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柑橘CLas 和CYVCV 雙重PCR 檢測(cè)體系的建立及應(yīng)用

2022-01-04 02:52:06王培育
武夷科學(xué) 2021年2期
關(guān)鍵詞:泳道黃化黃龍

王培育, 楊 學(xué)

(三明市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院, 福建沙縣365051)

柑橘(Citrus reticulataBlanco)又名寬皮橘、黃橘,是蕓香科(Rutaceae)柑橘屬(Citrus)的常綠小喬木。 柑橘?gòu)V泛種植于北緯35°以南的區(qū)域,目前中國(guó)是柑橘最大的生產(chǎn)國(guó),廣西是中國(guó)最大的柑橘產(chǎn)區(qū)(劉印璇,2019)。 柑橘營(yíng)養(yǎng)豐富,色香味兼優(yōu),既可鮮食又可加工成以果汁為主的各種加工制品(沈曉暉,2018)。 柑橘易受多種病害的影響,其中以柑橘黃龍病和黃化脈明病最為常見(jiàn)。

柑橘黃龍病是一種由韌皮部桿菌(CandidatusLiberibacter)引起的,對(duì)柑橘具有毀滅性的病害,可嚴(yán)重影響柑橘產(chǎn)量和品質(zhì),甚至造成柑橘樹(shù)枯死,能夠侵染包括柑橘屬、枳屬、金柑屬和九里香在內(nèi)的多種蕓香科植物(Guzet al,2020)。 我國(guó)的柑橘黃龍病主要是由柑橘黃龍病菌亞洲種(CandidatusLiberibacter asiaticus,CLas)引起的。 柑橘木虱和帶病苗木或帶病接穗是遠(yuǎn)距離傳病的主因,往往使無(wú)病的新區(qū)變成病區(qū),而柑橘長(zhǎng)期以來(lái)通過(guò)扦插或嫁接的方式進(jìn)行種苗繁育,極易造成大面積帶病植株的傳播。 在商業(yè)化種植過(guò)程中,通常在柑橘發(fā)現(xiàn)病害時(shí),將整株植株直接銷(xiāo)毀(Dinget al,2020;Zhou,2020;肖翠等,2019)。 柑橘黃化脈明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)屬于印度柑橘病毒屬(Mandarivirus),雖然80%的植物病毒病依賴于媒介昆蟲(chóng)傳播,但前期研究未發(fā)現(xiàn)介導(dǎo)該病毒在柑橘間進(jìn)行傳播的昆蟲(chóng)(劉翠花等,2016;劉惠芳,2018)。 有研究發(fā)現(xiàn),該病一旦發(fā)生,可在短時(shí)間內(nèi)迅速傳播,主要傳播方式是嫁接傳播,且傳毒效率較高,苗木帶毒可實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)距離傳播(張艷慧,2018)。 因此,培育不含CLas和CYVCV 的柑橘苗,并及早發(fā)現(xiàn)含有CLas 和CYVCV 的柑橘植株,是防控柑橘黃龍病和黃化脈明病的關(guān)鍵。

雖然受CLas 和CYVCV 感染的柑橘植株可表現(xiàn)出明顯特征,但并不排除表型良好的植株不含有CLas 和CYVCV,染病植株需經(jīng)過(guò)長(zhǎng)短不一的潛伏期后才表現(xiàn)癥狀,待其癥狀明顯時(shí),防治難度及經(jīng)濟(jì)損失增大(Zhou,2020;劉翠花等,2015)。 目前,對(duì)柑橘黃龍病和黃化脈明病已有大量研究,但其檢測(cè)技術(shù)仍較為復(fù)雜,且存在假陰性和假陽(yáng)性現(xiàn)象(胡浩等,2006)。 本研究通過(guò)同時(shí)檢測(cè)CLas 和CYVCV,可大大提高檢測(cè)效率,縮短檢測(cè)時(shí)間和檢測(cè)成本,并且通過(guò)對(duì)特異性引物的目的片段進(jìn)行檢測(cè),能夠排除檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)假陰性和假陽(yáng)性的產(chǎn)生。 研究結(jié)果可為柑橘田間病毒的快速檢測(cè)和后期病害防治及脫毒技術(shù)研究奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)位于三明市尤溪柑橘園,選取5 年生以上的柑橘植株, 采集感染有柑橘黃龍病菌(CLas)、柑橘黃化脈明病毒(CYVCV)以及健康柑橘苗的葉片,其中以PCR 檢測(cè)后呈現(xiàn)陰性的健康柑橘苗葉片為陰性對(duì)照。 采集的柑橘葉樣品均經(jīng)液氮處理后置于-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 引物設(shè)計(jì)

