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基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析乳腺癌中TERT相關(guān)分子網(wǎng)絡(luò)機(jī)制

2021-10-15 09:28陳運(yùn)景何貴省蘇亞靜吳燦章敬波吳煌福
海南醫(yī)學(xué) 2021年19期
關(guān)鍵詞:共表達(dá)生存率乳腺癌

陳運(yùn)景,何貴省,蘇亞靜,吳燦章,敬波,吳煌福

1.海南醫(yī)學(xué)院研究生院,海南 ???570100;

2.海南醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院乳甲外科,海南 海口 570100

乳腺癌是全球女性最常見(jiàn)、死亡率最高的惡性腫瘤,據(jù)2018 年GLDBOCAN (全球癌癥流行病學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù))估計(jì)全球癌癥發(fā)病率和死亡率顯示:女性乳腺癌發(fā)病率為11.55% (2 088 849/18 078 957)、僅次于肺癌發(fā)病率的11.58% (2093 876/18 078 957)[1-2]。已有研究分析表明,在未來(lái)10 年中,中國(guó)乳腺癌(breast cancer,BC)的發(fā)病率和死亡率將繼續(xù)上升[3]。隨著醫(yī)療技術(shù)和癌癥細(xì)胞分子技術(shù)發(fā)展,可手術(shù)治療的乳腺癌患者在手術(shù)切除腫瘤后,通過(guò)基因測(cè)序、候選突變基因來(lái)選擇術(shù)后的輔助治療,如化學(xué)治療、雌激素受體調(diào)節(jié)劑、雌激素受體拮抗劑,免疫抑制劑、靶向治療、放療等,乳腺癌患者生存率得到提高。但由于腫瘤原因多樣、發(fā)病機(jī)制尚未明確、生物學(xué)侵襲性、病理和分子水平上的異質(zhì)性,大部分乳腺癌患者因遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和相關(guān)并發(fā)癥而死亡,尤其是老年患者[2,4]。眾所周知,乳腺癌是一種全身性疾病,以綜合治療為主;乳腺癌的發(fā)病機(jī)制分子研究已成為國(guó)內(nèi)外研究的主要焦點(diǎn)之一,因此對(duì)乳腺癌發(fā)生、發(fā)展的機(jī)制研究,為臨床治療乳腺癌惡性腫瘤的藥物研究提供方向,為乳腺癌患者個(gè)體化治療及靶向治療提供依據(jù)。近年來(lái),隨著分子生物學(xué)和靶向藥物的發(fā)現(xiàn),藥物的應(yīng)用,極大地提高了乳腺癌患者的生存時(shí)間[5],但部分患者的腫瘤診斷如年齡大、分期高、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、分級(jí)高等對(duì)預(yù)后不良有顯著影響[6]。因此,通過(guò)分子生物學(xué)信息分析了解乳腺癌相關(guān)基因表達(dá),探索致病分子機(jī)制意義重大。

近年來(lái),許多研究表明,乳腺癌的發(fā)生及進(jìn)展是一個(gè)多因素、多階段、多基因共同參與的變化過(guò)程,其中易感基因突變是乳腺癌發(fā)生發(fā)展重要機(jī)制之一[7]。全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)已經(jīng)證明染色體5P15.33上的TERT-CLDTMIL 區(qū)域是一個(gè)乳腺癌易感基因位點(diǎn)[8],對(duì)于乳腺癌相關(guān)TERT (telomerase reverse transcriptase 端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶)基因的研究已成為當(dāng)前科研熱點(diǎn)。TERT 為端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶,是端粒酶中具有生物活性作用的催化亞基,對(duì)端粒酶維持端粒長(zhǎng)度起重要作用,導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞無(wú)限生長(zhǎng)[9]。研究表明,TERT高表達(dá)與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展相關(guān),并且與惡性腫瘤的預(yù)后不良有關(guān),下調(diào)TERT 表達(dá)則抑制腫瘤的發(fā)展[10]。研究顯示,TERT啟動(dòng)子突變導(dǎo)致TERT基因表達(dá)上調(diào)及基因多態(tài)性與前列腺癌預(yù)后不良及侵襲性有關(guān)[11-12],因此,TERT 基因啟動(dòng)子突變可能成為前列腺癌診斷和預(yù)后的生物學(xué)標(biāo)志物。但TERT基因在乳腺癌中的生物學(xué)功能及潛在機(jī)制研究尚少。

