許雪 鄧淑文 王曉東 趙蓉芬 張虹 于農(nóng) Mohammad Javad Najafzadeh 史冬梅 陸敏
(1. 蘇州高新區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,蘇州 215000;2. 新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院皮膚科,烏魯木齊 830011;3. Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran;4. 山東濟(jì)寧市第一人民醫(yī)院皮膚科/醫(yī)學(xué)真菌學(xué)實(shí)驗(yàn)室,濟(jì)寧 272000)
甲真菌病是一種常見(jiàn)的由真菌引起的甲感染,病原體包括皮膚癬菌、酵母菌和非皮膚癬菌絲狀真菌(non-dermatophytes mold,NDM)。近年來(lái),NDM所致甲真菌病(non-dermatophytes mold onycomycosis,NDMO)的發(fā)病率不斷增加[1-2]。曲霉作為非皮膚癬菌絲狀真菌(NDM),引起NDMO的報(bào)道逐漸增多[3-4]。隨著分子檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展,曲霉屬中許多新的菌種被報(bào)道可引起甲真菌病[2,5]。Bongomin[3]綜述了全球42篇甲真菌病流行病學(xué)文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)超過(guò)50%(23/42)的研究報(bào)道了曲霉屬菌種可作為甲真菌病的病原菌,占NDMO的50%~100%。在伊朗,既往研究表明曲霉可引起NDMO,且主要致病菌種為黃曲霉(AspergillussectionFlavi)。但值得注意的是,伊朗大多數(shù)研究報(bào)道中,菌種鑒定主要是基于形態(tài)學(xué)鑒定,且關(guān)于分離菌株體外抗真菌活性的研究數(shù)據(jù)很少。由于形態(tài)學(xué)鑒定并不能區(qū)分曲霉屬的近緣種(如AspergillussectionFlavi菌種),而準(zhǔn)確的曲霉屬菌種鑒定對(duì)臨床選擇最佳治療方案和判斷疾病預(yù)后具有重要作用。
Calmodulin(CaM)或β-tubulin(BenA)基因的部分序列是目前鑒定曲霉屬菌種,尤其曲霉復(fù)合體菌種的推薦鑒定基因[6]。此外,最近的研究表明,MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定可以作為基于DNA序列鑒定曲霉菌種的替代方法[7-8],尤其是對(duì)一些曲霉同形種(cryptic species),或者是分子鑒定不能區(qū)分的曲霉屬菌種[7],例如A.flavus/A.oryzae,MALDI-TOF質(zhì)譜有能力將其區(qū)分開(kāi)[9]。
因此,本研究對(duì)伊朗馬什哈德地區(qū)甲真菌病患者指/趾甲分離基于形態(tài)學(xué)鑒定的39株AspergillussectionFlavi菌株進(jìn)行分子鑒定聯(lián)合MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定。同時(shí),對(duì)這些菌株進(jìn)行了包括特比萘芬在內(nèi)的10種抗真菌藥物的體外抗真菌活性檢測(cè)。
1.1 菌種鑒定
39株AspergillussectionFlavi菌株分離自伊朗馬什哈德地區(qū)Emam Reza & Ghaem醫(yī)院診斷為甲真菌病患者的指/趾甲。曲霉菌屬引起的甲真菌病的診斷標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)文獻(xiàn)[3]滿足以下3點(diǎn):①直接鏡檢陽(yáng)性;②同部位反復(fù)培養(yǎng)或分子檢測(cè)為曲霉;③未分離出皮膚癬菌。該研究獲得了Mashhad醫(yī)學(xué)科學(xué)大學(xué)倫理委員會(huì)的倫理認(rèn)可和倫理規(guī)范(IR.MUMS.MEDICAL.REC.1397.660)。所有患者都理解并同意將其臨床標(biāo)本用于本研究。
1.2 分子鑒定
