郝繁運(yùn)
CYP2C19基因多態(tài)性檢測(cè)可用于氯吡格雷等藥物用藥安全監(jiān)測(cè)和用藥指導(dǎo),ApoE基因分型檢測(cè)結(jié)果可以作為心腦血管疾病及阿爾茲海默病(Alzheimer's disease,AD)臨床輔助診斷和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的重要指標(biāo)。CYP2C19基因多態(tài)性和ApoE基因分型檢測(cè)已被越來(lái)越多的臨床醫(yī)師重視,因此,準(zhǔn)確檢測(cè)CYP2C19基因多態(tài)性和ApoE基因分型至關(guān)重要,但目前在臨床檢測(cè)工作中缺少準(zhǔn)確可靠的商用質(zhì)量控制(質(zhì)控)品,因此,本研究使用醫(yī)院血庫(kù)制備濾膜的收集物,進(jìn)行基因檢測(cè)質(zhì)控品的研制,取得預(yù)期效果[1-4],現(xiàn)報(bào)告如下。
為獲得穩(wěn)定的質(zhì)控品來(lái)源,本研究對(duì)醫(yī)院血庫(kù)制備“去白細(xì)胞紅細(xì)胞”后棄留在過濾器濾膜上的白細(xì)胞進(jìn)行提取[5],作為自制質(zhì)控品的標(biāo)本來(lái)源。自制質(zhì)控品采用來(lái)自健康獻(xiàn)血者的標(biāo)本,而非提取后的DNA,目的在于進(jìn)行實(shí)驗(yàn)全流程質(zhì)控,包括核酸提取階段和聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)階段。
2.1 儀器與試劑 美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司生產(chǎn)的ABI 7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(已校準(zhǔn),該檢測(cè)系統(tǒng)已經(jīng)通過性能驗(yàn)證和室間準(zhǔn)確性比對(duì));CYP2C19基因多態(tài)性試劑盒(批號(hào):20181001H,武漢海吉力生物科技有限公司),ApoE基因分型試劑盒(批號(hào):AE201811005,廈門人瑞生物醫(yī)藥科技有限公司)。
2.2 標(biāo)本收集 使用無(wú)菌生理鹽水沖洗去白細(xì)胞過濾器,采用無(wú)菌操作將洗滌下來(lái)的液體小心收集在50 mL離心管中備用,總量約50 mL,取0.5 mL樣本在血液分析儀中進(jìn)行測(cè)定,以白細(xì)胞計(jì)數(shù)達(dá)到5.0×109/L為合格。本次實(shí)驗(yàn)共收集標(biāo)本28份,測(cè)得白細(xì)胞計(jì)數(shù)都在10×109/L以上。
2.3 收集標(biāo)本盲測(cè) 將收集的28份標(biāo)本使用ABI 7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行基因測(cè)試分型,采用CYP2C19基因多態(tài)性試劑盒和ApoE基因分型試劑盒進(jìn)行基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。
2.3.1 CYP2C19基因多態(tài)性的判斷 本實(shí)驗(yàn)采用的基因擴(kuò)增試劑每個(gè)標(biāo)本占據(jù)1條6連管。選擇1、2號(hào)管,根據(jù)每個(gè)反應(yīng)管到達(dá)FAM通道(450~490 nm)信號(hào)閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)差值(?Ct值)判斷樣本CYP2C19*2的基因多態(tài)性;選擇3、4號(hào)管,根據(jù)FAM信號(hào)?Ct值判斷樣本CYP2C19*3的基因多態(tài)性;選擇5、6號(hào)管,根據(jù)FAM信號(hào)?Ct值判斷樣本CYP2C19*17的基因多態(tài)性,然后根據(jù)表1判斷標(biāo)本的基因型。對(duì)分裝的自制質(zhì)控品進(jìn)行核酸提取后按照基因擴(kuò)增操作程序在PCR儀上機(jī)檢測(cè)。
表1 CYP2C19基因多態(tài)性分型判斷
2.3.2 ApoE基因分型判斷 待測(cè)樣品DNA內(nèi)控HEX通道(515~535 nm)信號(hào)正常時(shí)觀察樣品在ε2、ε3和ε4基因檢測(cè)試劑中的FAM信號(hào)有無(wú)曲線升起。如有擴(kuò)增曲線,計(jì)算Ct和?Ct值(?Ct=CtFAM-CtHEX),以≤?Ct臨界值判斷為陽(yáng)性。見表2。
本研究篩選出25份符合要求樣本,CYP2C19基因多態(tài)性檢測(cè)出*1/*1基因型10份,*1/*2基因型10份,*2/*2基因型3份,*1/*3基因型1份,*3/*3基因型 1份,未檢出 *1/*17、*2/*3、*2/*17、*3/*17、*17/*17基因型;篩選出27份符合要求樣本中ApoE基因分型檢測(cè)出ε3/ε3基因型19份,ε3/ε4基因型2份,ε2/ε3基因型4份,ε2/ε2基因型1份,ε4/ε4基因型1份,未檢出ε2/ε4基因型。
表2 ApoE基因分型判斷
2.4 自制質(zhì)控品的制備
