段思蒙 肖盟 黃晶晶 王賀, 張戈 張京家 康巍 王瞳 肖玉玲 倪芳 高嵐美 葉麗艷 郭鵬豪 萬喆 陳中舉 楊青 林潔 胡慶豐1 李虹玲1 岳娜1 崔蘭英1 李剛1 范會1 蘇丹虹1 劉麗文 田素飛 趙聲遠 杜雪飛2 周宏偉2 徐英春
[1.中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)院檢驗科,北京 100730;2.“侵襲性真菌病機制研究與精準(zhǔn)診斷”北京市重點實驗室,北京 100730;3. 丹娜(天津)生物科技有限公司,天津 300451;4. 四川大學(xué)華西醫(yī)院,成都 610041;5. 江蘇省人民醫(yī)院(南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院),南京 210029;6. 福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院,福州 350001;7. 解放軍總醫(yī)院,北京 100036; 8. 中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院,廣州 510080;9. 北京大學(xué)第一醫(yī)院,北京 100034;10.華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院附屬同濟醫(yī)院,武漢 4300030;11. 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院,杭州 310003;12. 杭州邵逸夫醫(yī)院,杭州 310016 ;13. 浙江省人民醫(yī)院,杭州 310014;14.中南大學(xué)湘雅醫(yī)院,長沙 410008;15.天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院,天津 300052;16.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院,哈爾濱 150001;17.寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院,銀川 750001;18.山東省立醫(yī)院,濟南 250021;19.廣州醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院,廣州 510120;20.遼寧省人民醫(yī)院,沈陽 110000; 21.中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院,沈陽 110001;22. 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院,上海 200025;23. 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院,哈爾濱 150001;24. 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院,杭州 310052]
侵襲性真菌病是臨床的一類重要疾病,已成為醫(yī)內(nèi)感染的重要部分。隨著易感人群的增加,侵襲性真菌病的發(fā)病率逐年上升,病死率居高不下[1]。最常見的病原菌是以念珠菌為主的酵母菌,其中,白念珠菌最多,其次為光滑念珠菌。中國醫(yī)院侵襲性真菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)(CHIF-NET)是中國首個針對侵襲性真菌病的全國性多中心研究。本研究作為CHIF-NET項目的一部分,收集了中國地區(qū)22家醫(yī)院1619株酵母樣真菌,通過菌種鑒定、體外藥物敏感性等數(shù)據(jù)分析,為侵襲性酵母菌感染的診治提供參考依據(jù)。
1.1 標(biāo)本來源
