秦海彬,牛坤,王遠(yuǎn)山*
1(浙江工業(yè)大學(xué),浙江省生物有機(jī)合成技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 杭州,310014) 2(生物轉(zhuǎn)化與生物凈化教育部工程研究中心(浙江工業(yè)大學(xué)),浙江 杭州,310014)
S-腺苷蛋氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)存在于各種生物組織內(nèi),具有廣泛的生物學(xué)功能[1],參與體內(nèi)蛋白質(zhì)、核酸、多糖、磷脂以及脂肪酸等物質(zhì)的生物合成[2-3]。SAM作為標(biāo)準(zhǔn)藥物的替代品對治療抑郁癥、骨關(guān)節(jié)炎、酒精性肝病和阿爾茲海默病具有相當(dāng)大的優(yōu)勢,市場需求巨大[4]。
SAM的生產(chǎn)方法主要有化學(xué)合成法、酶促轉(zhuǎn)化法和微生物發(fā)酵法,其中化學(xué)法合成產(chǎn)率低,反應(yīng)底物L(fēng)-半胱氨酸價(jià)格昂貴,且分離與純化過程困難,難以工業(yè)化應(yīng)用[5]。酶促轉(zhuǎn)化法需要SAM合成酶并添加價(jià)格昂貴的底物ATP,因其生產(chǎn)投入較高而缺乏市場競爭力。發(fā)酵法生產(chǎn)SAM具有工藝流程簡單、產(chǎn)量高、底物廉價(jià)易得等優(yōu)勢而被廣泛應(yīng)用[6]。目前,已報(bào)道生產(chǎn)SAM的微生物主要有大腸桿菌(Escherichiacoli)、巴斯德畢赤酵母(Pichiapastoris)和釀酒酵母(Saccharomycescere isiae)。通過同源或異源過表達(dá)SAM合成酶可以提高大腸桿菌SAM產(chǎn)量,但是過多的SAM積累不利于菌體生長。重組畢赤酵母生產(chǎn)SAM需要甲醇作為誘導(dǎo)劑,可能引起安全問題,并且發(fā)酵周期長。與上述2種微生物相比,釀酒酵母作為安全生物廣泛應(yīng)用于食品與發(fā)酵行業(yè),且SAM合成能力強(qiáng),適宜作為SAM工業(yè)生產(chǎn)的菌株[7]。
在傳統(tǒng)的產(chǎn)SAM菌株選育方面,SHIOZAKI等[8]篩選到1株野生釀酒酵母,在最適條件下通過發(fā)酵罐培養(yǎng),SAM產(chǎn)量達(dá)到10.8 g/L,這是迄今在野生菌發(fā)酵產(chǎn)SAM方面最高的報(bào)道。利用化學(xué)誘變(NTG、EMS、LiCl等)、物理誘變(60Co γ-射線、U 等)以及復(fù)合誘變篩選SAM產(chǎn)菌株高也有較多報(bào)道,HUANG等[9]利用太空育種方法獲得釀酒酵母突變株H5M147,SAM產(chǎn)量達(dá)到1.22 g/L,是原始菌株的1.87倍。CAO等[10]用紫外連續(xù)誘變結(jié)合乙硫氨酸抗性篩選的方法,得到SAM高活性合成酶的釀酒酵母CGMCC2842,與出發(fā)菌株相比SAM產(chǎn)量增加了2.7倍,同時(shí)在15 L發(fā)酵罐中分批補(bǔ)料發(fā)酵36 h后SAM產(chǎn)量達(dá)到6.1 g/L。為獲得SAM高效生產(chǎn)菌株,本實(shí)驗(yàn)擬采用常溫常壓等離體(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)和137Cs γ-射線誘變結(jié)合乙硫氨酸、制霉菌素抗性平板篩選,并通過搖瓶培養(yǎng)條件優(yōu)化,5 L發(fā)酵罐分批補(bǔ)料發(fā)酵,為發(fā)酵法生產(chǎn)SAM奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 主要材料、試劑與儀器
Saccharomycescere isiaeZY由本實(shí)驗(yàn)室保藏。SAM標(biāo)準(zhǔn)品、乙硫氨酸、制霉菌素、生物素、泛酸鈣、維生素B1、維生素B6,阿拉丁公司;其他試劑為國產(chǎn)分析純。
