張志華,王 蘭,周霄穎,鄭必霞,林 謙*
1南京醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院消化科,2兒科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210029
肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A(carnitine palmitoyltrans?ferase 1A,CPT1A)缺乏癥(OMIM#255120)是一種長鏈脂肪酸氧化障礙的常染色體隱性遺傳疾病,由CPT1A 基因(OMIM#600528)變異導(dǎo)致。CPT1A 是長鏈脂肪酸進(jìn)入線粒體進(jìn)行β氧化的限速酶。當(dāng)CPT1A缺乏癥患者長期禁食或處于病理狀態(tài)時(shí),糖原貯備不足,肝臟線粒體脂肪酸β氧化提供能量被抑制,出現(xiàn)低血糖、肝性腦病等多系統(tǒng)癥狀[1]。該疾病罕見,到目前為止,人類基因組突變數(shù)據(jù)庫(Human Genome Mutation Database,HGMD)僅收錄了41種突變(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/gene.php?gene=CPT1A),多為點(diǎn)突變,本文首次報(bào)道了中國人群中1例外顯子4~5純合缺失的變異類型,豐富了該基因變異譜,并結(jié)合qPCR進(jìn)行了驗(yàn)證。
患兒,男,2歲10個(gè)月。因“肝功能異常3周”入院?;純? 周前因“低血糖暈厥”于當(dāng)?shù)蒯t(yī)院治療,查丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(alanine aminotransferase,ALT)173.0 U/L,予美能、谷胱甘肽保肝治療3周,復(fù)查肝功能,ALT 250 U/L,遂來就診。入院查體:肝臟右肋下3 cm,質(zhì)中。余查體無異常。父母體健,否認(rèn)家族史。入院診斷:肝功能損害。
基因測(cè)序:采集患兒及其父母靜脈血3 mL(EDTA 抗凝)送至北京全譜醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室,進(jìn)行全外顯子組測(cè)序,外周血標(biāo)本DNA 抽提前,患兒監(jiān)護(hù)人填寫知情同意書,本研究獲南京兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。本實(shí)驗(yàn)將正常對(duì)照樣本與先證者及父母樣本進(jìn)行同組熒光定量PCR檢測(cè),以ALB基因?yàn)閮?nèi)參基因,對(duì)目標(biāo)基因CPT1A 的4~5 外顯子的拷貝數(shù)進(jìn)行相對(duì)定量檢測(cè)(用熒光定量PCR法)。計(jì)算公式為2-ΔΔCt。qPCR所用引物序列見表1。
表1 CPT1A基因外顯子4~5 qPCR擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)
入院后輔助檢查結(jié)果:ALT 206 U/L,天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(aspartate aminotransferase,AST)154 U/L,乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase,LDH)348 U/L,血糖4.11 mmol/L;凝血功能無異常;血氨、銅藍(lán)蛋白、噬肝病毒、傳染病4項(xiàng)無異常。彩超示肝臟右肋下38 mm,肝臟形態(tài)增大,腹部CT 示肝臟實(shí)質(zhì)密度彌漫性減低。肝組織光鏡病理:肝細(xì)胞腫脹、胞質(zhì)空亮,廣泛脂肪變性,匯管區(qū)纖維組織中度增生伴少量淋巴細(xì)胞浸潤(圖1);肝組織電鏡病理:肝細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi)可見大量脂滴沉積,細(xì)胞質(zhì)內(nèi)線粒體增多,線粒體局灶可見腫脹及空泡變性等改變,糖原顆粒輕度增多。遺傳代謝血液篩查示游離肉堿(C0)顯著升高,多種?;鈮A(C16、C18)降低,C0/(C16+C18)為2 609.78(正常值2.50~54.00)。以上檢查結(jié)果高度提示患兒為遺傳代謝性疾病,進(jìn)一步采用全外顯子組測(cè)序進(jìn)行基因檢測(cè)以明確診斷。
圖1 先證者肝臟穿刺活檢組織光鏡病理
基因診斷:全外顯子組測(cè)序結(jié)果提示患兒CPT1A基因外顯子4~5純合缺失,患兒父親、母親為該突變雜合攜帶者。CPT1A基因的純合或復(fù)合雜合型突變可以導(dǎo)致CPT1A缺乏癥。進(jìn)一步采用qPCR的方法驗(yàn)證該患兒CPT1A基因外顯子4~5純合缺失變異。
