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CircRNAs在肝細(xì)胞癌(HCC)中的研究進(jìn)展

2020-12-23 22:04賓庚偉黎軍宏馬燕渝茍堯
關(guān)鍵詞:環(huán)狀肝細(xì)胞肝癌

賓庚偉,黎軍宏,馬燕渝,茍堯

(1.廣西貴港市平南縣丹竹鎮(zhèn)赤馬衛(wèi)生院宿舍,廣西 貴港;2.廣西中醫(yī)藥大學(xué),廣西 南寧;3.廣西國際壯醫(yī)院,廣西)

0 引言

肝細(xì)胞癌(HCC)是原發(fā)性肝癌最常見的類型[1,2],占原發(fā)性肝癌的90%,在我國所有惡性腫瘤發(fā)病率中位列第4,病死率居第2位[3]。據(jù)估計(jì),中國的HCC患者每年占全球所有HCC病例的50%以上[4]。由于其發(fā)病機(jī)制尚未明確,目前甲胎蛋白(AFP)是其臨床診斷和預(yù)后的主要標(biāo)志物,此外,α-L-巖藻糖苷酶、肝細(xì)胞生長因子等亦用于HCC的診斷,但因其診斷的特異度及敏感度低,臨床對(duì)HCC的早期診斷和治療仍處于滯后階段,導(dǎo)致HCC患者預(yù)后差,復(fù)發(fā)率高[5]。臨床若實(shí)現(xiàn)對(duì)HCC患者的早期診斷,則可以在預(yù)期壽命方面取得顯著優(yōu)勢。盡管如此,大多數(shù)HCC患者通常在可以應(yīng)用任何治愈性治療之前被診斷處于具有轉(zhuǎn)移的晚期階段,且目前尚無有效的預(yù)防HCC的策略。因此,早期診斷HCC尤為關(guān)鍵。因此,迫切需要探索HCC腫瘤發(fā)生的分子機(jī)制,并確定有價(jià)值的HCC診斷生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)。

1 環(huán)狀RNA(circular RNAs,circ RNAs) 概述

CircRNAs屬于新型內(nèi)源性非編碼RNA(noncoding RNAs,nc RNAs),于20世紀(jì)70年代由Sanger等[6]在一些植物的類病毒中首次發(fā)現(xiàn),并于1979年由Hsu等人[7]首次通過電子顯微鏡發(fā)現(xiàn)一些真核生物細(xì)胞質(zhì)中亦存在共價(jià)連接的circ RNAs。然而,CircRNAs曾被認(rèn)為是前體RNA剪接過程中發(fā)生的錯(cuò)誤,期間一度被研究者忽視。隨著新一代測序(NGS),特別是高通量RNA測序 (RNA-sequencing,RNA-seq) 的深入研究,CircRNAs多種生物學(xué)功能逐漸被發(fā)現(xiàn),成為細(xì)胞基因表達(dá)的一種方式[8],存在于真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄中,通過反向剪接形成環(huán)狀轉(zhuǎn)錄物,以組織特異性和細(xì)胞特異性方式表達(dá),其具有連續(xù)的共價(jià)閉合性,沒有自由端的回路,因此,CircRNAs比線性RNA更穩(wěn)定[9,12]。研究發(fā)現(xiàn),CircRNAs在某些類型的病理反應(yīng)以及各種人類惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中起重要作用,與各種固體和血液惡性腫瘤相關(guān)聯(lián),據(jù)已有文獻(xiàn)報(bào)道,癌癥相關(guān)CircRNAs參與消化系統(tǒng)惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展[13,14],并且被證明是消化系統(tǒng)癌癥的潛在診斷生物標(biāo)志物[15]。CircRNAs的發(fā)現(xiàn),為肝細(xì)胞癌的早期診斷和治療提供新思路。

CircRNAs主要分為三類:外顯子 CircRNAs(eCircRNAs),外顯子-內(nèi)含子CircRNAs(EIciRNA)和環(huán)狀內(nèi)含子RNA(CircRNAs)[16],三種類型的CircRNAs由不同的環(huán)化機(jī)制產(chǎn)生。CircRNAs是高等真核生物中豐富的非編碼RNA類,與經(jīng)典線性剪接RNA不同,CircRNAs通過5’位剪接供體與3’位剪接受體形成[17,18],以共價(jià)鍵形成閉合的環(huán)形結(jié)構(gòu),具有穩(wěn)定性,核糖核酸酶R (RNase R)難以降解[19]。CircRNAs在組織和發(fā)育階段具有特異性,在表達(dá)方式上,具有普遍性、保守性等特征[20]。然而,新鑒定的環(huán)狀RNA的表達(dá)譜和功能,具體的生物活性仍需進(jìn)一步研究。近年來,CircRNAs在腫瘤治療中發(fā)揮重要作用,其在胃癌、胰腺癌、結(jié)直腸癌等腫瘤中表達(dá)方式各異,可能與腫瘤轉(zhuǎn)移存在相關(guān)性,為CircRNAs成為臨床診斷腫瘤的生物學(xué)標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)提供依據(jù),提示其在早期診斷、治療及預(yù)防等方面具有重要價(jià)值[21]。

