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滲透壓選擇性裂解法在MALDI-TOF MS直接鑒定血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本中的應(yīng)用

2021-01-05 10:17:22張麗娜陳莎楊柳胡成進(jìn)杭州迪安醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心杭州3003解放軍第九六醫(yī)院檢驗(yàn)科濟(jì)南50000
臨床檢驗(yàn)雜志 2020年11期
關(guān)鍵詞:質(zhì)譜儀甲酸革蘭

張麗娜,陳莎,楊柳,胡成進(jìn)(.杭州迪安醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心,杭州 3003;.解放軍第九六〇醫(yī)院檢驗(yàn)科,濟(jì)南 50000)

血流感染(blood stream infection,BSI)具有較高發(fā)病率和死亡率,我國(guó)院內(nèi)BSI致死率可高達(dá)30%~40%[1]。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,BSI病原菌鑒定報(bào)告時(shí)間每延遲1 h,患者存活率降低7.6%[2-3]。因此,準(zhǔn)確快速鑒定病原菌及合理的抗菌藥物治療對(duì)于BSI患者的生存率和預(yù)后極其關(guān)鍵。目前,BSI診斷的金標(biāo)準(zhǔn)依然是血培養(yǎng),而實(shí)驗(yàn)室傳統(tǒng)方法是陽(yáng)性血培養(yǎng)標(biāo)本分離培養(yǎng)出單克隆菌落后進(jìn)行生化鑒定和藥敏試驗(yàn),一般耗時(shí)48~72 h,極大地延遲血培養(yǎng)陽(yáng)性結(jié)果的報(bào)告時(shí)間,從而可能耽誤患者的后續(xù)治療?;|(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一種近年來(lái)發(fā)展的新技術(shù),可用于微生物病原菌的鑒定,已成為國(guó)內(nèi)外學(xué)者研究的熱點(diǎn)之一。本研究嘗試使用滲透壓選擇性裂解法直接用于MALDI-TOF MS檢測(cè),可極大地縮短血培養(yǎng)陽(yáng)性周轉(zhuǎn)時(shí)間(turn-around time,TAT),為臨床抗感染治療提供可靠依據(jù)。

1 資料與方法

1.1一般資料 收集2018年12月至2019年3月杭州迪安醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心微生物室送檢的陽(yáng)性血培養(yǎng)瓶179例,剔除同一患者短時(shí)間送檢的多套血培養(yǎng)標(biāo)本。

1.2儀器與試劑 Vitek 2 compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)及配套鑒定卡、Bact/ALERT3D全自動(dòng)血培養(yǎng)儀(法國(guó)生物梅里埃公司),基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀及基質(zhì)α-氰基-4-羥基肉桂酸(HCCA)(珠海美華公司),甲酸、乙腈、三氟乙酸(Sigma公司),快速革蘭染液(珠海貝索公司),血瓊脂平板、麥康凱平板、巧克力平板(鄭州博賽公司)。

1.3方法

1.3.1血培養(yǎng)涂片染色鏡檢 血培養(yǎng)儀陽(yáng)性報(bào)警后,取出血培養(yǎng)陽(yáng)性報(bào)警瓶抽取培養(yǎng)液涂片行革蘭染色,記錄鏡檢結(jié)果,排除假陽(yáng)性干擾。

1.3.2傳統(tǒng)血培養(yǎng)鑒定 根據(jù)涂片結(jié)果,轉(zhuǎn)種哥倫比亞血瓊脂平板和巧克力平板,置于CO2環(huán)境中培養(yǎng)18~24 h,選擇適合鑒定板條,用Vitek 2 compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)進(jìn)行鑒定,記錄結(jié)果。

1.3.3MALDI-TOF MS 取出陽(yáng)性血培養(yǎng)瓶混勻后,注射器抽取1.5 mL培養(yǎng)液于1.5 mL EP管中(a),600×g離心10 s,將上清液轉(zhuǎn)移至新的1.5 mL EP管中,3 000×g離心60 s后棄上清液(b),加入1.5 mL裂解液(8.29 g NH4Cl,0.037 g EDTA-2Na,1 g KHCO3溶于1 L蒸餾水配制而成),室溫放置3 min后3 000×g離心60 s,棄上清液(c)。加入900 μL乙醇重懸,13 000 r/min離心2 min,棄上清液,再次離心,使用移液槍完全去除殘余的上清液,整個(gè)過程不應(yīng)觸碰沉淀,室溫下干燥沉淀2~3 min,加入70%甲酸和乙腈,吹打混勻,13 000 r/min離心2 min,吸取1 μL蛋白質(zhì)溶液(d),點(diǎn)樣于MALDI靶板上,干燥后加入1 μL HCCA基質(zhì)溶液,室溫干燥,采用質(zhì)譜儀進(jìn)行檢測(cè)。