ARTP-II型等離子體誘變儀,無錫源清天木生物科技有限公司;Waters 1525高效液相色譜,美國WATERS公司;spectraMax M5酶標(biāo)儀,美國分子儀器公司;5 L BIOTECH發(fā)酵罐,上海保興生物設(shè)備工程有限公司。
1.1.2 培養(yǎng)基
種子培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨 20,酵母粉 10,葡萄糖 20,pH自然。固體培養(yǎng)基再加入20 g/L瓊脂粉,115 ℃滅菌30 min。
搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖 30,酵母粉 5,(NH4)2SO45,K2HPO45,KH2PO410, MnSO4·7H2O 0.1,ZnSO4·7H2O 0.1,MgSO40.2,CaCl20.1,CuSO40.001 6,檸檬酸三鈉二水合物 0.1,pH自然,115 ℃滅菌30 min。
發(fā)酵罐發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖 20,酵母粉 3,(NH4)2SO45,K2HPO45,KH2PO410, MnSO4·7H2O 0.1,ZnSO4·7H2O 0.6,MgSO43,CaCl20.5,CuSO40.001 6,鉬酸銨 0.004 8,NaCl 0.5,生物素 0.000 3,泛酸鈣 0.003 6,維生素B1 0.003 6,維生素B6 0.003 6。115 ℃滅菌30 min。
發(fā)酵罐流加培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖 500,酵母粉12。
1.2.1 培養(yǎng)方法
(1)菌種活化及種子培養(yǎng)。取菌種甘油管涂布于固體培養(yǎng)基平板,30 ℃培養(yǎng)2~3 d,挑取單菌落接入裝有10 mL種子培養(yǎng)基的試管中, 30 ℃,150 r/min培養(yǎng)12 h。活化結(jié)束后以2%的接種量接入裝有50 mL種子培養(yǎng)基的250 mL搖瓶中,30 ℃,150 r/min培養(yǎng)12 h。
(2)搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)。250 mL搖瓶中裝液量為50 mL搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基,以4%(體積分?jǐn)?shù))的接種量接種,30 ℃,150 r/min搖床中培養(yǎng)24 h,補(bǔ)加2 mL 36 g/LL-蛋氨酸,繼續(xù)培養(yǎng)24 h。
(3)5 L發(fā)酵罐補(bǔ)料發(fā)酵
發(fā)酵罐裝液量為3 L,經(jīng)過空消、實(shí)消滅菌后,種子培養(yǎng)基以10%(體積分?jǐn)?shù))接種到發(fā)酵罐中??刂茰囟?、pH,罐壓調(diào)控在0.05 MPa,以200 r/min的攪拌速度開始發(fā)酵,發(fā)酵全程通過控制攪拌轉(zhuǎn)速與葡萄糖流加速度,使溶氧保持在10%~20%,最高轉(zhuǎn)速為750 r/min。發(fā)酵過程中每隔2~3 h取樣,測定還原糖、菌體量、SAM含量等參數(shù)。
1.2.2 誘變方法
(1)ARTP誘變。試驗(yàn)工作氣體為氦氣,工作氣流量為8 SLM,處理距離為2 mm,電源輸出功率為120 W。將培養(yǎng)6~8 h的菌體適當(dāng)稀釋后制備菌懸液,取5 μL菌液加5 μL 10%的甘油均勻涂于載片,80%~90%致死率劑量照射。照射后用無菌培養(yǎng)基清洗載片,洗液適當(dāng)稀釋涂布篩選平板上,30 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)1~2 d,選擇較大單菌落進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。