2 CircRNAs功能

研究發(fā)現(xiàn),CircRNAs含有miRNA反應(yīng)元件(MREs),可以競爭性結(jié)合miRNA[22],并且CircRNAs可以作為競爭性內(nèi)源性RNA(ceRNAs)或miRNA海綿發(fā)揮作用,抑制miRNA功能。在細(xì)胞生理和病理過程中,天然內(nèi)源性環(huán)狀RNA具有抗外核溶解RNA衰變的作用,并含有選擇性保守的microRNA(microRNA)靶位點(diǎn)。因此,環(huán)狀RNA可以作為有效的microRNA海綿,與microRNA相互作用調(diào)節(jié)基因表達(dá),在miRNA發(fā)揮海綿作用的相關(guān)研究中,主要以(CDR1as或ciRS-7)為主,ciRS-7含有超過70個(gè)保守的miR-7結(jié)合位點(diǎn),從而影響miR-7附著于其靶mRNA的可用性,以解除miR-7對(duì)靶基因表達(dá)的抑制作用[23]。但越來越多的研究表明,CircRNAs的miRNA海綿功能在各種物種中是保守的,因此,需要更詳細(xì)的研究來闡明CircRNAs/miRNA相互作用對(duì)miRNA的表達(dá)和細(xì)胞定位的影響。

CircRNAs調(diào)節(jié)基因表達(dá)中具有重要功能,EIciRNA保留其親本基因的內(nèi)含子序列,因此能夠與轉(zhuǎn)錄機(jī)制相互作用。例如,circEIF3J和circPAIP2可以與宿主基因啟動(dòng)子區(qū)域中的U1小核核糖核蛋白(snRNP)和RNA Pol II相互作用,從而增強(qiáng)其親本基因,真核翻譯起始因子3J(EIF3J)和poly(A)的表達(dá)。結(jié)合蛋白相互作用蛋白2(PAIP2)[24]。CircRNAs主要積聚在細(xì)胞核中,能夠調(diào)節(jié)順式基因轉(zhuǎn)錄。Ci-ANKRD52,ci-MCM5和ci-SIRT7能夠與延長的Pol II復(fù)合物相互作用[25]。結(jié)果證明CircRNAs可通過調(diào)節(jié)延長的Pol II活性來促進(jìn)其親本基因的轉(zhuǎn)錄。CircRNAs在調(diào)節(jié)基因表達(dá)中起重要作用。

CircRNAs主要組成部分為外顯子,并且含有起始密碼子,為翻譯蛋白質(zhì)的重要條件,因此CircRNAs是否為轉(zhuǎn)錄本仍為當(dāng)前研究的熱點(diǎn)。其作用產(chǎn)生的機(jī)制為處于位點(diǎn)(IRES)的內(nèi)部核糖體被引入CircRNAs之際,CircRNAs即在體內(nèi)和體外進(jìn)行翻譯,指示CircRNAs編碼蛋白質(zhì)[26],Circ-ZNF609含有一個(gè)753個(gè)核苷酸的開放閱讀框(ORF),從起始密碼子到框內(nèi)終止密碼子,在環(huán)化時(shí)產(chǎn)生,并且它以剪接依賴性和不依賴帽的方式翻譯成蛋白質(zhì),提供真核生物中編碼蛋白質(zhì)的CircRNAs的實(shí)例[27]。

上述研究表明,CircRNAs在各種生物過程中起重要作用。然而,CircRNAs的功能尚未明確,探索CircRNAs生物學(xué)功能尤為重要。CircRNAs可以作為分子海綿來隔離miRNA或蛋白質(zhì),并且可以影響它們的細(xì)胞豐度和定位。

3 CircRNAs在與肝細(xì)胞癌(HCC)的相關(guān)性

HCC是消化系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤之一,病死率仍較高[2]。目前,針對(duì)HCC的治療方法臨床主要以外科手術(shù)為主,其中包括化療,肝移植,手術(shù)切除,抗腫瘤藥物療法和放射治療。由于疾病早期沒有癥狀,大多數(shù)患者被診斷為疾病晚期,具有轉(zhuǎn)移和肝儲(chǔ)備不足,從而失去了根治性切除的機(jī)會(huì)。在過去的十年中,改良的藥物治療劑已大大延長了患有晚期疾病的HCC患者的生存期。常用的治療方案包括索拉非尼,阿霉素(ADM),5-氟尿嘧啶(5-FU),含鉑抗癌藥物,喜樹堿和吉西他濱。然而,對(duì)這些藥物的多藥耐藥性(MDR)的獲得是臨床腫瘤學(xué)中的致命弱點(diǎn),并且可能導(dǎo)致不良的預(yù)后。HCC患者5年復(fù)發(fā)率也高達(dá)70%[29]。因此,目前臨床對(duì)HCC的綜合治療效果尚不如人意,HCC患者的預(yù)后仍很差[28]。因此,研究HCC發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,尋找新的分子治療靶點(diǎn),將有望為HCC患者尋求更有效的治療策略。

