陳 存,丁昌俊,黃秦軍,李政宏,張 靜,劉 寧,李 波,蘇曉華
(林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,國(guó)家林業(yè)局林木培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所,北京 100091)
豐富的種質(zhì)資源為植物育種、遺傳研究和新品種選育提供了條件和物質(zhì)基礎(chǔ)[1-2]。為更好地應(yīng)對(duì)當(dāng)前氣候條件變化,急需培育出適宜在不同條件下生長(zhǎng)的新品種,同時(shí)合理保護(hù)和利用植物種質(zhì)資源是一項(xiàng)復(fù)雜的任務(wù)。在原始種質(zhì)資源中挑選少部分有代表性的種質(zhì)構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)可以最大限度地保存其表型或遺傳多樣性,從而有效地解決種質(zhì)資源保存中成本高等問(wèn)題,縮短育種進(jìn)程,促進(jìn)種質(zhì)資源的合理開(kāi)發(fā)和利用[3-4]。
與作物種質(zhì)資源核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建相關(guān)的研究已有眾多報(bào)道[5-8],其構(gòu)建方法、策略和評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)均相對(duì)成熟。參考作物核心種質(zhì)庫(kù)的構(gòu)建策略,多種木本植物核心種質(zhì)庫(kù)已構(gòu)建成功,包括葡萄(Vitis viniferaL.)[9]、油橄欖(Olea europaeaL.)[10]和角豆(Ceratonia siliquaL.)[11]等經(jīng)濟(jì)樹(shù)種,歐洲黑楊(Populus nigraL.)[12]、木荷(Schima superbaGardn. et Champ.)[13]、杉木(Cunninghamia lanceolata(Lamb.) Hook.)[14]和馬 尾松(Pinus massonianaL.)[15]等用材林樹(shù)種。當(dāng)前,構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)所選用的數(shù)據(jù)因研究目的不同,主要有表型數(shù)據(jù)或基因型數(shù)據(jù)[16]。植株的表型數(shù)據(jù)測(cè)量方便,在核心種質(zhì)庫(kù)的構(gòu)建研究中應(yīng)用廣泛,同時(shí)隨著分子標(biāo)記技術(shù)和基因組測(cè)序技術(shù)在核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建研究中的應(yīng)用,相關(guān)學(xué)者越發(fā)認(rèn)識(shí)到植物表型研究的重要性和必要性。育種研究最終目的是獲得具有特定性狀和表型的新品種[7,17],因此,基于表型數(shù)據(jù)構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)仍是未來(lái)種質(zhì)資源研究的重要內(nèi)容。由于不同物種具有不同的表型特征和群體結(jié)構(gòu),在構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)的研究中采用的取樣策略不同,均具有一定的優(yōu)缺點(diǎn),如隨機(jī)取樣策略可以更好的保存原始種質(zhì)的群體結(jié)構(gòu),但構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)的代表性和多樣性相對(duì)較差;偏離度取樣可以保留較大的變異和多樣性;位點(diǎn)優(yōu)先取樣策略不僅可以保留具有性狀極值的種質(zhì),同時(shí)可以較好的保留群體結(jié)構(gòu)[18-19]。因此,研究者應(yīng)根據(jù)所研究種質(zhì)資源的特點(diǎn)選擇合適的取樣策略。
