黎妍妍,李錫宏*,王林,馮吉,張英,尹忠春
1.湖北省煙草科學(xué)研究院,武漢市硚口區(qū)寶豐路6號(hào)香溢大酒店4樓430030
2.湖北中煙工業(yè)有限責(zé)任公司,武漢市東西湖區(qū)金山大道1355號(hào)430040
3.湖北省煙草公司恩施州公司,湖北省恩施市施州大道119號(hào)445000
煙草是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,目前連作是我國(guó)煙草生產(chǎn)中的主要種植制度。煙草連作障礙在我國(guó)煙葉種植區(qū)普遍存在,且與根際土壤微生物區(qū)系的惡化密切相關(guān)。長(zhǎng)期連作可降低土壤微生物活性,改變土壤微生物多樣性,引起土壤中微生物選擇性富集,導(dǎo)致土壤微生物群落結(jié)構(gòu)發(fā)生改變[1-2],造成植物-土壤-微生物形成的相互依賴的生態(tài)系統(tǒng)失衡;而根際微生態(tài)失衡又會(huì)進(jìn)一步引起土壤環(huán)境惡化和病原菌的大量繁殖,使連作障礙加劇。近年來(lái),通過(guò)生物熏蒸來(lái)緩解連作障礙已成為研究熱點(diǎn)之一。蕓薹屬植物、綠肥等常被用作生物熏蒸材料[3-4]。Lazzeri等[5]、Seigies等[6]和趙衛(wèi)松等[7]將蕓薹屬植物殘?bào)w加入土壤中,發(fā)現(xiàn)土壤微生物群落得到明顯改善,有益微生物的相對(duì)豐度增加;沈桂花[8]研究表明,采用黑麥草、油菜和紫云英等進(jìn)行生物熏蒸可提高植煙土壤微生物代謝活性;劉昕昕[9]將高硫芥菜用于熏蒸設(shè)施連作黃瓜土壤,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌群落多樣性顯著提高。因此,生物熏蒸通過(guò)改善根際土壤微生物區(qū)系,可有效克服連作障礙。
在菊科作物中,萬(wàn)壽菊(Tagetes erecta L.)是一種多用途的作物,具有抗菌性能[10]。煙草生產(chǎn)中,Li等[11]發(fā)現(xiàn)煙草與萬(wàn)壽菊間作具有改善土壤微生物群落的作用,土壤細(xì)菌群落的多樣性和豐富度提高,有益微生物的相對(duì)豐度增加,而土壤青枯菌的相對(duì)豐度則降低。目前,萬(wàn)壽菊秸稈也被用作生物熏蒸材料。王曉芳等[12-14]研究表明,采用萬(wàn)壽菊植物粉末或秸稈熏蒸蘋果園土壤,土壤中細(xì)菌數(shù)量增加、真菌數(shù)量減少,真菌群落多樣性、均勻度和豐富度指數(shù)均降低,可有效緩解蘋果連作障礙。然而,關(guān)于萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸應(yīng)用于植煙土壤的研究則鮮見(jiàn)報(bào)道,對(duì)煙株根際土壤微生物群落的影響也不明確。為此,在煙田中設(shè)置施用萬(wàn)壽菊秸稈粉末、評(píng)價(jià)萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸對(duì)植煙土壤原核微生物群落多樣性和結(jié)構(gòu)的影響試驗(yàn),旨在為緩解煙草連作障礙提供依據(jù)。
熏蒸用萬(wàn)壽菊來(lái)自上年在煙田周圍播撒的試驗(yàn)材料,采集根莖,自然風(fēng)干后,用粉碎機(jī)粉碎,過(guò)2 mm孔徑篩,備用。
2017—2019年,試驗(yàn)設(shè)置在湖北省恩施州宣恩縣椒園鎮(zhèn)涼風(fēng)村。試驗(yàn)地?zé)煵葸B作15年,種植煙草品種為云煙87。
1.3.1 土壤主要原核微生物數(shù)量分析
1.3.1.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2017年進(jìn)行萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸用量篩選試驗(yàn)。設(shè)置5個(gè)處理,CK1:不進(jìn)行萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸;T1、T2、T3和T4均為萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸處理,用量分別為750、1 500、2 250和3 000 kg/hm2,于煙田施肥后(4月5日)撒施于各試驗(yàn)小區(qū),之后起壟覆膜。每處理3次重復(fù),隨機(jī)區(qū)組排列,每小區(qū)共植煙64株。種植行株距為1.2 m×0.55 m,4月25日移栽。其他按當(dāng)?shù)貎?yōu)質(zhì)煙葉生產(chǎn)技術(shù)規(guī)范進(jìn)行栽培管理。
