鄢海燕,鄒純才
皖南醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院,安徽 蕪湖241002
瓜蔞為葫蘆科植物栝樓(Trichosanthe kirilowii Maxim.)或雙邊栝樓(Trichosanthes rosthornii Harms)的干燥成熟果實(shí)[1],具清熱滌痰,寬胸散結(jié),潤(rùn)燥滑腸之功效。在臨床應(yīng)用中,瓜蔞常和其他中藥配伍使用,用于多種疾病的治療。其中,文獻(xiàn)報(bào)道用于胸痹癥治療的瓜蔞薤白白酒湯、瓜蔞薤白半夏湯因出自漢代名醫(yī)張仲景的《金匱要略》而為眾人所熟知[2-3];而出自孫一奎《赤水玄珠·醫(yī)旨緒余》的瓜蔞紅花甘草湯[4],雖具有清熱解毒、潤(rùn)燥止痛的作用,但研究報(bào)道相對(duì)較少。含瓜蔞的方劑較多,但未見系統(tǒng)研究含瓜蔞方劑的組方規(guī)律的相關(guān)報(bào)道。結(jié)合方劑學(xué)、中醫(yī)診斷學(xué)開展方劑配伍規(guī)律的現(xiàn)代研究是中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究的重要組成部分,對(duì)中醫(yī)臨床治療有很大的指導(dǎo)作用,對(duì)于繼承和發(fā)展中藥配伍理論、更有效地指導(dǎo)臨床和中藥新產(chǎn)品研發(fā)具有重要意義[5]。為此,本文基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)探討含瓜蔞方劑組方規(guī)律及核心藥對(duì)“瓜蔞-甘草”分子機(jī)制,以期為瓜蔞臨床配伍用藥及其分子機(jī)制研究提供參考與借鑒。
1.1.1 處方來(lái)源 含瓜蔞方劑來(lái)源于中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中國(guó)醫(yī)史文獻(xiàn)研究所中醫(yī)古籍知識(shí)庫(kù)(以下簡(jiǎn)稱中醫(yī)古籍知 識(shí) 庫(kù))(http://kb350.zywx.org/static/search/index.htm1),該數(shù)據(jù)庫(kù)共收載含瓜蔞方劑1310個(gè),含栝樓方劑390個(gè),出自約138個(gè)醫(yī)藥學(xué)典籍(不同卷的,按同一醫(yī)藥學(xué)典籍統(tǒng)計(jì)),主要涉及約694味中藥。
1.1.2 處方篩選與數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 參照《中國(guó)藥典》(2015年版)規(guī)范處方中的中藥名稱,如瓜蔞、栝樓統(tǒng)稱為瓜蔞,鑒于臨床常將瓜蔞皮、瓜蔞子按一定比例合用代替瓜蔞[6],故將瓜蔞皮、瓜蔞仁、瓜蔞子并入瓜蔞統(tǒng)計(jì);瓜蔞根和天花粉統(tǒng)稱天花粉;江子和巴豆統(tǒng)稱為巴豆;白芍、赤芍、芍藥統(tǒng)稱為芍藥;干姜、生姜、炮姜統(tǒng)稱為姜等。參照《中醫(yī)病證分類及編碼》(中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)GBT-15657-1995)對(duì)疾病的名稱進(jìn)行了規(guī)范,對(duì)古方主治的某些疾病,若在《中醫(yī)病證分類及編碼》表中找不到對(duì)應(yīng)疾病的,則按類進(jìn)行了劃分,如:古方中的喘?。ɑ淀槡?,開郁清火定喘)、肺傷(善泄咳、驚恐)、肺癰劃為肺系病類;在主治中記載為諸咳痰盛、化痰、痰喘等的,劃為痰證類等。
1.1.3 化學(xué)成分來(lái)源 通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(Traditiona1 Chinese Medicine Systems Pharmaco1ogy Database and Ana1ysis P1atform,TCMSP)以“瓜蔞”、“甘草”分別檢索瓜蔞、甘草的化學(xué)成分,選擇符合口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18的化學(xué)成分,繪制結(jié)構(gòu)式并以MDL SDfi1e(*.sdf)格式保存。將這些化學(xué)成分的MDL SDfi1e(*.sdf)格式結(jié)構(gòu)式導(dǎo)入SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù),檢索符合Probabi1ity≥0.1的化學(xué)成分靶點(diǎn)蛋白。