收集中國醫(yī)院侵襲性真菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)(CHIF-NET)中15個省份22家醫(yī)院2012年度(2011年8月1日—2012年7月31日)門急診及住院患者檢出的侵襲性酵母菌菌株,同時收集菌株相關(guān)的臨床及實驗室信息,包括患者年齡、性別、菌株分離時患者所在的科室(門診、急診、病房,病房細分科室包括內(nèi)科、外科、ICU、其他科室)。侵襲性酵母菌收集的標(biāo)本類型包括外周血、其他部位(包括腹水、膿腫、靜脈導(dǎo)管、腦脊液、肺泡灌洗液、膽汁、胸水、組織、關(guān)節(jié)積液和胃液),剔除同一患者7 d內(nèi)同一部位重復(fù)分離的菌株。
1.2 主要儀器與試劑
梅里?;|(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(VITEK-MS)(法國bioMérieux公司),科瑪嘉顯色培養(yǎng)基 (Chromagar),沙堡弱培養(yǎng)基(sabouraud dextrose agar, SDA,英國Oxoid公司),Mueller-Hinton瓊脂(葡萄糖美蘭MH瓊脂)。氟康唑藥敏紙片(25 μg,Oxiod),伏立康唑藥敏紙片(1 μg,Oxiod),Mueller-Hinton瓊脂(葡萄糖美蘭MH瓊脂)。
1.3 菌種鑒定
凍存菌種送至中心實驗室(北京協(xié)和醫(yī)院)后接種至念珠菌顯色培養(yǎng)基,35℃孵育48 h后取單菌落于沙堡弱培養(yǎng)基(SDA)進行純化孵育,采用Vitek MS進行復(fù)核鑒定, 對于疑難及少見菌株再進行ITS1/ITS4核糖體轉(zhuǎn)錄間區(qū)(rDNA internal transcribed spacer region,ITS)測序分析, 確保菌株鑒定的準(zhǔn)確性。
1.4 體外藥敏試驗
將2%葡萄糖加入BBL Mueller-Hinton Ⅱ型的瓊脂,再加0.5 μg/mL亞甲藍,制備4 mm厚的瓊脂板。將念珠菌落混入生理鹽水制成0.5麥?zhǔn)蠞岫鹊木鷳乙?,用一次性無菌棉拭子蘸取制備好的菌懸液均勻涂抹到瓊脂表面。將氟康唑(25 μg/片)和伏立康唑(1 μg/片)紙片貼于瓊脂表面,35℃孵育24 h。特殊生長緩慢的分離株(如隱球菌屬)需延長培養(yǎng)。使用CLSI M44-A文件推薦的紙片擴散法測定氟康唑和伏立康唑的抑菌圈直徑并根據(jù)CLSI菌種特異性折點對藥敏結(jié)果進行判定。
以白念珠菌ATCC 90028和近平滑念珠菌ATCC 22019作為藥敏質(zhì)量控制菌。根據(jù)CLSI菌種特異性折點對藥敏結(jié)果進行判定,針對白念珠菌、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌和光滑念珠菌采用CLSI M60念珠菌折點分析,對于其他念珠菌仍采用CLSI M44-S3進行分析。光滑念珠菌對于伏立康唑的敏感性根據(jù)流行病學(xué)折點(ECV)進行判定。分離株原始鑒定結(jié)果與復(fù)核鑒定結(jié)果對比中,顯著錯誤(major errors)為菌種鑒定錯誤,非顯著錯誤(minor errors)為正確鑒定到屬,但未鑒定到種或正確鑒定到菌種復(fù)合體。
2.1 侵襲性酵母菌分布情況
CHIF-NET項目2012年度收集的1619個菌株中,白念珠菌整體分離率高達43.48%(見表1)。念珠菌屬中白念珠菌所占比例47.4%,其次為熱帶念珠菌(18.0%)、近平滑念珠菌復(fù)合體(16.2%)、光滑念珠菌復(fù)合體(12.0%)。隱球菌屬中,97.1%為新生隱球菌復(fù)合體,毛孢子菌屬總體少見,其中最長見的仍為阿薩希毛孢子菌(77.8%),具體情況見表2。
表1 1619株酵母菌菌種分布情況
表2 1619株酵母菌樣本分布情況分析
2.2 樣本分布
樣本類型中,血流來源的標(biāo)本類型菌株數(shù)量最多(626株,38.7%),其次為腹水標(biāo)本(354株,21.9%)及膿腫(159株,9.8%)。念珠菌屬在大部分的標(biāo)本類型中最為常見,其中在血流標(biāo)本分離菌株中占94.4%(591株);相比血流中隱球菌僅為3.4%(21株)。念珠菌屬中常見的白念珠菌、熱帶念珠菌、光滑念珠菌等菌種,非血流標(biāo)本比例大于血流標(biāo)本比例(血流標(biāo)本比例:25.0%~41.6%)。相比,近平滑念珠菌復(fù)合體在血流標(biāo)本的比例(154/472)明顯高于非血流標(biāo)本(見表1)。
