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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對芪歸八味湯治療病毒性心肌炎作用機(jī)制的分析

2021-04-23 08:56高敏職利琴吳倩郭洪兆
山東醫(yī)藥 2021年11期
關(guān)鍵詞:網(wǎng)絡(luò)圖數(shù)目靶點

高敏,職利琴 ,吳倩,郭洪兆

1 陜西中醫(yī)藥大學(xué),陜西咸陽712046;2 西安市第五醫(yī)院

病毒性心肌炎(VMC)是指感染病毒之后引起的,以心肌非特異性炎癥為主要病變的心血管系統(tǒng)疾病,好發(fā)于年輕人群,被認(rèn)為是青少年群體發(fā)生心力衰竭、心律失常和猝死的一個重要原因[1]。目前,臨床上針對VMC 的治療以抗病毒治療和營養(yǎng)心肌為主,但療效并不樂觀。單純的西醫(yī)治療容易使病毒產(chǎn)生耐藥性,有研究在西醫(yī)基礎(chǔ)上聯(lián)合使用中藥治療VMC,結(jié)果顯示可有效改善患者癥狀,提高其免疫力、降低復(fù)發(fā)風(fēng)險[2-3]。芪歸八味湯以當(dāng)歸補(bǔ)血湯和生脈散為基礎(chǔ)方,主要由黃芪、當(dāng)歸、太子參、麥冬、五味子、柏子仁、天冬、紅花八味藥組成,主治氣陰兩虛型VMC。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是由英國藥理學(xué)家HOPKINS[4]首次提出的,主要是以系統(tǒng)生物學(xué)和生物信息學(xué)為基礎(chǔ),全面分析藥物與疾病和靶點之間的“多成分、多靶點、多途徑”協(xié)同作用關(guān)系。2019年10 月—2020 年9 月,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析芪歸八味湯治療VMC的作用機(jī)制?,F(xiàn)報告如下。

1 方法

1.1 藥物活性成分篩選與靶點預(yù)測 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp. php)數(shù)據(jù)庫中,根據(jù)ADME 參數(shù)設(shè)置口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18 為篩選條件,收集芪歸八味湯中各中藥的化學(xué)成分及其作用靶點。因TCMSP 數(shù)據(jù)庫中未收錄麥冬,在中藥分子機(jī)制的生物信息學(xué)分析工具(BATMAN-TCM)數(shù)據(jù)庫中獲得麥冬的化學(xué)成分,設(shè)置“藥物—靶點”模型的相似性閾值≥20、P≤0.05,選取符合條件的活性成分。選擇UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)的UniProtKB 搜索功能,將靶蛋白轉(zhuǎn)換為對應(yīng)的靶基因,得到所有靶基因的官方名稱。將得到的靶點信息進(jìn)行統(tǒng)計整理,利用Cytoscape3.7.2 軟件以8 味中藥篩選后的化學(xué)成分與標(biāo)準(zhǔn)化的基因名稱為基礎(chǔ),根據(jù)Degree 值大小依次排列,繪制藥物—成分—靶點關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。

1.2 藥物—疾病共同靶點獲取 在OMIM 數(shù)據(jù)庫(http://omim. org/)和 Genecards 數(shù)據(jù)庫,以“Viral myocarditis”為檢索詞,收集VMC 的疾病相關(guān)靶點。將去重后的疾病靶點與藥物靶點通過R軟件繪制韋恩圖,獲得藥物—疾病共同靶點。

1.3 蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點篩選 將關(guān)鍵靶點輸入String 數(shù)據(jù)庫(https://stringdb. org/),研究物種設(shè)置為Homo sapiens,置信度設(shè)置為0.9,隱藏游離的節(jié)點,獲得可視化關(guān)于藥物—疾病共同靶點的PPI 網(wǎng)絡(luò)圖,并導(dǎo)出TSV 文件。將PPI 網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)入 Cytoscape3.7.2,通過 Network Ana?lyzer 進(jìn)行分析,將平均 Degree 值為 8.870 4、平均緊密度為0.427 0、平均介度為0.014 9作為標(biāo)準(zhǔn),三項均高于上述標(biāo)準(zhǔn)的靶點即為芪歸八味湯治療VMC的核心靶點。

1.4 核心靶點的基因本體(GO)功能和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析 將芪歸八味湯治療VMC 的核心靶點進(jìn)行GO 功能和KEGG通路分析,設(shè)置P<0.01。按照每個條目涉及的靶點數(shù)目進(jìn)行排序,根據(jù)P值大小列出前20 條路徑,篩選排名靠前的生物過程和通路。

