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紹興地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌肺部感染情況分析

2020-03-22 07:38趙金云金法祥許文芳
檢驗(yàn)醫(yī)學(xué) 2020年2期
關(guān)鍵詞:菌種抗菌肺部

趙金云,金法祥,許文芳,許 鵬,童 丹

(紹興文理學(xué)院附屬醫(yī)院 紹興市立醫(yī)院檢驗(yàn)科,浙江 紹興 312000)

非結(jié)核分枝桿菌(nontuberculousMycobacterium,NTM)在自然界中廣泛存在,近年來,NTM感染率呈上升趨勢。NTM主要可引起人類肺部感染,尤其是在伴有慢性阻塞性肺疾病、既往結(jié)核、囊性纖維化、支氣管擴(kuò)張、獲得性免疫缺陷綜合癥和移植等相關(guān)危險(xiǎn)因素的情況下,其感染風(fēng)險(xiǎn)更大。NTM還可引起淋巴結(jié)、皮膚軟組織和中樞神經(jīng)系統(tǒng)等其他部位感染[1-2]。由于NTM肺部感染的臨床癥狀及影像學(xué)特征與肺結(jié)核相似,很多情況下會(huì)因漏診而延誤治療,臨床上通常借助病原學(xué)檢測來進(jìn)行區(qū)分[3]。不同種類NTM耐藥譜不同,治療方案也存在差異,因此NTM的準(zhǔn)確鑒定對(duì)臨床治療具有重要意義。為了解紹興地區(qū)NTM肺部感染的流行情況,本研究對(duì)2017年7月—2018年7月臨床分離的NTM進(jìn)行分析。

1 材料和方法

1.1 樣本來源

收集2017年7月—2018年7月紹興文理學(xué)院附屬醫(yī)院及各縣區(qū)醫(yī)院臨床樣本2 768例(排除重復(fù)及沒有完整結(jié)果記錄的樣本)。質(zhì)控菌株結(jié)核分枝桿菌H37RV敏感株(ATCC 27294)由浙江省疾病預(yù)防控制中心提供。

1.2 主要儀器與試劑

BioMixerⅡ芯片雜交儀、LuxScan10k-B微陣列芯片掃描儀(北京博奧生物有限公司)。羅氏培養(yǎng)基、藥物敏感性試驗(yàn)培養(yǎng)基、對(duì)硝基苯甲酸培養(yǎng)基、噻吩-2-羧酸肼培養(yǎng)基購自珠海貝索生物技術(shù)公司;分枝桿菌菌種鑒定試劑盒(DNA 微陣列芯片法)購自北京博奧生物有限公司,可鑒定結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群及17種臨床常見的NTM。

1.3 方法

1.3.1 細(xì)菌培養(yǎng) 在臨床樣本中加入1~2倍體積的4% NaOH溶液,振蕩后靜置15 min,采用無菌吸管吸取100 μL分別接種于羅氏培養(yǎng)基、對(duì)硝基苯甲酸培養(yǎng)基和噻吩-2-羧酸肼培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)。

1.3.2 菌種鑒定 按照分枝桿菌菌種鑒定試劑盒(DNA微陣列芯片法)操作說明書,通過核酸提取、聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增和芯片雜交、洗滌干燥等步驟制備樣本芯片,最終通過芯片掃描儀及相應(yīng)軟件進(jìn)行結(jié)果的判讀。

1.3.3 比例法體外藥物敏感性試驗(yàn) 制備1 mg/mL菌懸液,分別稀釋成1×10-2與1×10-4mg/mL的菌液,再分別接種至含藥異煙肼、利福平、鏈霉素、乙胺丁醇、對(duì)氨基水楊酸、卷曲霉素、卡那霉素、丙硫異煙胺、氧氟沙星培養(yǎng)基和對(duì)照培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)4周后觀察結(jié)果。以耐藥率≥1%判為耐藥。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。

2 結(jié)果

2.1 樣本類型及患者臨床特征

2 768例臨床樣本中,痰液樣本1 761例、肺泡灌洗液樣本696例、纖維支氣管鏡刷檢物樣本299例、肺組織樣本12例。共分離出NTM 243株(8.77%)。243例NTM感染患者中,男性占77.37%,<60歲的患者占65.43%;超過85.00%的患者同時(shí)患有其他疾病,患有慢性阻塞性肺疾病、支氣管擴(kuò)張和肺炎的患者超過60.00%,見表1。有9例患者為結(jié)核分枝桿菌和NTM混合感染,其中1例為泛耐藥結(jié)核分枝桿菌合并NTM肺部感染。6例肺癌患者中,僅1例NTM肺部感染得到控制,3例病情惡化,2例死亡;3例獲得性免疫缺陷綜合癥患者均未能堅(jiān)持治療。

表1 243例NTM感染患者臨床特征

2.2 NTM菌種鑒定

采用基因芯片法將分離所得的243株NTM進(jìn)行菌種鑒定。居前3位的分別為胞內(nèi)分枝桿菌(62.14%)、鳥分枝桿菌(19.75%)、龜或膿腫分枝桿菌(8.64%)。見表2。

