)行報(bào)告[3]。吉林省最早的手足口病病例報(bào)道于1984 年,感染病原體為Cox-A16[4],2008-2009年再次出現(xiàn)流行現(xiàn)象,發(fā)病主要集中在吉林省長(zhǎng)春地區(qū),主要病原體轉(zhuǎn)變?yōu)镋V-A71[5],此后也一直以EV-A71 為主[6]。由于手足口病的病原具有多樣性,而且不同血清型的病原之間常發(fā)生重組變異,導(dǎo)致每年的優(yōu)勢(shì)流行株發(fā)生變遷[7]。為了解吉林省長(zhǎng)春地區(qū)手足口病流行情況,現(xiàn)對(duì)2014-2018 年收集的手足口病病例標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),對(duì)手足口病流行特征及EV-A71 VP1 基因特征進(jìn)行分析,為手足口病防控策略的制定及疫苗株的挑選提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 資料與方法

1.1 資料來(lái)源

收集2014-2018 年中國(guó)疾病預(yù)防控制信息系統(tǒng)中吉林省長(zhǎng)春地區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)報(bào)告的手足口病例的流行病學(xué)相關(guān)資料;病原學(xué)檢測(cè)數(shù)據(jù)來(lái)自吉林省長(zhǎng)春市疾病預(yù)防控制中心手足口病網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室,人口資料來(lái)源于吉林省長(zhǎng)春市統(tǒng)計(jì)局。

1.2 標(biāo)本來(lái)源

2014-2018 年,經(jīng)吉林省長(zhǎng)春市14 家縣市區(qū)疾控中心采集的,來(lái)自吉林省長(zhǎng)春市市區(qū)及開發(fā)區(qū)的6 家醫(yī)療機(jī)構(gòu)(長(zhǎng)春市傳染病醫(yī)院、長(zhǎng)春市兒童醫(yī)院、吉林大學(xué)第一醫(yī)院、吉林大學(xué)第二醫(yī)院、中日聯(lián)誼醫(yī)院和長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院) 和附屬縣市區(qū)的5 家醫(yī)療機(jī)構(gòu)(榆樹市醫(yī)院、長(zhǎng)春市雙陽(yáng)區(qū)醫(yī)院、德惠市醫(yī)院、農(nóng)安縣醫(yī)院和長(zhǎng)春市九臺(tái)區(qū)醫(yī)院) 臨床診斷的部分手足口病病例標(biāo)本。

1.3 診斷標(biāo)準(zhǔn)

按照《手足口病診療指南(2018 年版)》[8]中診斷標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行診斷。①臨床診斷病例。在流行季節(jié)發(fā)病,常見于學(xué)齡前兒童,嬰幼兒多見,發(fā)熱伴手、足、口和臀部皮疹,部分病例可無(wú)發(fā)熱。極少數(shù)重癥病例皮疹不典型,臨床診斷困難,需結(jié)合病原學(xué)或血清學(xué)檢查做出診斷。②確診病例。臨床診斷病例具有下列結(jié)果之一者即可確診: 腸道病毒( Cox-A16 和EV-A71 等) 特異性核酸檢測(cè)陽(yáng)性;分離出腸道病毒,并鑒定為Cox-A16 、EV-A71 或其他可引起手足口病的腸道病毒; 急性期和恢復(fù)期血清Cox-A16 、EV-A71 或其他可引起手足口病的腸道病毒中和抗體有4 倍以上的升高。

1.4 標(biāo)本采集

按照《手足口病預(yù)防控制指南(2009 版)》要求采集吉林省長(zhǎng)春市各縣市區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)報(bào)告的部分手足口病臨床診斷病例的標(biāo)本,包括肛拭子、糞便和咽拭子等樣本,共采集2 680 例。

1.5 病毒核酸提取和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(realtime fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)法檢測(cè)