1.3.1.2 根際土壤樣品的取樣
2017年于煙苗移栽后50 d和100 d時(shí),在T1、T2、T3、T4和CK1處理每小區(qū)中5個(gè)區(qū)域分別選擇1株煙株,按文獻(xiàn)[15]的方法采集根際土壤樣品,混合形成1個(gè)土樣,共計(jì)30個(gè)土樣,用于土壤細(xì)菌和放線菌的培養(yǎng)。
1.3.1.3 土壤細(xì)菌和放線菌數(shù)量的測(cè)定
采用平板計(jì)數(shù)法統(tǒng)計(jì)T1、T2、T3、T4和CK1處理每克土中所含細(xì)菌和放線菌的個(gè)數(shù)[16]。細(xì)菌和放線菌分別采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基和高氏1號(hào)培養(yǎng)基培養(yǎng)。
1.3.2 土壤原核微生物群落結(jié)構(gòu)分析
1.3.2.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
基于2017年研究結(jié)果,選取最佳處理,于2018—2019年連續(xù)兩年(田間試驗(yàn)設(shè)置相同)開(kāi)展試驗(yàn)。設(shè)置2個(gè)處理,3次重復(fù),共6個(gè)小區(qū)。CK2:不進(jìn)行萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸;TE:萬(wàn)壽菊秸稈(1 500 kg/hm2)熏蒸,于煙田施肥后(4月5日)撒施于各試驗(yàn)小區(qū),之后起壟覆膜。種植行株距為1.2 m×0.55 m,每小區(qū)種植烤煙100株,4月28日移栽。其他按當(dāng)?shù)貎?yōu)質(zhì)煙葉生產(chǎn)技術(shù)規(guī)范進(jìn)行栽培管理。
1.3.2.2 根際土壤樣品的取樣
2019年于煙苗移栽后50 d和100 d時(shí),在TE和CK2處理每小區(qū)中5個(gè)區(qū)域分別選擇生長(zhǎng)基本一致的1株煙株并采集其根際土壤樣品,混合后形成1個(gè)土樣。按照取樣時(shí)期分別記作TE-50、CK2-50、TE-100和CK2-100,共計(jì)12個(gè)土樣,采集后的土樣保存于-80℃冰箱,用于土壤16S擴(kuò)增子的測(cè)序。
1.3.2.3 土壤原核微生物群落分析
(1)DNA提取及PCR擴(kuò)增。用FastDNA Spin Kit試劑盒(美國(guó)MP Biomedicals公司)提取TE和CK2處理土壤總DNA。以樣品DNA為模板,用引物515F和806R[515F:5′-GTGCCAGCMGCCGCG GTAA-3′;806R:5′-GGACTACHVGGGTWTCTAA T-3′]對(duì)16S rDNA V4可變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系和反應(yīng)程序參照文獻(xiàn)[15]的方法進(jìn)行。PCR產(chǎn)物檢測(cè)合格后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,在Illumina Hiseq PE250測(cè)序平臺(tái)上由諾禾致源生物信息科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。
(2)操作分類單元(Operational Taxonomic Units,OTU)聚類與物種注釋。對(duì)所有樣品的Effective Tags進(jìn)行聚類,將相似度≥97%的有效序列歸為1個(gè)OTU。利用QIIME軟件計(jì)算土壤微生物群落的多樣性指數(shù)(Shannon多樣性指數(shù)和Sobs、Chao1豐富度指數(shù))。對(duì)每個(gè)OTU的代表序列進(jìn)行物種注釋,并用Mothur方法與SILVA的SSUrRNA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行物種注釋分析,獲得每個(gè)OUT的分類水平。
采用單因素方差分析法(One-way ANOVA)分析土壤主要原核微生物數(shù)量在不同處理間的差異(P<0.05),采用T檢驗(yàn)(T-test)分析土壤原核微生物群落多樣性指數(shù)、物種相對(duì)豐度等在TE和CK2處理間的差異(P<0.05)。根據(jù)樣品在屬水平上的物種注釋及豐度信息,根據(jù)文獻(xiàn)[15]的方法對(duì)TE和CK2的前35位菌屬的相對(duì)豐度進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,然后采用HemI軟件對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化值繪制Heatmap圖。
