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科技動態(tài)

2020-10-27 03:50:12
糧油與飼料科技 2020年5期
關(guān)鍵詞:染色質(zhì)下丘腦胚胎

易降解有機(jī)物強(qiáng)化高粱對鎘的積累研究取得進(jìn)展

鎘污染農(nóng)田在全球廣泛分布,其修復(fù)治理備受關(guān)注。植物吸取是一種成本低廉、環(huán)境友好的修復(fù)手段,但鎘超富集植物的生物量一般較小,限制了修復(fù)效率。近年來,科學(xué)家在生物量較大的能源植物、纖維植物等用于鎘污染農(nóng)田修復(fù)方面開展了豐富研究,但其鎘富集能力相對較弱是重要限制因子。通過施加重金屬螯合劑強(qiáng)化植物吸取修復(fù)效率成為該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。低分子有機(jī)酸、可溶性有機(jī)物料降解周期短,是一類環(huán)境友好型螯合劑,如何在有限的降解周期內(nèi),提升其強(qiáng)化作物吸取鎘的效應(yīng)研究具有實(shí)用價(jià)值。

中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所研究員黃道友團(tuán)隊(duì)以生物質(zhì)高粱供試作物,以前期確定草酸配施水溶性有機(jī)肥(OA+DOF)和檸檬酸配施水溶性有機(jī)肥(CA+DOF)兩種易降解有機(jī)物料組合為供試材料,研究了高粱不同生育期施用易降解有機(jī)物對植株鎘積累的強(qiáng)化效應(yīng)。結(jié)果表明,OA+DOF和CA+DOF可顯著提高植株各部位鎘含量21.5%~72.1%,而施用時(shí)期顯著影響高粱植株對鎘積累,以抽穗期施用最佳、旗葉期施用強(qiáng)化效應(yīng)最弱;CA+DOF配方效果優(yōu)于OA+DOF配方。其主要作用機(jī)理是通過降低土壤pH值和增加土壤可溶性有機(jī)物(DOC)含量,進(jìn)而提高土壤有效態(tài)鎘含量和促進(jìn)高粱對鎘的吸收與累積。研究結(jié)果為鎘污染農(nóng)田的植物強(qiáng)化修復(fù)提供了新見解。

該項(xiàng)研究近期發(fā)表在環(huán)境科學(xué)類期刊Chemosphere上,論文第一作者為聯(lián)合培養(yǎng)博士生李波,通訊作者為副研究員朱捍華。該研究得到了國家麻類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、湖南省自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體和國家自然科學(xué)基金的支持。

(來源:亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所)

遺傳發(fā)育所玉米育性研究獲進(jìn)展

玉米雜交優(yōu)勢強(qiáng),是我國種植面積最大的作物之一,我國雜交種普及率近乎100%。玉米雄性不育系的利用是解決制種過程中人工去雄的有效途徑。中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳化榜組長期致力于玉米雄性不育基因的克隆和應(yīng)用,已克隆數(shù)個(gè)雄性不育基因(IPE1,2017,Plant Physiology;APV1,2017,The Plant Journal;Ms6021,2017,Scientific Reports),并探討雄性不育機(jī)理(Xiao et al.,2020,Molecular Plant)。

花藥角質(zhì)層和花粉壁是保護(hù)植物生殖細(xì)胞免受外界環(huán)境干擾的重要屏障。在玉米雄穗發(fā)育過程中,上述組織的破壞可導(dǎo)致玉米雄性不育。課題組獲得一個(gè)雄性不育徹底且穩(wěn)定的玉米突變體,命名為irregular pollen exine2(ipe2),該突變體表現(xiàn)為花藥皺縮,且成熟的花粉粒中無淀粉積累。圖位克隆和互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)證實(shí)IPE2控制玉米雄性育性,該基因在花藥發(fā)育的四分體期和小孢子釋放期特異表達(dá),編碼一個(gè)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位的GDSL脂肪酶。IPE2基因功能缺陷導(dǎo)致突變體中脂質(zhì)代謝發(fā)生異常,尤其是C16/C18脂肪酸以及相關(guān)衍生物的含量顯著下降,并造成突變體花藥絨氈層和中間層細(xì)胞延遲降解,花藥角質(zhì)層和花粉外壁發(fā)育異常,導(dǎo)致玉米雄性不育。該研究擴(kuò)展了對玉米雄性不育機(jī)理的認(rèn)知,并為玉米不育化制種提供了新材料。