2.3 患者性別比例、年齡分布
檢出侵襲性酵母菌患者中男性占比一半以上(62.14%),女性患者相對較少(37.80%);年齡范圍0~94歲,其中≥65歲患者498例(30.76%)。
2.4 科室分布
在分離的菌株中,急診患者5.37%(87例),門診患者3.15%(51例),未知病區(qū)患者54例。1427(88.14%)例住院患者中,內(nèi)科檢出24.21%(392例),外科27.24%(441例),ICU29.28%(474例),其他科室(包括兒科、婦產(chǎn)科、皮膚科、五官科、中醫(yī)科病房等)占比較少(共7.41%)。檢出率最高的科室為ICU。
2.5 菌株鑒定復(fù)核情況
CHIF-NET 2012年中所有收集的菌株采用Vitek MS進行鑒定,質(zhì)譜鑒定未出結(jié)果的菌株采用分子測序方法進行進一步鑒定。Vitek MS和ITS測序鑒定發(fā)現(xiàn),復(fù)核鑒定與原始鑒定的一致率為87.28%(1413/1619)。以復(fù)核鑒定的結(jié)果為準(zhǔn),評價項目中各單位常規(guī)方法鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性,其中4株擬平滑念珠菌被錯誤鑒定為近平滑念珠菌,25株熱帶念珠菌被錯誤鑒定為白念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌。錯誤鑒定的菌還有白念珠菌、光滑念珠菌,也包括葡萄牙念珠菌、季也蒙念珠菌、解脂念珠菌等臨床非常見菌株(見表3)。
表3 1619株分離株原始鑒定與復(fù)核鑒定對比
(續(xù)表) %
2.6 體外藥敏試驗
1619株分離株藥敏結(jié)果見表4,念珠菌屬中常見的白念珠菌對氟康唑較為敏感(99.2%),其次為近平滑念珠菌復(fù)合體和熱帶念珠菌,依次為93.7%和91.7%。白念珠菌、近平滑念珠菌復(fù)合體和熱帶念珠菌對伏立康唑敏感的菌株百分比分別為99.5%、95.0%、92.5%。分離株對氟康唑和伏立康唑的敏感程度從整體來看較接近。白念珠菌和近平滑念珠菌對兩種唑類藥物的敏感性都很高(>93%),熱帶念珠菌對氟康唑和伏立康唑的耐藥率分別為6.3%和5.9%,其中6%出現(xiàn)交叉耐藥。
表4 2012年CHIF-NET 1619株酵母菌氟康唑及伏立康唑體外藥敏試驗
(續(xù)表) %
2.7 不同菌株在各醫(yī)療機構(gòu)的分布差異
雖然白念珠菌為臨床最常見的念珠菌種,但其發(fā)生率在不同醫(yī)療機構(gòu)存在顯著差異,最高為北京協(xié)和醫(yī)院(PU),占12.78%,最低為浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院(Z2),僅占1.14%。除東北地區(qū)哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院(H1)以外,白念珠菌是所有參與研究單位分離株中最常見的念珠菌種,熱帶念珠菌在近一半(45.45%)的醫(yī)院是檢出率排名第二的念珠菌種,發(fā)生率在16.67%~29.79%之間(見圖1)。
圖1 2012年參與CHIF-NET的22個監(jiān)測點在全國的分布情況。BD:北京大學(xué)第一醫(yī)院;FJ:福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院;G1:廣州醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院;GH:解放軍總醫(yī)院;GZ:中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院;H1:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院;H4:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院;HX:四川大學(xué)華西醫(yī)院;JS:江蘇省人民醫(yī)院;LR:遼寧省人民醫(yī)院;NX:寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院;PU:北