美洲黑楊(Populus deltoidesMarsh.)種質(zhì)資源在楊樹(shù)育種研究工作中占有重要地位[20-21],合理保護(hù)其表型和遺傳多樣性是高效開(kāi)發(fā)和利用美洲黑楊種質(zhì)資源的前提,本課題組通過(guò)前期對(duì)其表型和遺傳多樣性研究,發(fā)現(xiàn)原始種質(zhì)資源庫(kù)具有豐富的多樣性[22]。為了更好地保存美洲黑楊種質(zhì)資源,有研究者利用分子標(biāo)記技術(shù)構(gòu)建其核心種質(zhì)庫(kù)[23-24],但基于表型數(shù)據(jù)構(gòu)建美洲黑楊核心種質(zhì)庫(kù)的研究仍未見(jiàn)報(bào)道。本研究基于美洲黑楊種質(zhì)資源表型和生理性狀,分析其群體結(jié)構(gòu),對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行分組,利用分組逐步聚類(lèi)取樣的方法構(gòu)建表型核心種質(zhì)庫(kù);通過(guò)與3 種常規(guī)取樣策略進(jìn)行比較,首次提出性狀頻率取樣策略并用于構(gòu)建美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù);在表型核心種質(zhì)庫(kù)的基礎(chǔ)上通過(guò)補(bǔ)充部分種質(zhì)構(gòu)建表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù),使其表型保留比例達(dá)到100.00%,最大化保存種質(zhì)資源的表型多樣性信息。本研究有助于研究者更好的了解、保護(hù)和利用美洲黑楊種質(zhì)資源,挖掘資源中的核心種質(zhì),為楊樹(shù)育種研究及其他物種表型核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建奠定基礎(chǔ)和提供參考。
本研究中的試驗(yàn)材料包括美洲黑楊6 個(gè)種源群體、27 個(gè)采樣點(diǎn)的258 個(gè)無(wú)性系(表1)。種質(zhì)來(lái)源地包括哥倫比亞河流域(美國(guó)華盛頓州,Was)、北美洲圣勞倫斯河流域(加拿大魁北克省,Que)和密西西比河流域(美國(guó)密蘇里州,Mis;艾奧瓦州,Iow;田納西州,Ten;路易斯安那州,Lou)。試驗(yàn)材料與前期研究中的材料來(lái)源信息一致[22]。
將美洲黑楊植株1 年生枝條剪成插穗,扦插于營(yíng)養(yǎng)缽中(口徑18 cm,高度25 cm),每個(gè)無(wú)性系扦插10 株,在中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院通州試驗(yàn)基地(39°73′35″ N,116°75′18″ E)溫室大棚進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)基質(zhì)為黃土:粗砂石:草炭土 = 6:1:1。
在植株生長(zhǎng)季,同時(shí)利用3 臺(tái)Li-6400 便攜式光合測(cè)定儀(Li-6400,LI-COR,美國(guó))測(cè)定植株葉片的凈光合速率(Pn)、胞間CO2濃度(Ci)、氣孔導(dǎo)度(Gs)和蒸騰速率(Tr),測(cè)定葉片為上部第5~7 片成熟葉片,每個(gè)無(wú)性系測(cè)定3 株。測(cè)量過(guò)程中充分考慮儀器、測(cè)量時(shí)間和環(huán)境等因素對(duì)測(cè)量指標(biāo)的影響,將258 個(gè)無(wú)性系分為9 組,每組28~29 個(gè)無(wú)性系,測(cè)量時(shí)間分為3 個(gè)時(shí)間段(9:00—9:40、9:40—10:20 和10:20—11:00),每臺(tái)儀器在1 個(gè)時(shí)間段內(nèi)可以完成1 組無(wú)性系1 株植株的1 個(gè)葉片光合參數(shù)的測(cè)量,最終使每個(gè)無(wú)性系測(cè)定的3 株的9 片葉片中每臺(tái)儀器在每個(gè)時(shí)間段各測(cè)定1 片,1 個(gè)生物學(xué)重復(fù)的測(cè)量周期為3 d,共測(cè)量9 d。使用葉綠素相對(duì)含量測(cè)定儀(SPAD-502,日本)測(cè)定植株上部第5~7 片成熟葉片的SPAD值,每個(gè)葉片選取6 個(gè)測(cè)定點(diǎn),每個(gè)無(wú)性系測(cè)定3 株。
每個(gè)無(wú)性系選取3 株生長(zhǎng)性狀相似的植株,各采集3~5 片成熟功能葉,稱(chēng)鮮質(zhì)量,使用葉面積儀(Yaxin-1241,北京)測(cè)量葉片形態(tài)性狀(長(zhǎng)度、寬度和葉面積),然后使其風(fēng)干稱(chēng)風(fēng)干質(zhì)量,最后烘干并稱(chēng)烘干質(zhì)量。利用元素分析儀(Thermo Fisher Scientific,Inc.,美國(guó)),測(cè)定烘干葉片中的碳、氮元素的含量。