人類(lèi)癌癥基因組圖譜(human Cancer Genome Atlas TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)廣泛的單個(gè)癌基因癥類(lèi)型的基因組數(shù)據(jù),保存包括基因表達(dá)數(shù)據(jù)、miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)、拷貝數(shù)變異、DNA甲基化、SNP等數(shù)據(jù),為科學(xué)研究人員提供了大量、全面的腫瘤基因組和表觀遺傳學(xué)特征數(shù)據(jù),識(shí)別及綜合分析癌癥基因組數(shù)據(jù)和基因組與臨床數(shù)據(jù)的關(guān)系及與腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展的相關(guān)[13-15]。

總之,TERT 表達(dá)在惡性腫瘤中起到促癌基因作用;目前TERT基因在乳腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用研究尚少,具體發(fā)病機(jī)制未明。本研究通過(guò)下載TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)乳腺癌中miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床特征數(shù)據(jù),分析TERT在乳腺癌中的作用及致病機(jī)制。

1 材料與方法

1.1 數(shù)據(jù)下載及整理從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載乳腺癌的miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)以及臨床資料,共收集1 222份癌標(biāo)本;其中正常標(biāo)本113份,乳腺癌腫瘤標(biāo)本1 109份。將下載的基因表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床資料數(shù)據(jù)文件解壓成文本文件,利用R軟件程序?qū)?shù)據(jù)整理為可處理的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù),包括基因名稱(chēng)(Ensembl ID,ensemble 格式名稱(chēng))和基因表達(dá)矩陣文件、臨床數(shù)據(jù)。在ensembl官網(wǎng)(http://asia.ensemble.org/index)中下載人類(lèi)基因注釋文件,在R語(yǔ)言程序中將基因Ensemble ID轉(zhuǎn)化成為Gene ID,以進(jìn)一步分析。

1.2 TERT 表達(dá)差異分析利用R 軟件包對(duì)下載的mRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合和標(biāo)準(zhǔn)化處理,提取TERT 基因,利用R stats 包Wilcox.test 函數(shù)Wilcoxon秩和檢驗(yàn)對(duì)TERT基因表達(dá)量數(shù)據(jù)在正常和腫瘤分組樣本下做差異分析。

1.3 TERT表達(dá)與臨床病理相關(guān)性分析及生存分析將乳腺癌患者中TERT 表達(dá)量水平的中位值分為T(mén)ERT 高表達(dá)組與TERT 低表達(dá)組,聯(lián)合臨床資料,使用R 軟件中survival 包進(jìn)行生存分析(Kaplan-Meier法),分析乳腺癌中該基因表達(dá)量高與患者生存率的關(guān)系。為了研究不同的臨床特征(年齡、分級(jí)、TNM 分期等)和TERT基因表達(dá)與乳腺癌患者預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,使用coxph 函數(shù)進(jìn)行COX 單、多因素回歸分析,并統(tǒng)計(jì)P值和HR (風(fēng)險(xiǎn)比)。在COX多因素分析基礎(chǔ)上通過(guò)R軟件中的nomogram函數(shù)建立預(yù)測(cè)生存率的列線圖,用Kaplan Meier 生存曲線建立對(duì)列線圖的預(yù)測(cè)能力進(jìn)行驗(yàn)證。