39株AspergillussectionFlavi菌株在SDA培養(yǎng)基于35℃培養(yǎng)4~5 d后,采用CTAB法提取菌株基因組DNA[10]。菌種鑒定采用Calmodulin (CaM)和β-tubulin(BenA)基因測(cè)序,引物序列參見(jiàn)表1。測(cè)序獲得的序列與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)(BLAST; http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)和荷蘭真菌多樣化研究中心(Westerdijk Institue)曲霉專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),鑒定到菌種水平。
表1 本研究使用引物名稱及序列
1.3 MALDI-TOF 質(zhì)譜鑒定
39株AspergillussectionFlavi菌株在SDA培養(yǎng)基上于35℃培養(yǎng)4~5 d后,采用安圖生物公司MS1000 MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定進(jìn)行菌種鑒定。鑒定方法參照說(shuō)明書(shū),即挑取適量曲霉孢子置于含1 mL 75%酒精的離心管中,混勻后以15 000 rcf離心5 min。棄去上清液,在恒溫金屬浴(Thermo Fisher Scientific, California, United States)上干燥殘留物,然后加入40 μL裂解液1并反復(fù)吹打使之產(chǎn)生氣泡,取1 μL滴于靶板上,在生物安全柜中自然干燥,然后再吸取1 μL基質(zhì)溶液于靶板的相同位置,在生物安全柜中自然干燥。最終,使用AUTOF MS1000質(zhì)譜儀對(duì)產(chǎn)生的質(zhì)譜進(jìn)行積分鑒定。
1.4 抗真菌藥敏試驗(yàn)
參考CLSL M38-A3方案[11],抗真菌藥物包括:阿尼芬凈(ANF)、卡泊芬凈(CAS)、米卡芬凈(MFG)、兩性霉素B(AmB)、伊曲康唑(ITC)、伏立康唑(VRC)、泊沙康唑(POS)、雷伏康唑(RAV)、艾沙康唑(ISA)和特比萘芬(TER)。其中,米卡芬凈購(gòu)自多倫多研究化學(xué)品公司,特比萘芬購(gòu)自阿拉丁生化科技公司,其余抗真菌藥物均購(gòu)自Sigma。以C.parapsilosisATCC22019 和A.fumigatusATCC MYA-3627 為質(zhì)控菌株。所有待測(cè)菌株在SDA瓊脂平板35℃培養(yǎng)4~5 d,以進(jìn)行菌株活化。取適量孢子于裝有1 mL無(wú)菌生理鹽水的研磨器中充分研磨,顯微鏡下通過(guò)計(jì)數(shù)板計(jì)算菌懸液的初始濃度并通過(guò)RPMI 1640培養(yǎng)基將菌懸液的最終接種濃度調(diào)整為(0.4~5)×104CFU/mL,然后置于96孔藥敏板中。棘白菌素類(米卡芬凈、阿尼芬凈和卡泊芬凈)抗真菌藥的濃度范圍為0.008~4 mg/L,而其他抗真菌藥的濃度范圍為0.031~16 mg/L。棘白菌素類藥敏板于35℃下培養(yǎng)24 h后觀察結(jié)果,其他培養(yǎng)板則在35℃下培養(yǎng)48 h。用顯微鏡(Olympus, Japan)在×40倍放大率下測(cè)定最低抑制濃度(MIC)和最低有效濃度(MEC)。表2列出了10種抗真菌藥物的藥物濃度范圍、MIC/MEC讀數(shù)時(shí)間和黃曲霉流行病學(xué)臨界值(epidemiological cutoff values, ECV)。
表2 本研究中檢測(cè)10種抗真菌藥物的濃度范圍、MIC/MEC讀數(shù)時(shí)間、ECV
2.1 菌種鑒定
以GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)(BLAST; http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)和荷蘭真菌多樣化研究中心(Westerdijk Institue)曲霉專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)為參考數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)根據(jù)CaM和BenA基因序列BLAST比對(duì)分析,基于形態(tài)學(xué)鑒定的39株AspergillussectionFlavi菌株,38株為A.flavus/A.oryzae,1株為A.minisclerotigenes。采用安圖生物MS1000 MALDI-TOF 質(zhì)譜儀,對(duì)39株AspergillussectionFlavi菌株進(jìn)行MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定,結(jié)果均為A.flavus,鑒定結(jié)果見(jiàn)表3。