所采集樣本采用全自動(dòng)核酸提取儀(江蘇碩世生物科技股份有限公司) 依據(jù)說(shuō)明書步驟提取核酸。采用德國(guó)QIAGEN 公司腸道病毒RT-qPCR 試劑盒(210212),對(duì)樣本中總腸道病毒、 EV-A71和Cox-A16 進(jìn)行檢測(cè),其中EV-A71 陽(yáng)性標(biāo)本VP1區(qū)通過(guò)RT-qPCR 進(jìn)行擴(kuò)增。引物序列:EV-A71-VP1-F,5′-ATAATAGCACTAGCGGCAGCC-3′;EV-A71-VP1-R,5′-CAAGATGTCGGTTGACCACTC-3′。反應(yīng)條件: 55 ℃、 30 min; 94 ℃、2 min;94 ℃、15 s,55 ℃、30 s,68 ℃、40 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃、10 min。PCR 反應(yīng)產(chǎn)物采用毛細(xì)管電泳儀(卡夾QIAxcel,DNA Screening Cartridge)進(jìn)行電泳并觀察結(jié)果,檢測(cè)到目的片段長(zhǎng)度為1 000 bp 的標(biāo)本送至生工生物工程(上海) 有限公司進(jìn)行測(cè)序。

1.6 EV-A71 基因比對(duì)和進(jìn)化樹的構(gòu)建

本研究采用LaserGene 軟件包中MegaAlign 軟件,對(duì)序列進(jìn)行比對(duì),截取VP1 區(qū)(891 bp) 進(jìn)行后續(xù)分析。用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹的EV-A71 各基因型代表株的參比序列均來(lái)自美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中 心 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov /)GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)。采用鄰接(neighbor-joining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,采用MEGA X 軟件并設(shè)置bootstrap 值為1 000。

1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

采用描述性流行病學(xué)方法對(duì)2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市手足口病流行病學(xué)資料進(jìn)行分析。采用SPSS 19.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)錄入和統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。地區(qū)分布和人群分布等計(jì)數(shù)資料的描述以率或構(gòu)成比表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1 吉林省長(zhǎng)春市手足口病疫情概況

2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市累計(jì)報(bào)告手足口病病例12 685 例,年均發(fā)病率為32.78/10 萬(wàn),累計(jì)報(bào)告重癥146 例,死亡2 例。

2.1.1 時(shí)間分布 2014-2018 年每年均有手足口病病例報(bào)告,流行趨勢(shì)基本相同呈單峰分布。報(bào)告病例從6 月份進(jìn)入快速上升期,7 月份達(dá)到高峰,8 月份逐步回落,呈明顯的季節(jié)性。

2.1.2 地區(qū)分布 吉林省長(zhǎng)春市2014- 2018 年14 個(gè)縣區(qū)均有手足口病病例報(bào)告,年均報(bào)告發(fā)病率前3 位的地區(qū)為高新區(qū)(129.14/10 萬(wàn))、寬城區(qū)(102.17/10 萬(wàn)) 和經(jīng)開區(qū)(100.98/10 萬(wàn)),報(bào)告發(fā)病率最低為榆樹市(6.16/10 萬(wàn))。

2.1.3 人群分布 吉林省長(zhǎng)春市2014-2018 年報(bào)告的手足口病例中,男性7 464 例,女性5 221 例,男女比為1.43∶1,男性高于女性?;颊咭? 歲以下兒童為主,占發(fā)病總數(shù)的93.08%。隨著患者年齡的增加,發(fā)病率呈逐漸下降趨勢(shì)。主要分布在散居兒童,占發(fā)病總數(shù)的80.77%,其次為幼托兒童(15.01%),學(xué)生占4.00%。