1.4 TERT 共表達(dá)分析分析TERT 基因的共表達(dá)情況,其中相關(guān)性系數(shù)過(guò)濾條件為0.4,P 值為0.001。 篩選與TERT表達(dá)顯著的75個(gè)基因,用“corrplot”、“circlize”包繪制TERT相關(guān)性分析圈圖。

1.5 TERT表達(dá)與腫瘤微環(huán)境及免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)性分析使用CIBERSORT 算法[17]對(duì)不同亞組的乳腺癌患者RNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,用來(lái)推斷22種免疫浸潤(rùn)細(xì)胞的相對(duì)比例,并對(duì)基因表達(dá)量以及免疫細(xì)胞含量進(jìn)行Spearman 相關(guān)性分析。P<0.05 被認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

1.6 TERT表達(dá)與藥物敏感性分析基于最大的藥物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(GDSC 癌癥藥物敏感性基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),https://www.cancerrxgene.org/)[18],使用R 軟件包“pRRophetic”來(lái)預(yù)測(cè)每個(gè)腫瘤樣本的化療敏感性;用回歸的方法得到每種特定化療藥物治療的IC50估計(jì)值,并用GDSC訓(xùn)練集進(jìn)行10次交叉驗(yàn)證檢驗(yàn)回歸和預(yù)測(cè)精度。所有參數(shù)都選擇了默認(rèn)值,包括去除批處理效應(yīng)的“combat”以及取重復(fù)基因表達(dá)的平均值。

1.7 GSEA 通路富集分析GSEA 分析[19]使用預(yù)先定義的基因集,將基因按照在腫瘤樣本和正常樣本中表達(dá)水平的高低進(jìn)行排序,然后檢驗(yàn)該基因集合是否富集在這個(gè)排序表的頂端或者底端。本研究通過(guò)GSEA比較預(yù)先定義的基因集的高風(fēng)險(xiǎn)組及低風(fēng)險(xiǎn)組的信號(hào)通路差異情況,探討兩組患者預(yù)后差異的可能分子機(jī)制,其中置換次數(shù)設(shè)置為1 000,置換類(lèi)型設(shè)置為phenotype。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法TERT 基因在正常樣本和腫瘤樣本的差異分析使用秩和檢驗(yàn),TERT 表達(dá)的乳腺癌患者的生存分析和驗(yàn)證回歸模型使用χ2檢驗(yàn)和Kaplan Meier 檢驗(yàn);利用Cox 比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型進(jìn)行單因素及多因素分析。所有統(tǒng)計(jì)分析均用R 語(yǔ)言(3.6版)進(jìn)行。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè),以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 TERT基因在正常組織與乳腺癌腫瘤組織中的差異性表達(dá)TCGA 乳腺癌數(shù)據(jù)集分析顯示TERT在乳腺癌樣本中的表達(dá)量高于正常樣本,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)圖1?;谌橄侔┗颊咝詣e、腫瘤分期及淋巴結(jié)亞組中分析,與正常組織樣本相比,TERT 基因在乳腺癌樣本中表達(dá)顯著上調(diào),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)圖2。

圖1 TCGA 乳腺癌數(shù)據(jù)集中TERT 在乳腺正常組織和乳腺癌組織中的表達(dá)差異

圖2 不同性別和腫瘤分期乳腺癌患者的TERT表達(dá)水平

2.2 高表達(dá)TERT 基因乳腺癌患者的生存率降低基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)及Prognoscan數(shù)據(jù)庫(kù)雙重驗(yàn)證TERT 基因表達(dá)量對(duì)乳腺癌患者生存率的影響,以TERT 表達(dá)水平中位值為分界點(diǎn)分為高低兩組,結(jié)果表明TERT高低表達(dá)水平兩組的生存率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)圖3A。取TERT 表達(dá)水平的最大選擇秩統(tǒng)計(jì)量分為高低兩組,結(jié)果表明TERT 表達(dá)高低兩組的生存率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05,圖3B)。用Prognoscan在線數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)基因表達(dá)綜合(GEO)數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗(yàn)證TERT基因不同表達(dá)量對(duì)乳腺癌患者的生存影響,其中三個(gè)TERT 表達(dá)量分組下生存狀態(tài)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,數(shù)據(jù)集分別為GSE1379 (P<0.05)、GSE11121 (P<0.05)、GSE12276 (P<0.05),見(jiàn)圖4。