在植株生長(zhǎng)后期,測(cè)量植株的株高、地徑和葉片數(shù)(葉痕數(shù)),同時(shí)對(duì)根系和莖段的生長(zhǎng)量(干質(zhì)量和鮮質(zhì)量)進(jìn)行測(cè)定。
表1 美洲黑楊種質(zhì)資源來(lái)源信息Table 1 Source information of P. deltoides germplasm resources
利用葉片的鮮質(zhì)量、風(fēng)干質(zhì)量和烘干質(zhì)量計(jì)算葉片自由水和結(jié)合水的含量,即自由水含量 = 鮮質(zhì)量-風(fēng)干質(zhì)量;結(jié)合水含量 = 風(fēng)干質(zhì)量-烘干質(zhì)量。
表型多樣性指數(shù)(Shannon-Wiener 指數(shù),H')的計(jì)算公式為:
式中:H'為Shannon-Wiener 指數(shù);ln 表示自然對(duì)數(shù);n為性狀指標(biāo)總數(shù);Pi表示某性狀指標(biāo)第i種級(jí)別的無(wú)性系數(shù)占總無(wú)性系數(shù)的比率,各性狀指標(biāo)被劃分為10 個(gè)級(jí)別,數(shù)值小于為第1 級(jí)別,數(shù)值大于等于為第10 級(jí)別,其中,每0.5σ劃分為一個(gè)級(jí)別。
無(wú)性系性狀頻率的計(jì)算公式為:
式中:Fj為第j個(gè)無(wú)性系的性狀頻率;n為性狀指標(biāo)總數(shù);Pij表示種質(zhì)庫(kù)中第j個(gè)無(wú)性系的第i個(gè)性狀指標(biāo)所在的性狀級(jí)別的頻率。
利用表型和生理指標(biāo)數(shù)據(jù)對(duì)6 個(gè)種源、258 個(gè)美洲黑楊無(wú)性系進(jìn)行分組,Was 種源的無(wú)性系單獨(dú)為一組;Que 和Iow 種源無(wú)性系為一組;Mis、Lou和Ten 種源無(wú)性系為一組?;跓o(wú)性系標(biāo)準(zhǔn)化的表型和生理指標(biāo)數(shù)據(jù)計(jì)算每組內(nèi)無(wú)性系間的歐式距離,采用可變類(lèi)平均法對(duì)無(wú)性系進(jìn)行聚類(lèi)分析,在最低聚類(lèi)水平上分別采用隨機(jī)取樣、偏離度取樣和位點(diǎn)優(yōu)先取樣的策略構(gòu)建表型核心種質(zhì)庫(kù)。同時(shí),本研究首次提出性狀頻率取樣策略,即在聚類(lèi)的最低級(jí)別的兩個(gè)或多個(gè)無(wú)性系中優(yōu)先選擇具有性狀極值的無(wú)性系,如果均具有性狀極值均進(jìn)入下一輪聚類(lèi)分析,如果均沒(méi)有性狀極值則選擇性狀頻率低的無(wú)性系進(jìn)入下一輪聚類(lèi)分析,以此類(lèi)推,直到構(gòu)建的種質(zhì)庫(kù)不滿(mǎn)足核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)。
參照前期研究中表型核心種質(zhì)庫(kù)的檢測(cè)方法,通過(guò)計(jì)算構(gòu)建的種質(zhì)庫(kù)相對(duì)于原始種質(zhì)庫(kù)的極差符合率(CR)、變異系數(shù)變化率(VR)、均值差異百分率(MD)、方差差異百分率(VD)和表型保留比例(RPR)對(duì)種質(zhì)庫(kù)的代表性進(jìn)行評(píng)價(jià),各參數(shù)的計(jì)算公式[5,18]如下:
式中:RC(i)是核心種質(zhì)第i個(gè)性狀的極差,RI(i)是原始種質(zhì)第i個(gè)性狀的極差,n是性狀總數(shù)。
式中:CVC(i)是核心種質(zhì)第i個(gè)性狀的變異系數(shù),CVI(i)是原始種質(zhì)第i個(gè)性狀的變異系數(shù),n是性狀總數(shù)。
式中:St是核心種質(zhì)與原始種質(zhì)進(jìn)行t測(cè)驗(yàn)得到的均值差異顯著(α= 0.05)的性狀數(shù),n是性狀總數(shù)。
式中:SF是核心種質(zhì)與原始種質(zhì)進(jìn)行F測(cè)驗(yàn)得到的方差差異顯著(α= 0.05)的性狀數(shù),n是性狀總數(shù)。
式中:MC(i)是核心種質(zhì)第i個(gè)性狀的表現(xiàn)型個(gè)數(shù),MI(i)是原始種質(zhì)第i個(gè)性狀的表現(xiàn)型個(gè)數(shù),n是性狀總數(shù)。