煙株根際土壤中細(xì)菌和放線菌數(shù)量測(cè)定結(jié)果見(jiàn)表1。表1顯示,細(xì)菌和放線菌數(shù)量在各處理間存在顯著差異。煙苗移栽后50 d時(shí),萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸的處理土壤中細(xì)菌數(shù)量較CK1增加9.80%~98.04%,其中T2、T3和T4處理顯著高于CK1;放線菌數(shù)量較CK1增加5.11%~53.98%,其中T1和T2處理顯著高于CK1。煙苗移栽100 d時(shí),萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸的處理土壤中細(xì)菌數(shù)量較CK1增加10.94%~94.27%,T1、T2、T3和T4處理均顯著高于CK1;放線菌數(shù)量較CK1增加2.06%~32.99%,其中T2、T3和T4處理顯著高于CK1。表明萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸能增加土壤中細(xì)菌和放線菌數(shù)量,但添加量750 kg/hm2(T1)、2 250 kg/hm2(T3)和3 000 kg/hm2(T4)的效果稍劣于1 500 kg/hm2(T3)的處理。因此,本試驗(yàn)中進(jìn)一步分析了萬(wàn)壽菊秸稈添加量1 500 kg/hm2的熏蒸效果。
表1 土壤細(xì)菌和放線菌數(shù)量的比較①Tab.1 Amount of bacteria and actinomycetes in soil
對(duì)萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸(1 500 kg/hm2,TE)和不熏蒸(CK2)的土壤原核微生物群落(圖1)比較發(fā)現(xiàn),煙苗移栽后50 d時(shí),TE-50和CK2-50樣品分別得到5 648個(gè)和5 233個(gè)OTUs,其中兩者間共有的OTUs數(shù)量為4 141個(gè);煙苗移栽后100 d時(shí),TE-100和CK2-100樣品分別得到5 626個(gè)和5 520個(gè)OTUs,其中兩者間共有的OTUs數(shù)量為4 330個(gè)。表明萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸(TE)后土壤原核微生物群落OTUs數(shù)量明顯增多。
由表2可以看出,煙苗移栽后50 d時(shí),TE-50土壤Sobs、Shannon和Chao 1指數(shù)均顯著高于CK2-50,較CK2-50分別增加11.81%、6.09%和11.27%。煙苗移栽后100 d時(shí),TE-100土壤Sobs、Shannon和Chao 1指 數(shù) 較CK2-100分 別 增 加3.18%、0.21%和3.28%。表明萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸可提高土壤原核微生物群落的多樣性和豐富度。
圖1 各組樣本OTUs分布Venn圖Fig.1 Venn diagram of OTUs distribution for each soil sample
表2 土壤原核微生物群落多樣性和豐富度分析①Tab.2 Diversity and richness indexes of prokaryotic microbial community in soil
2.3.1 土壤原核微生物在門水平上的組成
在門水平上,對(duì)相對(duì)豐度排名前10位的土壤原核微生物進(jìn)行了分析,結(jié)果見(jiàn)表3。不同時(shí)期檢測(cè)出TE和CK2土壤樣品中優(yōu)勢(shì)菌門的相對(duì)豐度從高到低依次為變形菌門(Proteobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、綠彎菌門(Chloroflexi)、厚壁菌門(Firmicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、浮霉菌門(Planctomycetes)和硝化螺旋菌門(Nitrospirae)。煙苗移栽50 d時(shí),TE-50土壤中芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)的相對(duì)豐度顯著高于CK2,其他9個(gè)菌門在兩處理間差異不顯著。煙苗移栽后100 d時(shí),TE-100土壤中變形菌門(Proteobacteria)和芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)的相對(duì)豐度均顯著高于CK2,其他8個(gè)菌門在兩處理間差異不顯著。