將正常對(duì)照樣本與先證者及父母樣本進(jìn)行同組qPCR檢測(cè),以ALB基因?yàn)閮?nèi)參基因,對(duì)目標(biāo)基因CPT1A 4~5外顯子的拷貝數(shù)進(jìn)行檢測(cè)。由圖2結(jié)果可見,先證者CPT1A 基因4~5 外顯子的拷貝數(shù)與正常對(duì)照的比值約為0,提示先證者CPT1A 基因4~5外顯子存在純合缺失,先證者父母CPT1A 基因4~5外顯子的拷貝數(shù)與正常對(duì)照的比值約為0.5,提示先證者父母CPT1A 基因4~5 外顯子存在雜合缺失。qPCR檢測(cè)結(jié)果與全外顯子組測(cè)序結(jié)果一致。
圖2 CPT1A基因外顯子4~5純合缺失突變qPCR驗(yàn)證結(jié)果
CPT1A 缺乏癥是一種常染色體隱性遺傳代謝性疾病,屬于長鏈脂肪酸氧化代謝紊亂類疾病,由11q13染色體上的CPT1A基因上的純合或復(fù)合雜合型突變所致。該疾病由Bougnères 等[2]于1981 年首次報(bào)道,具有種族特異性,在阿拉斯加、加拿大、格陵蘭島和西伯利亞東北地區(qū)發(fā)病率較高[3-5],其他地區(qū)較罕見,目前中國人群的患病率未知。
CPT1A 缺陷患者臨床表現(xiàn)差異較大,在正常生理情況下沒有明顯的臨床表現(xiàn),當(dāng)糖原儲(chǔ)備顯著減少時(shí),出現(xiàn)低血糖、嘔吐、腹瀉、抽搐、肝腫大、肝性腦病等典型的臨床特征[6],一些個(gè)體可出現(xiàn)腎小管性酸中毒表型[7-8]。也有個(gè)案報(bào)道以黃疸為首發(fā)癥狀[9]。心臟或骨骼肌受累并不常見[1]。實(shí)驗(yàn)室檢查可顯示低酮型低血糖、肝酶升高、高血氨等,實(shí)驗(yàn)室診斷的重要依據(jù)是脂酰肉堿的合成顯著減少,C0水平升高。本例患兒2 歲10 個(gè)月時(shí)因低血糖暈厥起病,肝功能持續(xù)異常,肝臟腫大,C0/(C16+C18)約為正常上限值的50倍,肝細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi)存在大量脂滴沉積,線粒體增多且線粒體局灶可見腫脹及空泡變性等改變,臨床表現(xiàn)及實(shí)驗(yàn)室檢查支持CPT1A 缺乏癥,我們采用全外顯子組測(cè)序進(jìn)行基因檢測(cè)以進(jìn)一步明確了診斷。
CPT1A缺乏癥的致病基因CPT1A位于11q13染色體上,包含20 個(gè)外顯子,編碼大小為773 個(gè)氨基酸殘基的CPT1A[10-11]。目前HGMD數(shù)據(jù)庫中收錄了41種CPT1A基因突變,多為錯(cuò)義突變、無義突變、剪切突變及插入缺失突變,以點(diǎn)突變?yōu)橹?。全外顯子檢測(cè)顯示本例患兒CPT1A基因4~5外顯子存在純合缺失,父母為該雜合突變攜帶者,qPCR 結(jié)果與基因測(cè)序結(jié)果一致。在正常人群數(shù)據(jù)庫中未發(fā)現(xiàn)該變異,未見相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道。CPT1A 基因的4~5 外顯子連續(xù)缺失屬于基因水平中型變異,造成開放閱讀框大片段缺失,從而影響蛋白功能,結(jié)合該患兒的臨床表現(xiàn),CPT1A基因外顯子缺失變異是本例患兒發(fā)病的分子機(jī)制。
CPT1A 缺乏癥患者出現(xiàn)急性低血糖癥時(shí),應(yīng)盡快提供足量10%葡萄糖注射液以糾正低血糖,并防止脂肪分解和隨后脂肪酸向線粒體的動(dòng)員。血糖濃度正常后應(yīng)繼續(xù)葡萄糖輸注,為糖原合成提供足夠底物。CPT1A 缺乏癥患者在應(yīng)激狀態(tài)下存在神經(jīng)系統(tǒng)損傷、肝功能衰竭、癲癇發(fā)作、昏迷及猝死風(fēng)險(xiǎn),預(yù)防急性發(fā)病可明顯改善預(yù)后。CPT1A缺乏癥患者應(yīng)經(jīng)常進(jìn)食,嬰兒夜間可予玉米淀粉喂養(yǎng)提供緩慢釋放碳水化合物的恒定來源,以防睡眠期低血糖癥;因?yàn)橹墟溨舅岵恍鐲PT1A協(xié)助即可進(jìn)入線粒體內(nèi)轉(zhuǎn)化為能量,應(yīng)采用高碳水化合物、減少長鏈脂肪酸攝入、增加中鏈甘油三酯的飲食結(jié)構(gòu)[1]。本例患兒在采取合理飲食結(jié)構(gòu)后,肝轉(zhuǎn)氨酶較前下降,未再出現(xiàn)低血糖等臨床表現(xiàn)。
預(yù)防CPT1A缺乏癥急性發(fā)作、及時(shí)采取干預(yù)措施可明顯改善患者預(yù)后,串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)聯(lián)合基因檢測(cè)有助于早期診斷。本例患者是國內(nèi)首例外顯子4~5 純合缺失的CPT1A 缺乏癥患者,豐富了該基因變異譜。近年來全外顯子測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用進(jìn)展很快,可以檢出外顯子缺失和重復(fù)的中型變異,結(jié)合qPCR 或者多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)驗(yàn)證,可以為這類變異的患兒提供精準(zhǔn)的分子診斷。