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兩種麻瘋樹核糖體失活蛋白基因Curcin和Curcin C在種子萌發(fā)過程中的表達(dá)模式研究

2021-01-28 03:21:08吉柔風(fēng)丁蒙蒙
關(guān)鍵詞:麻瘋樹核糖體子葉

張 敬, 吉柔風(fēng), 楊 千, 丁蒙蒙, 陳 放, 徐 鶯

(四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 成都 610065)

最初,核糖體失活蛋白是從蓖麻種子中分離純化出來的,被人們命名為ricin[1].之后,隨著研究的不斷深入,已經(jīng)在14個家族中發(fā)現(xiàn)了超過50種核糖體失活蛋白,研究較為清楚的有美洲商陸、麻瘋樹、苦瓜、相思子、絲瓜、樟樹等[2].植物核糖體失活蛋白已被證實(shí)具有N-糖苷酶活性、水解酶活性、DNA酶活性等酶學(xué)活性和抗真菌、抗病毒、抗腫瘤等生物學(xué)活性,關(guān)于其酶學(xué)活性研究的較為透徹和深入,而生物學(xué)活性的作用機(jī)制和機(jī)理,目前還沒有確切的結(jié)論[3].實(shí)驗(yàn)研究表明,麻瘋樹核糖體失活蛋白Curcin具有抗腫瘤、抗真菌等生物學(xué)活性.Zhang等人從麻瘋樹子葉中提取出核糖體失活蛋白Curcin C,證明其具有N-糖苷酶活性、翻譯抑制作用、抗腫瘤活性.關(guān)于核糖體失活蛋白的作用機(jī)制,并沒有得到很清晰的驗(yàn)證[4].

從麻瘋樹中分離出的核糖體失活蛋白多為Ⅰ型核糖體失活蛋白,Curcin是最早從麻瘋樹中分離出來,是由林娟等人根據(jù)前人的經(jīng)驗(yàn),純化出Curcin,該蛋白分子量為28.2 kD,等電點(diǎn)為8.54,并驗(yàn)證具有N-糖苷酶活性、翻譯抑制活性[5].之后魏琴等人發(fā)現(xiàn)了核糖體失活蛋白Curcin 2,Curcin L等與脅迫相關(guān)的蛋白,這種特殊蛋白的存在,可能會起到保護(hù)麻瘋樹的正常發(fā)育生長、抵御不良生理環(huán)境的作用[6-7].近年來,Zhang等人從麻瘋樹子葉中分離提取出麻瘋樹核糖體失活蛋白Curcin C,活性實(shí)驗(yàn)表明,Curcin和Curcin C蛋白均具有抗腫瘤活性,但兩者抗腫瘤活性效率差異較大[4,8].植物核糖體失活蛋白可抑制蛋白質(zhì)合成,也因其酶學(xué)活性和生物學(xué)活性,在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景[9].也有研究顯示,西昌地區(qū)的麻瘋樹種子核糖體失活蛋白含量最高,可作為核糖體失活蛋白應(yīng)用的材料來源和研究的重要原材料.這些麻瘋樹核糖體失活蛋白的特性可能與其定位、生物學(xué)作用具有緊密的關(guān)聯(lián),一直以來是研究的熱點(diǎn)和重點(diǎn).

麻瘋樹在中國西南和東南地區(qū)有著豐富的資源,為了研究和開發(fā)這一資源,因此本研究以此為切入點(diǎn),首先探討麻瘋樹種子萌發(fā)和幼苗生長過程的形態(tài)學(xué)的變化,為后續(xù)的研究奠定一定的基礎(chǔ),其次從基因?qū)用嫜芯柯榀倶浜颂求w失活蛋白的在種子萌發(fā)和幼苗生長過程中的一個動態(tài)變化,以及在各個組織器官中的表達(dá)情況,進(jìn)而推測其在種子萌發(fā)和幼苗形成過程中可能發(fā)揮的作用.采用生物信息學(xué)以及構(gòu)建含有GFP基因的瞬時表達(dá)載體等方法確定了這兩種蛋白的亞細(xì)胞定位信息.這些研究對于揭示其存在及發(fā)揮作用的機(jī)制具有重要的意義,同時也為這兩種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能研究打下了基礎(chǔ).

