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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學分析右歸丸治療糖尿病性勃起功能障礙的作用機制

2021-08-05 10:06翟新宇談鳴岳葛旻垚徐東亮
中國男科學雜志 2021年3期
關(guān)鍵詞:海綿體靶點通路

翟新宇 談鳴岳 葛旻垚 萬 眾 徐東亮

上海中醫(yī)藥大學附屬曙光醫(yī)院泌尿中心(上海 201203)

糖尿病性勃起功能障礙(diabetic erectile dysfunction,DED)是糖尿?。╠iabetes mellitus,DM)常見的慢性并發(fā)癥之一,主要表現(xiàn)為陰莖不能達到或維持足夠的勃起以完成滿意的性生活,病程在3個月以上。中國是DM第一大國,70%的DM男性患者都會引發(fā)不同程度的勃起功能障礙(erectile dysfunction,ED)[1]。正常人群的ED發(fā)病率僅為18%,而DM人群的ED發(fā)病率是正常人群的4倍,發(fā)病時間較正常人群要早10年,并隨著年齡的增長和DM病程的延長發(fā)病率呈逐漸上升趨勢[2-3]。DED的發(fā)生嚴重影響患者的生活質(zhì)量、心理健康及夫妻感情,甚至影響社會的和諧穩(wěn)定。因此,積極治療DED具有重要的臨床意義。

幾千年來,中醫(yī)藥一直被用來治療一系列疾病。由于中醫(yī)藥療效顯著,副作用小,已被世界各地越來越多的人所認可[4]。右歸丸是由明代著名醫(yī)學家、溫補學派創(chuàng)始者張仲景所創(chuàng),由附子、肉桂、鹿角膠、熟地黃、山藥、山茱萸、枸杞子、當歸、杜仲、菟絲子10種中草藥組成。該方劑具有“滋陰補腎、填精止遺”的功效,先前的臨床研究證實,右歸丸具有良好的改善糖尿病性勃起功能障礙的作用[5]。然而,對于右歸丸治療糖尿病性勃起功能障礙的作用機制尚不清楚,其主要成分和關(guān)鍵靶點的藥效學性質(zhì)尚待確定。

網(wǎng)絡(luò)藥理學可以通過不同層次的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建系統(tǒng)地揭示藥物作用靶點與疾病靶點之間的關(guān)系,從微觀層面觀察復雜藥物對多靶點疾病的干預和影響[6]。網(wǎng)絡(luò)藥理學研究策略的整體性、系統(tǒng)性與中醫(yī)的整體理念和辨證論治理論不謀而合,為中醫(yī)藥的現(xiàn)代醫(yī)學解讀提供了一條新穎的路徑[7]。鑒于臨床獲得右歸丸治療DED患者海綿體樣本的倫理局限性,我們采用網(wǎng)絡(luò)藥理學的方法篩選右歸丸中各單味藥的活性成分及作用靶點,檢索已知的DED相關(guān)靶點,對右歸丸干預DED的潛在關(guān)鍵作用靶點的生物功能進行預測,并分析其作用通路,為揭示右歸丸的科學內(nèi)涵和進一步挖掘右歸丸其他臨床應用奠定基礎(chǔ)。

材料與方法

一、右歸丸活性成分篩選及潛在作用靶點預測

本研究利用TCMSP數(shù)據(jù)庫(http://tcmspw.com/tcmsp.php)和TCMID數(shù)據(jù)庫(http://119.3.41.228:8000/tcmid/)收集右歸丸中各味中藥相關(guān)的活性成分,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18為篩選標準[7],得到符合條件的活性成分靶點信息。

二、疾病靶點的預測

登錄GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)和OMIM數(shù) 據(jù) 庫(https://omim.org/),以“糖 尿 病性勃起功能障礙”為關(guān)鍵詞,檢索篩選出疾病相關(guān)基因,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)進行確認并轉(zhuǎn)換后,剔除重復靶標,整理成DED疾病靶點數(shù)據(jù)庫。

三、中藥活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

將中藥活性成分相關(guān)靶點與疾病相關(guān)靶點取交集,通過韋恩圖將其可視化,并利用Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建中藥-活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖。

四、PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建和核心靶點的篩選

將得到交集基因的信息導入在線數(shù)據(jù)庫STRING(http://string-db.org/),篩選最小相關(guān)分數(shù)大于0.4的節(jié)點,去除無關(guān)聯(lián)的單個節(jié)點,獲得的剩余節(jié)點及關(guān)系導入Cytoscape3.7.2軟件繪制PPI網(wǎng)絡(luò),并通過計算每個節(jié)點的degree值篩選出核心靶點。