致死率/%=
(1)
(2)137Cs γ-射線誘變。在浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院輻照中心進(jìn)行,將培養(yǎng)6~8 h的菌體適當(dāng)稀釋后制備菌懸液,80%~90%致死率劑量照射。照射后的菌液經(jīng)適當(dāng)稀釋處理涂布篩選平板,30 ℃培養(yǎng)1~2 d,選擇較大單菌落進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。
1.2.3 突變株篩選方法
(1)ARTP誘變與乙硫氨酸抗性平板篩選。蛋氨酸在SAM合成酶與ATP的作用下轉(zhuǎn)化為SAM,但在蛋氨酸類似物如乙硫氨酸的存在下該反應(yīng)會(huì)被抑制,使用乙硫氨酸篩選高耐受突變株,有利于SAM產(chǎn)量的提高[11]。本實(shí)驗(yàn)將ARTP照射后的菌液適當(dāng)稀釋后涂布于0.4 mmol/L乙硫氨酸篩選平板,30 ℃培養(yǎng)1~2 d,選擇較大單菌落進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。
(2)137Cs γ-射線誘變與制霉菌素抗性平板篩選。SAM是酵母菌合成麥角固醇的主要甲基供體且消耗量大,而制霉菌素能夠結(jié)合酵母菌細(xì)胞膜上的麥角固醇,導(dǎo)致麥角固醇產(chǎn)生途徑缺失,細(xì)胞膜通透性改變。理論上,制霉菌素可以用來選育高產(chǎn)SAM菌株[12]。將γ-射線照射后的菌液進(jìn)行適當(dāng)稀釋涂布于5 μg/mL制霉菌素篩選平板,30 ℃培養(yǎng)1~2 d,選擇較大單菌落進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。
1.2.4 測定方法
(1)生物量測定。菌體干重(dry cell weight,DCW)的測定:烘干至恒重的離心管稱重(m1),加入固定體積的發(fā)酵液,10 000 r/min離心5 min,棄上清液,用蒸餾水清洗后離心,重復(fù)2次。然后85 ℃烘干至恒重后稱重(m2),m2-m1為菌體干重,經(jīng)換算可得每升發(fā)酵液的菌體干重。
(2)SAM含量的測定。采用高效液相色譜法[13]。取1 mL發(fā)酵液,12 000 r/min高速離心2 min,棄上清液,加入200 μL超純水,200 μL乙酸乙酯,30 ℃金屬浴振蕩30 min,隨后加入500 μL 0.35 mol/L硫酸,振蕩1.5 h后12 000 r/min離心2 min,取上清液,0.22 μm有機(jī)膜過濾待測。
液相測定條件:色譜柱J&K C18(5 μm,4.6 mm×250 mm),流動(dòng)相為40 mmol/L 磷酸二氫銨,2 mmol/L庚烷磺酸鈉和18%(體積分?jǐn)?shù))甲醇水溶液,檢測波長254 nm,流速1.0 mL/min,進(jìn)樣量10 μL,柱溫30 ℃。
(3)葡萄糖含量測定。3,5-二硝基水楊酸法[4]。
2.1.1 菌株ZY生長曲線與最佳照射劑量的確定
對釀酒酵母進(jìn)行ARTP誘變時(shí),一般使用對數(shù)生長中后期的菌體進(jìn)行誘變,由于此時(shí)菌株酶活力高,生長旺盛且易發(fā)生突變[15]。每隔2 h取樣測600 nm吸光值(OD600)繪制菌株ZY生長曲線。由圖1可知,菌株對數(shù)期生長期在4~12 h,確定培養(yǎng)6~8 h的酵母細(xì)胞進(jìn)行ARTP誘變與137Cs γ-射線誘變。經(jīng)過照射時(shí)間和劑量的優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)ARTP照射180 s致死率在87.4%,由于誘變的致死率在80%~90%之間時(shí),突變率相對較高,獲得優(yōu)良性能菌株的可能性最大[16],故實(shí)驗(yàn)選擇ARTP誘變照射時(shí)間為180 s。取ARTP照射后的優(yōu)勢菌株,進(jìn)行γ-射線輻照,照射劑量700 GY時(shí)致死率在87%,故實(shí)驗(yàn)選擇γ-射線誘變照射劑量為700 GY。
