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溫室白粉虱染色體水平基因組首次被揭示

2020-12-18 19:14
蔬菜 2020年5期
關(guān)鍵詞:煙粉白粉特異性

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和美國康奈爾大學(xué)BTI合作解析了世界重大農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱基因組,揭示了其發(fā)育特異性表達(dá)和抗藥性分子機(jī)制,對深入開展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物—昆蟲—微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。相關(guān)研究成果與3月27日在線發(fā)表于《分子生態(tài)資源(Molecular Ecology Resource)》上。

溫室白粉虱和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴(yán)重的2種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組早在2016年和2017年由以上合作雙方共同解析完成。本研究利用三代測序平臺(tái)Pacbio長reads和Hi-C技術(shù),實(shí)現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級別的組裝。結(jié)果發(fā)現(xiàn):白粉虱基因組組裝大小為787 Mb,含11條染色體級別scaffolds;注釋到18 275個(gè)蛋白編碼基因,重復(fù)序列占基因組的56.6%;對白粉虱發(fā)育階段特異性表達(dá)分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化關(guān)聯(lián)的基因,例如卵黃蛋白基因和cuticle基因;白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn),天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴(kuò)張,這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān);通過細(xì)胞色素P450家族的比較分析,在白粉虱找到和煙粉虱CYPCM1同源的4個(gè)P450基因,這4個(gè)基因有可能幫助到白粉虱代謝新煙堿類藥劑。

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