1.1.4 候選靶標(biāo)來(lái)源 通過(guò)CooLGeN數(shù)據(jù)庫(kù)(http://ci.smu.edu.cn/genc1ip3/ana1ysis.php)及GeneCards(https://www.genecards.org/),以“Ph1egm syndrome”(痰證)為關(guān)鍵詞收集疾?。ㄈ祟惢颍┌悬c(diǎn)蛋白,選擇與化學(xué)成分相匹配的靶點(diǎn)蛋白。
1.2.1 瓜蔞及其核心藥對(duì)“瓜蔞-甘草”用藥規(guī)律分析 本文使用中醫(yī)古籍知識(shí)庫(kù)的檢索平臺(tái),對(duì)含瓜蔞的方劑進(jìn)行藥味使用頻次分析、組方及疾病用藥規(guī)律分析等。統(tǒng)計(jì)以瓜蔞入藥治療頻率最高的疾病,明確瓜蔞治療痰證類疾病的核心組合。
1.2.2“瓜蔞-甘草”分子機(jī)制分析 利用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/too1s.jsp)進(jìn) 行 靶 點(diǎn) 蛋 白 的GOTERM_BP_DIRECT 富集分析和Kyoto Encyc1opedia of Genes and Genomes(KEGG)_PATHWAY通路注釋分析(標(biāo)示符為officia1_gene_symbo1,物種注釋為Homo sapiens)。根據(jù)預(yù)測(cè)結(jié)果,使用Gephi0.9.2軟件構(gòu)建化學(xué)成分-靶點(diǎn)蛋白-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)。
2.1.1 含瓜蔞方劑主治病癥分析 通過(guò)對(duì)中醫(yī)古籍知識(shí)庫(kù)的檢索,含瓜蔞方劑主要用于28種(類)疾病的治療,這些疾病的出現(xiàn)頻次總計(jì)為1101次。占出現(xiàn)總頻次3%以上的共計(jì)11種(類)疾病,其中痰證類134次、消渴病101次、肺系病類(肺癰?。?0次、外感熱病類89次、瘡瘍類病70次、乳癰病58次、胸痹心痛病56次、脾證類47次、咳嗽病39次、癰病35次、皮膚病類31次。痰證類出現(xiàn)頻次居首,占總頻次的14.0%。
2.1.2 含瓜蔞方劑藥味頻次分析 含瓜蔞方劑共計(jì)1700個(gè),去除重復(fù)方劑及含瓜蔞根(天花粉)(在中醫(yī)古籍知識(shí)庫(kù)的檢索平臺(tái)中,檢索瓜蔞時(shí),會(huì)檢索到瓜蔞根并納入統(tǒng)計(jì))553個(gè),瓜蔞的實(shí)際出現(xiàn)頻次為1147次,主要涉及與694味中藥配伍。使用頻次>150的共有11味中藥,其中甘草403次、半夏265次、黃芩222次、茯苓212次、黃連202次、桔梗200次、姜187次、陳皮182次、人參167次、芍藥152次。
2.1.3 含瓜蔞方劑核心藥對(duì)的分析 在“2.1.2”項(xiàng)基礎(chǔ)上,通過(guò)關(guān)聯(lián)分析,以出現(xiàn)頻次占處方量達(dá)10%為評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),獲得含瓜蔞方劑核心藥對(duì)15個(gè),其中2味藥對(duì)組合10個(gè),3味藥對(duì)組合5個(gè)。在出現(xiàn)頻次統(tǒng)計(jì)的基礎(chǔ)上,對(duì)各藥用于主治痰證類疾病的頻次進(jìn)行統(tǒng)計(jì)(表1)。
表1 含瓜蔞方劑核心藥對(duì)的分析Tab.1 Analysis of core drug pairs in prescriptions containing Trichosanthis fructus
2.2.1 核心組合藥對(duì)“瓜蔞-甘草”化學(xué)成分 通過(guò)TCMSP平臺(tái)檢索到瓜蔞有11個(gè)化學(xué)成分,甘草有92個(gè)化學(xué)成分符合OB ≥30%、DL ≥0.18,將這些化學(xué)成分的MDL SDfi1e(*.sdf)格式結(jié)構(gòu)式導(dǎo)入SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù),檢索到符合Probabi1ity≥0.1的化學(xué)成分靶點(diǎn)蛋白4984個(gè)。
