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本氏煙轉(zhuǎn)錄因子bZIP60多克隆抗血清的制備及其應(yīng)用

2021-09-26 07:30張浩莊新建郭梟徐紅梅賀振張坤
中國(guó)煙草學(xué)報(bào) 2021年4期
關(guān)鍵詞:原核電泳內(nèi)質(zhì)網(wǎng)

張浩,莊新建,郭梟,徐紅梅,賀振,張坤

揚(yáng)州大學(xué)園藝與植物保護(hù)學(xué)院,江蘇揚(yáng)州文昌中路567號(hào),225000

內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(Endoplasmic reticulum,ER)是植物細(xì)胞重要的具備膜和管道系統(tǒng)的細(xì)胞器,是分泌蛋白、膜蛋白合成、糖基化修飾的場(chǎng)所[1]。ER具有極強(qiáng)的內(nèi)穩(wěn)態(tài),但仍然有很多因素(病毒和細(xì)菌侵入等)導(dǎo)致內(nèi)穩(wěn)態(tài)失衡,未折疊或錯(cuò)折疊蛋白蓄積,膜雙層結(jié)構(gòu)組成紊亂,進(jìn)而引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激(ER stresses)[2]。當(dāng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白的折疊受到逆境等因素干擾時(shí),未折疊蛋白和錯(cuò)誤折疊蛋白就會(huì)大量積累,細(xì)胞就會(huì)啟動(dòng)一種非常保守的機(jī)制——未折疊蛋白應(yīng)答(Unfolded Protein Response,UPR)通路激活[3]。植物細(xì)胞主要通過(guò)兩條通路來(lái)感受和傳導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力,其中一條通路由S1P/S2P-bZIP17/bZIP28介導(dǎo),而另一條通路由IRE1-bZIP60mRNA介導(dǎo)[4]。

NbbZIP60是一個(gè)含有跨膜結(jié)構(gòu)域且定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的轉(zhuǎn)錄因子,而NbIRE1則是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)I型跨膜蛋白,在細(xì)胞質(zhì)側(cè)有激酶和RNase結(jié)構(gòu)域[5]。在正常情況下,NbbZIP60蛋白能定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上;bZIP60轉(zhuǎn)錄的初級(jí)轉(zhuǎn)錄物(pri-mRNA) 具有保守的莖環(huán)結(jié)構(gòu),在逆境脅迫(如高溫,病原菌侵染等)下,該結(jié)構(gòu)能被定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的IRE1剪接,而產(chǎn)生閱讀框移碼,從而編碼不含跨膜結(jié)構(gòu)域,但攜帶有核定位信號(hào)的NbbZIP60成熟蛋白。該蛋白在核轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合物的作用下能被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核內(nèi),從而啟動(dòng)下游分子伴侶基因的轉(zhuǎn)錄[6]。在沉默bZIP60時(shí), 普通煙(Nicotiana attenuata)更易感煙草赤星?。ˋlternaria alternata);在TuMV侵染擬南芥(Arabidopsis)時(shí)能顯著誘導(dǎo)bZIP60的剪切[7];在沉默NbbZIP60時(shí),馬鈴薯X病毒(potato virus X,PVX)更易擴(kuò)散到本氏煙(Nicotiana benthamiana)的上部葉;IRE1-bZIP60可以限制PVX在本氏煙中的侵染[8]。

鑒于本氏煙作為研究植物病毒的模式植物,本研究擬克隆本氏煙bZIP60基因,通過(guò)原核表達(dá)純化NbbZIP60重組蛋白并制備其特異性抗血清,制備的bZIP60抗體可以檢測(cè)DTT噴施過(guò)的本氏煙中bZIP60蛋白的表達(dá),對(duì)bZIP60蛋白剪切與非剪切兩種形式蛋白的定量能直接反應(yīng)本氏煙UPR反應(yīng)激活的強(qiáng)度。后續(xù)在病毒侵染本氏煙的條件下對(duì)UPR進(jìn)行研究時(shí),可以對(duì)本氏煙bZIP60蛋白的表達(dá)進(jìn)行檢測(cè),為探索bZIP60的相關(guān)功能和作用機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