質(zhì)譜儀參數(shù)設(shè)置:線性正性模式,氮激光器波長(zhǎng)377 nm,采集相對(duì)分子質(zhì)量為2 000~20 000的蛋白質(zhì)指紋圖譜,采集到的譜圖通過軟件進(jìn)行校正,然后與數(shù)據(jù)庫(kù)中的圖譜進(jìn)行比對(duì)。軟件根據(jù)微生物鑒定得到相應(yīng)分?jǐn)?shù),判斷分?jǐn)?shù)越高,鑒定準(zhǔn)確性的可信度越高:1.7分以下不可信,1.7~2.0屬水平可信,大于2.0種水平可信。

1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 用SPSS 23.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行。計(jì)數(shù)資料以率表示,率的比較采用四格表的卡方檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1革蘭染色與傳統(tǒng)鑒定法結(jié)果 共179例血培養(yǎng)瓶呈陽(yáng)性結(jié)果,其中3例為混合菌感染,1例為厭氧菌感染,2例涂片未找到細(xì)菌,查看梅里埃血培養(yǎng)儀報(bào)陽(yáng)曲線發(fā)現(xiàn),其曲線不連續(xù),為假陽(yáng)性結(jié)果。另外包括83例(47.1%)革蘭陰性桿菌,72例(26.7%)革蘭陽(yáng)性球菌,1例(0.57%)革蘭陰性球菌,11例(6.3%)革蘭陽(yáng)性桿菌,6例(3.4%)真菌,經(jīng)過16~24 h轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后采用Vitek 2 compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)可以鑒定出所有細(xì)菌。

2.2前處理除雜效果及MALDI-TOF MS的譜圖對(duì)比 以1例外周血培養(yǎng)大腸埃希菌為例,通過整個(gè)前處理操作過程中的外觀比對(duì),可見在第d步驟時(shí)除雜效果達(dá)到最好,得到的譜峰豐度最高,鑒定分值最優(yōu)。見圖1。

注:A,血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本原液;B,血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本原液低速離心后沉淀;C,血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本原液經(jīng)低速離心、裂解液裂解、離心后沉淀;D,血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本原液經(jīng)低速離心、裂解液裂解、甲酸萃取、離心后上清。

2.3MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果 174份單種菌血培養(yǎng)的種、屬水平鑒定的符合率分別是67.8%(118/174)、85.1%(148/174)。革蘭陰性桿菌的種、屬水平鑒定的符合率是74.7%(62/83)、91.6%(76/83),其中臨床常見菌株大腸埃希菌的種、屬水平的符合率是90.6%(29/32)、96.9%(31/32),肺炎克雷伯菌的種、屬水平符合率是72.7%(8/11)、81.8%(9/11),銅綠假單胞菌的種、屬水平符合率是80%(4/5)、100%(5/5),洋蔥伯克霍爾德菌的種、屬水平符合率是68.8%(11/16)、87.5%(14/16);革蘭陽(yáng)性球菌的種、屬水平鑒定符合率是69.4%(50/72)、80.6%(58/72),其中人葡萄球菌的種、屬水平的符合率是73.7%(14/19)、78.9%(15/19),頭狀葡萄球菌的種、屬符合率是80%(12/15)、86.7%(13/15),糞腸球菌的種、屬水平符合率是66.7%(4/6)、83.3%(5/6),革蘭陽(yáng)性桿菌的種、屬水平符合率是27.3%(3/11)、63.6%(7/11),念珠菌的種、屬水平符合率是33.3%(2/6)、100%(6/6)。3例復(fù)合菌感染的血培養(yǎng)陽(yáng)性鑒定分值均小于1.70,結(jié)果不可信。鑒定結(jié)果見表1。革蘭陽(yáng)性桿菌鑒定種水平的準(zhǔn)確率顯著低于革蘭陰性桿菌(P<0.05)和革蘭陽(yáng)性球菌(P<0.05),而革蘭陰性桿菌鑒定種水平的準(zhǔn)確率略高于革蘭陽(yáng)性球菌,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見表1。