9月10日,相關(guān)研究成果在線發(fā)表在Plant Physiology上(DOI:10.1104/pp.20.00105)。陳化榜研究組博士研究生霍燕青和裴元榮為論文共同第一作者,助理研究員劉娟為論文通訊作者。研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和國家自然科學(xué)基金的資助。

(來源:遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所)

營養(yǎng)與健康所在基于木霉的真菌毒素脫毒轉(zhuǎn)化、玉米原料中真菌毒素污染風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警研究中獲進(jìn)展

9月1日,Environmental Pollution在線發(fā)表了中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所研究員武愛波研究組題為Confrontation assays and mycotoxin treatment reveal antagonistic activities of Trichoderma and the fate of Fusarium mycotoxins in microbial interaction的研究論文。該研究報(bào)道生防木霉在與不同類型產(chǎn)毒真菌互作過程中,能夠通過糖基化和去氧化實(shí)現(xiàn)對不同類型真菌毒素的脫毒轉(zhuǎn)化,為發(fā)展基于木霉的真菌毒素源頭防控提出新路徑。同時(shí),從毒素轉(zhuǎn)化角度探討木霉與產(chǎn)毒真菌的互作關(guān)系,為真菌毒素污染的安全控制提供新思路。

圖1木霉-產(chǎn)毒鐮刀菌互作關(guān)系與毒素脫毒轉(zhuǎn)化路徑

9月6日,F(xiàn)ood Control在線發(fā)表了營養(yǎng)與健康所武愛波研究組題為Pre-warning of abiotic factors in maize required for potential contamination of fusarium mycotoxins via response surface analysis的研究論文。該研究建立了玉米基質(zhì)中多種真菌毒素的同步檢測方法,確定我國飼料及玉米原料中真菌毒素污染的主要類型(含隱蔽型)及其發(fā)生規(guī)律,進(jìn)而構(gòu)建玉米原料中真菌毒素污染風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)警模型(針對水活度、溫度等環(huán)境因子)。

圖2玉米原料中真菌毒素污染發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警模型

研究工作得到科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金委和中科院等的支持。博士生田野、于松分別為兩篇論文的第一作者,武愛波為論文通訊作者。

(來源:上海營養(yǎng)與健康研究所)

合肥研究院農(nóng)田活性氮氧化物交換通量研究獲進(jìn)展

近期,中國科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院安徽光學(xué)精密機(jī)械研究所研究員謝品華課題組在農(nóng)田HONO和NOx交換通量研究中取得進(jìn)展,相關(guān)研究成果發(fā)表在Science of the Total Environment上。

HONO作為OH自由基的前體物,在大氣中扮演著重要角色,因其對臭氧和光化學(xué)煙霧形成的促進(jìn)作用而引起關(guān)注。近年來的研究顯示,HONO對OH自由基的貢獻(xiàn)不單表現(xiàn)在清晨,在全天都有意義,對OH自由基初始來源的貢獻(xiàn)在50%(夏季)至80%(冬季)。考慮HONO已知源匯,通過模式計(jì)算得到的模擬值和實(shí)際外場觀測值差異較大,尤其是白天的HONO濃度,未知源強(qiáng)達(dá)到0.06-5 ppbv h-1,但具體的來源途徑存在爭議。

2019年,課題組研究員秦敏和唐科等利用自動動態(tài)箱技術(shù),在壽縣國家氣候觀象臺開展淮河流域農(nóng)田HONO和NOx交換通量觀測。同步獲得農(nóng)田土壤HONO和NO排放通量,HONO和NO最大通量分別為7.69ngm-2s-1和34.52ngNm-2s-1。外場觀測HONO通量結(jié)果與新鮮土樣的測量結(jié)果在同一數(shù)量級,在假定混合層高度為300米的情況下,平均土壤排放可以解釋大約0.06 ppbv h-1的缺失HONO源,是偏遠(yuǎn)地區(qū)白天HONO的重要來源途徑。

研究工作得到國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目的資助。

(來源:合肥物質(zhì)科學(xué)研究院)

