陳志堅
(福建農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院, 福州 350000;福建省特色旱作物品種選育工程技術(shù)研究中心, 福州 350013)
玉米進(jìn)入中國后,在西南地區(qū)種植的普通飼料玉米發(fā)生自然突變后經(jīng)人工選擇而獲得糯質(zhì)類型玉米,即糯玉米。學(xué)名ZeamaysL. sinensis Kulesh 即有“中國種”之意,糯玉米可作雜糧食用,具有一定的營養(yǎng)價值,可降低血液膽固醇濃度并防止其沉積于血管壁,能有效改善日常膳食結(jié)構(gòu)等,市場對品質(zhì)優(yōu)、營養(yǎng)價值高的糯玉米新品種要求越來越高[1]。但是目前糯育種玉米總產(chǎn)和品質(zhì)徘徊不前,根本原因是種質(zhì)遺傳基礎(chǔ)狹窄和種質(zhì)資源匱乏,迫切需要拓寬和創(chuàng)造新的種質(zhì)資源[2]。因此,為了適應(yīng)市場的需求,選育更多優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)糯玉米新品種,就需要利用現(xiàn)代生物技術(shù)對糯玉米種質(zhì)資源進(jìn)行深入的研究,從分子水平了解他們的親緣關(guān)系,為新品種選育提供參考。玉米是雜種優(yōu)勢研究的代表性作物,新品種的選育最重要的是選擇的玉米自交系配合力高,組配后有雜種優(yōu)勢,如果對現(xiàn)有的玉米自交系的親緣和血緣關(guān)系在分子水平上有科學(xué)的認(rèn)識,那將極大提高玉米自交系的改良及新品種的選育效率,但是自“雜種優(yōu)勢”概念的提出并運(yùn)用于玉米育種實(shí)踐后,隨著玉米雜交種的推廣,玉米種質(zhì)資源的匱乏且遺傳基礎(chǔ)狹窄已經(jīng)成為玉米育種界的共識[3-6]。研究表明,RAPD,RFLP,SSR、SNP等分子標(biāo)記技術(shù)提供的遺傳多態(tài)性信息含量豐富,結(jié)合相應(yīng)遺傳分析軟件,可以從分子水平上科學(xué)準(zhǔn)確的掌握自交系間的親緣關(guān)系和遺傳多樣性,玉米具有良好的雜種優(yōu)勢,利用這個優(yōu)勢進(jìn)行育種是選育玉米新品種的重要手段,詳細(xì)了解親本之間的親緣關(guān)系和雜種優(yōu)勢,從而更好地利用已有的各種優(yōu)異種質(zhì)資源,選育出更高產(chǎn)、更優(yōu)質(zhì)的新品種[7-10]。前人通過SSR和SNP標(biāo)記技術(shù)對玉米遺傳多樣性進(jìn)行過研究,SSR和SNP分子標(biāo)記方法的劃群結(jié)果均與系譜來源基本一致,且適用于糯玉米自交系的遺傳多樣性分析,同時結(jié)合自交系的田間表型性狀劃,一般配合力和特殊配合力的數(shù)據(jù),可以很大程度上提高育種效率[11-13]。本研究通過分子標(biāo)記技術(shù),從收集的糯玉米種質(zhì)資源中選出87份農(nóng)藝性狀較好的骨干自交系,利用國家玉米DUS測試使用的40個SSR 核心標(biāo)記進(jìn)行遺傳聚類分析。從分子水平對87份糯玉米種質(zhì)資源的親緣關(guān)系進(jìn)行聚類分析,為構(gòu)建育種群體提供親緣關(guān)系參考,從而提高糯玉米雜種優(yōu)勢利用質(zhì)量,加快優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)糯玉米和甜加糯玉米新品種選育效率。
供試材料為課題組近年收集的87份糯玉米自交系,含4個雙隱自交系N 1、N 3、N 4、N 5,12個紫色糯玉米自交系N 3、N 4、N 15、N 17、N 24、N 31、N 42、N 47、N 48、N 57、N 79、N 81,3個黃糯自交系N 72、N 73、N 75,其余67份為普通白色糯玉米自交系(表1)。
表1 87份糯玉米自交系代號
利用玉米品種鑒定規(guī)程SSR標(biāo)記法(NY/T 1432—2014)所用的40對SSR核心引物為標(biāo)記[13](表2)。
