馬稔秋 崔麗娟 杜煒
2018 年口腔癌新發(fā)病例約35.5 萬,引起相關死亡約17.7萬[1],其中口腔鱗狀細胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)占全部口腔癌的90%以上。手術聯(lián)合化療的治療方案在臨床收獲了較好的療效,但中晚期及復發(fā)OSCC的患者預后不佳,明確OSCC進展的機制對于相關診斷標志物及藥物靶標的發(fā)現(xiàn)具有重要價值。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是表觀遺傳及轉錄調控的關鍵參與者,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關,包括OSCC[2-3],但以目前的發(fā)現(xiàn)仍不足以完全闡明影響OSCC進展的調控網(wǎng)絡。本研究通過生物信息學檢索發(fā)現(xiàn)與OSCC患者預后密切相關的LncRNA LINC00705,并通過分子生物技術明確了LINC00705的體外生物學效應及相關機制,揭示了該分子在OSCC診斷及治療應用中的潛在價值。
人胚腎細胞293T、人口腔上皮細胞系HOEC及人OSCC細胞系CAL-27、SCC-4、SCC-9、SCC-25及Tca8113(上海生命科學研究院);DMEM、DMEM/F12培養(yǎng)基及胎牛血清(FBS)(Hyclone,美國);RNAiso Plus(Trizol)、逆轉錄試劑盒PrimeScript RT reagent Kit、核酸熒光染料SYBR Green I(Takara,日本);慢病毒包裝載體、plvx-LINC00705及plvx-Vector載體、miR-143-3p mimic及NC mimic(上海漢恒生物);轉染脂質體Lipofectamine MessengerMAX(Thermo,美國);CCK-8試劑(上海翊圣生物);Tranwell小室及Matrigal基質膠(BD,美國);Passive Lysis Buffer(PLB)裂解液、Luciferase Assay Reagent II及psiCHECK2載體(Promega,美國)。
收集內蒙古赤峰學院附屬醫(yī)院口腔科2018 年09 月 01日~2019 年12 月20 日收治的46 例OSCC患者,所有患者均首次診斷為惡性腫瘤,術前未行任何形式的抗腫瘤治療,所有提供腫瘤及癌旁組織的患者均對本研究知情同意,并簽字。
293T、CAL-27、SCC-4、SCC-9、SCC-25細胞采用DMEM+10%FBS培養(yǎng),Tca8113細胞采用DMEM/F12+10%FBS培養(yǎng),培養(yǎng)環(huán)境:37 ℃+5%CO2。利用慢病毒轉染技術在Tca8113細胞中轉染LINC00705過表達及相應的空白對照載體作為過表達組及空白組,在過表達組細胞中轉染miR-143--3p mimic作為回復組;在SCC-9細胞中轉染LINC00705敲降載體1#、2#及相應的干擾對照載體作為干擾1組、干擾2組及對照組。轉染方法:在對數(shù)生長期的293T細胞中利用脂質體轉染慢病毒包裝載體+目的載體(1.5 μg),收集病毒懸液與完全培養(yǎng)基1∶1混合培養(yǎng)Tca8113或SCC-9細胞3 d,1 μg/mL嘌呤霉素篩選細胞2 周以上。
TRIzoL試劑提取臨床組織樣本或各組細胞的總RNA,逆轉錄試劑盒對1 μg總RNA進行逆轉錄,另取1 μg總RNA進行miR-143-3p特異性的逆轉錄,轉錄產物cDNA稀釋至500 μL,將β-Actin、LINC00705及miR-143-3p引物與相應cDNA產物混合,在10 μL SYBR Green I體系中進行反應,反應條件:50 ℃ 2 min,95 ℃ 10 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min擴增循環(huán)30 次;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,95 ℃ 30 s,60 ℃ 15 s。以β-Actin為內參基因,2-ΔΔCT公式計算LINC00705及miR-143-3p的相對表達水平。