通過(guò)計(jì)算各個(gè)種質(zhì)庫(kù)各個(gè)性狀指標(biāo)的表型多樣性指數(shù)(H')對(duì)種質(zhì)庫(kù)的多樣性進(jìn)行評(píng)價(jià)?;谥鞒煞址治鰳?gòu)建的前2 個(gè)主成分因子的得分,繪制原始種質(zhì)庫(kù)和表型核心種質(zhì)庫(kù)的分布圖,對(duì)表型核心種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行確認(rèn)。
表型核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建的最低標(biāo)準(zhǔn)為:MD<20.00%且CR> 80.00%,RPR經(jīng)常作為評(píng)價(jià)表型核心種質(zhì)庫(kù)有效性和取樣比例必不可少的參數(shù),本研究要求核心種質(zhì)庫(kù)的RPR> 90.00%,同時(shí)認(rèn)為MD越小,CR、VR和VD越大表型核心種質(zhì)庫(kù)越能代表原始種質(zhì)庫(kù)的多樣性[18]。
在原始種質(zhì)庫(kù)中挑選出表型核心種質(zhì)庫(kù)后剩余的種質(zhì)稱(chēng)為保留種質(zhì)?;诒硇捅A舯壤畲蠡乃枷耄≧PR= 100.00%),分析并統(tǒng)計(jì)表型核心種質(zhì)庫(kù)相對(duì)于原始種質(zhì)庫(kù)中各性狀指標(biāo)丟失的表型類(lèi)型,然后在保留種質(zhì)中挑選最少數(shù)量的具備相應(yīng)表型的無(wú)性系補(bǔ)充到表型核心種質(zhì)庫(kù)中形成表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù),當(dāng)多個(gè)無(wú)性系均具有相應(yīng)表型類(lèi)型時(shí),選擇性狀頻率低的無(wú)性系,該部分無(wú)性系稱(chēng)為表型補(bǔ)充種質(zhì),最后對(duì)表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行評(píng)價(jià)。
對(duì)美洲黑楊3 個(gè)類(lèi)群的表型和生理指標(biāo)進(jìn)行對(duì)比分析(表2),發(fā)現(xiàn)第1 類(lèi)群(Was 種源)無(wú)性系的株高(H)、葉片數(shù)(LN)、葉片碳元素含量(C)、葉片氮元素含量(N)、Pn和Tr高于另外2個(gè)類(lèi)群的無(wú)性系;第2 類(lèi)群(Iow 和Que 種源)無(wú)性系的根系鮮質(zhì)量(RFW)、根系干質(zhì)量(RDW)和葉綠素相對(duì)含量(SPAD)最大;第3 類(lèi)群(Mis、Lou 和Ten 種源)無(wú)性系的地徑(GD)、莖段和葉片的生長(zhǎng)量、葉片形態(tài)性狀、葉片自由水和結(jié)合水含量、Gs和Ci均高于另外2 個(gè)類(lèi)群。3 個(gè)類(lèi)群的表型和生理特征均比較明顯,在該分組的基礎(chǔ)上分別在組內(nèi)篩選代表性的無(wú)性系構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)可以更好的代表美洲黑楊群體的表型和生理特征。
表2 不同類(lèi)群表型和生理指標(biāo)特征分析Table 2 Phenotypic and physiological characteristics of different groups
在構(gòu)建美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)時(shí),基于不同的取樣策略得到的結(jié)果存在較大差異(表3)。采用隨機(jī)取樣策略時(shí),構(gòu)建的第6 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(R6)的RPR為87.57%,低于90.00%,初步認(rèn)定第5 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(R5)為核心種質(zhì)庫(kù),包括32 個(gè)無(wú)性系,取樣比例為12.40%,MD、VD、CR、VR和RPR分別為0.00%、9.52%、85.69%、116.31%和91.90%;采用偏離度取樣策略時(shí),共構(gòu)建了5 個(gè)種質(zhì)庫(kù),第4 