以87份自交系2葉1心新鮮葉片為材料,用葉片DNA提取法 CTAB方法提取葉片基因組DNA。PCR擴(kuò)增總體積為10 μL,其中包括混合酶5 μL,上下游引物0.8 μL,DNA 2 μL,ddH2O 2.2 μL(混合酶和引物均購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司)。采用基因公司MG 96 G型 PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)程為:94 ℃模板DNA預(yù)變性5 min后,94 ℃變性55 s,55 ℃退火55 s,72 ℃延伸55 s,35個循環(huán),最后72 ℃延伸7 min;4 ℃保存。擴(kuò)增產(chǎn)物在40%聚丙烯酰胺凝膠120 V電壓下電泳90 min,銀染顯影。
根據(jù) PCR 擴(kuò)增圖譜,在相同位置有條帶標(biāo)記1,沒有條帶標(biāo)記0,缺失標(biāo)記9,建立矩陣數(shù)據(jù)庫。計算多態(tài)性含量 (PIC),各自交系間的遺傳相似系數(shù)(GS)和遺傳距離(GD),分別由SPAGeDi、PowerMarker V 3.25 和 MEGA 5.1軟件完成。
用40對SSR標(biāo)記對87份糯玉米自交系進(jìn)行多態(tài)性試驗(yàn)。利用PowerMarker V 3.25軟件分析,結(jié)果表明,40對核心引物SSR標(biāo)記共檢測到等位基因變異數(shù)89個,檢測的每對引物等位基因變異平均為2.23個,變異的范圍是1~4個,多態(tài)性信息含量PIC平均為0.32,等位基因頻率平均為0.71。40個SSR標(biāo)記的87份糯玉米自交系上PIC值平均為0.32,根據(jù)0.25 利用SPAGeDi軟件獲得群體的親緣關(guān)系矩陣,同時將矩陣中的負(fù)值設(shè)置為0,根據(jù)親緣關(guān)系矩陣進(jìn)行評估群體親緣關(guān)系的分布。分析87份自交系的Kinship得出,99.2%的自交系Kinship系數(shù)在0~0.5之間,其中59.8%的自交系Kinship系數(shù)為0,說明59.8%的自交系間無親緣關(guān)系;10.5%的自交系Kinship系數(shù)為0~0.1之間,說明這些自交系之間的親緣關(guān)系較弱;29.7%的自交系Kinship系數(shù)為0.1~0.5之間,表明這些自交系親緣關(guān)系較近;0.8%的自交系Kinship系數(shù)分布為0.5~1.2之間,說明這些自交系間的親緣很近,無雜種優(yōu)勢。其中,ZN 18與YYH 06之間的Kinship系數(shù)最大,為1.17,C 6 F與Z 362之間Kinship系數(shù)次之,為1.16,說明這兩對自交系的親緣關(guān)系很近,無雜種優(yōu)勢,不適合組配雜交種。 圖2 87份自交系的Kinship系數(shù)分布Fig.2 Kinship coefficient distribution of 87 inbred lines 利用PowerMarker V 3.25 軟件分析87份糯玉米的基因分型數(shù)據(jù),利用MEGA 5.1軟件,計算87份糯玉米自交系之間的遺傳距離,通過構(gòu)建遺傳圖譜進(jìn)行遺傳聚類分析,87份糯玉米自交系間的遺傳距離在0~0.63之間,平均為0.23;其中,自交系ZN 18與YYH 06之間遺傳距離最小,與Kinship分析結(jié)果一致。將87個糯玉米自交系分為四個類群,以N 8為代表的69個自交系為Ⅰ群,N 37為代表的10個自交系為Ⅱ群,N 15為代表的5個自交系為Ⅲ群,N 65為代表的3個自交系為Ⅳ群。聚類將4個雙隱的自交系N 1、N 3、N 4、N 5聚合在一起,同時,N 5與N 3和N 4的Kinship值為1.16和1.099 4,也表明他們之間有較近的親緣關(guān)系。12個紫色糯玉米自交系在Ⅰ群,3個黃糯自交系N 72,N 73,N 75在Ⅰ群,他們的Kinship值接近0.5,互相組配雜種優(yōu)勢不強(qiáng)。 根據(jù)遺傳分析劃分四個群,根據(jù)自交系生長特點(diǎn),結(jié)合Kinship值可明確自交系的利用方向,提高組配成功率。比如,N 1田間表現(xiàn)植株較矮,籽粒白,棒細(xì)長,配合力好,與N 1的Kinship值為0的自交系有47個,理論上可以從中組配出皮薄、脆、口感好的甜加糯新品種;黃色籽粒糯玉米自交系N 72,植株粗壯,果穗籽粒排列整齊色澤光亮,可以選擇Kinship值為0或者較低的白色自交系進(jìn)行組配,篩選黃白色澤對比度好品質(zhì)優(yōu)的雙色甜加糯新品種。