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實(shí)時(shí)熒光核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)和實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)解脲脲原體的效果比較

2020-12-17 10:59陳娟王庭強(qiáng)張?jiān)婎?/span>黃詠張?jiān)?/span>
關(guān)鍵詞:預(yù)測(cè)值敏感度尿液

陳娟 王庭強(qiáng) 張?jiān)婎?黃詠 張?jiān)?/p>

支原體是生物界最小的一種原核微生物,可生長(zhǎng)、繁殖于無(wú)生命培養(yǎng)基,解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,UU)、生殖道支原體等均屬于支原體,主要分離于泌尿生殖道,會(huì)造成泌尿生殖道疾病,可引發(fā)30%~40%的男性非淋菌性、非衣原體尿道炎[1]。在性傳播疾病中,UU感染較為常見(jiàn),近年來(lái)發(fā)生率日益升高。在UU檢測(cè)中,實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)是近年來(lái)應(yīng)用最廣泛的技術(shù)之一,但由于采集樣本是分泌物拭子,采樣過(guò)程中易產(chǎn)生損傷,而無(wú)損傷采集的樣本進(jìn)行qRT-PCR敏感度不高,且存在一定假陽(yáng)性概率,因此臨床上有必要尋找一種高敏感度、高特異度,同時(shí)可降低假陰陽(yáng)概率且適用于檢測(cè)病原微生物含量較低標(biāo)本的方法[2]。本研究統(tǒng)計(jì)分析了2018年1月—2020年1月就診于我院的89例疑似UU感染患者的臨床資料,旨在評(píng)估實(shí)時(shí)熒光核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(simultaneous amplification and testing,SAT)和qRT-PCR對(duì)UU的檢測(cè)效果,現(xiàn)報(bào)告如下。

1 資料與方法

1.1 研究對(duì)象及一般資料 選擇2018年1月—2020年1月本院收治的89例疑似UU感染患者,其中男性30例(占33.7%),女性59例(占66.3%);年齡19~58歲,平均(38.5±6.4)歲。

1.2 試劑與儀器 ABI 7500熒光定量PCR儀(美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司),SAT試劑盒購(gòu)自上海仁度生物科技有限公司,qRT-PCR試劑盒購(gòu)自廣州達(dá)安基因股份有限公司。

1.3 檢測(cè)方法

1.3.1 尿液樣本采集 取患者清晨首次尿液,或長(zhǎng)時(shí)間(至少1 h)不排尿后的首段尿標(biāo)本2 mL。采集的樣本在2~30 ℃條件下于24 h內(nèi)送至實(shí)驗(yàn)室加入樣本保存液,制備成待測(cè)樣本(RNA在菌體死亡后很容易發(fā)生降解,標(biāo)本須在24 h內(nèi)加入保存液)。

1.3.2 分泌物拭子采集 男性患者采集分泌物時(shí)用棉拭子在尿道內(nèi)停留15 s,取出時(shí)均勻旋轉(zhuǎn)3周;女性患者采集陰道內(nèi)分泌物或?qū)m頸口內(nèi)2 cm處分泌物。將采集的棉拭子置于無(wú)菌試管中立即送檢。

1.3.3 樣本保存 標(biāo)本采集后24 h內(nèi)將尿液與樣本保存液1:1混合(2 mL尿液加入樣本保存管至紅色刻度線附近),所取分泌物拭子加入1 mL生理鹽水。加入保存液后的待測(cè)樣本在2~8 ℃下保存不應(yīng)超過(guò)7 d,-20 ℃下保存不超過(guò)3個(gè)月,-70 ℃下可長(zhǎng)期保存,避免反復(fù)凍融。