生物物理所等發(fā)現(xiàn)哺乳動物下丘腦神經(jīng)前體細(xì)胞的分子和細(xì)胞特征

下丘腦是哺乳動物中最為復(fù)雜且進(jìn)化上相對保守的腦區(qū)之一,對于生物體的生理、行為穩(wěn)態(tài)的調(diào)節(jié)至關(guān)重要。與大腦皮層的層狀結(jié)構(gòu)不同,哺乳動物的下丘腦是由多種結(jié)構(gòu)及功能復(fù)雜的細(xì)胞核團(tuán)構(gòu)成。層狀結(jié)構(gòu)大腦皮層的組織原則及神經(jīng)發(fā)生規(guī)律在過去的十幾年里已經(jīng)得到比較深入的研究,中國科學(xué)院生物物理研究所研究員王曉群課題組前期工作揭示了放射性膠質(zhì)細(xì)胞(RG)和外側(cè)放射性膠質(zhì)細(xì)胞(oRG)細(xì)胞是大腦皮層神經(jīng)元發(fā)生的主要前體細(xì)胞(Nature Neuroscience 2011),并且揭示了這些皮層神經(jīng)前體細(xì)胞的分子特征以及在大腦皮層發(fā)育進(jìn)化上的貢獻(xiàn)(Cell Stem Cell 2017,Nature 2018)。但是,一直以來,人們對于細(xì)胞核團(tuán)類結(jié)構(gòu)的神經(jīng)發(fā)生發(fā)育機(jī)制仍不清楚,尤其是對于下丘腦神經(jīng)前體細(xì)胞的種類特點(diǎn)以及產(chǎn)生神經(jīng)元的細(xì)胞和分子機(jī)制所知甚少。

近日,該團(tuán)隊(duì)在Nature Communications在線發(fā)表了題為Cellular and molecular properties of neural progenitors in the developing mammalian hypothalamus的研究論文,系統(tǒng)闡明了哺乳動物下丘腦發(fā)育過程中神經(jīng)前體細(xì)胞的形態(tài)特征、分裂模式、譜系發(fā)育特點(diǎn),利用單細(xì)胞測序手段進(jìn)一步揭示人胚胎下丘腦的神經(jīng)前體細(xì)胞具有多樣性,并對不同細(xì)胞類型及其關(guān)鍵分子及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了系統(tǒng)探究。

研究人員發(fā)現(xiàn)在哺乳動物(人和小鼠)胚胎下丘腦中既存在典型的位于第三腦室的放射狀膠質(zhì)(hypothalamic radial glia,hRG),又找到了一種新的位于下丘腦外套層的單極RG(hypothalamic mantle zone radial glial,hmRG)。通過實(shí)時(shí)成像及免疫染色表明,hRG和hmRG在細(xì)胞分裂時(shí)分別歷經(jīng)動力核遷移過程和細(xì)胞易位過程,并產(chǎn)生子代前體細(xì)胞或神經(jīng)元細(xì)胞。譜系追蹤實(shí)驗(yàn)表明,在下丘腦發(fā)育早期,hmRG細(xì)胞以及后續(xù)的神經(jīng)發(fā)生都起始于hRG細(xì)胞,部分細(xì)胞譜系呈現(xiàn)放射柱狀分布。hRG細(xì)胞上的放射狀膠質(zhì)纖維束朝向特定下丘腦不同核團(tuán)亞區(qū)延伸分布,被認(rèn)為可能作為支架引導(dǎo)新生神經(jīng)元的遷移方向和最終定位。

此外,研究人員利用高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),解析了人胚胎下丘腦不同的神經(jīng)前體細(xì)胞亞型,差異表達(dá)基因及參與神經(jīng)前體細(xì)胞增殖調(diào)控的關(guān)鍵通路。通過深入分析和驗(yàn)證,研究揭示了下丘腦神經(jīng)前體細(xì)胞通過E2F1通路調(diào)控HMGA2基因和細(xì)胞增殖。該研究表明在人胚胎發(fā)育期10周,下丘腦神經(jīng)元已開始分化,表現(xiàn)出較為復(fù)雜的神經(jīng)元亞型,并表達(dá)核團(tuán)特異性基因。與小鼠胚胎下丘腦進(jìn)行比較,研究發(fā)現(xiàn)小鼠和人胚胎的下丘腦核團(tuán)結(jié)構(gòu)及參與調(diào)控核團(tuán)發(fā)育的關(guān)鍵分子在發(fā)育進(jìn)程中呈現(xiàn)保守性。對哺乳動物下丘腦神經(jīng)前體細(xì)胞的細(xì)胞特征及分子特性系統(tǒng)性研究,為進(jìn)一步深入研究非層狀結(jié)構(gòu)的下丘腦神經(jīng)發(fā)生及核團(tuán)形成機(jī)制提供了基礎(chǔ)理論。