根據(jù)NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中已登錄的CLas 16S 和CYVCV 外殼蛋白(coat protein,CP)以及內(nèi)參CTACT基因的保守核苷酸序列,使用DNAMAN 軟件設(shè)計(jì)CLas 16S 和CYVCV 的特異性引物各2 對(duì),內(nèi)參CTACT基因的特異性引物1 對(duì)(表1),以上引物均由北京六合華大基因科技股份有限公司合成。

表1 引物序列和預(yù)期目的片段大小Table 1 Primer sequence and expected target fragment size

1.3 總RNA 的提取及cDNA 的合成

采用王培育等(2018)改良的Trizol UP RNA 方法提取葉片RNA,用酶標(biāo)儀檢測(cè)RNA 濃度,利用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA 質(zhì)量,使用Prime ScriptTMRT-PCR Kit 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(大連TAKARA 生物公司)合成cDNA,反轉(zhuǎn)錄后將各模板樣品稀釋至10 ng·L-1,保存于4 ℃冰箱備用。

1.4 供試樣品PCR 擴(kuò)增

PCR 擴(kuò)增體系參照王培育等(2019)的研究方法,取25 μL PCR 產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè),以健康柑橘苗葉片作為陰性對(duì)照,于1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后拍照保存。

1.5 靈敏度檢測(cè)

采用1.4 中的PCR 體系對(duì)柑橘樣品進(jìn)行檢測(cè),樣品的cDNA 原液按10 倍梯度進(jìn)行稀釋,依次稀釋cDNA 原液濃度為100~10-5。 隨后在PCR 儀上進(jìn)行擴(kuò)增,檢測(cè)其靈敏度。

2 結(jié)果與分析

2.1 感病和健康柑橘樣品表型

采集的柑橘樣品,對(duì)其健康和感病葉片拍照記錄。 如圖1 所示,圖1A 為健康的柑橘葉片,葉片平整,脈絡(luò)清晰,葉色翠綠且有光澤度。 圖1B 為感染柑橘黃龍病的葉片,出現(xiàn)斑駁黃化、均勻黃化及缺錳、鋅狀黃化;其果小、畸形,著色異常如紅鼻子果、青頭果等,表面無(wú)光澤。而在光照條件下,可以觀察到圖1C 為感染黃化脈明病的柑橘葉片,葉脈發(fā)黃透亮,周邊葉肉有黃斑,后期葉片皺縮;有些柑橘品種感病后還常伴隨著褪綠、花葉等。 該病在新葉上表現(xiàn)出癥狀,且表現(xiàn)的脈明癥狀會(huì)隨著葉片的老化逐漸減弱。 圖1D 為同時(shí)感染了柑橘黃龍病和黃化脈明病的柑橘葉片,表現(xiàn)出葉片斑駁黃化,葉脈明顯且葉片皺縮現(xiàn)象。

圖1 健康和感病柑橘葉片表型Figure 1 Phenotype of healthy and susceptible in Citrus leaf

2.2 應(yīng)用PCR 檢測(cè)柑橘CLas 和CYVCV 的感病情況

PCR 擴(kuò)增約2 h 后,將擴(kuò)增產(chǎn)物于1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后觀察拍照,結(jié)果如圖2 所示。 1 號(hào)泳道以H2O 為模板,無(wú)條帶擴(kuò)增;2 號(hào)泳道為2 對(duì)CLas 和1 對(duì)CTACT特異引物組合,以感染黃龍病病葉cDNA 為模板,同時(shí)擴(kuò)增得到840、748 bp CLas 特異片段和120 bp 內(nèi)參CTACT基因片段;3 號(hào)泳道為2 對(duì)CYVCV 和1 對(duì)CTACT特異引物組合,以感染黃化脈明病病葉cDNA 為模板,同時(shí)擴(kuò)增得到447、325 bp CYVCV 特異片段和120 bp 內(nèi)參CTACT基因片段;4 號(hào)泳道為2 對(duì)CLas、2 對(duì)CYVCV 和1 對(duì)CTACT特異引物組合,以同時(shí)感染黃龍病和黃化脈明病病葉cDNA 為模板,除擴(kuò)增出120 bp 內(nèi)參CTACT基因片段,還同時(shí)擴(kuò)增得到840、748 bp CLas 特異片段和447、325 bp CYVCV 特異片段;5 號(hào)泳道以健康葉片cDNA 為模板(陰性對(duì)照),使用表1 所述的5 組引物組合,采用1.4 中PCR 反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件,并進(jìn)行雙重檢測(cè),只擴(kuò)增出120 bp 的內(nèi)參條帶,排除了假陽(yáng)性和假陰性產(chǎn)生的可能。 結(jié)果表明,待測(cè)葉片感染了 CLas 和 CYVCV。

