施韜關(guān)靜李進(jìn)趙翠 蘭蘭王大勇 王洪陽(yáng)王秋菊*
1 浙江中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)與信息工程學(xué)院(杭州 310053)
2 中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科醫(yī)學(xué)部,國(guó)家耳鼻咽喉疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心,解放軍耳鼻咽喉研究所,聾病教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;聾病防治北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(北京 100853)
PCDH15變異導(dǎo)致Usher綜合征1型(USH1)或常染色體隱性遺傳性耳聾23型(DFNB23)。USH1是一種以進(jìn)行性視網(wǎng)膜色素變性(retinitis pig‐mentosa,RP)和先天性感音神經(jīng)性聽(tīng)力損失為特征的常染色體隱性疾病,伴有先天性前庭功能障礙,運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩、難以保持平衡[1-4]。USH1在視力異常表型出現(xiàn)之前,與非綜合征型耳聾(Non-syn‐dromic hearing loss,NSHL)表型相同,也被稱(chēng)為擬非綜合征型耳聾(mimics NSHL)[5]。因此,當(dāng)臨床中發(fā)現(xiàn)PCDH15變異的患者,需監(jiān)測(cè)隨訪以鑒別是否可能為USH1。
目前,已報(bào)道的PCDH15變異位點(diǎn)為144個(gè)(http://www.hgmd.cf.ac.uk/,Update 2020/04),大多為國(guó)外報(bào)道,且很少有針對(duì)PCDH15變異患者的描述,國(guó)內(nèi)相關(guān)報(bào)道更少。本研究通過(guò)新一代測(cè)序技術(shù),在4個(gè)家系中檢出PCDH15復(fù)合雜合變異,并分析4個(gè)家系的基因型及表型特征。
研究對(duì)象為2016年3月-2019年6月在解放軍總醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科就診的4個(gè)漢族耳聾家系(圖1),共18人,6名患者均為先天性極重度感音神經(jīng)性耳聾,男性2名、女性4名,分別來(lái)自河北、北京、河南、山東;其中3名兒童,3名成人。收集先證者及其父母或家屬血樣,共18份。所有研究對(duì)象均已簽署知情同意書(shū),未成年子女由其父母簽署同意書(shū)。
圖1 PCDH15變異相關(guān)耳聾患者家系及聽(tīng)力圖。B1:+/+表示c.3441 del A/c.2528 C>A;A2:患者9月左側(cè)植入CI后助聽(tīng)聽(tīng)閾;B2:患者29歲雙耳聽(tīng)閾;C2:患者11月雙耳聽(tīng)閾;D2:患者10月齡右側(cè)植入CI后雙耳聽(tīng)閾。Fig.1 Pedigrees of deafness families related to variants of PCDH15.B1:+/+mean by c.3441 del A/c.2528 C>A;A2:The patient’s left hearing threshold after left cochlear implant in 9 months ago;B2:The patient’s binaural hearing threshold in 29 years old;C2:The patient’s binaural hearing threshold in 11 months old;D2:The patient’s binaural hearing threshold after right cochlear implant in 10 months ago.
采用項(xiàng)目組自主設(shè)計(jì)的問(wèn)卷調(diào)查表,記錄患者病史,完成家系調(diào)查并繪制家系圖。對(duì)患者進(jìn)行聽(tīng)力學(xué)檢查,包括純音測(cè)聽(tīng)、聲導(dǎo)抗、畸變產(chǎn)物耳聲發(fā)射(distortion product otoacoustic emissions,DPOAE),對(duì)嬰幼兒進(jìn)行聽(tīng)性腦干反應(yīng)(auditory brainstem re‐sponse,ABR)、40Hz聽(tīng)覺(jué)事件相關(guān)電位(40 Hz au‐ditory event related potential,40Hz AERP)及聽(tīng)覺(jué)穩(wěn)態(tài)反應(yīng)(auditory steady state responses,ASSR)檢查。聽(tīng)力損失程度根據(jù)500、1k、2k、4kHz平均聽(tīng)閾分類(lèi),分為26-40dB HL輕度、41-55 dB HL中度、56-70 dB HL中重度、71-90 dB HL重度以及>90 dB HL極重度聽(tīng)力損失。對(duì)患者進(jìn)行眼科檢查及影像學(xué)檢查,包括眼底鏡檢查、顳骨CT、內(nèi)聽(tīng)道MRI,評(píng)估患者眼部是否存在異常。對(duì)患者進(jìn)行1-3年電話(huà)隨訪及復(fù)診,對(duì)遲發(fā)性眼部臨床表型進(jìn)行長(zhǎng)期的關(guān)注。