圖3 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)TERT基因表達(dá)與乳腺癌患者生存率的關(guān)系

圖4 GEO乳腺癌數(shù)據(jù)集中TERT基因在乳腺癌組織和正常組織中的差異表達(dá)

2.3 臨床特征和高表達(dá)TERT 對(duì)乳腺癌患者預(yù)后的影響Cox 單因素、多因素回歸分析,如表1 所示,單因素Cox分析結(jié)果表明,臨床特征如年齡(HR=1.03,P<0.05)、腫瘤分期(HR=2.1,P<0.05)、浸潤(rùn)深度(HR=1.5,P<0.05)、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(HR=6.4,P<0.05)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(HR=1.7,P<0.05)與乳腺癌患者總生存期相關(guān),而TERT表達(dá)(HR=1.2,P<0.05)與總生存期無(wú)相關(guān)性。多因素Cox分析結(jié)果提示年齡(HR=1.03,P<0.05) 和TERT表達(dá)量(HR=1.474,P<0.05)與乳腺癌患者總生存期相關(guān)。因此,單因素分析提示TERT 表達(dá)對(duì)患者生存期無(wú)相關(guān),但多因素Cox 分析提示有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,可能TERT 表達(dá)對(duì)患者生存期影響受到其他因素的影響,表明年齡與TERT 基因?yàn)槿橄侔┆?dú)立預(yù)后因素,可能成為重要的預(yù)后標(biāo)志物。在Cox多因素回歸分析的基礎(chǔ)上,將臨床特征如年齡、腫瘤分期、TNM分期和TERT 基因表達(dá)量通過(guò)nomogram 函數(shù)建立一個(gè)列線圖(圖5),對(duì)臨床特征和TERT 表達(dá)量進(jìn)行評(píng)分,將各分值進(jìn)行相加,得到總分,然后再根據(jù)總分來(lái)預(yù)測(cè)TERT 基因表達(dá)乳腺癌中的5 年和8 年生存率,對(duì)臨床治療和預(yù)測(cè)乳腺癌患者的預(yù)后提供理想模型。為了驗(yàn)證列線圖對(duì)乳腺癌患者生存率的預(yù)測(cè)能力,使用Kaplan Meier 曲線建立預(yù)測(cè)校準(zhǔn)曲線圖,結(jié)果顯示如圖6 所示,5 年生存率和8 年生存率的預(yù)測(cè)校準(zhǔn)曲線在標(biāo)準(zhǔn)曲線附近,表明列線圖的預(yù)測(cè)能力良好。

表1 Cox 單因素、多因素分析TERT 表達(dá)與臨床特征對(duì)乳腺癌患者預(yù)后的影響

圖5 基于臨床特征和TERT 基因構(gòu)建的乳腺癌患者預(yù)測(cè)5 年和8 年生存率的列線圖

圖6 標(biāo)準(zhǔn)曲線圖

2.4 乳腺癌中TERT 的共表達(dá)基因及調(diào)控分子進(jìn)一步根據(jù)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中乳腺癌患者的表達(dá)譜,通過(guò)相關(guān)性分析來(lái)探討乳腺癌中TERT 基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。共篩選出75個(gè)與TERT表達(dá)顯著相關(guān)的基因,其中相關(guān)性系數(shù)正/負(fù)相關(guān)TOP 5基因熱圖(圖7A)所示,與TERT表達(dá)正相關(guān)絕對(duì)值最大的前5個(gè)基因如CNPY1、FSD1、HMGB1P1、ALKAL1、GF1B,與TERT表達(dá)負(fù)相關(guān)絕對(duì)值最大的前5 個(gè)基因如MCM5、DERA、CACNA1G-AS1、AC004858.1、SLCTA14。 以及共表達(dá)相關(guān)性圈圖如圖所示(圖7B)。LinkedOmics數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)一步探討與TERT潛在調(diào)控的miRNA,結(jié)果如圖所示(圖8)。其中正相關(guān)前五個(gè)miRNA 為hsa-mir-337、hsa-mir-10b、hsa-mir-1245、hsa-mir-199a-1、hsa-mir-377,負(fù)相關(guān)前五個(gè)為:hsa-mir-106b、hsa-mir-550a-2、hsa-mir-92a-2、hsa-mir-1307、hsa-mir-18a。