表3 39株Aspergillus section Flavi分子鑒定和MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果
2.2 藥敏結(jié)果
表4列出了39株AspergillussectionFlavi對(duì)10種抗真菌藥物MIC/MEC值的范圍、MIC90、GM、Modal MIC 及MIC/MEC分布。
表4 39株Aspergillus section Flavi對(duì)10種抗真菌藥物MIC/MEC值的范圍、MIC90、GM菌株分布
38株A.flavus對(duì)10種抗真菌藥物的Modal MIC和 GM(mg/L)值依次為(遞增順序)米卡芬凈(0.008)、阿尼芬凈(0.008)、特比萘芬(0.03)、泊沙康唑(0.097)、卡泊芬凈(0.142)、艾沙康唑(0.274)、伏立康唑(0.274)、伊曲康唑(0.311)、雷伏康唑(0.394)、兩性霉素B(2.151)。
1株A.minisclerotigenes對(duì)10種抗真菌藥物的MIC/MEC(mg/L)值分別為(遞增順序):米卡芬凈(0.008)、阿尼芬凈(0.008)、特比萘芬(0.03)、N:沒(méi)有鑒定結(jié)果。
卡泊芬凈(0.125)、伏立康唑(0.25)、艾沙康唑(0.25)、伊曲康唑(0.25)、雷伏康唑(0.5)、泊沙康唑(0.5)、兩性霉素B(1)。
本研究報(bào)道了伊朗馬什哈德地區(qū)致甲真菌病的AspergillussectionFlavi菌種的分子特征以及其對(duì)10種抗真菌藥物的體外敏感性。
研究結(jié)果表明A.flavus是伊朗馬什哈德地區(qū)AspergillussectionFlavi引起甲真菌病的主要菌種。在伊朗,已有研究報(bào)道曲霉屬菌種(主要是AspergillussectionFlavi)是NDM致甲真菌病的常見(jiàn)致病菌種[12-14]。我們的結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)AspergillussectionFlavi中A.flavus是主要致病菌種。此外,A.flavus也是伊朗地區(qū)慢性真菌性鼻竇炎的主要病原菌[15]。這可能是由于伊朗氣候溫暖,有利于黃曲霉等耐熱真菌的生長(zhǎng)。
根據(jù)新近分類,分子鑒定將A.minisclerotigenes歸屬于AspergillussectionFlavi,該菌種與A.flavus系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化親緣性相近[16]?;贜CBI Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),本研究中CaM基因不能將A.minisclerotigenes與A.flavus分開(kāi),而B(niǎo)enA基因鑒定為A.minisclerotigenes,并進(jìn)一步在荷蘭真菌多樣化研究中心(Westerdijk Institue)曲霉專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)確認(rèn),由此說(shuō)明多個(gè)基因位點(diǎn)聯(lián)合鑒定可以更準(zhǔn)確鑒定至菌種水平。伊朗學(xué)者Dehhan等[17]首次報(bào)道A.minisclerotigenes可引起人類感染。另一伊朗學(xué)者Esfahani等[18]報(bào)道1例由A.minisclerotigenes引起的真菌性角膜炎病例,建議許多的A.minisclerotigenes可能因基于形態(tài)學(xué)鑒定而被錯(cuò)誤鑒定為黃曲霉,從而被忽視了。本研究首次報(bào)道A.minisclerotigenes為甲真菌病的病原菌。