五、靶點基因生物信息富集分析

將右歸丸作用靶點導入DAVID數(shù)據(jù)庫(https://DAVID.ncifcrf.gov),限定物種為人,進行基因本體論(gene ontology,GO)分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,篩選P<0.05的生物過程及信號通路,取排名前20條信號通路用R包(ggplot2)繪圖將其可視化。

六、基因-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

為進一步篩選出明顯富集在通路中的核心作用靶基因,利用Cytoscape3.7.2構(gòu)建基因-通路網(wǎng)絡(luò)圖。

圖1 右歸丸治療DED的網(wǎng)絡(luò)藥理學分析流程圖

結(jié) 果

一、右歸丸活性成分及作用靶點信息收集

通過TCMSP、TCMID平臺檢索符合標準的右歸丸活性成分,剔除重復值后共86個。其中附子有效成分6個,作用靶點20個,當歸有效成分2個,作用靶點53個,杜仲有效成分23個,作用靶點216個,枸杞子有效成分35個,作用靶點208個,鹿茸膠有效成分1個,作用靶點4個,肉桂有效成分1個,作用靶點19個,山藥有效成分12個,作用靶點80個,山茱萸有效成分14個,作用靶點70個,熟地黃有效成分2個,作用靶點31個,菟絲子有效成分10個,作用靶點222個,將所獲得的活性成分預測靶點導入Uniprot數(shù)據(jù)庫進行基因標準化,去除重復值,共得到作用靶點基因227個。

二、糖尿病性勃起功能障礙靶點的收集

使用GenCards數(shù)據(jù)庫獲得相關(guān)靶點784個,OMIM數(shù)據(jù)庫獲得295個,刪除重復值,合并后共收集到DED潛在靶基因1061個。

三、中藥-疾病交集基因韋恩圖

計算得到右歸丸與DED交集靶點78個,說明右歸丸可能通過以上78個靶點作用于DED,并用R包繪圖將其可視化,見圖2。

圖2 藥物-疾病交集基因韋恩圖

四、中藥-活性成分-靶基因網(wǎng)絡(luò)分析

將78個作用靶點所對應的中藥活性成分,運用Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建中藥-活性成分-靶基因網(wǎng)絡(luò)(見圖3),網(wǎng)絡(luò)中共有152個節(jié)點和365條邊,包含74種活性成分,78個作用靶點,每條邊表示化合物和靶點之間的相互作用關(guān)系。經(jīng)過和核心靶基因?qū)Ρ群Y選,獲得degree值排名前五的核心中藥活性成分信息及對應靶點數(shù)目,見表1。

圖3 中藥-活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)

表1 核心中藥活性成分信息及對應靶點數(shù)目

五、PPI網(wǎng)絡(luò)分析

將得到交集基因的信息導入在線數(shù)據(jù)庫STRING,篩選minimum required interaction score大于0.4的節(jié)點,去除無關(guān)聯(lián)的單個節(jié)點,獲得的剩余節(jié)點及關(guān)系導入Cytoscape3.7.2軟件繪制PPI網(wǎng)絡(luò)。得到的網(wǎng)絡(luò)圖由77個節(jié)點和737條邊組成;進一步按degree值進行篩選,根據(jù)“右歸丸-活性化合物-潛在作用靶點”網(wǎng)絡(luò)與PPI網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵作用靶點相互映射,推測右歸丸的有效成分可能通過VEGFA(degree值51)、IL-6(degree值50)、CASP3(degree值44)、NOS3(degree值39)、IL-1β(degree值38)這5個核心靶點發(fā)揮改善糖尿病性勃起功能障礙的作用,見圖4。

圖4 右歸丸核心蛋白網(wǎng)絡(luò)互作圖

六、GO功能富集與KEGG通路富集分析

將得到78個作用靶點通過DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO與KEGG富集分析,共有1509條生物功能顯著富集(P<0.05),見圖5。1332個在生物過程(BP)中富集,75個在細胞成分(CC)中富集,100個在分子功能(MF)中富集。選擇排名前20的GO中條目繪制柱狀圖,主要涉及抗菌反應、脂多糖反應、細菌分子反應、活性氧水平反應、第二信使介導信號轉(zhuǎn)導、乙醇反應、G蛋白-偶聯(lián)第二信使環(huán)核苷酸受體信號通路等生物過程。細胞成分(CC)主要有:膜筏、膜微域、膜區(qū)、神經(jīng)元胞體等。分子功能(MF)為:G蛋白-偶聯(lián)胺受體活性、細胞因子受體結(jié)合、腎上腺素能受體活性、兒茶酚胺結(jié)合、銨離子結(jié)合、核受體活性等。KEGG通路網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果顯示,富集靶基因數(shù)目較多,且具有較大意義的通路為:神經(jīng)活性配體-受體相互作用信號通路、糖尿病并發(fā)癥中的晚期糖基化產(chǎn)物-受體信號通路、PI3K-Akt信號通路、流體剪應力與動脈粥樣硬化信號通路、鈣信號通路等,見圖6。