采集的血樣提取基因組DNA,試劑盒由天根生物科技(北京,中國(guó))提供。將DNA片段化及末端修復(fù)之后,構(gòu)建DNA文庫(kù)。運(yùn)用新一代測(cè)序技術(shù),對(duì)其中2名患者進(jìn)行目標(biāo)區(qū)域測(cè)序(Targeted Regions Sequencing,TES),2名患者全外顯子測(cè)序(Whole exome sequencing,WES)。通過(guò)生物信息分析方法,確定可疑致病基因變異,先證者及其親屬均進(jìn)行變異位點(diǎn)的Sanger驗(yàn)證。
得到變異位點(diǎn)后,根據(jù)美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)會(huì)(The American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南將變異分為致病變異、疑似致病變異、意義不明的變異以及良性變異[6-8]。對(duì)于拷貝體變異(Copy number variations,CNVs),同樣參考ACMG指南[9]。
1707699 (圖1-A1:III.1),女,8歲,2月齡ABR檢測(cè),雙耳氣骨導(dǎo)在100dB nHL均無(wú)反應(yīng);ASSR檢測(cè),雙耳100dB nHL均無(wú)反應(yīng);40Hz AERP檢測(cè),雙耳100 dB nHL均無(wú)反應(yīng)。
1707867 (圖1-B1:II.3),女,29歲,先天性聾,右耳平均聽(tīng)閾96.25dB HL,左耳平均聽(tīng)閾103.75 dB HL,聲導(dǎo)抗正常。II.2先天性聾,右耳平均聽(tīng)閾105dB HL,左耳平均聽(tīng)閾107.5 dB HL。
1808120 (圖1-C1:III.3),男,3歲,7月齡ABR檢測(cè),雙耳氣導(dǎo)在100dB nHL均無(wú)反應(yīng);ASSR檢測(cè),雙耳100dB nHL均無(wú)反應(yīng);DPOAE檢測(cè),雙耳各頻率均未引出;聲導(dǎo)抗顯示雙耳A型。
1908312 (圖1-D1:II.1),女,4歲,10月齡ABR檢測(cè),雙耳氣導(dǎo)在95dB nHL均無(wú)反應(yīng);ASSR檢測(cè),雙耳平均聽(tīng)閾均為116dB nHL;DPOAE檢測(cè),雙耳各頻率均未引出?;純河?0月齡右側(cè)植入人工耳蝸(cochlear implant,CI),助聽(tīng)后右耳平均聽(tīng)閾23.75dB HL。
四名先證者顳骨CT檢查正常,提示無(wú)內(nèi)耳畸形。
家系1707699和1908312的先證者及父母進(jìn)行WES檢測(cè),家系1707867和1808120的先證者進(jìn)行TES檢測(cè),共檢測(cè)出7種PCDH15變異(NM_033056.3),2種無(wú)義變異,2種剪接位點(diǎn)變異,1種錯(cuò)義變異,1種移碼變異,1種CNV(表1)。7種變異中,c.733C>T為已報(bào)道的致病變異位點(diǎn)[2],c.2528C>A為已報(bào)道的意義不明的變異位點(diǎn)[10],根據(jù)該家系表型及ACMG指南建議(PM2+PP1+PP3,PM表示證據(jù)強(qiáng)度中等,PP表示輔助證據(jù)),考慮該變異位點(diǎn)為疑似致病。其余均為新發(fā)現(xiàn)的變異。
表1 基因檢測(cè)結(jié)果及分析Table 1 Summary and analysis of genotype
對(duì)先證者父母及家族成員(12人)進(jìn)行Sanger驗(yàn)證,結(jié)果顯示所有親屬均為PCDH15變異單雜合攜帶者。家系1707699中,III.1為EX19-21del和c.1997+1G>A復(fù)合變異遺傳模式,EX19-21長(zhǎng)度約為27kb,III.2檢測(cè)結(jié)果為EX19-21 del單雜合攜帶。家系1707867中,II.3為c.3441 del A和c.2528C>A復(fù)合雜合變異,II.1和II.2與II.3的變異位點(diǎn)相同。家系1808120中,II.3為c.733C>T和c.157+1G>A,家系1908312中,II.1為c.733C>T和c.2756del T,均攜帶c.733C>T這個(gè)變異位點(diǎn)。所有先證者均符合常染色體隱性遺傳模式。
得到變異位點(diǎn)后,為明確患者病因,需對(duì)患者及攜帶者進(jìn)行隨訪,告知有可能存在遲發(fā)性RP表型的可能性,強(qiáng)調(diào)視力方面檢查的重要性(表2)。
表2 先證者表型匯總Table 2 Summary of phenotype of probands
1707699 (圖1-A1:III.1)于9月齡時(shí)左側(cè)植入CI,植入后左耳平均聽(tīng)閾為41.25dB HL,3歲時(shí)為31.25dB HL(圖2-B)。雙音節(jié)言語(yǔ)識(shí)別率為100%,語(yǔ)句識(shí)別為95%?;純?8月齡能獨(dú)立行走,雙眼遠(yuǎn)視、散光,5歲時(shí)眼底鏡檢查正常(圖2-A)。III.2為EX19-21del雜合攜帶者,目前三歲,聽(tīng)力正常,言語(yǔ)發(fā)育可。
圖2 170769眼底鏡檢查與助聽(tīng)后聽(tīng)閾變化。A為患者眼底鏡檢查結(jié)果(正常);B為患者植入CI聽(tīng)閾變化。Fig.2 Ophthalmofundoscopy and threshold change after CI of 170769.A:result of ophthalmofundoscopy(normal);B:threshold change after CI.