京協(xié)和醫(yī)院;RJ:上海市瑞金醫(yī)院;SD:山東省立醫(yī)院;TJ:華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院附屬同濟醫(yī)院;TZ:天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院;XY:中南大學(xué)湘雅醫(yī)院;Z1:中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院;Z2:浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院;Z3:浙江省人民醫(yī)院;ZD:浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院;ZS:杭州邵逸夫醫(yī)院
CHIF-NET 2012中國多中心侵襲性酵母菌感染的臨床研究結(jié)果表明:念珠菌屬仍然是最常見的侵襲性酵母菌感染病原體,占分離株的91.8%,其中白念珠菌最為常見占47.4%,與文獻報道一致[2]。在血流樣本分離株中,白念珠菌的分離率依然位居榜首(34.0%),這一點不同于美國(38.0%)[3]。由非白念珠菌引起的菌血癥超過一半[4-5],近平滑念珠菌和熱帶念珠菌是位于第2、3位的導(dǎo)致血流感染的病原菌(見表2)。在全球范圍內(nèi),白念珠菌仍是主要病原菌。
從流行病學(xué)角度分析,納入研究的病例中,男性占62.1%,女性占37.8%,其中≥65歲患者占30.76%,長期使用抗菌藥物的高齡患者易感染。本監(jiān)測顯示,ICU檢出率最高,其次為外科及內(nèi)科。全球范圍內(nèi)ICU侵襲性真菌感染的問題亦很嚴峻[6]。本研究對2012年22家參與單位侵襲性酵母菌分布特點及體外藥敏結(jié)果做了研究分析,為酵母菌感染的診治提供依據(jù)。
研究對1619株真菌進行了復(fù)核鑒定,復(fù)核正確率為87.2%。由于目前實驗室常規(guī)基于生化鑒定的方法不能區(qū)別鑒定到種水平,其中25種似平滑念珠菌被鑒定為近平滑復(fù)合體。此外,還有部分菌株無鑒定結(jié)果如季也蒙念珠菌、葡萄牙念珠菌。臨床對于侵襲性真菌病的診治取決于分離菌株的正確鑒定與否,故實驗室在真菌的診斷方面,不僅需要使用常規(guī)的表型鑒定方法,還需要結(jié)合分子生物學(xué)的方法進行確認,研究可以看出,參與的醫(yī)療機構(gòu)利用常規(guī)的監(jiān)測手段鑒定念珠菌的準(zhǔn)確率僅為60.1%,其中出現(xiàn)把季也蒙念珠菌、葡萄牙念珠菌、近平滑念珠菌等錯誤鑒定為無名念珠菌的情況,研究中亦發(fā)現(xiàn)毛孢子菌屬的鑒定錯誤,其中3株阿薩希毛孢子菌被錯誤鑒定為白念珠菌,這可能和表型鑒定錯誤相關(guān)。而測序方法雖準(zhǔn)確性高,但也有一定的局限性,如方法缺乏標(biāo)準(zhǔn)化,成本也相對較高。綜合考慮,想要兼顧準(zhǔn)確性及較低的成本,VITEK MS略顯其優(yōu)越性。
研究中大部分的白念珠菌(79.83%,736/922)、光滑念珠菌(87.08%,155/178)、近平滑念珠菌(93.78%,226/241)對氟康唑和伏立康唑較敏感,伏立康唑?qū)巳崮钪榈拿舾行钥蛇_91%以上,侵襲性真菌感染的藥物治療中氟康唑不良反應(yīng)小,氟康唑的大量使用已使念珠菌病的致病菌譜發(fā)生了顯著變化,對氟康唑的敏感性也明顯下降。唑類是治療念珠菌感染最常用的藥物,除了固有耐藥比如克柔念珠菌,其他念珠菌如白念珠菌、熱帶念珠菌、光滑念珠菌在長期用藥以及過度用藥的情況下亦會出現(xiàn)耐藥[7-11]。近平滑念珠菌對棘白菌素類藥物MIC和其他念珠菌比較相對較高[12],因此唑類耐藥的近平滑念珠菌將限制臨床的可用治療方案,對臨床意義重大[13]。除此之外,也有少見的念珠菌出現(xiàn)唑類交叉耐藥的情況,如5.99%的熱帶念珠菌和4.56%的近平滑念珠菌出現(xiàn)了氟康唑和伏立康唑的交叉耐藥,出現(xiàn)在非同一醫(yī)療機構(gòu)中。CHIF-NET2012研究中熱帶念珠菌的交叉耐藥率已經(jīng)高于近平滑念珠菌復(fù)合體和白念珠菌,尤其是血流感染,應(yīng)引起關(guān)注。