圖5 GO分析得出的排名前二十條目的BP、CC、MF氣泡圖

圖6 KEGG富集分析前二十條信號通路

七、基因-通路網(wǎng)絡(luò)分析

將排名前20的KEGG通路信息和相應富集在這些信號通路上的基因?qū)隒ytocape3.7.2軟件構(gòu)建基因-通路網(wǎng)絡(luò),見圖7。網(wǎng)絡(luò)包含70個節(jié)點,203條邊,其中富集基因50個,信號通路20條。將這些節(jié)點進行分析,degree值越大,圖形面積越大,代表目標基因或通路在網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮的作用越大。

圖7 富集基因-KEGG信號通路圖

討 論

糖尿病性勃起功能障礙是在糖尿病進展過程中出現(xiàn)的一種慢性并發(fā)癥,并隨著病程的延長,發(fā)病率呈上升趨勢。DED的發(fā)病機制復雜,涉及多基因、多靶點的病理機制,目前主要學說涉及神經(jīng)病變、血管內(nèi)皮細胞病變、雄激素水平改變等[8]。一線治療主要為口服西地那非,但有增加心腦血管意外的風險。近年來,中醫(yī)藥治療DED的研究逐漸增多,因其安全性高、不良反應小、患者接受度好,在臨床應用上逐漸被認可。

中醫(yī)雖沒有DED的病名,但糖尿病屬中醫(yī)“消渴病”范疇,勃起功能障礙屬“陽痿”范疇,DED可認為是消渴所致陽痿。陽痿病機主要是腎陽虧虛,命門火衰,陰器冷縮,痿而不起。而腎陽不足是源于消渴日久,耗傷真陰,導致腎精虧損。由于陰陽互根互用,病程日久,必陰損及陽,導致腎陰陽兩虛。消渴所致陽痿是以腎陽虛為主要矛盾的陰陽兩虛之證,治療當以溫腎填精、壯陽起痿為主,同時兼顧補腎滋陰。右歸丸是明代著名醫(yī)學家、溫補學派創(chuàng)始者張景岳所創(chuàng)制的陰中求陽代表方。方中用滋陰藥“熟地黃、枸杞子、酒萸肉、山藥、當歸”補養(yǎng)精血以培其本,再配合補陽藥“炮附子、肉桂、鹿角膠、菟絲子、鹽杜仲”溫腎壯陽,諸藥陰陽雙補,陰中求陽,使陽氣得陰生化無窮,可以溫腎填精、壯陽起痿,主治命門火衰之證。右歸丸方證與消渴所致陽痿病機吻合,故中醫(yī)用藥常選用右歸丸治療DED,并佐以臨證加減。

網(wǎng)絡(luò)藥理學從藥物、疾病之間相互作用的整體性和系統(tǒng)性出發(fā),采用復雜網(wǎng)絡(luò)模型表達和分析研究對象的藥理學性質(zhì),為中藥多成分、多途徑和多靶點的作用機制進行整合及闡明,為基礎(chǔ)實驗研究提供方向。

結(jié)果發(fā)現(xiàn),槲皮素、Cinchonan-9-al,6'-methoxy-,(9R)-、(-)-Tabernemontanine(丹參堿)、山奈酚、β-谷甾醇可能是右歸丸治療的DED的主要活性成分。其中槲皮素與山奈酚均屬黃酮類化合物,已有多項研究證實[9-10],黃酮類物質(zhì)具有抗氧化、抗炎、抗心腦血管疾病等藥理活性,有效抑制炎癥及纖維化的進展,在治療糖尿病相關(guān)并發(fā)癥中起到重要作用。其中,槲皮素可以有效降低醛糖還原酶的活性,降低AGE的生成,抑制AGERAGE信號通路引起的糖尿病組織(如糖尿病腎臟、糖尿病心臟)相應的氧化應激、細胞凋亡等病理過程[11],同時能改善DM-ED模型大鼠的血管內(nèi)皮功能,增加陰莖海綿體血管平滑肌竇壓(ICP),增強一氧化氮合酶的活性和亞型的表達[12]。山奈酚屬于過氧化物酶體增殖物激活受體γ激動劑,具有增強脂肪組織及骨骼肌葡萄糖儲運的作用,能夠提高胰島素敏感性,被廣泛地應用于糖尿病及相應并發(fā)癥的治療。山奈酚可通過調(diào)節(jié)血管活性相關(guān)因子的動態(tài)平衡,從而發(fā)揮對微血管病變的保護作用[13]。β-谷甾醇是動植物細胞膜重要的組成之一,具有抗氧化、抗炎、降血糖等藥理活性。研究發(fā)現(xiàn)[14],β-谷甾醇可以有效清除氧自由基,降低細胞內(nèi)過氧化物酶的水平,發(fā)揮抗氧化作用;通過抑制巨噬細胞IL-6活性,減少IL-1、TNF等炎性因子的分泌,起到抗炎的作用。因此,槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇可能是右歸丸改善DED的關(guān)鍵成分。