以1 000 個/孔細胞密度接種各組細胞于96孔細胞培養(yǎng)板中,每組設置5 個重復孔,在細胞貼壁后的0、24、48、72 h及96 h于待測孔中加入10 μL CCK-8試劑,避光于37 ℃+5%CO2環(huán)境下培養(yǎng)3 h,檢測450 nm處吸光度(A)值,以各時間點相比0 h A值增高的倍數(shù)衡量細胞相對增殖能力。
無血清培養(yǎng)基稀釋10×Matrigel基質膠,滴加至Transwell小室上室面中央,風干6 h后無血清培養(yǎng)基水化10 min備用。各組細胞消化重懸后進行細胞計數(shù),調整細胞濃度至5×105個/mL并以含培養(yǎng)基+1%FBS重懸,200 μL細胞懸液接種至Transwell小室,下室面加入600 μL培養(yǎng)基+10%FBS,以含Matrigel基質膠的Transwell小室為侵襲模型,未含Matrigel基質膠的Transwell小室作為遷移模型,37 ℃+5%CO2環(huán)境下培養(yǎng)48 h,無水乙醇固定細胞10 min,0.1%結晶紫染色20 min,40×顯微鏡下拍照,采用ImageJ軟件進行細胞計數(shù)。
構建LINC00705全長序列+psiCHECK2載體(psiCHECK2-705),接種293T細胞于6孔細胞培養(yǎng)板中,分為NC組及miR組,NC組通過脂質體轉染psiCHECK2-705載體及NC mimic,miR組轉染psiCHECK2-705載體及miR-143-3p mimic,轉染后48 h,200 μL PLB裂解液處理細胞30 min,取10 μL加入避光的96孔板中,100 μL預混Luciferase Assay Reagent II檢測熒光強度為RLU1,加入100 μL預混Stop&Glo Reagent檢測熒光強度為RLU2,以RLU1/RLU2作為各組相對熒光強度。
使用SPSS 23.0軟件進行統(tǒng)計學分析,單因素方差分析比較計量資料多組間差異,兩兩比較采用SNK-q法,檢驗水準α=0.05。
根據(jù)GEPIA平臺(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)中提供的數(shù)據(jù)顯示,頭頸鱗癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)組織中LINC00705表達顯著高于正常癌旁組織(P<0.01,圖 1A),且高表達LINC00705的HNSC患者無病生存時間顯著低于低表達患者(P<0.01,圖 1B)。
圖 1 LINC00705在 OSCC組織中的表達特征
RT-qPCR結果顯示,相比正常癌旁組織,OSCC組織中LINC00705表達顯著增高(P<0.01,圖 2A),miR-143-3p表達顯著降低(P<0.01,圖 2B),兩者在OSCC組織中表達顯著負相關(R=-0.484,P<0.01,圖 2C),圖 2D為口腔鱗癌組織HE染色。
圖 2 OSCC中LINC00705及miR-143-3p的表達及其相關性
RT-qPCR結果顯示,相比空白組,過表達組Tca8113細胞中LINC00705表達顯著增高,miR-143-3p表達顯著降低(P<0.01),相比過表達組,回復組LINC00705表達無顯著變化(P>0.05),miR-143-3p表達顯著增高(P<0.01,圖 3A);相比對照組,干擾1組及干擾2組SCC-9細胞中LINC00705表達顯著降低(P<0.01),miR-143-3p表達顯著增高(P<0.01,圖 3B),圖 3C為細胞轉染后熒光表達情況。
圖 3 各組細胞中LINC00705及miR-143-3p表達的比較
CCK-8結果顯示,相比空白組,過表達組48 h及以后增殖能力顯著增高(P<0.05),相比過表達組,回復組48 h及以后增殖能力顯著降低(P<0.01,圖 4A);相比對照組,干擾1組及干擾2組48 h及以后增殖能力顯著降低(P<0.01,圖 4B)。
圖 4 各組細胞相對增殖能力的比較