通過(guò)CooLGeN 數(shù)據(jù)庫(kù)中以“Ph1egm syndrome”(痰證)為關(guān)鍵詞檢索到痰證類疾病靶點(diǎn)蛋白204個(gè)。比較化學(xué)成分靶點(diǎn)蛋白與痰證類疾病靶點(diǎn)蛋白,有41個(gè)蛋白靶點(diǎn)為瓜蔞、甘草化學(xué)成分與痰證類疾病共有靶點(diǎn)蛋白,涉及52個(gè)化學(xué)成分,其中瓜蔞9個(gè)、甘草43個(gè)(表2)。
將瓜蔞、甘草化學(xué)成分與痰證類疾病共有的41個(gè)靶點(diǎn)蛋白導(dǎo)入DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù),進(jìn)行靶點(diǎn)蛋白的KEGG_PATHWAY 通 路 注 釋 分 析 和 GOTERM_BP_DIRECT、GOTERM_CC_DIRECT、GOTERM_MF_DIRECT富集分析。
2.2.2 KEGG信號(hào)通路分析 通過(guò)DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行KEGG_PATHWAY富集分析,信號(hào)通路結(jié)果見圖1。主要為Pathways in cancer(P=7.4×10-4)、Graft-versushost disease(P=1.8×10-3)、Acute mye1oid 1eukemia(P=5.5×10-3)、NOD-1ike receptor signa1ing pathway(P=6.7×10-3)、Pancreatic cancer(P=1.0×10-2)等。
2.2.3 Gene Onto1ogy(GO)分析“瓜蔞-甘草”中的52個(gè)化 學(xué) 成 分 通 過(guò)PPARD、NLRP3、PPARG、MMP9、CCND1等靶點(diǎn)蛋白發(fā)揮與痰證類疾病相關(guān)的生物功能,主要與positive regu1ation of ce11 pro1iferation、positive regu1ation of mo1ecu1ar function、ce11 motion、ce11 migration、regu1ation of ce11 pro1iferation等有關(guān)(圖2,P<1.0×10-6)。細(xì)胞組成主要與extrace11u1ar space、extrace11u1ar region part、extrace11u1ar region等有關(guān),分子功能主要與steroid hormone receptor activity、1iganddependent nuc1ear receptor activity、monocarboxy1ic acid binding等有關(guān)(圖3A、B)。
2.2.4 活性成分-靶點(diǎn)蛋白-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 使用Gephi 0.9.2 軟件構(gòu)建化學(xué)成分-靶點(diǎn)蛋白-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)?!肮鲜V-甘草”中的52個(gè)活性成分通過(guò)41個(gè)靶點(diǎn)蛋白、17條信號(hào)通路發(fā)揮與“痰證”相關(guān)的作用,網(wǎng)絡(luò)關(guān)系復(fù)雜、蛋白靶點(diǎn)與信號(hào)通路多(圖4)。
2.3“瓜蔞-甘草”藥對(duì)活性成分與靶點(diǎn)蛋白分子對(duì)接結(jié)果分析
一般以結(jié)合能≤?5 kJ/mo1 或Tota1 Score 值≥5.0作為篩選標(biāo)準(zhǔn)。本文以SYBYL-X 2.1.1 對(duì)接軟件進(jìn)行分子對(duì)接,獲得Tota1 Score值(表3)。分子對(duì)接結(jié)果表 明,MOL001494、MOL007179、MOL004806、MOL004860、MOL004805等40個(gè)化學(xué)成分與PPARD、NLRP3、PPARG、MMP9、CCND1 等10 個(gè)靶點(diǎn)蛋白的Tota1 Score值≥5.0。Tota1 Score值≥7.0的代表性核心活性成分與靶點(diǎn)蛋白分子對(duì)接模式(圖5)。