圖2 PCR 檢測(cè)柑橘CLas 和CYVCVFigure 2 PCR detection of citrus CLas and CYVCV

2.3 靈敏度檢測(cè)

分別以100~105稀釋倍數(shù)的cDNA 液為模板進(jìn)行目標(biāo)片段PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物于1.0%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測(cè)。 檢測(cè)結(jié)果如圖3 所示,以CLas 16S F118、CLas 16S R866、CLas 16S R958 組合分別可以擴(kuò)增出 748 和 840bp 特異性條帶;CYVCV CP F41、CYVCV CP F163、CYVCV CP R488 組合分別可以擴(kuò)增出447 和325 bp 特異性條帶;CTACTF460、CTACTR580組合可擴(kuò)增出120 bp 特異性條帶。 結(jié)果表明,待測(cè)樣品含有CLas 和CYVCV 且cDNA 合成質(zhì)量可用。 圖 3 中泳道 1~5 分別為待測(cè)樣品 cDNA 在原液及稀釋 101、102、103、104倍條件下擴(kuò)增出的CLas、CYVCV 及CTACT目的條帶;泳道6 為待測(cè)樣品cDNA 在稀釋105倍條件下還能擴(kuò)增出CYVCV 目的條帶。 結(jié)果表明,該特異性引物組合不僅能夠排除假陽(yáng)性和假陰性產(chǎn)生,還具有高度靈敏性。

圖3 PCR 檢測(cè)柑橘CLas 和CYVCVFigure 3 PCR detection of citrus CLas and CYVCV

3 結(jié)論與討論

柑橘產(chǎn)業(yè)深受病害問(wèn)題的困擾。 迄今為止,我國(guó)的柑橘病害有300 多種,分為侵染性病害和非侵染性病害兩大類(lèi)。 在病菌類(lèi)病害中,以黃龍病最嚴(yán)重,曾造成大批柑橘園毀害,使用常用藥劑防治,效果不佳(Bove 等,2011)。 培育脫毒柑橘母本樹(shù)和苗木以及進(jìn)行抗病品種選育工作時(shí),對(duì)其進(jìn)行病原菌檢測(cè),在病害防治過(guò)程中起到至關(guān)重要的作用。 PCR 檢測(cè)方法雖然具有較高的特異性和靈敏度,但其檢測(cè)技術(shù)復(fù)雜、效率低,具有一定的局限性。 因此,多重PCR技術(shù)在植物病原菌檢測(cè)方面得到大力地推廣應(yīng)用(張婧穎,2016)。 劉歡等(2016)利用多重PCR 技術(shù)一次性擴(kuò)增出番茄煙草花葉病毒(TMV)、黃瓜花葉病毒(CMV)、番茄斑萎病毒(TSWV)和馬鈴薯X 病毒(PVX)的特異性片段;匡云波等(2018)運(yùn)用多重PCR 技術(shù)建立PCR檢測(cè)方法,可快速、穩(wěn)定、準(zhǔn)確地檢測(cè)太子參蠶豆萎蔫病毒(BBWV2)和蕪菁花葉病毒(TuMV);焦楠等(2019)建立了西番蓮夜來(lái)香花葉病毒(TeMV)和黃瓜花葉病毒(CMV)的雙重 PCR 檢測(cè)體系。 本方法利用雙重PCR 技術(shù)進(jìn)行CLas 和CYVCV 檢測(cè),大大提高檢測(cè)效率,縮短檢測(cè)時(shí)間和檢測(cè)成本;同時(shí),對(duì)CLas 和CYVCV 特異性引物的目的片段進(jìn)行檢測(cè),可排除假陽(yáng)性的產(chǎn)生,對(duì)內(nèi)參基因CTACT特異性引物的目的片段進(jìn)行檢測(cè),能夠排除檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)假陰性。

本試驗(yàn)在前人研究基礎(chǔ)上,首次建立起能同時(shí)檢測(cè)柑橘CLas 和CYVCV 的測(cè)體系。 以單一PCR 檢測(cè)為基礎(chǔ),設(shè)計(jì)特異性引物,對(duì)樣品柑橘進(jìn)行檢測(cè),靈敏度試驗(yàn)顯示建立的PCR 體系具有較高的靈敏性,能夠檢測(cè)到10-5mg 的組織量,這是PCR 技術(shù)在柑橘病原菌檢測(cè)上的應(yīng)用,對(duì)培育脫毒柑橘母本樹(shù)和苗木以及進(jìn)行抗病品種的選育具有重要意義。

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