汪小五,朱義朗,李團(tuán)團(tuán),高勇
2019 年12 月,我國湖北省武漢市出現(xiàn)了41 例不明原因肺炎患者,中國工程院院士徐建國博士領(lǐng)導(dǎo)的科研團(tuán)隊(duì)宣布引起此次肺炎暴發(fā)的為一種新型冠狀病毒,世界衛(wèi)生組織(WHO)暫定其為2019 年新型冠狀病毒[2019-nCoV,后更新為嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)][1]。2020 年1 月3 日,在1例患者的支氣管肺泡灌洗液樣本中發(fā)現(xiàn)了SARSCoV-2,其被認(rèn)為是導(dǎo)致新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的原因[2]。SARS-CoV-2 主要通過呼吸道傳播,實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)技術(shù)是目前COVID-19 患者呼吸道標(biāo)本核酸檢測(cè)的主要方法[3]。有研究報(bào)道,COVID-19 患者糞便標(biāo)本SARSCoV-2 核酸檢測(cè)顯陰性的時(shí)間比呼吸道標(biāo)本晚[4]。因此,糞便標(biāo)本用于SARS-CoV-2 的核酸檢測(cè)不應(yīng)被忽略。本研究收集了本院住院治療恢復(fù)期COVID-19 患者痰液、咽拭子和肛拭子3 種標(biāo)本,同期進(jìn)行SARS-CoV-2 核酸檢測(cè),并分析其臨床價(jià)值。
1.1 一般資料 選取2020年1月24日—2月17日于本院確診的COVID-19 患者50 例,其中男24 例,女26 例,年齡1~82歲,平均(42.56±17.46)歲。診斷標(biāo)準(zhǔn)參照《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第七版)》[5]。35 例(70.0%)有發(fā)熱癥狀,體溫36.3~38.9 ℃,33 例(66.0%)有咳嗽癥狀,19 例(38.0%)有咳痰癥狀,6 例(12.0%)有腹瀉。23 例(46.0%)有武漢接觸史?;颊咦≡禾鞌?shù)11~36 d,平均(22.5±8.0)d。
1.2 試劑與儀器 SARS-CoV-2 ORF1ab/N基因雙重核酸檢測(cè)試劑盒(qPCR 法)購自上海伯杰醫(yī)療科技有限公司;SLAN96P熒光定量PCR儀購自上海宏石醫(yī)療科技有限公司;核酸提取試劑盒及自動(dòng)核酸提取儀均購自江蘇碩世生物科技有限公司。
1.3 方法
1.3.1 標(biāo)本采集 采集50例患者住院恢復(fù)期的呼吸道標(biāo)本(下呼吸道深咳痰和口咽拭子標(biāo)本)和肛拭子標(biāo)本,3種標(biāo)本同期進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測(cè)。住院恢復(fù)期指患者經(jīng)過治療后一般情況穩(wěn)定,隔日復(fù)查呼吸道標(biāo)本2次顯示SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陰性,肺部CT明顯病灶吸收良好,癥狀好轉(zhuǎn)。痰液標(biāo)本采集:由護(hù)士于床旁,患者先漱口后深吸氣并用力咳嗽,得到的痰液(下呼吸道深咳痰)吐進(jìn)已做好標(biāo)識(shí)的標(biāo)本盒內(nèi),蓋上蓋子擰緊密封(痰標(biāo)本應(yīng)避免混入唾液、漱口水或鼻涕等)??谘适米訕?biāo)本的采集:患者先用清水漱口,再張口發(fā)出“啊”音,必要時(shí)可以使用壓舌板。護(hù)士使用滅菌棉簽在患者的咽側(cè)壁及咽后壁擦拭數(shù)次,再將棉簽放入采樣管中密封。肛拭子標(biāo)本的采集:使用滅菌棉簽,蘸取少量無菌生理鹽水后,插入患者的肛門2~3 cm處,再旋轉(zhuǎn)2~3圈,迅速將棉簽放入采樣管中密封。所有標(biāo)本采集完畢后,電話聯(lián)系專門運(yùn)送疑似SARS-CoV-2感染患者標(biāo)本的人員及時(shí)運(yùn)送至檢驗(yàn)科。