在中醫(yī)古籍知識(shí)庫(kù)中收載的1700個(gè)含瓜蔞方劑中,瓜蔞-甘草配伍應(yīng)用頻次最高,達(dá)403次。在《古今醫(yī)鑒》(第3卷)傷寒(篇)《小柴胡湯》的方劑中,在含有甘草藥味的處方基礎(chǔ)上進(jìn)行藥味的加減:痰多,加瓜蔞仁。此方功用主治為:治足少陽(yáng)膽經(jīng)受證,耳聾脅痛,寒熱嘔而口苦,脈來(lái)弦數(shù),屬半表半里,宜和解,此膽經(jīng)無(wú)出入,有三禁,不可汗、下,利小便也。按疾病類別劃分,并未劃入痰證類疾病中,但鑒于瓜蔞在此方中的作用,主要是用于痰證的治療,因此,在統(tǒng)計(jì)瓜蔞甘草用于哪些疾病治療時(shí),把此方列入痰證類病統(tǒng)計(jì)。其他藥味組合也根據(jù)藥味在處方中的實(shí)際作用進(jìn)行了歸納。在含瓜蔞方劑核心藥對(duì)中,“瓜蔞-甘草”藥對(duì)出現(xiàn)頻次最高且用于痰證類疾病的頻次也較高,達(dá)113次。現(xiàn)代文獻(xiàn)已有“瓜蔞-甘草”藥對(duì)配伍用于肺炎的免疫炎癥研究的報(bào)道[7],為此,本文主要對(duì)核心藥對(duì)“瓜蔞-苷草”用藥規(guī)律進(jìn)行分析。
表2 核心藥對(duì)“瓜蔞-甘草”化學(xué)成分Tab.2 Chemical composition in the core medicine pair"Trichosanthis fructus(A)-Glycyrrhizae radix et rhizoma(B)"
圖1“瓜蔞-甘草”活性成分潛在靶點(diǎn)的KEGG信號(hào)通路富集分析Fig.1 Enrichment analysis of KEGG signal pathway of potential target of active components in "Trichosanthis fructus-Glycyrrhizae radix et rhizoma".
圖2“瓜蔞-甘草”活性成分潛在靶點(diǎn)的GOTERM_BP_FAT過(guò)程富集分析Fig.2 Enrichment analysis of GOTERM_BP_FAT process of potential target of active components in"Trichosanthis fructus-Glycyrrhizae radix et rhizoma".
圖3“瓜蔞-甘草”活性成分潛在靶點(diǎn)的GOTERM_CC_FAT(A)和GOTERM_MF_FAT(B)富集分析Fig.3 Enrichment analysis of GOTERM_CC_FAT(A)process and GOTERM_MF_FAT(B)process of potential target of the active components in"Trichosanthis fructus-Glycyrrhizae radix et rhizoma".
瓜蔞用于痰證類相關(guān)疾病的治療在中醫(yī)藥古籍中多有記載,如《本草衍義補(bǔ)遺》:“治嗽之要藥”;《本草綱目》:“潤(rùn)肺燥,治咳嗽,滌痰結(jié)…”;《本草新編》:“祛痰”;《長(zhǎng)沙藥解》:“治肺痿,滌痰涎,止咳嗽…”[8]。甘草用于痰證類相關(guān)疾病的治療也有記載,如《湯液本草》:“治肺痿之膿血…”;《醫(yī)學(xué)入門·本草》:“止渴止嗽及肺痿吐膿…”。現(xiàn)代藥學(xué)典籍中也記載了瓜蔞具清熱滌痰之功效,用于肺熱咳嗽,痰濁黃稠等的治療;甘草具袪痰止咳之功效,用于咳嗽痰多等的治療[1]。
瓜蔞具清熱滌痰,寬胸散結(jié)等主要功效。鄒純才等[9-10]報(bào)道了瓜蔞抗心肌缺血再灌注損傷作用、瓜蔞皮在痰濁內(nèi)阻證冠心病治療中的應(yīng)用等。中藥多配伍使用,以便更好發(fā)揮藥效。瓜蔞薤白、瓜蔞薤白半夏源自張仲景的《金匱要略》,主要用于胸痹癥的治療?;诒姸嗟闹嗅t(yī)中藥古籍中含瓜蔞方劑的組方規(guī)律數(shù)據(jù)分析,深入探討瓜蔞和哪種或哪些藥味配伍且主要用于哪種疾病的治療,為瓜蔞的組方研究提供參考。
圖4“瓜蔞-甘草”藥對(duì)化學(xué)成分()-靶點(diǎn)蛋白()-信號(hào)通路()網(wǎng)絡(luò)Fig.4 Chemical components ( )-target protein ( )-signal pathway () network of"Trichosanthis fructus-Glycyrrhizae radix et rhizoma"drug pair.