原核表達(dá)載體pET28(+)a、大腸桿菌DH5α菌株、BL21菌株來(lái)自中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)李大偉教授的饋贈(zèng);pMD19-T質(zhì)粒、RTase M-MLV、5 × M-MLV Buffer、dNTP Mixture、RNase Inhibitor 、Nco I限制性內(nèi)切酶、Xho I 限制性內(nèi)切酶等購(gòu)自于寶生物工程(大連)有限公司;FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit試劑盒,2 × Taq Master Mix、180 kDa Protein Marker、RNA-easyTM Isolation Reagent Kit購(gòu)自于南京諾唯贊生物科技有限公司;Ni -NTA 親和層析介質(zhì)購(gòu)自南京金斯瑞生物科技有限公司;PMSF、DTT購(gòu)自上海生工生物工程股份有限公司;IPTG購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司。NbbZIP60多克隆抗血清由揚(yáng)州大學(xué)植物病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室保存。本氏煙(Nicotiana benthamiana)培育在揚(yáng)州大學(xué)植物病毒學(xué)恒溫室;生長(zhǎng)條件為在(24 ± 1)℃,光周期為 16/8 h,其中16 h四級(jí)光照,8 h黑暗處理。

1.2 NbbZIP60基因擴(kuò)增及原核表達(dá)載體構(gòu)建

登錄本氏煙數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站(https://solgenomics.net/tools/blast)查詢并獲得可能的NbZIP60基因序列,按照獲得的本氏煙bZIP60基因合成引物bZIP60-Nco I/F: 5’-CATGCCATGGNcoITTGGATGACATCGATGATATCG-3’ ,bZIP60-Xho I/R:5’-CCGCTCGAGXhoIAGACTCCTGC-TTGGTCAT ACAAG-3’;按照RNA-easyTM Isolation Reagent Kit說(shuō)明書(shū)的方法來(lái)提取本氏煙葉片的總RNA。以提取的本氏煙葉片總RNA為模板,bZIP60-Xho I/R作為引物,使用逆轉(zhuǎn)錄酶M-MLV,于42℃條件下合成cDNA;用上述合成的cDNA為模板,按設(shè)計(jì)的正反引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增本氏煙的bZIP60基因。PCR產(chǎn)物經(jīng)1% 瓊脂糖凝膠電泳分離并回收純化,用Nco I和Xho I對(duì)純化片段與載體進(jìn)行酶切反應(yīng),隨后于16℃連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α。經(jīng)菌落PCR 驗(yàn)證陽(yáng)性克隆后并測(cè)序,從中選擇測(cè)序結(jié)果正確的克隆進(jìn)行后續(xù)的研究,并將該質(zhì)粒命名為pET28a-bZIP60。

1.3 蛋白表達(dá)和SDS-PAGE分析

將pET28a-bZIP60質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),挑取單菌落接種于5 mL含卡那霉素(100 μg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜?;罨喊?:100加入50 mL含卡那霉素(100 μg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至OD600為0.6。分別在28℃和37℃下進(jìn)行誘導(dǎo),每個(gè)溫度取2管,其中一管加IPTG至終濃度為1 mmol/L,誘導(dǎo)培養(yǎng)4 h。取2 mL誘導(dǎo)培養(yǎng)物,12 000 rpm離心30 s收集菌體。加入100 μL SDS-PAGE Loading Buffer,沸水煮10 min,12 000 rpm離心10 min。取5 μL上清進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè)。電泳結(jié)束后,通過(guò)考馬斯亮藍(lán)R-250對(duì)凝膠進(jìn)行染色,檢測(cè)分析融合蛋白的表達(dá)情況。

1.4 NbbZIP60蛋白的Ni柱純化

通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定蛋白表達(dá)后,在1 L液體LB培養(yǎng)基中按1:100加入10 mL活化菌液,37℃培養(yǎng)至OD600為0.6,用1 mmol/L IPTG于18℃誘導(dǎo)18 h。然后離心收集菌體,用40 mL含20 mmol/L Tris-HCl (pH 7.0)、500 mmol/L NaCl、10%甘油的蛋白buffer重懸,加蛋白酶抑制劑PMSF至終濃度為1 mmol/L,超聲波破碎,離心收集上清和沉淀備用。上清用High Affinity Ni-NTA Resin進(jìn)行純化。取5 mL High Affinity Ni-NTA Resin過(guò)5倍柱體積蛋白buffer,上清過(guò)柱子5遍,之后分別用10 mL含40 mmol/L、60 mmol/L、80 mmol/L、100 mmol/L、200 mmol/L、300 mmol/L咪唑的蛋白緩沖液進(jìn)行洗脫,取上清、沉淀、穿柱液以及各濃度的洗脫液等體積加入SDS-PAGE Loading Buffer,使用SDS-PAGE電泳來(lái)檢測(cè)蛋白的洗脫情況。使用超濾管對(duì)將含靶標(biāo)蛋白的洗脫液進(jìn)行離心濃縮,分裝后液氮速凍,-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.5 NbbZIP60蛋白抗血清的制備