1.3.4 操作步驟 對(duì)所有患者尿液標(biāo)本進(jìn)行SAT檢測(cè),并對(duì)比同一患者分泌物標(biāo)本的qRT-PCR結(jié)果,差異樣本進(jìn)行第三方鑒定。① SAT:洗脫拭子樣本,置于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)1~2 d?;靹?00 μL尿液或分泌物(加有保存液)+100 μL核酸提取液,在60 ℃下恒溫、室溫分別放置5 min、10 min,在磁珠分離器上靜置5 min,加入洗滌液洗滌2次。置于半自動(dòng)核酸提取儀上提取RNA,然后吸取含磁珠的30 μL擴(kuò)增檢測(cè)液,放置于8連管中,加入42 ℃預(yù)熱的SAT酶液,在42 ℃下進(jìn)行40 min實(shí)時(shí)恒溫?cái)U(kuò)增。②qRT-PCR:加入1 mL生理鹽水樣本振蕩數(shù)秒,將液體轉(zhuǎn)移至1.5 mL離心管中,以12 000 r/min(離心半徑11 cm)離心10 min,棄去上清,加入50 μL核酸提取液,100 ℃金屬浴中煮沸10 min,以1 000 r/min(離心半徑11 cm)離心5 min,取5 μL上清液進(jìn)行qRT-PCR。

1.4 結(jié)果判讀 ① SAT:依據(jù)閾值線與樣本曲線交點(diǎn)的橫坐標(biāo)讀數(shù)(dt),dt≤35為陽(yáng)性(UU攜帶者),dt≤界值參考品dt值表明樣本中UU≥104 cfu/mL,需進(jìn)行臨床干預(yù);35<dt<40建議重新檢測(cè),dt<40為陽(yáng)性,無(wú)數(shù)值或dt=40為陰性[3]。② qRT-PCR:根據(jù)陽(yáng)性參考對(duì)照曲線,每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)(Ct值)無(wú)數(shù)值為陰性,Ct值<30.0為陽(yáng)性[4]。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 使用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件分析數(shù)據(jù),符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以例或率表示,采用χ2檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 SAT和qRT-PCR檢測(cè)UU陽(yáng)性率比較 89例疑似UU感染的臨床標(biāo)本中,使用尿液標(biāo)本的SAT陽(yáng)性檢出率明顯高于拭子標(biāo)本的qRT-PCR陽(yáng)性檢出率(P<0.05)。見(jiàn)表 1。

表1 SAT和qRT-PCR檢測(cè)UU的陽(yáng)性情況比較

2.2 SAT和qRT-PCR對(duì)UU的診斷效能 89例疑似UU感染的臨床標(biāo)本中,臨床診斷陽(yáng)性59例,陰性30例,SAT法檢測(cè)陽(yáng)性62例,陰性27例;qRT-PCR檢測(cè)陽(yáng)性46例,陰性43例。以臨床診斷作為“金標(biāo)準(zhǔn)”,SAT檢測(cè)的敏感度為100.0%(59/59),特異度為 90.0%(27/30),準(zhǔn)確度為 96.6%(86/89),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為 95.2%(59/62),陰性預(yù)測(cè)值為 100.0%(27/27);qRT-PCR檢測(cè)的敏感度為78.0%(46/59),特異度為100.0%(30/30),準(zhǔn)確度為 85.4%(76/89),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為 100.0%(46/46),陰性預(yù)測(cè)值為 69.8%(30/43)。SAT檢測(cè)的敏感度、特異度、準(zhǔn)確度、陰性預(yù)測(cè)值均明顯高于qRT-PCR(均P<0.05),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值和特異度均低于qRT-PCR(均P<0.05)。見(jiàn)表2~3。