隨著研究不斷深入,證明CircRNAs表達(dá)的改變對(duì)肝癌的生物學(xué)特性具有廣泛的影響。CircRNAs在HCC中起癌基因或抑癌作用。許多CircRNAs參與肝細(xì)胞癌(HCC)的發(fā)生和發(fā)展[30]。CircRNAs在組織和器官生長中發(fā)揮發(fā)育和調(diào)節(jié)的作用[31,32],包括細(xì)胞凋亡[33,34],細(xì)胞應(yīng)激[35,36],細(xì)胞衰老[37]和炎癥反應(yīng)[38]。HCC中過表達(dá)has_circ_0078710可以通過海綿體miR-31上調(diào)HDAC和CDK2水平,同時(shí)介導(dǎo)細(xì)胞周期成分和陰性細(xì)胞周期調(diào)節(jié)因子p21的表達(dá),誘導(dǎo)細(xì)胞周期進(jìn)展,促進(jìn)細(xì)胞增殖,遷移,侵襲和腫瘤生長[39]。薛莉等研究發(fā)現(xiàn)circ_001569可以直接吸收miR-411-5p和miR-432-5p,進(jìn)而調(diào)節(jié)circ_001569的部分致癌功能,證明circ_001569可以提示肝細(xì)胞癌預(yù)后不良,并促進(jìn)細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移[40]。王斌等人通過RT-PCR測定HCC組織和HCC細(xì)胞系中circRBM23和miR-138的表達(dá)水平,證實(shí)上調(diào)的circRBM23通過調(diào)節(jié)腫瘤抑制因子miR-138在HCC中起致癌基因的作用[41]。邱思等通過定量實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)研究了73對(duì)肝細(xì)胞癌(HCC)和相鄰非腫瘤組織中CircRNAs hsa_circ_0001445的表達(dá)水平,證明了hsa_circ_0001445可以促進(jìn)細(xì)胞凋亡并抑制這些細(xì)胞的增殖,遷移和侵襲[42]。韓鼎等人將肝癌與鄰近正常組織比較,發(fā)現(xiàn)circc3p1的表達(dá)與TNM呈負(fù)相關(guān),并通過CCK8和Transwell分析,證明circ3p1過度表達(dá),顯著抑制了肝癌細(xì)胞,鑒定了CircRNAs circ3p1作為腫瘤抑制因子[43]。hsa_circ_0000673與HCC細(xì)胞中的miR-767-3p直接相關(guān),通過抑制miR-767-3p,hsa_circ_0000673促進(jìn)HCC細(xì)胞增殖和侵襲和調(diào)節(jié)miR-767-3p/SET途徑促進(jìn)HCC惡性行為[44]。更有研究證明hsa_circ_0003570表達(dá)水平與HCC臨床病理學(xué)特征相關(guān),環(huán)狀RNA(CircRNAs)中的Hsa_circ_0003570不僅首先在HCC細(xì)胞系中發(fā)現(xiàn)下調(diào),而且在HCC組織中也被下調(diào),因此,CircRNAs可能是HCC治療的有希望的新治療靶標(biāo)。周祖樺等通過RT-PCR在各種肝癌細(xì)胞系和人癌組織中定量分析circCDK13表達(dá),證實(shí)了circSMARCA5的過表達(dá)導(dǎo)致抑制增殖,增加細(xì)胞凋亡和抑制侵襲。這些研究表明,CircRNAs可能是HCC治療的新治療靶標(biāo)。

4 結(jié)語與展望

HCC是最主要的惡性腫瘤之一,盡管最近幾年相繼進(jìn)行了新的先進(jìn)治療方法,但是HCC的存活率仍然很低。越來越多的證據(jù)表明,改變的CircRNAs表達(dá)可影響HCC的發(fā)生和發(fā)展,并且在HCC治療和預(yù)后方面顯示出巨大的潛力。CircRNAs充當(dāng)miRNA海綿,調(diào)節(jié)參與細(xì)胞周期,增殖,侵襲和轉(zhuǎn)移的基因、蛋白質(zhì)的表達(dá)。且CircRNAs具有高豐度和穩(wěn)定的優(yōu)勢,可作為HCC診斷生物標(biāo)記物,將有望成為HCC有效的治療靶標(biāo)。目前,CircRNAs在HCC的研究仍處于起步階段,CircRNAs可能通過不同的機(jī)制參與HCC的腫瘤發(fā)生,進(jìn)一步了解CircRNAs與HCC病因之間的關(guān)系將加速CircRNAs在HCC診斷和治療中的臨床應(yīng)用。對(duì)CircRNAs在HCC中的功能和機(jī)制的深入研究將豐富我們對(duì)參與肝癌發(fā)生的復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的了解。此外,進(jìn)一步了解CircRNAs與HCC病因之間的關(guān)系將加速CircRNAs在HCC診斷和治療中的臨床應(yīng)用。

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