由本文含瓜蔞方劑組方規(guī)律可見,含瓜蔞方劑的用藥規(guī)律可循,通過(guò)不同配伍達(dá)到不同的治療目的。含瓜蔞方劑主要用于痰證類、消渴病、肺系病類、胸痹心痛病等28種(類)疾病的治療,主要涉及與甘草、半夏、黃芩等的配伍。在含瓜蔞方劑核心藥對(duì)中,“瓜蔞-甘草”藥對(duì)出現(xiàn)頻次最高且用于痰證類疾病的頻次也較高,達(dá)113次?!肮鲜V-甘草”配伍使用,在唐代的《千金翼方》、《外臺(tái)秘要》中多有記載,在南宋《女科濟(jì)陰要語(yǔ)萬(wàn)金方》中記載,痰喘氣急、痰氣串痛、老痰及口吐癰膿或痰血作腥臭者,難治也,加瓜蔞。元朝《風(fēng)科集驗(yàn)名方》之十一卷,傷寒中風(fēng)(篇)(方十一首)中關(guān)于瓜蔞湯(含瓜蔞-甘草配伍)方的記載,治傷寒中懈五七日,胸中煩躁,干嘔,并宜服之。在明朝《有醫(yī)方集略》、《古今醫(yī)鑒》、《簡(jiǎn)明醫(yī)彀》、《明醫(yī)雜著》、《壽世保元》、《醫(yī)林繩墨》、《醫(yī)宗必讀》、《李氏家藏奇驗(yàn)秘方》、《重刻萬(wàn)氏家傳濟(jì)世良方》、《諸癥辨疑》、《醫(yī)家必用》、《救急療貧易簡(jiǎn)奇方》、《傳信尤易方》、《本草匯言》等諸多醫(yī)藥曲籍中有記載,如明朝中期以前《儒醫(yī)心鏡》(四)各癥病原并用藥治法要訣(篇)痰飲(章)記載,痰在咽喉間,如綿絮,如梅核,咯不出,咽不下,或升或降,塞礙不能,亦痰氣也。后成膈噎病,加瓜蔞。痰飲者,痰在胸脅間,痛而有聲也。痰飲與死血皆窠囊,加瓜蔞。濕痰流注癥者,凡人骨體串痛,或作寒熱,發(fā)腫塊,皆是濕痰流注經(jīng)絡(luò)也,加瓜蔞。明清醫(yī)籍《商便奇方》(三卷)咳嗽篇記載,痰結(jié),吐難出,加瓜蔞七分。在現(xiàn)代劑型中,由“瓜蔞-甘草”配伍組方的瓜蔞甘草顆粒,具清熱化痰、解毒扶正之功效。瓜蔞主治痰熱,可通腑瀉熱、活血化瘀,為主藥;甘草可解毒化痰、益氣扶正,為輔藥。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)果顯示,“瓜蔞-甘草”中的MOL001494、MOL007179、MOL004806、MOL004805等52個(gè)成分作用于PPARD、PPARG、NLRP3、MMP9、CCND1 等41 個(gè)蛋白靶點(diǎn),通過(guò)Pathways in cancer、NOD-1ike receptor signa1ing pathway等17條通路發(fā)揮治療痰證類疾病作用,Pathways in cancer通路居首。中醫(yī)認(rèn)為痰是癌癥發(fā)生的病理機(jī)制之一,是腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的病理產(chǎn)物也是新致病因素[11]。不同方劑可能作用于不同的腫瘤轉(zhuǎn)移環(huán)節(jié),且同一方劑在不同腫瘤轉(zhuǎn)移環(huán)節(jié)發(fā)揮作用不同[12]。分子對(duì)接結(jié)果表明,MOL001494、MOL007179、MOL004806、MOL004860、MOL004805等40個(gè)化學(xué)成分與PPARD、NLRP3、PPARG、MMP9、CCND1 等10 個(gè) 靶 點(diǎn) 蛋 白 的Tota1 Score 值≥5.0。MOL001494、MOL007179、MOL004806、MOL004805等11個(gè)化合物與PPARD、PPARG、NLRP3、MMP9、CCND1、STAT3、TNF、IL2 等8 個(gè)靶點(diǎn)蛋白的Tota1 Score值≥7.0。
PPARD是過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體家族中重要的一員,它首先被鑒定為通過(guò)結(jié)合過(guò)氧化物酶體增殖物來(lái)控制過(guò)氧化物酶體的大小和數(shù)量的蛋白質(zhì),與癌癥等多種疾病有關(guān)。PPARD基因及其啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化是潛在的肺癌早期篩查分子標(biāo)志物,為肺癌早期臨床診斷和治療提供了科學(xué)線索[13]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL001494、MOL007179等8種化合物可作用于PPARD靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Pathways in cancer,發(fā)揮positive regu1ation of ce11 pro1iferation 等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL001494、MOL007179、MOL004355、MOL006756等4種化合物與PPARD 的Tota1 Score 值≥5.0,其中MOL001494、MOL007179 與 與PPARD 的Tota1 Score 值>10,與PPARD 靶點(diǎn)蛋白具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在positive regu1ation of ce11 pro1iferation等生物學(xué)功能方面可能發(fā)揮重要作用。