3 討論

生殖道支原體感染與男性前列腺炎、女性宮頸炎等密切相關(guān)[5]。在UU檢測(cè)中,qRT-PCR是臨床通常采用的方法,qRT-PCR的檢測(cè)原理是在原有PCR的基礎(chǔ)上增加了一條熒光探針,在擴(kuò)增時(shí)熒光探針與病原體的一條DNA鏈結(jié)合,當(dāng)引物延伸時(shí),外切酶切斷熒光探針中的熒光基團(tuán),此時(shí)熒光基團(tuán)發(fā)光,通過(guò)拍照設(shè)備獲得圖像,檢測(cè)熒光強(qiáng)度,從而反映病原體的產(chǎn)物量[6]。在對(duì)UU進(jìn)行檢測(cè)的過(guò)程中,qRT-PCR只能采用拭子樣本,取樣過(guò)程具有侵入性,給患者造成一定痛苦。但由于qRT-PCR操作簡(jiǎn)便、較為經(jīng)濟(jì),同時(shí)能夠降低產(chǎn)物污染,因此現(xiàn)階段在臨床實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)中較為常用[7]。SAT是指靶標(biāo)RNA在反轉(zhuǎn)錄酶作用下反轉(zhuǎn)錄合成一條包含T7啟動(dòng)子的雙鏈DNA,T7 RNA聚合酶以這條雙鏈DNA為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,每個(gè)RNA可以擴(kuò)增出100~1 000個(gè)拷貝的RNA。合成所得的RNA與分子信標(biāo)結(jié)合,發(fā)出熒光,可以被熒光檢測(cè)儀檢測(cè)到[8]。與此同時(shí),新合成的RNA繼續(xù)在反轉(zhuǎn)錄酶和T7 RNA聚合酶的作用下循環(huán)反轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄的過(guò)程,如此往復(fù),以達(dá)到高效擴(kuò)增的目的[9]。SAT的檢測(cè)樣本可以為泌尿生殖道分泌物,也可以為尿液,而尿液取樣具有非侵入性,可以讓受檢者自行取材,一方面能減少醫(yī)生工作量,另一方面還能避免拭子取樣給患者造成的痛苦,易為患者所接受。

表2 SAT和qRT-PCR檢測(cè)UU的效果與臨床診斷比較

表3 SAT和qRT-PCR對(duì)UU的診斷效能比較

有研究顯示,在UU檢測(cè)中,SAT具有較高的準(zhǔn)確性,能有效滿足快速、簡(jiǎn)便的實(shí)驗(yàn)要求,且SAT的檢測(cè)樣本可以為尿液,因此臨床應(yīng)用價(jià)值較高[10]。本研究結(jié)果表明,實(shí)驗(yàn)方案共驗(yàn)證89例疑似UU感染臨床標(biāo)本,其中SAT法(尿液標(biāo)本)共檢出62例陽(yáng)性,陽(yáng)性率為69.7%;qRT-PCR(拭子標(biāo)本)共檢出46例陽(yáng)性標(biāo)本,陽(yáng)性率為51.7%。SAT法陽(yáng)性率高于qRT-PCR,且qRT-PCR檢出陽(yáng)性的標(biāo)本SAT均檢出陽(yáng)性。SAT法檢測(cè)的敏感度、準(zhǔn)確度、陰性預(yù)測(cè)值均高于qRT-PCR,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值低于qRT-PCR,與上述研究結(jié)果[10]一致,表明SAT法在UU檢測(cè)中具有較高的陽(yáng)性率、敏感度、準(zhǔn)確度和陰性預(yù)測(cè)值,同時(shí)還具有檢測(cè)速度快、取樣方便的優(yōu)點(diǎn)。SAT屬于一種新型RNA檢測(cè)技術(shù),有機(jī)結(jié)合了實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)與RNA恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù),運(yùn)用磁珠法特異性提取尿液樣本中的UU RNA,不需要高溫加熱和高速離心,具有較高的提取效率。同時(shí),RNA在常規(guī)環(huán)境中易降解,交叉污染較少,能有效解決污染引發(fā)的假陽(yáng)性問(wèn)題,也能為監(jiān)測(cè)臨床療效提供有利條件。此外,SAT采用水相洗滌,可特異性捕獲靶標(biāo),具有較少的反應(yīng)抑制物,能有效降低假陰性概率和提高檢測(cè)敏感度[11]。

綜上所述,采用SAT檢測(cè)UU較qRT-PCR效果更好,值得在臨床推廣。

利益沖突 所有作者均聲明不存在利益沖突

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