2.4.1 CYP2C19基因多態(tài)性檢測(cè)質(zhì)控品的制備取上述不同基因型(*1/*2、*2/*2、*1/*3、*3/*3)的陽(yáng)性標(biāo)本,分別顛倒混勻10次。室溫下以2 000 r/min(離心半徑為15 cm)離心30 min。然后用一次性塑料吸管小心吸出位于紅細(xì)胞和血漿層中間的白細(xì)胞層(白膜),置于5 mL雙蒸水(ddH2O)中,顛倒混勻后靜置10 min,使吸出的少量紅細(xì)胞低滲溶血,以3 500 r/min離心15 min;吸棄上清,保留細(xì)胞層,視溶血效果可重復(fù)低滲溶血操作1~2次。合并相同基因型的白細(xì)胞,以適量(按原血標(biāo)本總體積的1/2)模擬血漿重懸。充分混勻后按照每管不少于200 μL分裝到0.5 mL離心管中,于-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2.4.2 ApoE基因分型檢測(cè)質(zhì)控品的制備 取上述不同基因型(ε3/ε4、ε2/ε3、ε3/ε3、ε4/ε4)的陽(yáng)性標(biāo)本,按照2.4.1項(xiàng)下方法制備ApoE基因分型檢測(cè)質(zhì)控品并分裝,于-70 ℃保存。
2.5 自制質(zhì)控品的分裝 上述自制質(zhì)控品按6個(gè)月量進(jìn)行配制。用0.5 mL離心管分裝,每支分裝量應(yīng)足夠進(jìn)行至少1次檢測(cè),在質(zhì)控品外部粘貼標(biāo)簽,需注明質(zhì)控品名稱、配制日期、有效期及配制人。
3.1 每日取1支自制質(zhì)控品作為外部陽(yáng)性質(zhì)控(不同基因型交替輪換使用),隨日常標(biāo)本進(jìn)行核酸提取及PCR上機(jī)檢測(cè),外部陽(yáng)性質(zhì)控標(biāo)本位置隨機(jī)。每塊反應(yīng)板均需運(yùn)行室內(nèi)質(zhì)控,包括試劑盒自帶的陰性、陽(yáng)性質(zhì)控以及空白對(duì)照,自制質(zhì)控品每日檢測(cè)1次。
3.2 根據(jù)室內(nèi)質(zhì)控結(jié)果與已知結(jié)果的一致性判斷本批次結(jié)果是否正常,報(bào)告能否發(fā)出。
4.1 均勻性評(píng)估 每批新制質(zhì)控品均需進(jìn)行1次均勻性評(píng)價(jià),每個(gè)基因型質(zhì)控品配制成一定濃度后混勻分裝并上機(jī)檢測(cè),以不同瓶間無(wú)明顯差別(本實(shí)驗(yàn)為判定分型結(jié)果一致)作為均勻性評(píng)價(jià)指標(biāo)。每個(gè)分型標(biāo)本取5瓶在1 d內(nèi)進(jìn)行核酸提取后擴(kuò)增檢測(cè),根據(jù)試劑盒要求判讀結(jié)果,定型結(jié)果與已知結(jié)果一致為合格。見表3~4。
表3 CYP2C19基因多態(tài)性自制質(zhì)控品同批次均勻性結(jié)果
表4 ApoE基因分型自制質(zhì)控品同批次均勻性結(jié)果
4.2 穩(wěn)定性評(píng)估 將自制質(zhì)控品保存于-70 ℃,每批次選取3瓶進(jìn)行上機(jī)檢測(cè),記錄第0、1、3、6個(gè)月后檢測(cè)結(jié)果,與預(yù)期陽(yáng)性結(jié)果一致則為穩(wěn)定性良好,穩(wěn)定期為檢測(cè)時(shí)間,否則將上一次檢測(cè)時(shí)間作為穩(wěn)定時(shí)間。見表5~6。
表5 CYP2C19基因多態(tài)性自制質(zhì)控品階段性復(fù)測(cè)結(jié)果
表6 ApoE基因分型自制質(zhì)控品階段性復(fù)測(cè)結(jié)果
4.3 穩(wěn)定性回顧評(píng)價(jià)[8-10]定期對(duì)質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)進(jìn)行回顧性評(píng)價(jià),每月質(zhì)控小結(jié)回顧首先確認(rèn)質(zhì)控品的有效性。如果自制質(zhì)控品Ct值有降低趨勢(shì),或無(wú)明確原因與預(yù)期結(jié)果不一致,則需停止使用并重新確認(rèn)該批次質(zhì)控品的有效性,更換新批次的質(zhì)控品。
自制室內(nèi)質(zhì)控品在PCR擴(kuò)增儀中的位置不能永久固定在1個(gè)孔,應(yīng)盡量在每次擴(kuò)增檢測(cè)時(shí)進(jìn)行相應(yīng)順延,使得在一定時(shí)間內(nèi)可以盡可能地監(jiān)測(cè)每1個(gè)孔的擴(kuò)增有效性。
本研究以醫(yī)院血庫(kù)制備“去白細(xì)胞紅細(xì)胞”后棄留在濾膜上的白細(xì)胞作為原料,對(duì)其進(jìn)行提取,自制基因檢測(cè)質(zhì)控品,結(jié)果顯示,自制質(zhì)控品的均勻性和穩(wěn)定性符合預(yù)期質(zhì)量要求。并且可獲得穩(wěn)定充足的樣本,克服通過其他渠道獲得樣本來(lái)源有限、不能有效監(jiān)測(cè)實(shí)驗(yàn)反應(yīng)全過程等缺點(diǎn),制備的質(zhì)控品在臨床實(shí)驗(yàn)室中可用于ApoE基因分型和CYP2C19多態(tài)性檢測(cè)。自制質(zhì)控品需較長(zhǎng)時(shí)間凍存,本研究未加入甘油、二甲基亞砜、血清等外源性保護(hù)劑和穩(wěn)定劑,可以避免檢測(cè)中可能存在的非特異性干擾。
利益沖突 作者聲明不存在利益沖突