1707867 (圖1-B1:II.3),主訴無(wú)眩暈、走路不穩(wěn)等前庭相關(guān)功能異常,視力在正常范圍之內(nèi)。II.1和II.2臨床表型與其相同,II.1目前33歲,13歲時(shí)右側(cè)植入CI,使用兩年后效果不佳,后未再佩戴。II.2和II.3均雙側(cè)佩戴助聽(tīng)器,自述交流能力一般。III代子女聽(tīng)力均正常,視力在正常范圍之內(nèi),年齡10月-13歲。
1808120 (圖1-C1:III.3),11月齡左側(cè)植入CI,交流能力尚可。患兒確診為運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩,走路和下樓梯經(jīng)常性的摔倒。由于年齡限制,無(wú)法進(jìn)行視網(wǎng)膜電圖檢查,家長(zhǎng)拒絕進(jìn)行眼底鏡檢查。
1908312 (圖1-D1:II.1),10月齡右側(cè)植入CI,交流能力尚可。18月齡獨(dú)立行走,視力雙眼遠(yuǎn)視及散光,存在夜晚外出困難的癥狀,由于年齡限制,無(wú)法進(jìn)行視網(wǎng)膜電圖檢查,家長(zhǎng)拒絕進(jìn)行眼底鏡檢查。
PCDH15與鈣粘蛋白23是內(nèi)耳毛細(xì)胞靜纖毛頂連接(tip-link)的重要組成部分,內(nèi)耳毛細(xì)胞是一種機(jī)械-電傳感器,完成聲電轉(zhuǎn)換,幫助產(chǎn)生聽(tīng)覺(jué)和平衡知覺(jué)[11,12]。毛細(xì)胞頂端存在靜纖毛,靜纖毛的擺動(dòng)可以通過(guò)tip-link的控制打開(kāi)機(jī)械門(mén)控通道[13,14]。PCDH15變異改變蛋白結(jié)構(gòu)域的空間形態(tài),機(jī)械門(mén)控通道出現(xiàn)異常,引起USH1F或DF‐NB23[1,2,1517]。Alagramam等在成人和胎兒視網(wǎng)膜及內(nèi)耳內(nèi)發(fā)現(xiàn)PCDH15的表達(dá)[1]。Ahmed等發(fā)現(xiàn)在人眼的感光細(xì)胞中存在PCDH15,這表明USH1患者在視力方面存在缺陷,將出現(xiàn)進(jìn)行性RP[16]。因此,USH1臨床表型包括耳聾、前庭功能障礙和RP。
表3 在不同種族中PCDH15導(dǎo)致的USH1Table 3 USH1 caused by PCDH15 in different races
PCDH15變異導(dǎo)致的USH1是一種典型的mimics NSHL,患者在早期僅表現(xiàn)出耳聾特征,而RP是遲發(fā)性的。通常,患者10歲左右將會(huì)出現(xiàn)夜盲和隧道視覺(jué)等RP早期癥狀,隨后視野進(jìn)行性向心性縮小,直至完全失明[18]。有研究發(fā)現(xiàn),患者在21歲時(shí)才出現(xiàn)RP早期癥狀[3]。1908312已出現(xiàn)夜盲的癥狀,并且其與1707699均為遠(yuǎn)視及散光。有研究表明在NSHL兒童中USH1發(fā)生率為1.3-2.2%[22]。在Vonam等的研究中,新一代測(cè)序能使USH1的診斷年齡早于視力損失的發(fā)病年齡[24],為USH1家庭帶來(lái)許多即時(shí)和長(zhǎng)期的幫助[17]。本研究通過(guò)基因檢測(cè)后的隨訪,3名最初診斷為NSHL的兒童,在檢測(cè)出PCDH15變異后,隨訪發(fā)現(xiàn)視力及前庭的異常表型。