圖1 ZY菌株搖瓶生長曲線Fig.1 Growth cur e of strain ZY in shake flask fermentation
2.1.2 ARTP誘變育種結(jié)果
ARTP照射菌株ZY 180 s,培養(yǎng)后涂布于乙硫氨酸篩選平板,挑選相對較大的單菌落進(jìn)行搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)。經(jīng)過5輪誘變,共獲得比出發(fā)菌株SAM產(chǎn)量高20% 的突變株23株。通過搖瓶復(fù)篩,突變株A-17的SAM產(chǎn)量最高,較出發(fā)菌株ZY提高了55.5%(表1)。因此,選擇突變株A-17為進(jìn)一步誘變的出發(fā)菌株。
表1 ARTP誘變復(fù)篩結(jié)果Table 1 The rescreening results of ARTP mutagenesis
2.1.3137Cs γ-射線誘變育種結(jié)果
突變株A-17經(jīng)700 GY γ-射線照射4輪,共獲得比出發(fā)菌株SAM產(chǎn)量高20% 的突變株11株。通過搖瓶復(fù)篩,突變株AC-4、AC-6和AC-10的SAM產(chǎn)量提升較高,其中突變株AC-10的SAM產(chǎn)量達(dá)到1.15 g/L,比突變株A-17提高了36.9%,比菌株ZY提高了130.0%(表2)。
表2 137Cs γ-射線誘變復(fù)篩結(jié)果Table 2 The rescreening results of 137Cs γ-mutagenesis
2.1.4 突變株遺傳穩(wěn)定性
為考察突變株傳代后發(fā)酵水平穩(wěn)定性,采用平板劃線方法傳代培養(yǎng),將復(fù)篩的突變株AC-4、AC-6和AC-10各傳代10次。挑取偶數(shù)代檢測SAM含量,結(jié)果見圖2。與突變株AC-4和AC-6相比,突變株AC-10的SAM產(chǎn)量較高且能穩(wěn)定遺傳,因此選作SAM的生產(chǎn)菌株。
圖2 突變株AC-4、AC-6和AC-10遺傳穩(wěn)定性Fig.2 The inherit stability of mutant AC-4,AC-6 and AC-10
2.1.5 突變株AC-10搖瓶培養(yǎng)條件優(yōu)化
2.1.5.1 培養(yǎng)溫度的確定
考查了24、27、30、33和36 ℃對突變株AC-10生長和SAM產(chǎn)量的影響。由圖3可知,溫度對菌體量無顯著影響,而對SAM產(chǎn)量有顯著影響。30 ℃時(shí)菌體量和SAM產(chǎn)量都達(dá)到最大,分別為7.19 g/L和1.16 g/L,當(dāng)溫度繼續(xù)升高,SAM產(chǎn)量則降低。綜合SAM產(chǎn)量和菌體量,選擇30 ℃為最適培養(yǎng)溫度。
圖3 溫度對突變株AC-10生長和SAM生產(chǎn)的影響Fig.3 Effect of temperature on growth and SAM titer of mutant AC-10
2.1.5.2 初始pH的確定
pH會(huì)對菌體細(xì)胞結(jié)構(gòu)、參與代謝的各種酶活性力產(chǎn)生較大影響,間接影響菌體對培養(yǎng)基的利用,菌體的生長以及產(chǎn)物的生成[17]。在30 ℃下研究了不同初始pH值對突變株AC-10生長和SAM產(chǎn)量的影響。由圖4可知,初始pH由4.5提高到7.5的過程中,SAM產(chǎn)量和生物量變化顯著,且偏酸性環(huán)境有利于菌體生長和SAM生成,初始pH為5.5時(shí)菌體量及SAM產(chǎn)量達(dá)到最大值,分別為7.24 g/L和1.21 g/L。因此,選擇初始pH 5.5為最適pH。