2.1 材 料

購買于四川省西昌市金沙江干熱河谷地區(qū)的麻瘋樹成熟種子.

2.2 方 法

2.2.1種子萌發(fā) 選取干粒質(zhì)量達(dá)到0.68 g以上的麻瘋樹種子置于室溫條件下用水浸泡2 h,將蛭石和營養(yǎng)土等比例混合均勻,加入適量的水,保證濕潤.浸泡完畢后,將種子種入花盆中,萌發(fā)條件為30 ℃,光照/黑暗為18 h/6 h;定期澆水使得培養(yǎng)床保持一定的濕度;每天定時觀察并記錄萌發(fā)狀態(tài),隨時準(zhǔn)備收集各個時期的胚乳、子葉、胚根等樣品.

2.2.2Curcin、CurcinC基因表達(dá)分析 按照天根RNAprep Pure植物總RNA提取試劑盒說明書提取材料的總RNA,采用瓊脂糖凝膠電泳檢測核酸的完整度.利用PrimeScriptTMRT reagent Kit (Perfect Real Time) (TAKARA,大連)試劑盒合成單鏈cDNA.反應(yīng)完成后cDNA產(chǎn)物-20 ℃保存?zhèn)溆?采用SYBR?Premix Ex TaqTMⅡ試劑盒對Curcin、CurcinC基因進(jìn)行熒光定量PCR,每個樣品均重復(fù)三次以避免加樣誤差,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)利用iQ5-Cycler 進(jìn)行分析,分析方法為ΔΔCt 法.

2.2.3 Curcin、Curcin C蛋白表達(dá)分析 采用磷酸鹽緩沖液浸提丙酮沉淀法提取不同組織(胚根、胚軸、子葉、真葉)的總蛋白后進(jìn)行SDS-PAGE、轉(zhuǎn)膜、封閉、孵育抗體以及顯色反應(yīng).

2.2.4 生物信息學(xué)分析 利用在線網(wǎng)站Cell-PLoc2.0(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/)對Curcin、Curcin C蛋白亞細(xì)胞定位進(jìn)行預(yù)測,利用在線網(wǎng)站(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/對Curcin、Curcin C)蛋白信號肽進(jìn)行預(yù)測.

2.2.5 農(nóng)桿菌侵染煙草葉片表達(dá)Curcin/Curcin C-GFP融合蛋白 設(shè)計(jì)引物并構(gòu)建pBI221-Curcin/pBI221-Curcin C重組載體,將重組載體轉(zhuǎn)入大腸桿菌并挑選陽性克隆進(jìn)行測序,采用質(zhì)粒大量提取純化試劑盒(Vigorous Plasmid Maxprep Kit)提取pBI221-Curcin/ Curcin C重組質(zhì)粒,將其轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌,挑選陽性單菌落轉(zhuǎn)入煙草中,注射后培養(yǎng)2~3 d,在共聚焦顯微鏡下進(jìn)行熒光檢測.

2.2.6 原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化 參考Dr. Sheen's Lab(http://genetics.mgh.harvard.edu/sheenweb/protocols_reg.html)的操作手冊進(jìn)行擬南芥原生質(zhì)體制備,利用PEG介導(dǎo)的方式進(jìn)行原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化,取出轉(zhuǎn)化后的原生質(zhì)體于載玻片上,熒光共聚焦顯微鏡觀察.