表3 門水平上土壤原核微生物的相對(duì)豐度分析Tab.3 Relative abundances of main soil prokaryotic microbes at phylum level (%)
2.3.2 土壤原核微生物在屬水平上的組成
在屬水平上,土壤中相對(duì)豐度>1%的土壤原核微生物分析結(jié)果見(jiàn)表4。表4表明,煙苗移栽后50 d時(shí),TE-50和CK2-50土壤中分別有8個(gè)和5個(gè)菌屬的相對(duì)豐度高于1%;TE-50中水恒桿菌屬(Mizugakiibacter)、羅思河小桿菌屬(Rhodanobacter)的相對(duì)豐度顯著低于CK2-50,而鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、未確定屬的芽單胞菌科(unidentified Gemmatimonadaceae)[17]和H16的相對(duì)豐度顯著高于CK2-50。煙苗移栽后100 d時(shí),TE-100和CK2-100處理土壤中分別有11個(gè)和6個(gè)菌屬的相對(duì)豐度高于1%;TE-100處理中水恒桿菌屬(Mizugakiibacter)、未確定屬的芽單胞菌科(unidentified Gemmatimonadaceae)、伯克霍爾德菌屬(Burkholderia-Paraburkholderia)和Candidatus Solibacter的相對(duì)豐度顯著高于CK2-100,而Candidatus Nitrosotalea的相對(duì)豐度顯著低于CK2-100。
對(duì)35個(gè)菌屬相對(duì)豐度的相似性進(jìn)行HEMI聚類分析,結(jié)果見(jiàn)圖3。圖3表明,煙苗移栽后50 d時(shí),TE-50中鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、苯基桿菌屬(Phenylobacterium)、變桿菌屬(Variibacter)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、假雙頭斧形菌屬(Pseudolabrys)、未確定屬的芽單胞菌科(unidentified Gemmatimonadaceae)、未確定屬
的硝化螺旋菌科(unidentified Nitrospiraceae)[18]、Ramlibacter、赭黃嗜鹽囊菌屬(Haliangium)、溶桿菌屬(Lysobacter)、H16和Gaiella的相對(duì)豐度較高;CK2-50中水恒桿菌屬(Mizugakiibacter)、羅思河小桿菌屬(Rhodanobacter)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、堆囊菌屬(Sorangium)、戴氏菌屬(Dyella)、不動(dòng)桿菌屬(Acidibacter)、未確定屬的酸桿菌科[unidentified Acidobacteriaceae(Subgroup 1)][19]、Granulicella和慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)的相對(duì)豐度較高。煙苗移栽100 d時(shí),TE-100中RB41、根微菌屬(Rhizomicrobium)、Bryobacter、Candidatus Solibacter、Reyranella、伯霍爾德桿菌屬(Burkholderia-Paraburkholderia)、紅游動(dòng)菌屬(Rhodoplanes)、黃色土源菌屬(Flavisolibacter)和酸桿菌屬(Acidobacterium)的相對(duì)豐度較高;CK2-100中Candidatus Nitrosotalea、unidentified OPB35 soil group、豐佑菌屬(Opitutus)和Aquicella的相對(duì)豐度較高。
表4 屬水平上土壤原核微生物的相對(duì)豐度分析Tab.4 Relative abundances of major soil prokaryotic microbes at genus level (%)
圖3 屬水平上原核微生物物種豐度聚類熱圖Fig.3 Heatmap of relative abundances of soil prokaryotic microbes at genus level
