高婷 袁芳艷 劉澤文 劉威 周丹娜 楊克禮 郭銳 梁婉 陳文杰 田永祥
摘要:為比較豬鏈球菌中g(shù)idA缺失菌株與野生菌株氨基酸代謝之間的差異,揭示GidA調(diào)控氨基酸代謝的規(guī)律,為豬鏈球菌致病性的解析以及防控提供理論依據(jù),分別收集gidA缺失菌株、野生菌株菌體,采用高效液相色譜法(HPLC)、質(zhì)譜儀在正離子模式下進(jìn)行質(zhì)譜分析,檢測(cè)樣本中30種氨基酸及其衍生物的含量,比較gidA缺失菌株、野生菌株菌體中氨基酸代謝譜的差異。結(jié)果表明,2種菌株中精氨酸、賴氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺、絲氨酸、谷氨酰胺、蘇氨酸、丙氨酸、纈氨酸、色氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、肌酸酐及鳥氨酸具有顯著差異(P<0.05,倍數(shù)差異>1.2),其中精氨酸上調(diào)約4倍,天冬酰胺下調(diào)約17倍。說明tRNA修飾酶GidA缺失引起豬鏈球菌氨基酸代謝異常,尤其是精氨酸與天冬酰胺,其機(jī)制可能與豬鏈球菌致病性下降相關(guān)。
關(guān)鍵詞:豬鏈球菌;tRNA修飾酶;GidA;氨基酸代謝
中圖分類號(hào):S858.28? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A? ? ? ? 文章編號(hào):1007-273X(2021)07-0010-03
豬鏈球菌(Streptococcus suis,SS)是一種重要的人獸共患傳染病病原菌,不僅感染豬還感染人,嚴(yán)重時(shí)導(dǎo)致敗血癥型休克甚至死亡,給養(yǎng)豬業(yè)造成重大的經(jīng)濟(jì)損失,也威脅著人類的身體健康和生命安全[1-3]。tRNA修飾酶葡萄糖抑制分裂蛋白A(Glucose inhibited division protein A,GidA)是全局性的調(diào)控因子,對(duì)細(xì)菌的生長(zhǎng)以及致病性具有重要的調(diào)控作用[4],然而GidA蛋白對(duì)豬鏈球菌的氨基酸代謝譜的影響尚未見文獻(xiàn)報(bào)道。本研究利用多反應(yīng)監(jiān)測(cè)技術(shù),以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)特定氨基酸代謝物群進(jìn)行有針對(duì)性、特異性的檢測(cè)與分析,發(fā)現(xiàn)GidA對(duì)豬鏈球菌的氨基酸代謝譜產(chǎn)生了嚴(yán)重的擾動(dòng),尤其是精氨酸,而精氨酸代謝又與豬鏈球菌致病性相關(guān)。毒力因子ADS 是精氨酸代謝的重要途徑,廣泛存在于原核生物體內(nèi)。ADS主要由精氨酸脫亞氨ArcA、ArcB 和ArcC 3種核心酶組成,通過上述核心酶的作用最終將精氨酸催化降解生成鳥氨酸、二氧化碳、氨和ATP,為細(xì)菌提供能量以及增強(qiáng)細(xì)菌對(duì)酸性環(huán)境的適應(yīng)性。因此,本研究為豬鏈球菌致病性的解析以及防控提供了新的理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)儀器和試劑
試驗(yàn)儀器:5500 QTRAP質(zhì)譜儀(AB SCIEX),Agilent 1290 Infinity LC超高效液相色譜系統(tǒng),低溫高速離心機(jī)(Eppendorf 5430R),色譜柱Zic-HILIC 3.5 ?m,2.1 mm×150 mm Column。
試劑:甲酸(Fluka,06450),乙腈(Merck,1499230-935),甲醇(Merck,144282),所有氨基酸及其衍生物的標(biāo)準(zhǔn)品均購(gòu)自Sigma-Aldrich。
1.2 代謝物提取
取細(xì)菌菌體樣本,每個(gè)樣本中加入1 mL 預(yù)冷甲醇/乙腈/水(2∶2∶1,V/V/V),轉(zhuǎn)移至1.5 mL離心管中,渦旋混合,冰浴中超聲30 min,-20 ℃孵育1 h用于沉淀蛋白,14 000 r/min 4 ℃離心20 min,取上清,真空干燥。質(zhì)譜檢測(cè)時(shí)加入100 μL乙腈-水溶液(1∶1,V/V)復(fù)溶,14 000 r/min,4 ℃離心15 min,取上清進(jìn)樣分析。每組另取樣本適量,等量混合為質(zhì)控(Quality control,QC)樣本。QC樣本按照上述方法平行進(jìn)行制備。
1.3 高效液相色譜條件