圖7 乳腺癌中TERT基因的共表達(dá)基因

圖8 LinkedOmics數(shù)據(jù)庫(kù)中TERT潛在調(diào)控的miRNA相關(guān)性分析

2.5 TERT 表達(dá)量與腫瘤微環(huán)境及免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)性腫瘤微環(huán)境主要由腫瘤相關(guān)成纖維細(xì)胞、免疫細(xì)胞、細(xì)胞外基質(zhì)、多種生長(zhǎng)因子、炎癥因子及特殊的理化特征和癌細(xì)胞自身等共同組成,腫瘤微環(huán)境顯著影響著腫瘤的診斷、生存結(jié)局和臨床治療敏感性。通過(guò)分析在TCGA 數(shù)據(jù)集中核心基因與腫瘤免疫浸潤(rùn)的關(guān)系,進(jìn)一步探討核心基因影響乳腺癌進(jìn)展的潛在分子機(jī)制。使用CIBERSORT 算法和Spearman 相關(guān)性分析,分析TERT 與腫瘤微環(huán)境的相關(guān)性。研究結(jié)果表明,TERT與T cells CD4 memory activated、Macrophages M0、Macrophages M1顯著正相關(guān),與Mast cells resting、T cells CD4 memory resting 顯著負(fù)相關(guān)(圖9A);TERT 與Mast cells resting 的線性關(guān)系如圖所示(圖9B)。

圖9 乳腺癌中TERT基因與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)性

2.6 TERT 基因的GSEA 通路富集分析接下來(lái)研究TERT 基因涉及的具體信號(hào)通路,探討TERT 影響腫瘤進(jìn)展的潛在分子機(jī)制。GSEA 結(jié)果表明,TERT 可富集Mismatch repair、Primary immunodeficiency、RNA polymerase 信號(hào)通路(圖10),提示TERT可能通過(guò)免疫途徑影響乳腺癌進(jìn)展。

圖10 乳腺癌TERT基因的Gsea通路富集分析

2.7 乳腺癌患者TERT 表達(dá)與藥物敏感性分析早期乳腺癌進(jìn)行手術(shù)治療結(jié)合化療、靶向治療效果明確。研究基于GDSC 數(shù)據(jù)庫(kù)的藥物敏感性數(shù)據(jù),通過(guò)R 包“pRRophetic”來(lái)預(yù)測(cè)腫瘤樣本的化療敏感性,進(jìn)一步探討核心基因與常見(jiàn)藥物的敏感性。研究結(jié)果如圖11 所示,TERT 的表達(dá)與患者 對(duì)Imatinib ( 伊馬替尼)、Cisplatin ( 順鉑)、Gefitinib ( 吉非替尼)、Dasatinib ( 達(dá)沙替尼)、Erlotinib(埃羅替尼)以及Gemcitabine (吉西他濱)的敏感性相關(guān)(P<0.05)。