表3 各化學(xué)成分與靶點(diǎn)蛋白作用的Tota1 Score 值Tab.3 Total Score value of docking between chemical components and target protein
續(xù)表3
圖5 代表性核心活性成分與靶點(diǎn)蛋白分子對(duì)接模式Fig.5 Docking mode between core active components and target protein(Total Score ≥7.0).
NLRP3炎癥小體作為天然免疫的重要組成部分,在機(jī)體免疫反應(yīng)和疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮著重要作用[14-15],其過(guò)度活化可導(dǎo)致多種人類重大疾病如阿爾茨海默病、炎癥性腸病、糖尿病以及惡性腫瘤如肺癌等的發(fā)生[16]。研究表明蒽醌類化療藥物能夠誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞發(fā)生免疫原性細(xì)胞死亡,釋放大量免疫原性物質(zhì)如HMGB1和ATP,誘導(dǎo)NLRP3炎癥小體活化和IL-1β和IL-18等細(xì)胞因子產(chǎn)生,從而促進(jìn)腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)并提高化療誘導(dǎo)的抗腫瘤免疫[17]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL001494、MOL004838 可作用于NLRP3 靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)NOD-1ike receptor signa1ing pathway,發(fā)揮positive regu1ation of mo1ecu1ar function等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL001494、MOL004838與NLRP3具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在positive regu1ation of mo1ecu1ar function 等生物學(xué)功能方面可能發(fā)揮作用。
CCND1已被公認(rèn)為是一種原癌基因,主要功能是促進(jìn)細(xì)胞增殖,但其過(guò)度表達(dá)可致細(xì)胞增殖失控而惡性化。研究表明,在多種腫瘤中發(fā)現(xiàn)了CCND1基因過(guò)表達(dá)和基因擴(kuò)增,包括胰腺癌、非小細(xì)胞肺癌、乳腺癌等[18]。醫(yī)學(xué)上也提出以CCND1異常表達(dá)作為診斷癌癥一項(xiàng)指標(biāo)的設(shè)想,以及研究CCND1在細(xì)胞周期調(diào)控中的作用,從而尋找出治療癌癥的藥物[19]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL004805、MOL004855等14種化合物可作用于CCND1靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Pathways in cancer,發(fā)揮positive regu1ation of ce11 pro1iferation 等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL004805、MOL004855等10種化合物與CCND1的Tota1 Score 值≥5.0,與CCND1 具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在positive regu1ation of ce11 pro1iferation等生物學(xué)功能方面可能會(huì)發(fā)揮作用。
STAT3被認(rèn)為在包括肺癌在內(nèi)的多種惡性腫瘤中發(fā)揮致癌作用,因此,靶向STAT3被認(rèn)為是一種干預(yù)治療途徑。但Beatrice Grabner等卻發(fā)現(xiàn)在KRAS突變的肺腺癌中,STAT3 具有意想不到的腫瘤抑制作用:STAT3改變了腫瘤的微環(huán)境和腫瘤血管的生成,通過(guò)阻斷細(xì)胞質(zhì)中的P65來(lái)降低NF-κB的活性,最終抑制Kras誘導(dǎo)的肺癌發(fā)展[20]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL004805、MOL004808作用于STAT3靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Pathways in cancer,發(fā) 揮ce11 motion、positive regu1ation of biosynthetic process等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL004805、MOL004808與STAT3的Tota1 Score 值分別為7.7656、6.8389,與STAT3具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在惡性腫瘤的治療中可能會(huì)發(fā)揮作用。