以誘導(dǎo)表達(dá)的特異的NbbZIP60蛋白為抗原,參照張超等[8]的方法,分4次在第1 d、22 d、36 d、50 d免疫新西蘭大白兔, 最后一次注射10 d后,自大白兔頸動(dòng)脈取血,5000 r·m-1離心10 min,經(jīng)過(guò)2次離心后收集 NbbZIP60抗血清30 mL。

1.6 Western blot免疫印跡檢測(cè)

將待檢測(cè)蛋白樣品進(jìn)行SDS- PAGE電泳,將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上;隨即轉(zhuǎn)入10 mL 封閉液 (10 mL TBST緩沖液+0.5 g脫脂奶粉),37℃反應(yīng)1 h;在封閉液中加入1:10000的抗血清,37℃反應(yīng)1 h,隨后使用1×TBST緩沖液洗脫3次,每次10 min;隨后將膜置入含有AP-IgG二抗的TBST緩沖液(1 : 5 000),37℃反應(yīng)45 min;1×TBST洗脫3次,每次10 min;在避光條件下,將膜放至含有165 μg/mL BCIP和330 μg/mL NBT底物的堿性磷酸酯酶緩沖液中顯色至條帶清晰。

1.7 抗血清效價(jià)測(cè)定

提取DTT噴施過(guò)的本氏煙葉片總蛋白,采用Western blot的方法對(duì)NbbZIP60的抗血清進(jìn)行效價(jià)測(cè)定。梯度稀釋NbbZIP60抗血清,稀釋倍數(shù)為1000、2000、5000、8000、10000和20000,測(cè)定其效價(jià)。

1.8 抗血清的靈敏度分析

以DTT噴施過(guò)的本氏煙葉片和原核表達(dá)純化的NbbZIP60為材料,使用Western blot來(lái)對(duì)抗血清的靈敏度進(jìn)行分析。稱取本氏煙葉片0.2 g,組織粉碎研磨后加入200 μL SDS-PAGE Loading Buffer,制備蛋白電泳樣品,即以1:1稀釋樣品。繼續(xù)使用SDSPAGE Loading Buffer來(lái)制備梯度稀釋的電泳樣品,稀釋倍數(shù)依次為5、10、50、100、200、300、500、1000,NbbZIP60特異性抗血清以1:2000 稀釋,進(jìn)行western blot 檢測(cè)。另取已知濃度原核表達(dá)純化的NbbZIP60蛋白,分別取50、40、30、20、10、8、6、4、1 ng蛋白上樣,NbbZIP60抗血清以1:5000稀釋進(jìn)行Western blot檢測(cè)。

2 結(jié)果與分析

2.1 NbbZIP60的誘導(dǎo)表達(dá)、純化

將構(gòu)建成功的原核表達(dá)載體pET28a-bZIP60轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),篩選陽(yáng)性克隆,并經(jīng)過(guò)1 mM的IPTG誘導(dǎo)表達(dá),SDS-PAGE電泳顯示在35 kDa附近位置出現(xiàn)與預(yù)期大小一致的融合蛋白條帶,表明NbbZIP60重組蛋白在大腸桿菌中能正確表達(dá)。剩余菌體經(jīng)蛋白懸浮緩沖液懸浮后,通過(guò)超聲波細(xì)胞破碎儀破碎,將上清和沉淀分別取出,并進(jìn)行SDSPAGE電泳,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示靶標(biāo)融合蛋白主要是以可溶的狀態(tài)存在于破碎后的上清液中(圖2)。選擇陽(yáng)性菌株,經(jīng)過(guò)大量發(fā)酵培養(yǎng)后,在18℃條件下誘導(dǎo)蛋白表達(dá),菌體經(jīng)破碎后,利用Ni-NTA親和層析介質(zhì)對(duì)上清液中的靶標(biāo)蛋白進(jìn)行純化。SDS-PAGE電泳分析表明,在沉淀和上清中都檢測(cè)到NbbZIP60融合蛋白的存在(圖2),說(shuō)明通過(guò)該原核表達(dá)技術(shù)誘導(dǎo)表達(dá)的NbbZIP60融合蛋白是一個(gè)部分可溶性蛋白。進(jìn)一步通過(guò)Ni-NTA親和層析介質(zhì)進(jìn)行NbbZIP60融合蛋白的純化,使用100 mmol/L、300 mmol/L咪唑進(jìn)行洗脫時(shí),與介質(zhì)結(jié)合的非特異性蛋白的量較少,目的蛋白純度相對(duì)較高,使用200 mmol/L的咪唑洗脫時(shí)獲得的蛋白濃度最高。因此,結(jié)果表明利用Ni-NTA親和層析介質(zhì)純化NbbZIP60融合蛋白時(shí),咪唑濃度為200 mmol/L洗脫緩沖液為最佳濃度。