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(D4)被初步認(rèn)定為核心種質(zhì)庫(kù),取樣比例為19.38%,MD、VD、CR、VR和RPR分別為9.52%、28.57%、93.17%、113.44%和94.71%;采用位點(diǎn)優(yōu)先取樣策略時(shí),共構(gòu)建了8 個(gè)種質(zhì)庫(kù),第8 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(P8)的RPR低于90.00%,初步確定第7 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(P7)為核心種質(zhì)庫(kù),包括32 個(gè)無(wú)性系,MD、VD、CR、VR和RPR分別為0.00%、76.19%、100.00%、141.66% 和91.69%;采用性狀頻率取樣策略時(shí),共構(gòu)建了10 個(gè)種質(zhì)庫(kù),第10個(gè)種質(zhì)庫(kù)(F10)的RPR為89.89%,第9 個(gè)種質(zhì)庫(kù)(F9)被初步認(rèn)定為核心種質(zhì)庫(kù),取樣比例為10.47%,MD、VD、CR、VR和RPR分別為0.00%、80.95%、100.00%、148.94%和90.85%。在隨機(jī)取樣、偏離度取樣和位點(diǎn)優(yōu)先取樣策略下形成的種質(zhì)庫(kù)之間H'沒(méi)有顯著的變化,而在性狀頻率取樣策略下,H'在不同種質(zhì)庫(kù)間存在明顯差異,隨著取樣比例的減少,H'先增大后減小,但在4 種不同的取樣策略下構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)的H'與原始種質(zhì)庫(kù)均沒(méi)有顯著差異,均能代表原始種質(zhì)庫(kù)表型和生理性狀的多樣性。
表3 不同取樣策略種質(zhì)庫(kù)對(duì)比分析Table 3 Comparative analysis of banks with different sampling strategies
通過(guò)對(duì)比不同取樣策略下構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)的評(píng)價(jià)參數(shù)可以看出:通過(guò)性狀頻率取樣策略構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)在取樣比例最低的前提下,MD為0.00%,VD、CR和VR均高于另外3 種取樣策略,代表性最好,而且在構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)的過(guò)程中,性狀頻率可以更好的對(duì)無(wú)性系進(jìn)行區(qū)分,表明性狀頻率取樣策略在構(gòu)建美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)的研究中是可行的,而且優(yōu)于隨機(jī)取樣、偏離度取樣和位點(diǎn)優(yōu)先取樣的策略。
通過(guò)對(duì)比不同取樣策略構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)的有效性,最終采用性狀頻率取樣策略構(gòu)建美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)。核心種質(zhì)庫(kù)共包括27 個(gè)無(wú)性系,在第1、第2、第3 類(lèi)群中分別選取了2、15、10個(gè)無(wú)性系,在每個(gè)種源中均有無(wú)性系被選擇(表4),說(shuō)明取樣策略具有一定的代表性和廣泛性。
表4 原始種質(zhì)庫(kù)、表型核心種質(zhì)庫(kù)與表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的組成Table 4 The composition of original, phenotypic core and phenotypic optimize core banks
