近日,德國(guó)馬普學(xué)會(huì)發(fā)育生物學(xué)研究所Detlef Weigel研究團(tuán)隊(duì),通過(guò)不使用完整基因組實(shí)現(xiàn)對(duì)植物表型變化背后遺傳變異的鑒定。
研究人員重新分析了擬南芥、番茄和玉米種群中的2000個(gè)性狀。用k-mers鑒定的關(guān)聯(lián)概括了用SNP發(fā)現(xiàn)的關(guān)聯(lián),但具有更強(qiáng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)支撐。重要的是,他們發(fā)現(xiàn)了與結(jié)構(gòu)變異和參考基因組缺失區(qū)域的新關(guān)聯(lián)。這些結(jié)果證明了在將序列讀數(shù)聯(lián)系到特定基因組區(qū)域之前執(zhí)行GWAS的效力,這使得可以檢測(cè)到影響表型變化的大量遺傳變異。
據(jù)《科學(xué)網(wǎng)》