圖1 原核表達(dá)本氏煙 bZIP60蛋白的SDS-PAGE圖Fig.1 SDS-PAGE analysis of NbbZIP60 expression in Escherichia coli

圖2 本氏煙 bZIP60抗血清效價(jià)的檢測(cè)Fig.2 Determination of antibody titer of NbbZIP60

2.2 抗血清效價(jià)的測(cè)定

成功制備了NbbZIP60血清抗體后,通過(guò)Western Blot對(duì)抗血清效價(jià)進(jìn)行測(cè)定。當(dāng)血清抗體稀釋不同濃度時(shí),均能檢測(cè)到目的蛋白(圖3)。通過(guò)Western Blot對(duì)本氏煙進(jìn)行檢測(cè)分析發(fā)現(xiàn),當(dāng)抗血清按比例稀釋到1:20000時(shí),制備的抗血清仍然能夠特異地檢測(cè)到目的蛋白(圖3),說(shuō)明制備的抗血清效價(jià)良好。

圖3 Western blot分析本氏煙 bZIP60抗血清靈敏度圖Fig.3 Sensitivity of NbbZIP60 antiserum determined by Western blot

2.3 抗血清靈敏度的檢測(cè)鑒定

為了分析多克隆抗血清的檢測(cè)靈敏性,分別以本氏煙葉片和原核表達(dá)蛋白為材料,梯度稀釋樣品進(jìn)行Western blot檢測(cè)。當(dāng)抗血清稀釋倍數(shù)為1:2000時(shí),0.2 g本氏煙葉片的總蛋白稀釋500倍后反應(yīng)呈陽(yáng)性(圖4-A),而以1:5000稀釋的抗血清可以檢測(cè)到大約4 ng原核表達(dá)蛋白(圖4-B),說(shuō)明制備的抗血清具有較強(qiáng)的靈敏度。同時(shí),通過(guò)His抗體對(duì)純化的蛋白進(jìn)行檢測(cè)(圖4-C),結(jié)果進(jìn)一步驗(yàn)證了制備的抗血清具有較強(qiáng)的靈敏度。

2.4 Western blot 免疫印跡分析本氏煙總蛋白

為了進(jìn)一步驗(yàn)證制備的抗體是否能夠用于檢測(cè)本氏煙中UPR機(jī)制中bZIP60蛋白,提取本氏煙總蛋白進(jìn)行Western blot檢測(cè)。Western blot結(jié)果顯示,產(chǎn)生了兩條特異性條帶(圖4),表明制備的抗體可以特異地與本氏煙中的bZIP60蛋白結(jié)合,可以檢測(cè)到本氏煙中兩種形式的bZIP60蛋白,為后續(xù)開(kāi)展bZIP60調(diào)控植物防御脅迫的分子機(jī)理提供了研究基礎(chǔ)。

圖4 本氏煙bZIP60抗血清特異性的Western blot 分析Fig.4 Western blot analysis of the specificity of NbbZIP60 antiserum

3 結(jié)論

本研究利用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng),成功表達(dá)可溶性的重組bZIP60蛋白,并制備了高效價(jià)的多克隆抗體,能夠檢測(cè)出本氏煙中表達(dá)的bZIP60蛋白, 為進(jìn)一步研究bZIP60基因在植物發(fā)育和抗逆性中的功能奠定了基礎(chǔ)。

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