表型核心種質(zhì)庫(kù)的RPR為90.85%(表3),通過(guò)與原始種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行對(duì)比發(fā)現(xiàn):其在14 個(gè)表型和生理性狀上共缺失了19 個(gè)表現(xiàn)型,為了使RPR達(dá)到100.00%,在保留種質(zhì)中挑選最少數(shù)的無(wú)性系,使其表型和生理性狀包括缺失的19 個(gè)表現(xiàn)型,最終篩選出5 個(gè)美洲黑楊無(wú)性系為補(bǔ)充種質(zhì),補(bǔ)充到表型核心種質(zhì)中,形成表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)。表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例為12.40%,共32 個(gè)美洲黑楊個(gè)體,其中,Was、Que、Iow、Lou、Ten和Mis 種源各選擇了2、16、1、5、7、1 個(gè)無(wú)性系(表4)。表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的MD、VD和VR分別為0.00%、71.43%和142.19%,CR和RPR均達(dá)到了100.00%,平均表型多樣性指數(shù)為2.097(表3),表明表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)保留了原始種質(zhì)庫(kù)21 個(gè)表型和生理性狀的極值和10 個(gè)等級(jí)的表現(xiàn)型,極大限度地去除了冗余,可以有效地保存美洲黑楊群體的表型多樣性。
為了進(jìn)一步對(duì)核心種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行確認(rèn),基于21 個(gè)表型和生理性狀進(jìn)行主成分分析提取的第1、第2 和第3 主成分因子得分繪制保留種質(zhì)、核心種質(zhì)和補(bǔ)充種質(zhì)的分布圖,從圖1 可看出:保留種質(zhì)的分布存在大量的重疊現(xiàn)象,表明種質(zhì)間表型相似性高,而表型核心種質(zhì)均勻分布在原始種質(zhì)范圍內(nèi),沒(méi)有重疊現(xiàn)象,說(shuō)明核心種質(zhì)庫(kù)去除了冗余,具有良好的代表性。補(bǔ)充種質(zhì)進(jìn)一步的豐富了核心種質(zhì)的分布范圍,形成的表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)具有更好的代表性。
圖1 保留種質(zhì)、核心種質(zhì)和補(bǔ)充種質(zhì)的 PCoA 分析Fig. 1 PCoA analysis of original, core and supplementary collection
在表型核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建的過(guò)程中,對(duì)原始種質(zhì)進(jìn)行合理的分組,可以提高組內(nèi)的冗余度,通過(guò)聚類(lèi)取樣可以快速鑒定相似種質(zhì),提高核心種質(zhì)庫(kù)的表型或遺傳變異[25-26]。前期研究表明:由于基因組DNA 突變、遷移、選擇和漂變的綜合作用,使不同種源具有不同的表型和遺傳特征[27],因此,可以基于種源地理信息對(duì)原始種質(zhì)進(jìn)行分組[28-29];但Katinas 等[30]認(rèn)為,僅以種源地理信息為依據(jù)對(duì)種質(zhì)進(jìn)行分組可能達(dá)不到預(yù)期效果,同時(shí)結(jié)合種質(zhì)的表型或遺傳信息特征的聚類(lèi)分析結(jié)果對(duì)其進(jìn)行分組,構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)更具有代表性[8]。本研究中,基于表型和生理性狀分析美洲黑楊種質(zhì)資源的群體結(jié)構(gòu)并對(duì)其進(jìn)行分組,發(fā)現(xiàn)不同類(lèi)群的個(gè)體間表型和生理特征差異顯著,但每個(gè)類(lèi)群內(nèi)個(gè)體間的相似性較高,因此,通過(guò)分組取樣可以快速降低資源的冗余度,有效提高種質(zhì)庫(kù)的表型變異和多樣性水平。
根據(jù)不同的種質(zhì)資源特點(diǎn)制定合適的取樣策略是核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建研究中首先需要解決的重要問(wèn)題。目前,常規(guī)取樣策略包括隨機(jī)取樣、偏離度取樣和位點(diǎn)優(yōu)先取樣。張歡等基于水青樹(shù)(Tetarcention sinenseOliv.)葉片表型性狀比較3 種不同取樣策略,發(fā)現(xiàn)利用位點(diǎn)優(yōu)先取樣策略構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)保留了原始種質(zhì)庫(kù)的多樣性,且種質(zhì)庫(kù)的差異水平明顯提高[31];在構(gòu)建櫻桃番茄(Lycopersicon esculentumMill.)