2 結(jié)果

2.1 活性成分篩選結(jié)果 TCMSP 數(shù)據(jù)庫對芪歸八味湯中7 味中藥的活性成分進(jìn)行檢索,結(jié)果顯示共收集 616 種成分(黃芪 87 種、當(dāng)歸125 種、太子參 25種、五味子130種、天冬32種、柏子仁28種、紅花189種),篩選并刪除無靶點的成分后得到42 種有效成分(黃芪16種、當(dāng)歸2種、太子參5種、五味子7種、天冬 7 種、柏子仁 5 種、紅花 16 種);BATMAN-TCM 數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果顯示麥冬的有效成分共18種。其中,太子參、紅花、天冬和當(dāng)歸的重復(fù)成分為β-谷甾醇,太子參和紅花的重復(fù)成分為木犀草素,紅花和黃芪的重復(fù)成分為山柰酚,紅花、黃芪和天冬的重復(fù)成分為槲皮素,紅花、當(dāng)歸、天冬和麥冬的重復(fù)成分為豆甾醇。8 味中藥共對應(yīng)有效基因靶點1 252 個,剔除重復(fù)靶點后最終獲得479個藥物靶點。

2.2 藥物—成分—靶點關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖繪制結(jié)果 藥物—成分—靶點關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖包括552個節(jié)點(藥物8個、成分 66 個、靶點479 個)和1 706 條邊。成分按Degree 值大小排名前10 位分別為槲皮素(448)、豆甾醇(210)、β-谷甾醇(140)、山柰酚(115)、木犀草素(112)、尿苷(44)、花生四烯酸(38)、7-O-methyliso?mucronulatol(38)、pseudoprotodioscin_qt(38)、鳥 嘌呤核苷(38),靶點按Degree 值大小排名前10 位分別為 PTGS2(41)、NCOA2(37)、PTGS1(31)、PRSS1(22)、PGR(20)、AR(20)、GABRA1(20)、DPP4(18)、SCN5A(17)、ADRB2(17)。

2.3 藥物—疾病共同靶點獲取 將OMIM 和Gene?cards 數(shù)據(jù)庫的VMC 相關(guān)靶點匯總,刪除重復(fù)靶點后得到1 058個疾病靶點,與479個藥物靶點取交集,得到124個藥物—疾病共同靶點。

2.4 PPI 網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建及核心靶點篩選結(jié)果 PPI 網(wǎng)絡(luò)圖包括124 個節(jié)點、479 條邊,篩選出的核心靶點有19 個,分別為腫瘤壞死因子(TNF)、JUN、RELA、AKT1、MAPK1/8/14、白細(xì)胞介素(IL)-4/6、TP53、CXCL8、EGFR、FOS、VEGFA、CASP8、EGF、CTNNB1和EDN1。見表1。

表1 芪歸八味湯治療VMC的核心靶點信息

2.5 核心靶點的GO 功能富集分析結(jié)果 GO 功能富集分析得到2 739 個條目,在生物學(xué)過程(BP)中富集2 502 條路徑,主要參與對細(xì)菌來源分子的反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)、對氧化應(yīng)激的反應(yīng)、外源性凋亡信號通路等過程;在細(xì)胞成分(CC)中富集92條路徑,主要涉及薄膜筏、膜微域、膜區(qū)域等部位;在分子功能(MF)中富集145 條路徑,主要涉及受體配體活動、細(xì)胞因子受體結(jié)合等方面。

2.6 核心靶點的KEGG通路富集分析結(jié)果 KEGG通路富集分析得到164 條通路途經(jīng),富集排名靠前的通路主要有糖尿病并發(fā)癥中的AGE/RAGE 信號通路(靶點數(shù)目32)、TNF 信號通路(靶點數(shù)目29)、流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化信號通路(靶點數(shù)目30)、乙型肝炎(靶點數(shù)目31)、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染信號通路(靶點數(shù)目32)、南美錐蟲?。ò悬c數(shù)目26)、IL-17 信號通路(靶點數(shù)目27)、人巨細(xì)胞病毒感染(靶點數(shù)目30)、MAPK信號通路(靶點數(shù)目30)、丙型肝炎(靶點數(shù)目26)、甲型流感(靶點數(shù)目26)、人類免疫缺陷病毒1 感染(靶點數(shù)目25)、細(xì)胞凋亡(靶點數(shù)目24)等。