2 結(jié)果

3.1 Curcin、Curcin C在種子萌發(fā)及幼苗生長過程中的動態(tài)變化

為了探究Curcin和CurcinC基因在胚乳和子葉中的表達(dá)量情況,我們采用了qRT-PCR實(shí)驗(yàn)對Curcin基因和CurcinC基因在種子萌發(fā)及幼苗生長過程中各個時期的胚乳、子葉中的表達(dá)水平進(jìn)行了定量分析,研究結(jié)果表明(圖1),Curcin基因在種子萌發(fā)過程中的胚乳中的表達(dá)呈現(xiàn)C1、C3期逐漸增加,C5、C7、C9開始出現(xiàn)下降,C13、C15、C17期最少,呈現(xiàn)出先增加后減少的趨勢.然而,Curcin在子葉中基本沒有表達(dá)[4].CurcinC基因則在種子萌發(fā)的初始階段胚乳中C3期表達(dá)量最高,隨著萌發(fā)過程的進(jìn)行,表達(dá)量逐漸下降,在C15、C17期幾乎檢測不到.在子葉中,CurcinC基因的表達(dá)經(jīng)歷了“從無到有,先上升后下降”的過程,CurcinC的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物首先在C3期出現(xiàn),其表達(dá)量在C5時期達(dá)到最大值,隨后迅速下降,到C9期時,其水平不到最高期的10%,到C15期就低至到無法檢測的水平了.

圖1 不同萌發(fā)時期Curcin,Curcin C基因在胚乳、子葉中的表達(dá)分析

3.2 Curcin、Curcin C在幼苗中的組織特異性表達(dá)

為了探究核糖體失活蛋白在幼苗中各個組織中的表達(dá)情況,我們收集了C11時期的幼苗,分別以該時期的根、下胚軸和真葉為對象進(jìn)行熒光定量實(shí)驗(yàn)和Western blot雜交鑒定.熒光定量結(jié)果顯示(圖2A),可以看出,在子葉、真葉組織中Curcin基因的表達(dá)量比CurcinC基因的表達(dá)量低,Curcin基因在這四種組織中的表達(dá)量都特別低;對于CurcinC基因來說,在真葉和子葉中的表達(dá)量很高,而在根和下胚軸中幾乎檢測不到.Western雜交實(shí)驗(yàn)顯示(圖2B、C),Curcin蛋白在根、下胚軸、子葉和真葉中幾乎不表達(dá);Curcin C蛋白則在根、下胚軸中不表達(dá),而在子葉和真葉中表達(dá),且在子葉中表達(dá)量高于真葉的表達(dá)量.熒光定量實(shí)驗(yàn)檢測Curcin、CurcinC基因的表達(dá)情況與Western實(shí)驗(yàn)檢測結(jié)果基本一致.

圖2 Curcin, Curcin C組織特異性表達(dá)分析

3.3 Curcin和Curcin C的亞細(xì)胞定位研究

為了進(jìn)一步確定Curcin 、Curcin C蛋白在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的定位,進(jìn)而研究其在種子萌發(fā)和幼苗生長中所具有的功能.我們首先利用在線網(wǎng)站(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/、http://www.cbs.dtu.dk/services/ SignalP/) 對Curcin、Curcin C蛋白信號肽、亞細(xì)胞定位進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示兩種蛋白都含有信號肽且都定位在細(xì)胞壁上.為了對預(yù)測結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,我們分別構(gòu)建了Curcin:GFP和CurcinC:GFP融合蛋白的植物表達(dá)載體,以35S:GFP為對照載體,分別用根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)侵染煙草葉片法和原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法讓其在植物細(xì)胞中瞬間表達(dá),在激光共聚焦顯微鏡下檢測熒光信號,確定亞細(xì)胞定位信息.實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:陽性對照組為圖3A(g、h、i),可以看到在煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜(壁),細(xì)胞核,細(xì)胞質(zhì)中都有表達(dá),Curcin、Curcin C蛋白的結(jié)果分別如圖3A(a、b、c和d、e、f),在細(xì)胞膜(壁)上可以看到熒光信號,由此可以初步的確定這兩種蛋白定位在細(xì)胞壁或者細(xì)胞膜上.之后進(jìn)行亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn),結(jié)果如下,陽性對照如圖3B(a、b、c、d),在細(xì)胞質(zhì)中檢測到了熒光信號,而對于實(shí)驗(yàn)組(圖3B(e、f、g、h和i、g、k、l))未檢測到熒光信號.結(jié)合這兩種方法的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,可以從側(cè)面間接的說明這兩種蛋白可能定位在細(xì)胞壁上,通過分泌到細(xì)胞外發(fā)揮相應(yīng)的生物學(xué)作用.該結(jié)果與網(wǎng)站預(yù)測的結(jié)果基本一致.