核心種質(zhì)庫(kù)的研究中發(fā)現(xiàn),3 種不同取樣策略均能提高種質(zhì)庫(kù)的變異水平,其中,利用偏離度取樣策略構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)具有更好的代表性[32];李洪果在構(gòu)建杜仲(Eucommia ulmoidesOliv.)雄性資源核心種質(zhì)庫(kù)的研究中發(fā)現(xiàn),采用位點(diǎn)優(yōu)先取樣策略構(gòu)建的核心種質(zhì)最大程度代表了原始種質(zhì)庫(kù)的表型變異特征[33]。本研究中提出的性狀頻率取樣策略,即優(yōu)先選擇具有極值的個(gè)體,然后基于性狀頻率對(duì)其他種質(zhì)進(jìn)行篩選。通過(guò)與上述3 種取樣策略比較發(fā)現(xiàn),性狀頻率取樣策略可以更好的對(duì)種質(zhì)進(jìn)行鑒定和區(qū)分,從而有效降低種質(zhì)庫(kù)冗余,增加核心種質(zhì)庫(kù)變異水平,因此,性狀頻率取樣策略在美洲黑楊核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建的研究中更加可行有效。
在核心種質(zhì)庫(kù)構(gòu)建研究中如何有效對(duì)其評(píng)價(jià)至關(guān)重要。目前,主要通過(guò)與原始種質(zhì)庫(kù)的性狀均值(MD)、方差(VD)、極差(CR)和變異系數(shù)(VR)之間的差異比較,評(píng)價(jià)基于表型性狀構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)的代表性,認(rèn)為在MD< 20.00%且CR>80.00%時(shí)構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)有效,且MD越小,VD、CR和VD越大,核心種質(zhì)庫(kù)的代表性和多樣性越好[1,12,16,18,31];同時(shí)RPR可以直接反映核心種質(zhì)庫(kù)保留表型性狀信息的多少,是評(píng)價(jià)其有效性必不可少的參數(shù)[5,28]。本研究中,采用MD、VD、CR、VR和RPR對(duì)美洲黑楊核心種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行評(píng)價(jià),在常用標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上確保核心種質(zhì)庫(kù)的RPR> 90.00%,使其能夠保留更多的表型性狀信息,提高核心種質(zhì)庫(kù)的代表性和有效性。最終構(gòu)建的美洲黑楊表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的MD、VD、CR、VR和RPR分別為0.00%、71.43%、100.00%、142.19%和100.00%,并通過(guò)對(duì)比種質(zhì)性狀的主成分分布圖對(duì)表型核心種質(zhì)庫(kù)和表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的代表性進(jìn)行了確認(rèn)。
取樣比例是體現(xiàn)核心種質(zhì)庫(kù)代表性的重要參數(shù),由于不同種質(zhì)資源具有豐富的多樣性,核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例存在差異。草本植物核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例主要在5.00%~40.00%之間[6,8,34],木本植物的取樣比例則在10.00%~45.00%之間[10,15-14]。在本研究初期沒(méi)有規(guī)定核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例,而是按照核心種質(zhì)庫(kù)的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),構(gòu)建最小取樣比例的核心種質(zhì)庫(kù),最終構(gòu)建的美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例為10.47%,表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的取樣比例為12.40%。