1.3.2 SARS-CoV-2 核酸檢測(cè) 采用qPCR 技術(shù),針對(duì)SARS-CoV-2 基因組中開放讀碼框1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)和核殼蛋白(nucleocapsid protein,N)進(jìn)行檢測(cè)。SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)結(jié)果判讀:(1)靶基因檢測(cè)判讀。①FAM通道檢測(cè)ORF lab基因,HEX/C通道檢測(cè)N基因;②陰性為Ct 值>37 或未檢出;③陽性為擴(kuò)增曲線呈S 型,且Ct 值≤37;④可疑為擴(kuò)增曲線呈S 型,且37<Ct 值<40。(2)SARSCoV-2 檢測(cè)陽性判讀標(biāo)準(zhǔn)。①同一份標(biāo)本中SARS-CoV-2中2 個(gè)靶標(biāo)(ORF la/b、N)均為陽性;②單靶標(biāo)陽性患者重新采樣,重新檢測(cè),如果仍然為單靶標(biāo)陽性,判定為陽性[5]。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 本文主要采用描述性統(tǒng)計(jì),對(duì)正態(tài)分布的計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()形式;分類變量采用例(%)形式進(jìn)行描述。
2.1 恢復(fù)期患者3 種標(biāo)本中SARS-CoV-2 核酸結(jié)果分析 本次50 例COVID-19 患者的156 份標(biāo)本包括痰液標(biāo)本41 份、咽拭子標(biāo)本55 份及肛拭子60 份,痰液、咽拭子和肛拭子標(biāo)本病毒核酸陽性率分別為19.5%、10.9%和18.3%。50 例COVID-19 患者中有痰液標(biāo)本檢測(cè)病毒核酸陽性8例,咽拭子有6例,肛拭子有10例,陽性率分別為19.5%、12.0%和20.0%,見表1。
Tab.1 Test results of SARS-CoV-2 nucleic acid in 156 samples from COVID-19 patients表1 COVID-19患者156份樣本SARS-CoV-2核酸檢測(cè)結(jié)果
2.2 肛拭子病毒核酸陽性患者痰液和咽拭子標(biāo)本病毒核酸檢測(cè)分析 10 例肛拭子病毒核酸檢測(cè)陽性患者同期呼吸道病毒核酸檢測(cè)分析結(jié)果見表2。在治療恢復(fù)期,10 例患者中有9 例在肛拭子病毒核酸檢測(cè)陽性時(shí)痰液或咽拭子標(biāo)本檢測(cè)已是陰性?;颊? 在入院12 d 時(shí)肺部CT 病灶有所吸收,癥狀好轉(zhuǎn),痰液標(biāo)本未檢測(cè)核酸,咽拭子檢測(cè)呈陰性,肛拭子檢測(cè)呈陽性;入院14 d時(shí)咽拭子檢測(cè)呈陽性,肛拭子檢測(cè)呈可疑;入院16 d 和19 d 結(jié)果與入院14 d 一致,肛拭子連續(xù)2 次SARS-CoV-2 N 基因檢測(cè)陽性,即肛拭子核酸檢測(cè)判斷為陽性。患者10在入院15 d時(shí),肺部CT明顯病灶吸收良好,癥狀好轉(zhuǎn),痰液標(biāo)本核酸檢測(cè)呈陽性,咽拭子、肛拭子均呈陰性;入院17 d時(shí),痰液和咽拭子標(biāo)本核酸檢測(cè)呈陰性,肛拭子未檢測(cè);入院19 d 時(shí)痰液和咽拭子標(biāo)本核酸檢測(cè)均呈陰性,肛拭子核酸檢測(cè)呈陽性。其余8例患者同期3種標(biāo)本做SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)時(shí),呼吸道標(biāo)本核酸檢測(cè)呈陰性,而肛拭子核酸檢測(cè)均呈陽性。
Tab.2 Analysis of respiratory tract specimens of 10 cases with positive SARS-CoV-2 nucleic acid test in anal swabs表2 10例肛拭子SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽性患者呼吸道標(biāo)本檢測(cè)情況分析
3.1 COVID-19患者恢復(fù)期3種標(biāo)本中SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)結(jié)果比較 SARS-CoV-2 存在人傳人已經(jīng)被證實(shí),有研究報(bào)道還存在無癥狀感染患者傳播[6]。為了遏制病毒蔓延,無論是對(duì)密切接觸者的大排查,還是對(duì)康復(fù)出院患者的復(fù)查都至關(guān)重要。呼吸道標(biāo)本的SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)是COVID-19患者治療后出院和解除隔離的標(biāo)準(zhǔn)之一。有研究表明,糞便標(biāo)本中存在SARS-CoV-2顆粒[7-8]。