生物物理所博士周新為論文第一作者,王曉群為論文通訊作者。北京師范大學(xué)博士鐘穗娟、教授吳倩參與了該課題研究。研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)、國家自然科學(xué)基金和腦科學(xué)與類腦研究北方科學(xué)中心科研項(xiàng)目等資助。

(來源:生物物理研究所)

遺傳發(fā)育所農(nóng)業(yè)資源中心等在谷子株型調(diào)控研究中取得進(jìn)展

合理提高作物種植密度來實(shí)現(xiàn)有限耕地條件下的糧食產(chǎn)量提升,是解決糧食安全問題的主要途徑之一。葉片是作物光合作用和有機(jī)物合成的主要器官,葉片形態(tài)建成與作物株型相關(guān),可直接影響作物種植密度及產(chǎn)量。為提高密植狀態(tài)下作物的光合作用及產(chǎn)量,作物育種過程中追求葉片直立(即葉片不下垂)而又緊湊(即葉片與莖的夾角?。?。BR是重要的植物生長發(fā)育調(diào)節(jié)激素,圍繞BR信號調(diào)控葉片與莖的夾角已經(jīng)開展了大量深入機(jī)理的研究,但關(guān)于葉片直立與下垂的遺傳基礎(chǔ)尚缺乏認(rèn)識,制約了禾谷類作物株型改良的效率和水平。

近期,中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所農(nóng)業(yè)資源研究中心與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所聯(lián)合開展的谷子株型調(diào)控研究工作取得進(jìn)展,闡釋了谷子的披垂葉基因(DROOPY LEAF1)作為油菜素內(nèi)酯(BR)激素信號的“剎車”基因如何調(diào)控葉片直立與披垂。

該研究利用谷子(Setaria italica)葉片嚴(yán)重披垂的突變體(droopy leaf 1,dpy1),克隆了控制谷子葉片披垂的基因(DPY1)。該基因編碼了一個(gè)新的富亮氨酸重復(fù)型膜蛋白受體激酶,其編碼蛋白可以與油菜素內(nèi)酯的共受體(SiBAK1)通過胞內(nèi)的激酶結(jié)構(gòu)互作,并競爭性地抑制油菜素內(nèi)酯受體(SiBRI1)與共受體(SiBAK1)間的互作水平,從而以負(fù)反饋的方式抑制早期油菜素內(nèi)酯信號的過度激活。因此,DPY1起到了“剎車”基因的作用(圖2)。該過程可以促進(jìn)葉片中脈的遠(yuǎn)軸厚壁細(xì)胞分裂及木質(zhì)素的沉積,從而提高葉片的支撐力并促進(jìn)葉片直立性。此外,該研究通過玉米披垂葉基因回補(bǔ)谷子突變體(dpy1)試驗(yàn),證實(shí)在禾本科作物中這種機(jī)制是保守和共享的。該研究成果揭示了禾谷類作物葉片堅(jiān)實(shí)度的遺傳學(xué)基礎(chǔ)及其調(diào)控機(jī)制,為作物株型改良提供了新的基因資源及研究思路。

谷子是我國的原產(chǎn)作物,且至今仍是旱作生態(tài)農(nóng)業(yè)的主栽作物,在食物多樣性和種植業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整中具有不可或缺的作用。谷子及其野生種青狗尾草(Setaria viridis)由于基因組小、高效轉(zhuǎn)化、生育期短,且易于實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)操作,正在快速發(fā)展成為禾本科黍亞科和C4光合作用的模式植物。該研究也證實(shí)了谷子作為功能基因組研究模式植物的潛力,有助于促進(jìn)谷子模式植物體系的發(fā)展。

相關(guān)成果以DROOPY LEAF1 Controls Leaf Architecture by Orchestrating Early Brassinosteroid Signaling(披垂葉基因通過調(diào)控早期油菜素內(nèi)酯信號來控制谷子株型)為題,發(fā)表在《美國科學(xué)院院刊》上。農(nóng)業(yè)資源中心博士趙美丞,作物科學(xué)研究所副研究員湯沙、博士張皓珊為論文共同第一作者;作物科學(xué)研究所研究員刁現(xiàn)民、農(nóng)業(yè)資源中心研究員劉西崗為共同通訊作者。研究得到科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金、中科院STS計(jì)劃、河北省自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。