3 討論

VMC 根據(jù)臨床癥狀劃屬于“溫病”“心悸”“胸痹”“怔忡”等范疇。因患者體質(zhì)虛弱,又復(fù)感溫?zé)岵⌒?,溫毒之邪犯及心脈發(fā)為本病。該病病位在心,涉及脾、肺、腎等臟器,屬本虛標(biāo)實之證[5]。目前臨床藥物治療策略大多是抗氧化、營養(yǎng)心肌、抗病毒等,但效果并不理想。芪歸八味湯是筆者導(dǎo)師多年的臨床經(jīng)驗總結(jié),由當(dāng)歸補(bǔ)血湯和生脈散為基礎(chǔ)方加減,主治氣陰兩虛型VMC,共八味藥。黃芪、當(dāng)歸補(bǔ)氣養(yǎng)血,太子參、麥冬和五味子滋陰止汗、益氣復(fù)脈,柏子仁和天冬滋心陰、安心神,紅花調(diào)和諸藥、通暢血運。研究表明,黃芪皂苷可以顯著抑制炎癥因子IL-1β、TNF-α 等表達(dá),太子參多糖可抑制心肌細(xì)胞凋亡,麥冬改善心肌缺血,五味子能減少炎癥反應(yīng)對心肌的損害,紅花強(qiáng)心,天冬降壓、減慢心率,柏子仁營養(yǎng)心?。?]。因此,芪歸八味湯全方八味中藥對心血管系統(tǒng)有不同的保護(hù)作用。

本研究通過對藥物—成分—靶點網(wǎng)絡(luò)圖分析可知,芪歸八味湯主要的化學(xué)成分是槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素等。研究表明,槲皮素具有抗病毒、抗炎、清除活性氧自由基等作用,可通過降低 VMC 小鼠 TGF-β1和 TNF-α 表達(dá)抑制 NF-κB通路的激活[7-9]。豆甾醇可顯著抑制 TNF-α、IL-6 和IL-1β 表達(dá),并通過下調(diào)NF-κB p65 和p38 MAPK,增加 IL-10 釋放[10]。JINA 等[11]研究發(fā)現(xiàn),β-谷甾醇具有抗炎作用,可減少IL-1、TNF-α 等炎癥因子釋放。木犀草素可以減輕炎癥反應(yīng),并通過調(diào)節(jié)NF-κB 和MAPK 信號通路來緩解氧化應(yīng)激[12]。由此可見,芪歸八味湯的化學(xué)成分主要通過抗炎以及降低氧化應(yīng)激來治療VMC。

本研究PPI 結(jié)果顯示,芪歸八味湯作用于VMC的 核 心 靶 點 主 要 是 TNF、JUN、RELA、AKT1、MAPK1/8/14、IL-4/6、TP53、CXCL8、EGFR、FOS、VEGFA、CASP8、EGF、CTNNB1 和 EDN1。TNF 是一類促炎因子,而VMC 的心肌病變可能與TNF-α 有關(guān),高水平的TNF-α 會對心肌造成損傷;此外,TNF-α 還可以激活NF-κB 信號通路,進(jìn)而促進(jìn)炎癥因子分泌[13]。JUN 主要參與細(xì)胞增殖、免疫相關(guān)以及凋亡抑制等信號通路[14]。AKT 是 PI3K/AKT 信號通路中的核心橋梁點,參與炎癥過程、心血管疾病等的發(fā)生發(fā)展[15-16];此外,AKT 可以促進(jìn) CASP 磷酸化,進(jìn)而抑制細(xì)胞凋亡[17]。鞏子漢等[18]發(fā)現(xiàn),MAPK1 不僅可以正向調(diào)控TNF-α 表達(dá),還可以和MAPK14 共同參與炎癥反應(yīng)過程。由此可見,芪歸八味湯可通過多個靶點治療VMC。

本研究KEGG 富集分析結(jié)果顯示,排名靠前的通路有糖尿病并發(fā)癥中的AGE/RAGE 信號通路、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染信號通路、乙型肝炎、流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化信號通路、人巨細(xì)胞病毒感染、MAPK 信號通路、TNF 通路、細(xì)胞凋亡、IL-17 信號通路等。TNF通路主要促進(jìn)TNF-α、IL-6、IL-8 等炎癥因子釋放,加重機(jī)體的炎癥反應(yīng)[19]。IL-17信號通路是一條經(jīng)典的促炎通路,參與機(jī)體炎癥反應(yīng)過程[20]。MAPK 信號通路涉及細(xì)胞生長、增殖和凋亡等功能[21]。楊超茅等[22]發(fā)現(xiàn),AGE/RAGE 信號通路可以激活NADPH 氧化酶,繼而活化NF-κB,從而釋放大量 TNF-α、IL-1 等炎癥因子。TNF 通路和IL-17信號通路與炎癥反應(yīng)密切相關(guān),提示芪歸八味湯可能主要作用于炎癥因子來抑制炎癥反應(yīng),從而發(fā)揮治療VMC的作用。

綜上所述,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法系統(tǒng)研究了芪歸八味湯治療VMC 的作用機(jī)制,表明芪歸八味湯中的活性成分可通過調(diào)節(jié)AGE/RAGE、MAPK、TNF、IL-17信號通路等,減輕炎癥反應(yīng)、抑制細(xì)胞凋亡,發(fā)揮治療VMC 的作用,證實了中藥復(fù)方多靶點、多途徑、協(xié)調(diào)治療疾病的過程。

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