圖11 乳腺癌TERT基因與藥物的敏感性分析

3 討論

乳腺癌是全球女性最常見(jiàn)、死亡率最高的惡性腫瘤,因此研究乳腺癌的發(fā)病機(jī)制及預(yù)后生物分子是必要的,目前研究表明,TERT基因表達(dá)與與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展顯著相關(guān)及預(yù)后不良有關(guān)[20]。在甲狀腺癌中,研究發(fā)現(xiàn)TERT基因表達(dá)上調(diào)與TERT擴(kuò)增及TERT啟動(dòng)子突變有關(guān),并且與甲狀腺不良預(yù)后有關(guān)[21]。在尿路上皮癌、子宮頸癌、頭頸癌中,也研究表明TERT 表達(dá)上調(diào)與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)[22-24]。但TERT基因表達(dá)在乳腺癌中研究較少,發(fā)病機(jī)制尚未清楚。近年來(lái),隨著分子診斷技術(shù)和科技發(fā)展,利用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)分析乳腺癌中預(yù)后的標(biāo)志物及致病機(jī)制,為預(yù)測(cè)乳腺癌患者預(yù)后及研究致病分子機(jī)制和治療提供新思路。

在這項(xiàng)研究中,基于TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)[16]中的乳腺癌數(shù)據(jù)集對(duì)TERT基因在乳腺癌中的表達(dá)進(jìn)行了全面和詳細(xì)的評(píng)估,結(jié)果表明TERT 基因在腫瘤組織及正常組織中表達(dá)的差異,研究發(fā)現(xiàn),TERT基因在乳腺癌樣本中表達(dá)顯著升高,并且TERT高表達(dá)乳腺癌患者,其生存期較短。被證實(shí)是乳腺癌的獨(dú)立預(yù)后因子[26-27]。

共表達(dá)基因是大量功能相關(guān)的基因在相關(guān)一組條件下有非常相似的表達(dá)譜,如被共同的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的基因、產(chǎn)物構(gòu)成同一蛋白復(fù)合體、參與相同的調(diào)控通路等。因此這些共表達(dá)基因在生物學(xué)上具有相似的功能。通過(guò)基因共表達(dá)分析來(lái)預(yù)測(cè)其共表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)TERT基因表達(dá)與CNPY1、FSD1、HMGB1P1、ALKAL1、GF1B 共同促進(jìn)乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展,其中有研究表明ALKAL1 通過(guò)激活SHH 信號(hào)通路參與大腸癌的遷徙和侵襲[28]。但FSD1 低表達(dá)可促進(jìn)愛(ài)因斯坦- 巴爾病毒(EBV) 相關(guān)胃癌的進(jìn)展[29]。 CNPY1、HMGB1P1、GF1B 等在腫瘤中的生物學(xué)功能鮮有研究。分析與TERT基因上調(diào)抑制MCM5、DERA、CACNA1G-AS1、AC004858.1、SLCTA14基因的表達(dá)參與了乳腺癌的侵襲,其中已有研究發(fā)現(xiàn)下調(diào)MCM5表達(dá)水平通過(guò)減少了處于G2期的細(xì)胞增殖來(lái)抑制乳腺癌的增殖及轉(zhuǎn)移[30]。這與此項(xiàng)研究不一致。需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。通過(guò)LinkedOmics數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)一步預(yù)測(cè)可能調(diào)控TERT 基因的分子,得出交集的miRNA:hsa-mir-337、hsa-mir-10b、hsa-mir-1245、hsa-mir-199a-1、hsa-mir-377,其中hsa-mir-10b 已經(jīng)被證實(shí)和TERT 啟動(dòng)子突變與神經(jīng)膠質(zhì)瘤預(yù)后不良有關(guān)[31]。通過(guò)相關(guān)性分析基因共表達(dá)基因和潛在調(diào)控分子,可以為T(mén)ERT 可能參與分子機(jī)制研究提供實(shí)驗(yàn)方向及理論基礎(chǔ)。這對(duì)于展望目前乳腺癌治療的進(jìn)步應(yīng)該是非常有意義的,可能會(huì)發(fā)現(xiàn)潛在的生物標(biāo)志物或預(yù)后決定因素的靶點(diǎn)。