圖3 Curcin, Curcin C蛋白亞細(xì)胞定位分析

4 討 論

Curcin、Curcin C蛋白是分別從麻瘋樹的種仁和子葉中提取分離純化出來的,為了更深入的了解這兩種蛋白的生物學(xué)功能,本文首先對麻瘋樹種子萌發(fā)和幼苗生長過程中各個組織器官的動態(tài)變化進(jìn)行了相關(guān)的研究,通過收集不同萌發(fā)時期的胚乳和子葉材料,探討了麻瘋樹種子萌發(fā)和幼苗生長過程中Curcin、CurcinC基因在胚乳和子葉中的表達(dá)情況,并推測其在萌發(fā)及幼苗生長中所發(fā)揮的生物學(xué)作用,進(jìn)而加快探索核糖體失活蛋白在生物體內(nèi)存在意義的進(jìn)程.之后對Curcin、Curcin C蛋白的組織特性了進(jìn)行了相關(guān)的研究,研究發(fā)現(xiàn),Curcin基因在這四種組織中的表達(dá)量都特別低,可以認(rèn)為幾乎不表達(dá),結(jié)合Curcin基因在種子萌發(fā)中的動態(tài)變化的研究,以及Curcin 蛋白的抗真菌、抗病毒活性等,由此推測,該蛋白可能是在種子萌發(fā)過程中,既作為一種貯藏蛋白,為種子后續(xù)的萌發(fā)提供營養(yǎng)物質(zhì),又作為一種防御性蛋白維護(hù)種子的正常萌發(fā)起到一定的作用.Curcin C蛋白在真葉和子葉中都有表達(dá),由此推測它可能是一種誘導(dǎo)性蛋白,在發(fā)育過程、脅迫,病毒感染等生物學(xué)過程中表達(dá),起著保護(hù)植物正常生長的作用.

通過對核糖體失活蛋白Curcin、Curcin C的生物信息學(xué)的分析得出這兩種蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位預(yù)測及信號肽的分析,對于后續(xù)的對這兩種核糖體失活蛋白的研究奠定相應(yīng)的基礎(chǔ).蛋白質(zhì)在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的定位,直接影響著其在生物體內(nèi)功能作用的發(fā)揮,為了進(jìn)一步探究兩種核糖體失活蛋白的定位,之后通過將核糖體失活蛋白Curcin、CurcinC基因構(gòu)建綠色熒光蛋白表達(dá)載體,注射煙草和轉(zhuǎn)化擬南芥原生質(zhì)體后,采用激光共聚焦顯微鏡觀察這兩種蛋白的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的定位,綜合兩種實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,這兩種蛋白可能定位在細(xì)胞壁上.

文獻(xiàn)研究結(jié)果表明:Ⅰ型核糖體失活蛋白在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中定位主要有:細(xì)胞間隙處(dioicin 1、dioicin 2、Gypsophilin)、細(xì)胞壁和細(xì)胞膜之間的擬壁體(皂草素)以及葉肉細(xì)胞的細(xì)胞壁基質(zhì)(PAP)[10-13].眾所周知,核糖體失活蛋白對核糖體具有一定的抑制作用,而這種特殊的定位分離了蛋白與自身細(xì)胞核糖體,使其自身細(xì)胞不會受到核糖體失活蛋白的毒害作用[14].并且,一般來說膜定位的蛋白質(zhì)一般會存在至少一個跨膜結(jié)構(gòu)域,通過對這兩種蛋白進(jìn)行跨膜結(jié)構(gòu)域的預(yù)測,發(fā)現(xiàn)并未含有跨膜結(jié)構(gòu)域,結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)及實(shí)驗(yàn)結(jié)果,從而推測這兩種蛋白定位在細(xì)胞壁上,通過分泌到胞外來發(fā)揮相應(yīng)的生物學(xué)功能.

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