圖4 初始pH對突變株AC-10生長和SAM生產(chǎn)的影響Fig.4 Effect of initial pH on growth and SAM titer of mutant AC-10
2.1.6 突變株AC-10 5 L發(fā)酵罐分批補(bǔ)料發(fā)酵
在5 L發(fā)酵罐中溫度控制30 ℃,用氨水調(diào)節(jié)pH至5.5,以分批補(bǔ)料方式考查突變株AC-10產(chǎn)SAM的能力,其發(fā)酵曲線見圖5。整個(gè)發(fā)酵過程可分為適應(yīng)期、快速生長期和轉(zhuǎn)化期3個(gè)階段。發(fā)酵前期,菌株生長緩慢,糖耗低,培養(yǎng)至15 h葡萄糖基本耗完,溶氧迅速升高,此時(shí)開始流加培養(yǎng)基,起始流加速度10 mL/h,其中葡萄糖流加濃度約為2.5 g/(L·h)。15 h后菌株生長迅速,糖耗高,通過調(diào)節(jié)流加速度,使罐內(nèi)殘?zhí)强刂圃? g/L左右。配合轉(zhuǎn)速與通氣量調(diào)節(jié),使溶氧保持在10%~20%。參考王杰鵬等[18]]蛋氨酸補(bǔ)加策略,當(dāng)菌體量達(dá)到100 g/L時(shí)開始補(bǔ)加蛋氨酸。52 h時(shí)加入8 gL-蛋氨酸作為前體,此后每隔4 h補(bǔ)加一次。在L-蛋氨酸加入之前,胞內(nèi)幾乎沒有SAM積累,在加入后則快速生成,在第68 h SAM產(chǎn)量達(dá)到5.62 g/L,最高產(chǎn)率為0.63 g/(L·h)。
圖5 AC-10突變株5 L發(fā)酵罐分批補(bǔ)料發(fā)酵曲線Fig.5 Time course of fed-batch fermentation by mutant AC-10
突變株AC-10在菌體量和SAM產(chǎn)量方面比原始菌株均有所提高,搖瓶中SAM最高產(chǎn)量為1.21 g/L,經(jīng)5 L發(fā)酵罐分批補(bǔ)料發(fā)酵,SAM產(chǎn)量可達(dá)5.62 g/L,與HUANG等[9]、CAO等[10]報(bào)道的SAM產(chǎn)量基本持平。突變株AC-10在52~62 h最高SAM產(chǎn)率為0.63 g/(L·h),但62 h后生長明顯停滯,原因可能是營養(yǎng)物質(zhì)匱乏間接導(dǎo)致SAM產(chǎn)量降低。參考釀酒酵母發(fā)酵SAM的報(bào)道,如LI等[19]以突變株釀釀酒酵母CGMCC 13760利用豆腐黃漿液發(fā)酵SAM,在優(yōu)化的工藝條件下,產(chǎn)量達(dá)到16.14 g/L;王杰鵬等[20]通過釀酒酵母SAM0801高密度發(fā)酵SAM,在優(yōu)化的工藝條件下,SAM產(chǎn)量達(dá)到17.1 g/L;而LIU等[21]使用CRISPR工具整合外源基因獲得重組釀酒酵母HDL-R2菌株,通過蛋氨酸補(bǔ)加策略優(yōu)化,SAM產(chǎn)量達(dá)到10.3 g/L。因此,突變株AC-10仍有進(jìn)一步發(fā)掘的潛力,后續(xù)可通過發(fā)酵工藝優(yōu)化達(dá)到高密度發(fā)酵、蛋氨酸添加策略優(yōu)化或遺傳改造,進(jìn)一步提高其SAM產(chǎn)量。
針對S.cere isiaeZY發(fā)酵生產(chǎn)SAM產(chǎn)量低的問題,對其進(jìn)行了5輪ARTP誘變和4輪137Csγ-射線輻照誘變,結(jié)合乙硫氨酸、制霉菌素抗性平板篩選,獲得1株遺傳穩(wěn)定性較好的突變株AC-10,其SAM產(chǎn)量為1.15 g/L,與出發(fā)菌株ZY相比提高了130.0%。通過搖瓶培養(yǎng)條件優(yōu)化,確定最適條件為30 ℃、初始pH 5.5,經(jīng)5 L發(fā)酵罐分批補(bǔ)料發(fā)酵68 h后SAM產(chǎn)量達(dá)到5.62 g/L。結(jié)果表明,ARTP與137Csγ-射線突變率高,易獲得遺傳穩(wěn)定性良好突變株,結(jié)合乙硫氨酸、制霉菌素抗性的理性化篩選育種,能夠提高篩選效率。本研究可為發(fā)酵法生產(chǎn)SAM奠定基礎(chǔ)。