PCDH15是導(dǎo)致USH1的主要致病基因,在德系猶太人中PCDH15是最常見(jiàn)的致病基因,c.733C>T在該人群中存在始祖效應(yīng),占據(jù)USH1的比例為50%-60%,c.733C>T的攜帶率為0.79%-2.48%[2,20]。在本研究中,2名患者均有c.733C>T致病位點(diǎn),考慮將其作為中國(guó)人群PCDH15熱點(diǎn)變異進(jìn)行下一步研究。
PCDH15變異導(dǎo)致的USH1,除了可以通過(guò)單核苷酸變異致病,CNV同樣也是關(guān)鍵致病變異類(lèi)型。CNV與遺傳性耳聾關(guān)系密切[25]。1707699外顯子19-21缺失,長(zhǎng)度約為27kb,CNV是指大于1kb的DNA片段的缺失/重復(fù)[26]。大多數(shù)已報(bào)道的CNV集中在PCDH15前5個(gè)外顯子及第20外顯子附近,在本研究中檢測(cè)出的EX19-21 del包含在已報(bào)道的CNV范圍內(nèi)(表4)。由此可見(jiàn),PCDH15基因除了點(diǎn)變異,CNV也是的主要變異類(lèi)型。
表4 PCDH15已報(bào)道的拷貝體變異Table 4 CNVs has been reported in PCDH15
PCDH15表達(dá)于毛細(xì)胞靜纖毛間的tip-link,其變異影響耳蝸的機(jī)電轉(zhuǎn)換,CI是通過(guò)手術(shù),將電極片植入內(nèi)耳,直接作用于螺旋神經(jīng)節(jié)細(xì)胞,繞過(guò)耳蝸的機(jī)電轉(zhuǎn)換,進(jìn)而幫助患者感知聲音[35-37]。在本次研究中,通過(guò)隨訪發(fā)現(xiàn),3例兒童CI植入效果較好,1707699植入后雙音節(jié)詞言語(yǔ)識(shí)別率達(dá)到100%。1707867的哥哥在13周歲時(shí)才植入CI,效果不佳,佩戴兩年后未再使用。通過(guò)這些發(fā)現(xiàn),PCDH15變異的耳聾患者均存在先天性重-極重度聽(tīng)力損失,早期植入CI,可以讓兒童在言語(yǔ)發(fā)育關(guān)鍵期接受更多的聲音刺激,言語(yǔ)發(fā)育更好,后期兒童可以通過(guò)視力閱讀唇語(yǔ),配合聽(tīng)覺(jué)康復(fù)來(lái)獲得更好地言語(yǔ)發(fā)展[2-3,38]。
PCDH15變異是導(dǎo)致DFNB23和USH1的重要原因,USH1在臨床上表現(xiàn)為雙耳先天性重-極重度聽(tīng)力損失、運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩及進(jìn)行性RP。本研究為4個(gè)極重度感音神經(jīng)性聾家系明確了分子病因,發(fā)現(xiàn)均為PCDH15復(fù)合雜合變異,其中有7個(gè)變異位點(diǎn),包括2種無(wú)義變異,2種剪接位點(diǎn)變異,1種錯(cuò)義變異,1種移碼變異,1種CNV,5個(gè)為新發(fā)變異位點(diǎn);考慮c.733C>T為熱點(diǎn)變異位點(diǎn),需進(jìn)一步研究;通過(guò)隨訪,分析PCDH15致病患者聽(tīng)力、視力、前庭功能的臨床表型,及CI佩戴效果,發(fā)現(xiàn)對(duì)于PCDH15基因變異導(dǎo)致的先天性極重度聾的患兒,在早期植入CI言語(yǔ)發(fā)育尚可,為PCDH15變異導(dǎo)致的USH1及DFNB23的分子診斷及治療干預(yù)提供參考意見(jiàn),USH1作為mimics NSHL的一種,早期診斷及干預(yù)至關(guān)重要。