通過聚類和Kinship分析,將糯玉米自交系劃分至不同的群中,明確自交系間的遺傳距離和親緣關(guān)系,提高育種效率。 表3 40對引物遺傳分析信息 圖3 87份糯玉米自交系遺傳距離NJ聚類分析 Fig.3 Neighbor-joining cluster map of genetic distance of 87 waxy maize inbred lines 采用分子標(biāo)記技術(shù)研究玉米遺傳信息,對改良玉米自交系和組配優(yōu)質(zhì)雜交組合有很高的參考價值。本研究采用40對SSR引物,在87份玉米自交系中檢測到89個等位基因變異,平均每對引物檢測出的等位基因變異為2.23個,變異范圍為1~4。通過聚類分析與Kinship系數(shù)分析,利用SSR分子標(biāo)記可以有效得出玉米自交系間的親緣關(guān)系,可以將親緣關(guān)系不清或血緣關(guān)系不明晰的玉米種質(zhì)資源進(jìn)行科學(xué)的劃分,為科學(xué)劃分玉米雜種優(yōu)勢群和雜交種的組配提供科學(xué)參考。 Kinship系數(shù)能清晰地反映87份自交系之間兩兩的遺傳親緣關(guān)系。N 4、N 5兩個均為雙隱改良親本選的二環(huán)系的姊妹系,與Kinship值為1.10相吻合,兩者組配無雜種優(yōu)勢,與實(shí)際組配情況一致。利用Ⅰ群中的N 13與Ⅲ群的N 2和N 15雜交,組配出兩個雜種優(yōu)勢優(yōu)良的組合閩糯133(閩審玉20180007)和花糯1101(贛審玉20170004)。N 13與N 2、N 15的Kinship相似系數(shù)分別為0和0.12,從分子水平也說明他們具有一定雜種優(yōu)勢。以此為指導(dǎo),用N 13與Ⅲ群中的N 33、N 77、N 84組配,檢驗(yàn)后代雜種優(yōu)勢是否與遺傳分析結(jié)果相一致。 目前,選育的在參試或者已經(jīng)通過的幾個新品種,花糯1101由N 13與N 15組配而來,2017年通過江西省審定;閩糯133由N 13與N 2組配而來,2018年通過福建省審定;閩糯811由N 13與N 58組配而來,2018年通過福建省審定,審定編號為閩審玉20180006;這3個組合間的Kinship值均為0。 在甜加糯品種選育方面,N 3作為雙隱親本,植株中等,花粉量大,與其Kinship值為0的自交系達(dá)49個,目前組配的4個甜加糯玉米新組合閩花甜糯136,薈甜糯139,閩甜糯251和閩甜糯816正在參加南方國家糯玉米區(qū)試、國家東南科企聯(lián)合體糯玉米區(qū)試和福建省糯玉米區(qū)試,其中閩花甜糯136以產(chǎn)量第一的優(yōu)勢通過國家東南區(qū)2018年糯玉米區(qū)試 ,進(jìn)入2019年續(xù)試。說明N 3配合力高,可以繼續(xù)與其他更多的Kinship值為0 的自交系進(jìn)行組配,篩選出優(yōu)質(zhì)甜加糯新品種。 王兵偉等[14]和韓晴等[15]采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對玉米自交系進(jìn)行聚類,分析結(jié)果與已知系譜關(guān)系基本一致,說明SSR分子標(biāo)記技術(shù)可靠,可用于玉米自交系遺傳多樣性分析。福建省糯玉米種質(zhì)資源遺傳基礎(chǔ)比較狹窄,育種中突破較少,隨著近些年的對外交流,在種質(zhì)資源創(chuàng)制方面取得一些突破,今后在加強(qiáng)對現(xiàn)有的種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析研究和利用的基礎(chǔ)上,加大種質(zhì)資源的創(chuàng)制、引進(jìn)與改良工作,結(jié)合現(xiàn)代分子育種技術(shù),通過掌握他們之間的親緣關(guān)系,進(jìn)行有目的性的創(chuàng)制,能夠提高親緣關(guān)系較近的自交系間的多態(tài)性位點(diǎn)和SSR位點(diǎn)的等位基因數(shù),促進(jìn)該類群自交系的利用,結(jié)合種質(zhì)資源自身特性配合力高低等,為后續(xù)骨干自交系的選育和優(yōu)質(zhì)組合的組配提供科學(xué)的指導(dǎo)[16-18]。2.2 87份自交系基因型間的親緣關(guān)系(Kinship)分析
2.3 87份自交系基因型的遺傳聚類分析
3 討 論