表2 243株NTM菌種分布

2.3 藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果

243株NTM對(duì)一線抗菌藥物的耐藥率均較高,除胞內(nèi)分枝桿菌和鳥分枝桿菌對(duì)乙胺丁醇的耐藥率分別為66.89%和62.50%外,NTM對(duì)其他一線抗菌藥物的耐藥率均高于80.00%,尤其是對(duì)異煙肼和鏈霉素,幾乎均為100.00%;而NTM對(duì)二線抗菌藥物的耐藥率要低于一線藥物,卡那霉素和卷曲霉素具有一定的抗菌作用,尤其是卡那霉素,常見NTM對(duì)其的耐藥率均低于75.00%。

表3 243株NTM的耐藥率

3 討論

NTM是一種條件致病菌,廣泛存在于水、土壤和氣溶膠中,可致免疫力低下者廣泛感染,輕者可致皮膚感染,重者會(huì)危及生命[1]。近年來,隨著糖尿病、肺結(jié)核、獲得性免疫缺陷綜合癥及免疫抑制治療患者的增多,NTM感染病例顯著增多。隨著臨床診斷技術(shù)的提高,NTM的檢出率也明顯增高[3]。NTM的種類和感染率存在著一定的地區(qū)差異性,且與氣候、環(huán)境有關(guān),呈現(xiàn)出南方高于北方、沿海高于內(nèi)地、氣候溫和地區(qū)高于寒冷地區(qū)的流行特點(diǎn)[4]。NTM菌種鑒定的方法較多,傳統(tǒng)的表型鑒定分析和生理生化方法步驟較繁鎖、耗時(shí)長,且鑒定結(jié)果不準(zhǔn)確。目前,對(duì)NTM進(jìn)行菌種鑒定的方法主要是基于PCR技術(shù)的分子生物學(xué)方法,其他方法還包括噬菌體生物擴(kuò)增法、高效液相色譜法、探針法及基因芯片法等,其中基因芯片法具有快速、簡便、準(zhǔn)確、敏感等優(yōu)點(diǎn)[5]。

本研究共分離出243株NTM,檢出率為8.77%,低于2010年全國平均水平(22.9%)和2015年廣州地區(qū)水平(19.1%),但高于2015年江蘇地區(qū)(2.35%)和2012年沈陽地區(qū)(1.87%)水平[6]。納入的病例中,以男性患者居多,占77.37%,且以年齡<60歲的中青年為主;只有13.17%的患者僅為NTM肺部感染,而其他絕大多數(shù)患者同時(shí)患有其他疾病,約70.00%的患者患有其他肺部疾病,包括慢性阻塞性肺疾病、支氣管擴(kuò)張、肺炎、肺結(jié)核和肺癌等。通過基因芯片技術(shù)對(duì)分離的NTM進(jìn)行菌種鑒定,胞內(nèi)分枝桿菌和鳥分枝桿菌是臨床感染最常見的NTM,超過80.00%;其次為龜或膿腫分枝桿菌,與ZHENG等[7]的研究結(jié)果一致。本研究結(jié)果表明,紹興地區(qū)堪薩斯分枝桿菌的檢出率要稍高于其他地區(qū)[8],這也說明NTM感染存在一定的地區(qū)差異性。有研究報(bào)道堪薩斯分枝桿菌最易侵犯的部位是肺,常侵犯晚期獲得性免疫缺陷綜合癥患者[9],與本研究分離自3例獲得性免疫缺陷綜合癥患者NTM均為堪薩斯分枝桿菌的結(jié)果一致。本研究還分離出偶然分枝桿菌、戈登分枝桿菌等不常見的分枝桿菌,一般認(rèn)為其很少引起肺部感染,常作為一類非致病性環(huán)境分枝桿菌污染水源及醫(yī)療器械等[10]。NTM由于種類不同,對(duì)抗菌藥物的耐藥性差異較大,從體外藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果來看,NTM對(duì)一線抗菌藥物均有著較高的耐藥率,尤其是對(duì)鏈霉素和異煙肼,幾乎達(dá)到了100.00%;而對(duì)二線抗菌藥物的耐藥率稍低,尤其是卡那霉素,分離率較高的4種分枝桿菌對(duì)其耐藥率均低于75.00%,而堪薩斯分枝桿菌對(duì)卡那霉素的耐藥率僅為31.25%。

綜上所述,NTM肺部感染已成為不可忽視的疾病,尤其是患有肺部基礎(chǔ)疾病的患者,更應(yīng)警惕其發(fā)生。NTM肺感染疾病與肺結(jié)核臨床癥狀相似,給臨床診斷帶來很大困難,并且NTM種類繁多,耐藥率高,不同種類的NTM耐藥譜有差異,這些情況加大了臨床確定治療方案的難度。因此,快速、準(zhǔn)確地進(jìn)行菌種鑒定有助于臨床對(duì)患者進(jìn)行早期診斷及治療。

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