腫瘤細(xì)胞的組織微環(huán)境對(duì)腫瘤的發(fā)展起著至關(guān)重要的作用。腫瘤微環(huán)境顯著影響著腫瘤的診斷、生存結(jié)局和臨床治療敏感性。通過(guò)分析在TCGA 數(shù)據(jù)集中核心基因與腫瘤免疫浸潤(rùn)的關(guān)系及核心基因影響乳腺癌進(jìn)展的潛在分子機(jī)制。研究結(jié)果表明,TERT與M0 型巨噬細(xì)胞、記憶激活的CD4 T 細(xì)胞、M1 型巨噬細(xì)胞)顯著正相關(guān),與靜息的肥大細(xì)胞、靜息的記憶CD4 T 細(xì)胞)顯著負(fù)相關(guān)。有研究發(fā)現(xiàn)三陰性乳腺癌患者的細(xì)胞毒性和記憶性T 細(xì)胞顯著減少,而調(diào)節(jié)性T細(xì)胞和凋亡T細(xì)胞顯著增加。腫瘤浸潤(rùn)有極化調(diào)節(jié)性T細(xì)胞提示三陰性乳腺癌患者的免疫抑制微環(huán)境和預(yù)后較差,認(rèn)為腫瘤浸潤(rùn)極化調(diào)節(jié)性T 細(xì)胞提示免疫抑制微環(huán)境和三陰性乳腺癌患者預(yù)后較差[32]。研究發(fā)現(xiàn)記憶CD4+T 細(xì)胞誘由淋巴結(jié)中激活的單核/巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的,作用于特定腫瘤細(xì)胞,從而起到抗腫瘤免疫作用,而且miR-18a 通過(guò)抑制CD4+T 細(xì)胞的增殖和增加活化誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡[33-34]。

TERT 基因表達(dá)是乳腺癌疾病進(jìn)展及預(yù)后的分子,并且早期乳腺癌手術(shù)治療、化療、靶向治療效果明確。因此,進(jìn)一步探討核心基因與常見(jiàn)化療藥物的敏感性。研究結(jié)果表明,TERT 的高表達(dá)乳腺癌患者對(duì)伊馬替尼、順鉑、吉非替尼、達(dá)沙替尼、埃羅替尼以及吉西他濱等藥物敏感性高。但低表達(dá)hTERT 抑制通過(guò)改變白血病腫瘤細(xì)胞周期導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞衰老來(lái)增強(qiáng)伊馬替尼[35],并且上調(diào)hTERT端粒酶活性增加伊馬替尼對(duì)白血病的耐藥性[36]。順鉑在抗腫瘤藥物中是屬于鉑類(lèi)藥物,在腫瘤細(xì)胞中可抑制其DNA復(fù)制來(lái)達(dá)到抗腫瘤作用,有較強(qiáng)的廣譜抗癌作用。順鉑也可以與其他抗腫瘤藥聯(lián)合用藥,如順鉑聯(lián)合紫衫類(lèi)藥物治療頭頸鱗狀細(xì)胞癌[37]及間變性甲狀腺癌[38]。吉西他賓為胞密啶類(lèi)抗腫瘤藥。研究表明,吉西他賓與hTERT抑制劑聯(lián)合用藥可增加抗腫瘤活性[39]。吉非替尼是一種選擇性表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)洛氨酸激酶抑制劑。研究表明吉非替尼通過(guò)EGFR 誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞hTERT 下調(diào),使乳腺癌細(xì)胞端粒酶活性喪失,使腫瘤細(xì)胞失活[40-41]。

綜上所述,TERT在乳腺癌中異常上調(diào),其過(guò)表達(dá)提示這患者預(yù)后差及腫瘤的惡性發(fā)展,并且主要參與了錯(cuò)配修復(fù)、原發(fā)性免疫缺陷、RNA 聚合酶信號(hào)通路的調(diào)控。TERT 基因是乳腺癌治療的新型靶點(diǎn),與多種化療藥物、靶向治療藥物敏感性相關(guān)。

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