Transwell侵襲及遷移結果顯示,相比空白組,過表達組侵襲及遷移細胞數(shù)顯著增多(P<0.01),相比過表達組,回復組侵襲及遷移細胞數(shù)顯著降低(P<0.01,圖 5);相比對照組,干擾1組及干擾2組侵襲及遷移細胞數(shù)顯著降低(P<0.01,圖 5)。
圖 5 各組細胞的相對增殖能力
LncBase Predicted v2平臺(http://carolina.imis.athena-innovation.gr/diana_tools/web)分析結果顯示,LINC00705與miR-143-3p存在堿基互補配對序列(圖 6)。熒光素酶報告基因結果顯示,相比共轉染NC mimic載體(NC mimic相對熒光表達量:1.000±0.126),轉染miR-143-3p mimic可顯著降低LINC00705熒光素酶的表達(miR-143-3p mimic相對熒光表達量:0.319±0.045,P<0.01)。
圖 6 LINC00705與miR-143-3p預測結合區(qū)域
LncRNA在惡性腫瘤中重要的生物學價值已被廣泛的研究證實[4],其可與蛋白直接結合,直接影響靶蛋白的結構及功能[5],但更多是作為內源競爭RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)影響靶微小RNA(microRNA,miRNA)的生物學效應,進而間接調控miRNA的靶蛋白[6-7]。本研究通過生物信息技術發(fā)現(xiàn)LINC00705在OSCC組織中高表達,并與患者預后不良密切相關,提示LINC00705在OSCC中可能具有重要研究價值。而Liu等[8]研究發(fā)現(xiàn)LINC00705在乳腺癌復發(fā)患者的腫瘤組織中表達顯著上調,暗示了LINC00705可作為乳腺癌預測復發(fā)的潛在標志物,因此,對LINC00705的靶miRNA進行分析,結果顯示miR-143-3p與LINC00705轉錄本229-253序列存在互補序列,且連續(xù)互補片段為9-mer,提示結合可能性較強。而miR-143-3p被多項研究證實在不同來源的惡性腫瘤中發(fā)揮抑癌作用:He等[9]發(fā)現(xiàn)miR-143-3p在食管鱗癌組織中表達顯著降低,且其低表達與患者預后不良密切相關,體內外研究顯示RNA結合蛋白QKI-5是miR-143-3p的直接靶蛋白,miR-143-3p可通過抑制QKI-5 mRNA的表達,介導細胞上皮-間質轉化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)及細胞增殖轉移能力的抑制;Chen等[10]發(fā)現(xiàn)miR-143-3p在乳腺癌組織中低表達,且受到MYB原癌基因樣蛋白2(MYBL2)的負向調控,miR-143-3p的過表達可抑制乳腺癌細胞體內外的惡性表型;同時,miR-143-3p也參與調控OSCC的惡性表型,其被發(fā)現(xiàn)在OSCC組織中表達顯著降低,且作為lncRNA UCA1及MALAT1的靶基因,顯著抑制OSCC細胞的惡性行為[11-12]。另外miR-143-3p在結直腸癌、胰腺導管腺癌及宮頸癌中發(fā)揮抑癌作用[13-15]。
上述研究表明miR-143-3p作為抑癌因子在不同來源的惡性腫瘤中發(fā)揮生物學作用,而考慮到LINC00705在OSCC中有待闡明的生物學意義及其與miR-143-3p潛在的相互作用,本研究在OSCC臨床組織樣本中進行了LINC00705與miR-143-3p表達相關性的分析,結果顯示兩者表達顯著負相關,提示了兩者在OSCC中存在潛在的調控作用,體外研究顯示,過表達LINC00705可促進OSCC細胞的惡性表型,而干擾LINC00705則抑制細胞的增殖轉移能力。在回復miR-143-3p表達后,LINC00705的促癌作用被完全拮抗,同時,miR-143-3p對LINC00705熒光素酶的抑制作用提示兩者存在相互結合作用。綜上,本研究表明LINC00705可下調OSCC細胞中miR-143-3p的表達,促進細胞增殖及轉移能力。在接下來的研究中將以balb/c裸鼠為體內模型探究LINC00705的體內生物學效應,并通過擴大臨床樣本及長期隨訪,明確LINC00705的臨床意義,以期為相關藥物靶標及診斷試劑盒的研發(fā)提供關鍵依據(jù)。