2.2 病原學(xué)檢測(cè)結(jié)果

對(duì)2014-2018年吉林省長(zhǎng)春市手足口病2 680例樣本進(jìn)行病原學(xué)檢測(cè),共1 924 例核酸檢測(cè)為陽(yáng)性,占病例總數(shù)的71.75%。在1 920 例核酸檢測(cè)陽(yáng)性病例中,Cox-A16 陽(yáng)性452 例,占陽(yáng)性病例總數(shù)的23.94%;EV-A71 陽(yáng)性678 例,占陽(yáng)性病例總數(shù)的35.24%;其他腸道病毒陽(yáng)性794 例,占陽(yáng)性檢出的41.27%。其中2014 和2017 年優(yōu)勢(shì) 型別為EV-A71,分別占比63.34% 和66.20%,其他年份為其他腸道病毒高發(fā)。吉林省長(zhǎng)春市EV-A71 陽(yáng)性樣本各月份均有檢出。2014 年3-9 月手足口病病毒型別以EV-A71 為主,2015 和2016 年EV-A71 型檢出較少。2017 年5 月-2018 年5 月吉林省長(zhǎng)春市手足口病監(jiān)測(cè)病例中檢出的手足口病病毒型別以EV-A71 為主,且呈逐漸上升的趨勢(shì),在2018年2月和5 月達(dá)到峰值,占當(dāng)月病例的100%。見圖1 和表1。

表1 2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者的病原學(xué)構(gòu)成Tab.1 Pathogenic compositions of patients with hand-foot-mouth disease in Changchun City of Jiin Province from 2014-2018[n(η/%)]

圖1 2014-2018 年不同月份吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者EV-A71 陽(yáng)性檢出率Fig.1 Positive detection rates of EV-A71 in patients with hand-foot-mouth disease in Changchun City of Jilin Province from 2014 to 2018

2.3 EV-A71 VP1 區(qū)基因特征分析

2.3.1 進(jìn)化分析 基于VP1 區(qū)(891 bp) 對(duì)本次實(shí)驗(yàn)獲的146 條EV-A71 序列及EV-A71 各基因型和亞型參考株序列進(jìn)行進(jìn)化分析,結(jié)果顯示:2014-2018 年手足口病病例中EV-A71 毒株相對(duì)集中,136條序列屬于C4亞型,其余10條(2017年3條,2018 年7 條) 屬于B5 亞型(圖2)。所獲得序列與EV-A71 的原型株同源性為82.3%~83.8%,與C4 亞型同源性為94.2%~97.5%,其中與C4a 亞型同源性較高,各株之間同源性為92.3%~99.8%。見圖3。

圖2 2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者病原EV-A71 的VP1 蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of VP1 region of EV-A71 strains isolated from patients with hand-foot-mouth disease in Changchun City of Jilin Proince from 2014-2018

圖3 2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者病原EV-A71 基于VP1 區(qū)序列同源性分析Fig.3 Homology analysis on EV-A71 of patients with hand-foot-mouth disease based on sequences of VP1 region in Changchun City of Jilin Provice from 2014-2018

2.3.2 變異位點(diǎn)分析 選取所獲得序列中的代表序列通過(guò)MEGA X 翻譯獲得氨基酸序列進(jìn)行變異位點(diǎn)分析,其中VP1 區(qū)145 氨基酸位點(diǎn)為E ,2018 年2株(ccHFME2018008 和ccHFME2018003)檢測(cè)到VP1104D,另外3株(ccHFME2018043、 ccHFME2018044 和ccHFME2018041) 檢測(cè)到VP1218R; 與C4 亞型比較,B5 亞型有VP143E、VP158T和VP1184T3 個(gè)氨基酸位點(diǎn)差異,其余各株主要毒理位點(diǎn)和抗原性位點(diǎn)未發(fā)生變異。見圖4。

圖4 2014-2018 年吉林省長(zhǎng)春市手足口病患者病原EV-A71 的VP1 區(qū)氨基酸變異位點(diǎn)Fig.4 Variation sites of amino acid in VP1 region of EV-A71 of patients with hand-foot-mouth disease in Changchun City of Jilin Province from 2014 to 2018

