丁勁峰,陳霞
(1.江蘇醫(yī)藥職業(yè)學(xué)院,江蘇 鹽城;2.江蘇醫(yī)藥職業(yè)學(xué)院司法鑒定所,江蘇 鹽城)
短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)檢測(cè)已經(jīng)廣泛應(yīng)用到法醫(yī)物證學(xué)個(gè)體識(shí)別及親權(quán)鑒定中,本文對(duì)855 例鹽城北部地區(qū)(以阜寧縣、濱海縣為中心的5 個(gè)縣在生活習(xí)慣、語(yǔ)言環(huán)境等方面與以鹽城城區(qū)、大豐區(qū)為中心的南部地區(qū)差異較大)漢族無(wú)關(guān)人群19 個(gè)STR 基因座進(jìn)行遺傳多態(tài)性分析。
根據(jù)“知情同意”原則,從來(lái)自鹽城北部地區(qū)5 縣(阜寧縣、濱??h、響水縣、射陽(yáng)縣、建湖縣)的學(xué)生中采集無(wú)親緣關(guān)系的口腔拭子855 份,其中男性524 份,女性331 份。
采用GoldenEyeTM-20A(北京基點(diǎn)認(rèn)知公司)試劑盒進(jìn)行直接PCR 擴(kuò)增,按照說(shuō)明書(shū)在Gene Amp PCR System9700 擴(kuò)增儀(賽默飛世爾公司)進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。參數(shù)設(shè)置:95℃預(yù)變性5min;94℃30S,60℃1min,70℃1min,共28 個(gè)循環(huán);60℃保溫1h。擴(kuò)增產(chǎn)物在AB3130XL 型遺傳分析儀 (賽默飛世爾公司)上進(jìn)行檢測(cè),用ABI IDX 軟件對(duì)基因型進(jìn)行分析。
采用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算等位基因頻率及基因型頻率,用Modified-Powerstates 軟件[1]進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)算19 個(gè)STR 基因座雜合度(H0)匹配概率(PM)、個(gè)體識(shí)別率(DP)、非父排除率(PE)、多態(tài)性信息總量(PIC)等遺傳學(xué)參數(shù);采用精確檢驗(yàn)法進(jìn)行Hardy-Weinberg 平衡吻合度檢驗(yàn)。
表1 鹽城北部地區(qū)漢族人群19 個(gè)STR 基因座遺傳參數(shù)(n=855)
鹽城北部地區(qū)人群855 位無(wú)關(guān)個(gè)體19 個(gè)STR 基因座共檢出等位基因229 個(gè),基因型788 種。經(jīng)χ2檢驗(yàn)19 個(gè)基因座頻率均符合Hardy-Weinberg 平衡(P>0.05)。遺傳學(xué)參數(shù)見(jiàn)表1,,等位基因頻率見(jiàn)表2。
表2 鹽城北部地區(qū)漢族人群19 個(gè)STR 基因座基因頻率(n=855)
根據(jù)數(shù)據(jù)顯示,鹽城北部地區(qū)漢族人群19 個(gè)STR 基因座的H 值在0.635~0.914 之間,DP 值在0.795~0.983 之間,一般認(rèn)為基因座DP>0.9,H>0.7 鑒別率高;PE 值在0.362~0.835 之間,PIC 值在0.560~0.910 之間,當(dāng)PE 值>0.5,PIC 值>0.5 即具有高多態(tài)性,高信息性[2]。除CSF1PO、D3S1358、TH01、TPOX 外的15 個(gè)STR基因座均屬高多態(tài)性,高鑒別能力基因座,19 個(gè)STR 基因座累積匹配概率2.13×10-22,累積個(gè)體識(shí)別力大于0.999 999 999 998,累積非父排除率為0.999 999 994,表明該19 個(gè)STR 基因座聯(lián)合使用可滿足該地區(qū)相關(guān)人群的親權(quán)鑒定、法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和群體遺傳學(xué)研究,同時(shí)可為遺傳學(xué)資料數(shù)據(jù)庫(kù)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)[3]。