(來源:遺傳發(fā)育所農(nóng)業(yè)資源研究中心)

北京基因組所等揭示豬早期胚胎發(fā)育的三維基因組學(xué)重編程規(guī)律

豬不僅是重要的經(jīng)濟(jì)家畜,在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域也有重要應(yīng)用。生豬的育種中廣泛應(yīng)用了輔助生殖技術(shù),包括體外受精技術(shù)、孤雌和孤雄生殖技術(shù)等。但與體外受精胚胎相比,孤雌和孤雄胚胎的存活率級低。這一存活率差異產(chǎn)生的機(jī)制目前還不清楚。深入理解這一機(jī)制不僅有助于增加商業(yè)化豬育種的產(chǎn)仔數(shù),也將有利于生物醫(yī)學(xué)研究中轉(zhuǎn)基因豬模型的建立。哺乳動物早期胚胎發(fā)育過程中經(jīng)歷復(fù)雜的表觀遺傳信息的重編程。表觀遺傳信息的重編程其與胚胎的存活緊密關(guān)聯(lián)。染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)是重要的表觀遺傳因素,與基因表達(dá)調(diào)控、發(fā)育及疾病等密切相關(guān)。然而豬的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)及其在早期胚胎發(fā)育過程中的變化規(guī)律目前還是一個(gè)未知的領(lǐng)域。

近期,中國科學(xué)院北京基因組研究所(國家生物信息中心)張治華團(tuán)隊(duì)與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院王彥芳團(tuán)隊(duì)及中科院動物研究所趙建國團(tuán)隊(duì)合作在Genome Biology期刊發(fā)表論文,構(gòu)建了豬體細(xì)胞染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)圖譜,追蹤了豬早期胚胎發(fā)育過程染色質(zhì)空間構(gòu)象重編程過程,并比較了孤雌、孤雄胚胎與體外受精胚胎發(fā)育過程中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的異同,揭示了在豬早期胚胎發(fā)育過程中的重要染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重編程特點(diǎn)。

該研究分析了豬體細(xì)胞染色質(zhì)構(gòu)象的特點(diǎn)并與小鼠進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)豬染色質(zhì)同樣存在不同層次的折疊,包括染色質(zhì)區(qū)室、拓?fù)湎嚓P(guān)結(jié)構(gòu)域(TAD)、染色質(zhì)環(huán),并且在各個(gè)折疊層次上與小鼠染色質(zhì)結(jié)構(gòu)相對保守。研究人員對豬體外受精胚胎的不同發(fā)育階段進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)與小鼠類似,豬染色質(zhì)空間構(gòu)象(染色質(zhì)區(qū)室、TAD)在早期胚胎階段逐漸建立。但與小鼠相比,豬早期胚胎的染色質(zhì)區(qū)室結(jié)構(gòu)范圍更大。豬早期胚胎中,大約有一半的基因組被超過10Mb的超大染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域所覆蓋(超級結(jié)構(gòu)域)。超級結(jié)構(gòu)域在豬中比例顯著高于小鼠,提示可能是大型哺乳動物的一個(gè)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。研究人員比較了孤雌、孤雄胚胎與體外受精胚胎發(fā)育過程中染色質(zhì)重編程的異同,發(fā)現(xiàn)孤雌、孤雄胚胎在合子基因組激活的4細(xì)胞時(shí)期存在特殊的染色質(zhì)區(qū)室的解體過程。解體的染色質(zhì)區(qū)室在桑葚胚時(shí)期被部分重建。三種胚胎TAD的建立同樣存在差異,雖然在孤雌、孤雄胚胎中TAD也是逐漸建立的,但孤雌胚胎在各個(gè)發(fā)育階段TAD結(jié)構(gòu)都要比孤雄胚胎更加明顯,研究人員在小鼠胚胎中發(fā)現(xiàn)了同樣的趨勢,母源來源的染色體比父源的染色體具有更顯著的TAD結(jié)構(gòu)。

這項(xiàng)研究表明,染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重編程的速率可能在胚胎成功發(fā)育中起關(guān)鍵作用。研究成果為染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的進(jìn)化研究提供了資源,而且為提高豬的輔助生殖效率提供了參考。張治華與王彥芳為本文共同通訊作者。該研究得到中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)、科技部重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目及國家自然科學(xué)基金委等的資助。

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