通過對活性成分-疾病靶點分析,根據(jù)度值的大小得出右歸丸與DED相互作用的關(guān)鍵節(jié)點有VEGFA、IL6、CASP3、NOS3、IL1β。VEGF家族是一類多功能的細胞因子,在血管生成中具有重要的調(diào)控作用。在大鼠和人陰莖組織的內(nèi)皮細胞和平滑肌細胞中都發(fā)現(xiàn)了VEGF信號傳導途徑[15-16],在大鼠陰莖海綿體內(nèi)注射VEGF,可以有效改善ED[17-18]。IL-6、IL-1β為兩種炎癥因子,隨著糖尿病病程的延長,組織分泌大量的炎癥介質(zhì)及細胞因子,降低炎癥介質(zhì)及細胞因子對于糖尿病相關(guān)并發(fā)癥的治療至關(guān)重要。NOS3是內(nèi)皮型一氧化氮合酶,NOS3催化左旋精氨酸產(chǎn)生NO是陰莖勃起的關(guān)鍵物質(zhì),糖尿病大鼠陰莖海綿體組織內(nèi)的NOS活性顯著降低且隨糖尿病病程的延長而下降,引起陰莖海綿體局部NO水平降低,導致ED[19-20]。CASP3是細胞凋亡的標志性蛋白,隨著糖尿病病程的進展,患者糖、脂代謝紊亂使全身大動脈發(fā)生粥樣硬化,血管、微血管病變,導致海綿體缺血、缺氧,海綿體平滑肌數(shù)量減少,纖維化程度增加及海綿體細胞凋亡增加,同時發(fā)生陰莖海綿體白膜纖維減少,最終促使DED發(fā)生,眾多研究均已證實細胞凋亡在DED的發(fā)生、發(fā)展過程中扮演一定角色[21-22]。右歸丸中篩選出的核心成分槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇均對炎癥因子有不同程度的控制。本研究篩選出來的關(guān)鍵活性成分槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇可以有效控制氧化應激反應、減輕糖尿病的炎癥反應、降低血管內(nèi)皮細胞凋亡蛋白表達、保護血管內(nèi)皮等功能[23-25],臨床上可能通過調(diào)控這些關(guān)鍵靶點從而發(fā)揮改善DED的作用。

從GO分析可知,右歸丸可通過對多種生物學過程和和分子功能的調(diào)控來改善DED的發(fā)生發(fā)展,核心靶點主要富集在生物過程(BP)環(huán)節(jié),其關(guān)聯(lián)的生物過程主要有調(diào)節(jié)參與抗菌反應、脂多糖反應、細菌分子反應、活性氧水平反應等。糖尿病是一種慢性炎癥反應,可以啟動多條信號通路,導致機體氧化應激反應從而引起全身血管炎癥因子釋放增加,進而引起血管平滑肌增生、血管粥樣硬化,血管內(nèi)NO釋放降低,促發(fā)DED的發(fā)生[26-27]。根據(jù)KEGG的富集結(jié)果可知,右歸丸作用于DED的核心靶點主要富集在神經(jīng)活性配體-受體相互作用信號通路、糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、PI3K-Akt信號通路。糖尿病引起的神經(jīng)病變是發(fā)生ED的重要原因[28]。自主神經(jīng)病變可以引起陰莖靜脈漏的形成,而周圍神經(jīng)病變可引起神經(jīng)反射傳導障礙,支配陰莖的舒血管腸肽能、膽堿能腎上腺素能神經(jīng)損壞,導致與陰莖勃起有關(guān)的神經(jīng)遞質(zhì)濃度改變,最終導致ED。AGE-RAGE信號通路激活可直接滅活NO或間接減少NO生成,增加縮血管因子水平,同時還能引起海綿體組織內(nèi)氧化應激反應,導致血管炎癥因子產(chǎn)生增多、血管內(nèi)皮細胞凋亡,從而引發(fā)ED,抑制該信號通路可有效改善DED[29]。PI3K-AKT信號通路為細胞內(nèi)重要信號轉(zhuǎn)導通路之一,是細胞功能的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。該信號通路激活,可有效增加陰莖海綿體平滑肌細胞內(nèi)NO含量,進而改善DED[30-31]。

綜上所述,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學明確了右歸丸主要通過VEGFA、IL-6、CASP3、NOS3、IL-1β等靶點調(diào)節(jié)神經(jīng)活性配體-受體相互作用信號通路、糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、PI3K-Akt信號通路進而改善DED,但本研究結(jié)果有待于后期進一步實驗驗證。

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