本研究中發(fā)現(xiàn),不同用量萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸后植煙土壤細(xì)菌和放線菌數(shù)量均有所增加,這與其應(yīng)用于連作蘋果土壤上的研究結(jié)果一致[14]。在4種用量中,萬(wàn)壽菊秸稈1 500 kg/hm2的添加量在增加土壤細(xì)菌和放線菌數(shù)量中的作用最為顯著,低添加量(750 kg/hm2)的熏蒸效果不理想可能是由于添加量不足所造成的;高添加量(2 250 kg/hm2和3 000 kg/hm2)則可能會(huì)由于植物材料過(guò)多而沒(méi)有充分腐解,導(dǎo)致土壤透氣性不良、土壤顆粒黏結(jié)[14],進(jìn)而刺激病原菌的生長(zhǎng)[20]。
土壤微生物多樣性是表征土壤穩(wěn)定性與質(zhì)量的重要指標(biāo)。微生物群落多樣性和豐富度指數(shù)越高,群落結(jié)構(gòu)越趨于穩(wěn)定[21]。煙草連作5年后,土壤微生物群落的多樣性顯著降低,逐漸趨于單一化[22]。本研究結(jié)果表明,萬(wàn)壽菊秸稈(1 500 kg/hm2)熏蒸提高了土壤原核微生物群落尤其是煙苗移栽后50 d時(shí)的土壤原核微生物群落Sobs、Shannon和Chao1指數(shù),這與水稻秸稈還田、油菜綠肥翻壓等提高煙草根際微生物群落多樣性的作用相似[23],有利于避免微生物種群趨于單一化,提高土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。
萬(wàn)壽菊秸稈(1 500 kg/hm2)熏蒸可顯著提高土壤中芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)的相對(duì)豐度,有利于更好地抑制土傳病原菌的定殖,促進(jìn)植物的健康生長(zhǎng)[15,24-25]。屬水平上的土壤原核微生物群落構(gòu)成在萬(wàn)壽菊秸稈(1 500 kg/hm2)熏蒸后也發(fā)生了變化,煙苗移栽后50 d時(shí)土壤中拮抗 菌(Sphingomonas、Pseudomonas、Gemmatimonas、unidentified Gemmatimonadaceae、Lysobacter)以及降解菌(Ramlibacter)的相對(duì)豐度明顯提高,這些原核微生物有利于抑制土傳病原菌對(duì)煙草生長(zhǎng)的危害[26-30],降解土壤中多環(huán)芳烴物質(zhì),減輕化感自毒物質(zhì)對(duì)根系的損傷[31];煙苗移栽后100 d時(shí)土壤中拮抗菌(Burkholderia)、功能菌(Candidatus Solibacter、Bryobacter和Rhizomicrobium)、根際促生菌(Flavisolibacter)相對(duì)豐度也較高,這些原核微生物有利于抑制土傳病原菌,同時(shí)可分解土壤有機(jī)質(zhì)、促進(jìn)土壤碳循環(huán),為煙株生長(zhǎng)提供足夠的營(yíng)養(yǎng),促進(jìn)煙株根系發(fā)育[32-34]。萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸提高根際土壤中這些有益菌相對(duì)豐度的原因可能是萬(wàn)壽菊秸稈中含有豐富的纖維素和木質(zhì)素[35],可為土壤微生物的活動(dòng)提供豐富的碳源和氮源,促進(jìn)微生物的生長(zhǎng)和繁殖,從而改善土壤微生物結(jié)構(gòu)[36]。
本研究中將萬(wàn)壽菊秸稈粉碎,分析并證實(shí)了萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸在改善植煙土壤原核微生物群落結(jié)構(gòu)中的作用,而有關(guān)萬(wàn)壽菊秸稈的其他利用方式是否也具有同樣的作用效果還有待進(jìn)一步研究。
萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸(750~3 000 kg/hm2)可增加煙株根際土壤細(xì)菌和放線菌數(shù)量,以1 500 kg/hm2的用量效果最明顯。萬(wàn)壽菊秸稈熏蒸(1 500 kg/hm2)可提高根際土壤原核微生物群落Shannon多樣性指數(shù)和Sobs、Chao1豐富度指數(shù),增加拮抗菌、降解菌、功能菌和根際促生菌的相對(duì)豐度,在改善連作煙田土壤微生物群落結(jié)構(gòu)中具有積極作用,同時(shí)具有緩解煙草連作障礙的潛在作用。