TNF-α是一種具有多種生物學(xué)功能的細(xì)胞因子,不但可以誘導(dǎo)細(xì)胞炎性因子的產(chǎn)生,還參與了細(xì)胞的增殖、存活以及凋亡等生物學(xué)反應(yīng)[21-22]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL004848、MOL004827等6個(gè)化學(xué)成分作用于TNF靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Graft-versus-host disease,發(fā)揮positive regu1ation of ce11 pro1iferation、positive regu1ation of mo1ecu1ar function等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL004848、MOL004827等5個(gè)化學(xué)成分與TNF的Tota1 Score 值>5,與TNF具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在positive regu1ation of ce11 pro1iferation、positive regu1ation of mo1ecu1ar function中可能會(huì)發(fā)揮作用。
IL2是抗腫瘤效應(yīng)的重要因子[23],可激活多種效應(yīng)細(xì)胞如細(xì)胞毒性T細(xì)胞、自然殺傷細(xì)胞等[24]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL004855、MOL004864等11個(gè)化學(xué)成分作用于IL2 靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Graft-versus-host disease、A11ograft rejection 等作用通路,發(fā)揮positive regu1ation of ce11 pro1iferation、positive regu1ation of mo1ecu1ar function等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL004855、MOL004864等6個(gè)化學(xué)成分與IL2的Tota1 Score 值>5,與IL2具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在惡性腫瘤的治療中可能會(huì)發(fā)揮作用。
MMP-9 與肺癌的發(fā)生發(fā)展緊密相關(guān),可用于判斷肺癌病理分型及分期[25]。MMP9 過(guò)表達(dá)與多種惡性腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)[26],MMP9為明膠酶類分子,由可能存在惡性傾向的腫瘤細(xì)胞、巨噬細(xì)胞分泌,參與ECM降解過(guò)程,破壞基底膜完整性,在惡性腫瘤的血管化、腫瘤細(xì)胞的浸潤(rùn)及轉(zhuǎn)移灶的形成過(guò)程中起重要作用[27];同時(shí),MMP9可促成腫瘤新生血管形成,導(dǎo)致血管局部基底膜降解,創(chuàng)造促血管生成微環(huán)境,促成腫瘤細(xì)胞的侵襲、轉(zhuǎn)移[28]。本文網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明,MOL004860、MOL004815等23個(gè)化學(xué)成分作用于MMP9靶點(diǎn)蛋白,通過(guò)Pathways in cancer,發(fā)揮regu1ation of 1ocomotion、regu1ation of apoptosis等生物學(xué)功能。本文進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)預(yù)測(cè)MOL004860、MOL004815等16個(gè)化學(xué)成分與MMP9的Tota1 Score 值>5.0,與MMP9具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在惡性腫瘤的治療中可能會(huì)發(fā)揮作用。
在化學(xué)成分-靶點(diǎn)蛋白-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)研究表明,MOL001494、MOL007179、MOL004806、MOL004860、MOL004805等40個(gè)化學(xué)成分與PPARD、NLRP3、PPARG、MMP9、CCND1等10個(gè)靶點(diǎn)蛋白的Tota1 Score值≥5.0,結(jié)合程度較高,可能為“瓜蔞-甘草”藥對(duì)發(fā)揮治療“痰癥類”疾病的主要物質(zhì)基礎(chǔ)?!饵S帝內(nèi)經(jīng)·靈樞·刺節(jié)真邪》云:“已有所結(jié),氣歸之,津液留之,邪氣中之,凝結(jié)日以易甚,連以聚居,為昔瘤,以手按之堅(jiān)?!敝斓は岢觯骸胺踩松砩稀⒅?、下有塊者,多屬痰證”,認(rèn)為氣滯津結(jié)痰凝可致腫瘤?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接技術(shù)的“瓜蔞-甘草”配伍用于“痰癥類”疾病治療機(jī)制研究可為從痰論治腫瘤提供一個(gè)新角度和新思路。
南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2021年2期