表1 質(zhì)譜鑒定結(jié)果

3 討論

MALDI-TOF MS的最大優(yōu)勢(shì)在于可直接鑒定血培養(yǎng)瓶中的病原菌,省去了轉(zhuǎn)種于固體培養(yǎng)基孵育的時(shí)間,為臨床爭(zhēng)取時(shí)間。大量文獻(xiàn)[4-5]表明,不同的標(biāo)本預(yù)處理方法可用于MALDI-TOF MS直接鑒定血培養(yǎng)陽(yáng)性瓶病原菌,而不需要轉(zhuǎn)種培養(yǎng);前處理方法不同,MALDI-TOF MS鑒定的準(zhǔn)確率也會(huì)有所差異。本研究使用滲透壓選擇裂解法預(yù)處理對(duì)血培養(yǎng)陽(yáng)性瓶中的病原菌進(jìn)行直接鑒定,首先根據(jù)細(xì)胞密度的差異,離心后細(xì)菌菌體位于沉淀上層,然后利用氯化銨溶液進(jìn)一步裂解殘余的血細(xì)胞,獲得相對(duì)較純的細(xì)菌菌體,最后采用甲酸萃取法提取細(xì)菌蛋白質(zhì)進(jìn)行MALDI-TOF MS直接鑒定。甲酸萃取法的目的是破壞細(xì)菌細(xì)胞壁,產(chǎn)生更多蛋白質(zhì)譜,并且甲酸提取法中水和乙醇能洗掉培養(yǎng)基內(nèi)的雜質(zhì),2種溶劑混合作用可以將菌體表面和細(xì)胞內(nèi)的高峰強(qiáng)度的蛋白質(zhì)提取出來(lái),當(dāng)細(xì)菌量少、70%甲酸和乙腈的量多時(shí),會(huì)產(chǎn)生強(qiáng)度不夠的峰。如果細(xì)菌數(shù)量太大而70%甲酸和乙腈的量少時(shí)會(huì)造成檢測(cè)器的飽和,從而只有優(yōu)勢(shì)峰被檢測(cè)到,后者還會(huì)造成MALDI-TOF MS系統(tǒng)的污染,干擾鑒定準(zhǔn)確性。本研究參照文獻(xiàn)報(bào)道,70%甲酸和乙腈的量為菌體沉淀的6倍,鑒定準(zhǔn)確性最好[6]。

本研究對(duì)174例單種菌陽(yáng)性血培養(yǎng)直接進(jìn)行MALDI-TOF MS鑒定,結(jié)果顯示革蘭陽(yáng)性桿菌鑒定種水平的準(zhǔn)確率顯著低于革蘭陰性桿菌,這與國(guó)內(nèi)外學(xué)者的研究相符合[7],可能與革蘭陰性桿菌生長(zhǎng)速度快,相對(duì)比較容易達(dá)到MALDI-TOF MS鑒定的檢出限有關(guān)。另外,部分質(zhì)譜得分低的革蘭陰性桿菌,可能由于80%的血培養(yǎng)瓶含有活性炭或樹脂等抗菌藥物吸附劑,但其中的活性炭成分可能會(huì)干擾蛋白質(zhì)譜峰。對(duì)真菌的鑒定效果不理想,可能因?yàn)椋?1)真菌的細(xì)胞壁比較厚,結(jié)構(gòu)堅(jiān)韌,不能很好地與甲酸結(jié)合,從而蛋白質(zhì)不能完全被釋放出來(lái);(2)真菌生長(zhǎng)緩慢,血培養(yǎng)瓶中數(shù)量少導(dǎo)致靶點(diǎn)涂抹時(shí)不均勻,不能形成良好的結(jié)晶譜圖[8];(3)本實(shí)驗(yàn)使用的國(guó)產(chǎn)質(zhì)譜儀所使用的數(shù)據(jù)庫(kù)不完善。但是鑒于本研究中樣本數(shù)量較少,無(wú)法進(jìn)一步驗(yàn)證。

本研究對(duì)3例復(fù)合菌的鑒定,沒有1例鑒定成功。MALDI-TOF MS不適合作復(fù)合菌感染的鑒定[9],而Schubert等[10]在研究中提出應(yīng)用新的計(jì)算程序和新的數(shù)據(jù)庫(kù)直接鑒定混合感染的血培養(yǎng)標(biāo)本,此研究為MALDI-TOF MS直接鑒定混合菌感染的血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本提供了可能。另外,本研究發(fā)現(xiàn)1株被鑒定錯(cuò)誤的大腸埃希菌(得分為2.02分),實(shí)際上梅里埃儀器結(jié)果是99%的日勾維腸桿菌,這可能與本文使用質(zhì)譜儀的數(shù)據(jù)庫(kù)中參考指紋圖譜數(shù)量少有關(guān)。另外,由于成本問題,本研究中沒有用第3種方法來(lái)驗(yàn)證鑒定結(jié)果的可靠性,以及樣本量較少,使得統(tǒng)計(jì)結(jié)果可能有所偏差,有待于進(jìn)一步驗(yàn)證。

綜上,MALDI-TOF MS 采用滲透壓裂解法對(duì)血培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本直接鑒定,大大縮短了TAT,有助于臨床醫(yī)生對(duì)BSI患者作出及時(shí)準(zhǔn)確的判斷,適宜在微生物室常規(guī)開展。但是,血培養(yǎng)瓶成分、樣品的前處理方法、質(zhì)譜儀型號(hào)、判斷標(biāo)準(zhǔn)的差異均會(huì)對(duì)鑒定結(jié)果產(chǎn)生影響,有待進(jìn)一步優(yōu)化方法,提高質(zhì)譜鑒定準(zhǔn)確性。

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