3 討 論

手足口病是一種常見于兒童的自限性急性傳染病,其傳播途徑復(fù)雜,發(fā)展速度較快,少數(shù)重癥患者可出現(xiàn)嚴(yán)重并發(fā)癥,甚至危及生命[8-9]。EV-A71是一種快速傳播的病原體,會(huì)導(dǎo)致手足口病,在世界范圍內(nèi)造成了嚴(yán)重的疾病負(fù)擔(dān)[10-11]。

2014-2018 年,吉林省長(zhǎng)春市累計(jì)報(bào)告手足口病病例12 685 例,年均發(fā)病率為32.78/10 萬(wàn),其中2014 和2017 年優(yōu)勢(shì)型別均為EV-A71,其他年份為其他腸道病毒高發(fā)。從時(shí)間來(lái)看,吉林省長(zhǎng)春市手足口病陽(yáng)性樣本各月份均有檢出,發(fā)病具有明顯的季節(jié)性,6~8 月病例數(shù)明顯增多,夏季高發(fā),2014 年3-9 月和2017 年5 月-2018 年5 月,手足口病病毒型別以EV-A71 為主,呈逐漸上升的趨勢(shì)。本研究手足口病患者中,男性7 464 例,女性5 221 例,男性高于女性,男女比為1.43∶1;患者年齡分布較為集中,多數(shù)病例為5 歲以下兒童,與國(guó)內(nèi)相關(guān)報(bào)道[12-13]一致??赡苁且?yàn)槟泻⒏鼮榛顫姾脛?dòng),戶外活動(dòng)較多,增加了暴露和感染的風(fēng)險(xiǎn)[14]。

世界范圍內(nèi)流行的EV-A71 包括A~F 6 種不同基因型,其中主要流行型別為B 和C 型,其中B 型又包括B0~B5 6 個(gè)亞型,C 型包括C1~C5 5 個(gè)亞型,我國(guó)主要流行型別為C4 亞型[15-16]。本研究獲得的146 條序列中136 條為C4 亞型中的C4a 型,與國(guó)內(nèi)流行趨勢(shì)一致。B5 亞型為一種只在亞洲流行的型別,日本、馬來(lái)西亞、文萊和新加坡多次有暴發(fā)檢出[17-18],近年來(lái)我國(guó)臺(tái)灣省、 江蘇省、 廈門市、重慶市和昆明市等地有檢出,此次檢出10 條序列為B5 亞型,需持續(xù)監(jiān)測(cè)。VP1 蛋白是腸道病毒分子結(jié)構(gòu)中重要的結(jié)構(gòu)蛋白[19]。通常腸道病毒的分類可以通過(guò)VP1 區(qū)域的核苷酸差異來(lái)定義[20-21]。EV-A71 VP1 蛋白包含297 個(gè)氨基酸,位于衣殼區(qū)最外部,包含重要的中和表位。EV-A71 VP1 蛋白145 位氨基酸位點(diǎn)是研究最多的毒力位點(diǎn)[22-23],存在VP1145G、VP1145Q和VP1145E3 種類型,本次實(shí)驗(yàn)所獲序列均為VP1145E,為手足口病患者中最為常見的類型。VP1N104D可能是影響感染能力的表位[24],2018 年有2 株病毒檢測(cè)到有此變異,另外有3 條檢測(cè)到VP1K218R,可能會(huì)影響疫苗免疫效果,引起免疫后逃逸,需要密切關(guān)注并持續(xù)監(jiān)測(cè)。B5 亞型較C4 亞型多VP143E、VP158T和VP1184T3 個(gè)突變位點(diǎn),其是否會(huì)引起廣泛的流行還需進(jìn)一步的研究監(jiān)測(cè)。總之,對(duì)EV-A71 流行特征及變異情況進(jìn)行系統(tǒng)分析并追溯其傳播規(guī)律,對(duì)手足口病防控具有重要意義。

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