利用表型數(shù)據(jù)構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)是最基本、最直接且最常用的方法[29],但表型性狀容易受到外界環(huán)境的干擾,從而影響表型核心種質(zhì)庫(kù)的有效性[28,32,35],因此,在獲取種質(zhì)資源表型性狀數(shù)據(jù)時(shí)應(yīng)保證試驗(yàn)材料的一致性,并嚴(yán)格控制植株生長(zhǎng)的環(huán)境條件,減少材料本身及環(huán)境引起的誤差[36];同時(shí)觀(guān)測(cè)性狀代表性、穩(wěn)定性和可比性對(duì)表型核心種質(zhì)庫(kù)的構(gòu)建具有重要影響,葉片相關(guān)的形態(tài)指標(biāo)在水青樹(shù)[31]、普通杏(Prunus armeniacaL.)[35]和灰楸(Catalpa fargesiiBur.)[37]等表型核心種質(zhì)庫(kù)的研究中得到應(yīng)用,植株生長(zhǎng)、材性和生理性狀數(shù)據(jù)也經(jīng)常作為構(gòu)建表型核心種質(zhì)庫(kù)的依據(jù)[12,27,37]。本研究中,主要利用植株生長(zhǎng)、葉片形態(tài)、葉片養(yǎng)分含量、葉片葉綠素相對(duì)含量、光合參數(shù)等表型和生理性狀構(gòu)建表型核心種質(zhì)庫(kù)。由于光合參數(shù)與植株生長(zhǎng)密切相關(guān)且易受外界環(huán)境的影響,為了保證光合數(shù)據(jù)的可比性,本研究同時(shí)使用3 臺(tái)光合儀進(jìn)行測(cè)定,并將測(cè)量時(shí)間段進(jìn)行劃分,制定合理的測(cè)量策略,從而減少測(cè)量時(shí)間、儀器和外界環(huán)境等因素的影響。
構(gòu)建美洲黑楊核心種質(zhì)庫(kù)參考的表型指標(biāo)數(shù)據(jù)可以較全面的反映植株的生長(zhǎng)特性,但表型性狀是植株基因與環(huán)境共同作用的結(jié)果,基于表型數(shù)據(jù)構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù)具有一定的局限性,因此,有必要結(jié)合本研究的分析結(jié)果進(jìn)一步利用分子標(biāo)記的方法分析美洲黑楊群體的遺傳結(jié)構(gòu)并構(gòu)建核心種質(zhì)庫(kù),使得構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)同時(shí)包括美洲黑楊的表型信息和遺傳信息,從而更加有效的保存美洲黑楊種質(zhì)資源。
美洲黑楊不同類(lèi)群之間具有明顯的表型和生理特征,Was 種源個(gè)體的高生長(zhǎng)量、葉片數(shù)和葉片養(yǎng)分含量和光合生理活性較高;Iow 和Que 種源無(wú)性系的根系生長(zhǎng)較發(fā)達(dá);Mis、Lou 和Ten 種源無(wú)性系的莖生長(zhǎng)量、葉片生長(zhǎng)量和葉片形態(tài)高于其他類(lèi)群無(wú)性系?;诒硇秃蜕硇誀?,通過(guò)與隨機(jī)取樣、偏離度取樣和位點(diǎn)優(yōu)先取樣3 種常規(guī)取樣策略進(jìn)行比較,首次提出并確定性狀頻率取樣策略為構(gòu)建美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)的最適取樣策略。在258 個(gè)美洲黑楊種質(zhì)中篩選出27 個(gè)核心種質(zhì),取樣比例為10.47%。篩選了5 個(gè)種質(zhì)補(bǔ)充到表型核心種質(zhì)庫(kù)中形成表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù),使其表型保留比例達(dá)到100.00%。通過(guò)對(duì)表型核心種質(zhì)庫(kù)和表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)進(jìn)行評(píng)價(jià)和驗(yàn)證,表明均具有良好的代表性。美洲黑楊表型核心種質(zhì)庫(kù)和表型優(yōu)化核心種質(zhì)庫(kù)的建立可以更好的對(duì)美洲黑楊種質(zhì)資源進(jìn)行管理、保護(hù)和利用,為有效保存、管理和利用美洲黑楊種質(zhì)資源提供科學(xué)依據(jù)。