本研究對(duì)COVID-19患者恢復(fù)期痰液、咽拭子和肛拭子3種標(biāo)本同時(shí)檢測(cè)SARS-CoV-2 核酸(ORF1ab 基因和N基因),發(fā)現(xiàn)痰液標(biāo)本病毒核酸陽性率高于咽拭子。呼吸道標(biāo)本盡量以痰液標(biāo)本為主,當(dāng)痰液標(biāo)本無法獲得時(shí)可考慮咽拭子標(biāo)本。SARS-CoV-2核酸檢測(cè)由于假陰性結(jié)果的存在,有的患者多次核酸檢測(cè)陰性后又出現(xiàn)陽性結(jié)果,因此在標(biāo)本取材時(shí)一定要按照正確的操作規(guī)范進(jìn)行。有研究報(bào)道,糞便標(biāo)本SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)陽性率高于肛拭子[4]。本研究發(fā)現(xiàn)COVID-19患者在恢復(fù)期痰液標(biāo)本和肛拭子標(biāo)本SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽性率接近。50例患者中有10 例恢復(fù)期肛拭子SARS-CoV-2 核酸檢測(cè)陽性,故患者肛拭子標(biāo)本用于病毒核酸檢測(cè)的價(jià)值應(yīng)予以重視,能獲取糞便標(biāo)本檢測(cè)核酸價(jià)值更高。
3.2 肛拭子病毒核酸陽性患者痰液和咽拭子標(biāo)本病毒核酸檢測(cè)分析 本研究中COVID-19患者住院最短11 d,最長(zhǎng)36 d,住院期間多次檢測(cè)病毒核酸。尤其是呼吸道標(biāo)本,在患者恢復(fù)期基本上是隔天檢測(cè)病毒核酸,觀察是否轉(zhuǎn)陰,連續(xù)測(cè)得核酸陰性以及肺部CT顯示明顯好轉(zhuǎn)即可出院。俞龍等[4,8]報(bào)道糞便標(biāo)本核酸檢測(cè)陽性率高于肛拭子,由于糞便標(biāo)本處理流程比較復(fù)雜,而且同期糞便標(biāo)本可能不能及時(shí)留取,本研究只留取了肛拭子,較糞便標(biāo)本在做qPCR前處理過程簡(jiǎn)單。本研究發(fā)現(xiàn)10例患者在恢復(fù)期SARS-CoV-2肛拭子核酸檢測(cè)呈陽性?;颊?,年齡1歲,無法自主深咳痰液做病毒核酸檢測(cè),故采集咽拭子標(biāo)本檢測(cè)核酸;在住院第12天時(shí)同時(shí)檢測(cè)了咽拭子和肛拭子的SARS-CoV-2核酸,咽拭子呈陰性而肛拭子呈陽性;入院第12天時(shí)患者肺部CT顯示病灶有所吸收,后期是隔天采集咽拭子和肛拭子,最后咽拭子轉(zhuǎn)陰后肛拭子仍然可疑。50例患者中6例患者有腹瀉癥狀,包括患者7?;颊?0入院15 d時(shí)呼吸道標(biāo)本核酸檢測(cè)呈陽性,肛拭子呈陰性,CT顯示病灶明顯吸收;入院19 d時(shí)呼吸道標(biāo)本病毒核酸轉(zhuǎn)陰,肛拭子呈陽性,但是該患者并無腹瀉癥狀。SARS-CoV-2最主要的傳播途徑是經(jīng)呼吸道傳播[9],至于患者出現(xiàn)肛拭子核酸檢測(cè)呈現(xiàn)陽性的原因,以及是否存在以糞-口方式傳播有待進(jìn)一步研究。WHO指出SARS-CoV-2檢測(cè)結(jié)果的臨床意義為陽性結(jié)果表明患者現(xiàn)在或過去被SARS-CoV-2感染,但不一定出現(xiàn)癥狀;陰性結(jié)果則不一定表明患者沒有被SARS-CoV-2感染。本研究發(fā)現(xiàn)在COVID-19患者治療恢復(fù)期呼吸道標(biāo)本中核酸檢測(cè)轉(zhuǎn)陰的情況下,肛拭子仍然是陽性,有的患者還有腹瀉癥狀,有的則沒有。Huang等[10]也同樣提到COVID-19部分患者有腹瀉癥狀。COVID-19患者糞便中存在SARS-CoV-2顆粒,是由于呼吸道入侵后通過消化系統(tǒng)排毒,還是由于本身對(duì)消化系統(tǒng)有損傷,均有待證明。這一檢測(cè)結(jié)果需要引起臨床的重視。應(yīng)盡可能加大力度進(jìn)行排查,防止疫情進(jìn)一步擴(kuò)大。
3.3 局限性 本研究樣本量偏小,對(duì)結(jié)果分析可能存在一定的影響。實(shí)驗(yàn)室在后期才開展的肛拭子檢測(cè)SARS-CoV-2 核酸,同一患者未進(jìn)行多次肛拭子病毒核酸檢測(cè)。如果肛拭子進(jìn)行連續(xù)2 次以上SARS-CoV-2核酸檢測(cè)將更有說服力。
綜上所述,對(duì)從COVID-19 患者糞便中檢測(cè)到SARS-CoV-2 是否具有傳染性,還須進(jìn)行病毒的細(xì)胞培養(yǎng)和流行病學(xué)調(diào)查。此外,在COVID-19 患者恢復(fù)期對(duì)糞便或者肛拭子標(biāo)本進(jìn)行病毒核酸檢測(cè)同樣值得重視。