樣品采用Agilent 1290 Infinity LC超高效液相色譜系統(tǒng)進(jìn)行分離。流動(dòng)相:A液為含0.08% FA 25 mmol/L甲酸銨水溶液,B液為0.1% FA乙腈。樣品置于4 ℃自動(dòng)進(jìn)樣器中,柱溫40 ℃,流速為250 μL/min,進(jìn)樣量2 μL。相關(guān)液相梯度如下:0~12 min,B液從 90%線性變化到70%;12~18 min,B液從70%線性變化到50%;18~25 min,B液從50%線性變化到40%,30.0~30.1 min,B液從40%線性變化到90%;30.1~37.0 min,B液維持在90%。樣本隊(duì)列中每間隔一定數(shù)量的樣本設(shè)置一個(gè) QC 樣本,用于檢測(cè)和評(píng)價(jià)系統(tǒng)的穩(wěn)定性及重復(fù)性。
1.4 質(zhì)譜分析
采用5500 QTRAP 質(zhì)譜儀(AB SCIEX)在正離子模式下進(jìn)行質(zhì)譜分析。5500 QTRAP ESI 源條件如下:Source temperature 500 ℃,Ion source gas1(Gas1):40,Ion source gas2(Gas2):40,Curtain gas(CUR):30,Ion sapary voltage floating(ISVF)5500 V;采用多反應(yīng)監(jiān)測(cè)模式檢測(cè)待測(cè)離子對(duì)。
1.5 數(shù)據(jù)處理
采用Multiquant軟件提取色譜峰面積及保留時(shí)間。采用氨基酸及其衍生物的標(biāo)準(zhǔn)品矯正保留時(shí)間,進(jìn)行代謝物鑒定。
2 結(jié)果與分析
2.1 △gidA缺失菌株與野生菌株SC19氨基酸及其衍生物多反應(yīng)監(jiān)測(cè)結(jié)果
樣本中共檢測(cè)到23種氨基酸及其衍生物,以△gidA與SC19定量比較,其中精氨酸、賴氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺、絲氨酸、谷氨酰胺、蘇氨酸、丙氨酸、纈氨酸、色氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、肌酸酐以及鳥氨酸具有顯著差異(P<0.05,倍數(shù)差異>1.2),其中精氨酸上調(diào)約4倍,天冬酰胺下調(diào)約17倍,詳細(xì)定量數(shù)據(jù)見表1。
2.2 氨基酸代謝組聚類分析
為了評(píng)價(jià)候選氨基酸的合理性,同時(shí)更全面直觀地顯示樣本之間的關(guān)系以及氨基酸在不同樣本中的表達(dá)模式差異,利用定性的顯著性差異氨基酸的表達(dá)量對(duì)各組樣本進(jìn)行層次聚類分析,結(jié)果見圖1。由圖1可見,精氨酸上調(diào)顯著,天冬酰胺下調(diào)顯著(紅色代表顯著性上調(diào)氨基酸,藍(lán)色代表顯著性下調(diào)氨基酸)。
2.3 系統(tǒng)穩(wěn)定性評(píng)價(jià)
所有樣品等量混合制備成為QC樣本,采用QC樣本對(duì)實(shí)驗(yàn)過程儀器系統(tǒng)的穩(wěn)定性和重復(fù)性進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果見圖2。由圖2可見,檢測(cè)氨基酸及其衍生物在QC樣本中相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差小于30%,說明實(shí)驗(yàn)過程儀器系統(tǒng)穩(wěn)定、數(shù)據(jù)可靠。
3 小結(jié)與討論
氨基酸對(duì)于維持細(xì)菌正常的生理功能至關(guān)重要,氨基酸代謝的異常對(duì)細(xì)菌的適應(yīng)性、耐藥性及致病性影響重大[5]。細(xì)菌在宿主體內(nèi)對(duì)酸性環(huán)境的耐受性與存活、定殖、感染、組織炎癥反應(yīng)密切相關(guān),而精氨酸代謝途徑通過產(chǎn)生氨來增強(qiáng)細(xì)菌對(duì)酸性環(huán)境的適應(yīng)性,并且已有文獻(xiàn)證實(shí)精氨酸代謝途徑與細(xì)菌的致病性有關(guān)[6-8]。Khoury 等[9]研究發(fā)現(xiàn),在補(bǔ)充谷氨酰胺以后,肺炎鏈球菌在青霉素作用下的存活率提高,表明谷氨酰胺降低了細(xì)菌對(duì)青霉素的敏感性。豬鏈球菌是一種人畜共患病原菌,根據(jù)莢膜多糖的差異,可分為33個(gè)血清型,其中2型是毒力最強(qiáng)的優(yōu)勢(shì)血清型[10],然而豬鏈球菌2型的氨基酸代謝研究尚未見有人涉及。本研究采用靶向氨基酸代謝組學(xué)技術(shù),分析了tRNA修飾酶GidA對(duì)豬鏈球菌氨基酸代謝譜的影響,篩選到精氨酸、天冬酰胺等顯著改變的氨基酸,揭示了GidA調(diào)控氨基酸代謝的規(guī)律,為豬鏈球菌致病性的解析以及防控提供了理論依據(jù)。
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