由于A.flavus和A.oryzae分子序列相似度很高,CaM和BenA兩個(gè)基因均不能將A.flavus與A.oryzae區(qū)分。因此,目前這兩個(gè)菌種的鑒定主要依賴菌株來(lái)源和真菌毒素的產(chǎn)生而鑒別:A.oryzae通常在食物發(fā)酵和生物技術(shù)中廣泛使用,不產(chǎn)生真菌毒素,而A.flavus產(chǎn)生黃曲霉毒素[19],不用于食品加工。而 MALDI-TOF 質(zhì)譜鑒定將本研究的指/趾甲分離38株A.flavus菌株正確鑒定,與Chang等[9]報(bào)道相同。MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定可將A.flavus與A.oryzae鑒別,可能是這兩個(gè)菌種在氨基酸水平的差異。然而,MALDI-TOF質(zhì)譜將1株A.minisclerotigenes錯(cuò)誤鑒定為A.flavus,因本研究使用的MALDI-TOF質(zhì)譜儀的真菌數(shù)據(jù)庫(kù)未包含此少見(jiàn)的新菌種,說(shuō)明MALDI-TOF質(zhì)譜的準(zhǔn)確菌種鑒定需要繼續(xù)完善參考菌株數(shù)據(jù)庫(kù)。我們的研究表明將分子鑒定和MALDI-TOF質(zhì)譜兩者結(jié)合能更準(zhǔn)確鑒定曲霉屬菌種。
體外抗真菌藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明特比萘芬(GM:0.03 mg/L,Modal MIC:0.03 mg/L,n=35)對(duì)AspergillussectionFlavi菌種具有良好的抗真菌活性,且抗菌活性明顯高于唑類藥物和兩性霉素B。與既往研究結(jié)果相似[20-21]。而且已有許多研究報(bào)道特比萘芬在臨床治療曲霉引起的甲真菌病中具有良好的臨床活性[3,22]。因此,特比萘芬可作為AspergillussectionFlavi所致甲真菌病的治療選擇。
黃曲霉的ECV值參照CLSI M61方案[23](泊沙康唑0.5 mg/L;伊曲康唑1 mg/L;伏立康唑1 mg/L;艾沙康唑1 mg/L和兩性霉素B 4 mg/L),本研究中所檢測(cè)的5種唑類藥物對(duì)38株A.flavus均具有良好的活性。其中泊沙康唑GM值最低(0.097 mg/L),其次是伏立康唑和艾莎康唑(均為0.274 mg/L),然后是伊曲康唑(0.311 mg/L)和雷伏康唑(0.394 mg/L)。雖然目前還沒(méi)有雷伏康唑的流行病學(xué)臨界值,我們的研究中發(fā)現(xiàn)所有的AspergillussectionFlavi菌株對(duì)雷伏康唑的MIC值(MIC 范圍:0.25~0.5 mg/L)均小于1 mg/L,與Pfaller等[24]的研究結(jié)果相似。除此之外,兩性霉素B對(duì)所有檢測(cè)AspergillussectionFlavi菌株的MIC值均較高(GM:2.109 mg/L;MIC范圍:1~4 mg/L),其中有9株菌的MIC值為4 mg/L,與美國(guó)、歐洲以及中東地區(qū)先前的報(bào)道相似。本研究結(jié)果表明A.minisclerotigenes和A.flavus的體外抗真菌活性沒(méi)有明顯差異。
本研究中所檢測(cè)的三個(gè)棘白菌素類抗真菌藥物對(duì)所有AspergillussectionFlavi菌株均顯示良好的活性,其中米卡芬凈和阿尼芬凈具有相似MIC值(MIC值范圍為0.008~0.015 mg/L),而卡泊芬凈的MIC值范圍為0.125~0.5 mg/L。與既往研究相似,表明米卡芬凈和阿尼芬凈比卡泊芬凈敏感性高[20,25]。
根據(jù)分子鑒定聯(lián)合MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定結(jié)果,表明在伊朗馬什哈德地區(qū)AspergillussectionFlavi菌種中A.flavus是引起甲真菌病的最常見(jiàn)菌種。本文首次報(bào)道A.minisclerotigenes可作為甲真菌病的致病菌。建議分子測(cè)序聯(lián)合MALDI-TOF質(zhì)譜能更精準(zhǔn)鑒定AspergillussectionFlavi到菌種水平。因不同的菌種對(duì)抗真菌藥物的敏感性可能不同,正確鑒定曲霉至菌種水平對(duì)敏感藥物的選擇具有重要作用。除此之外,本研究結(jié)果表明特比萘芬、泊沙康唑和棘白菌素類藥物是治療AspergillussectionFlavi引起的甲真菌病的潛在有效藥物,但其在體內(nèi)的療效有待進(jìn)一步確定。