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膠原三股螺旋重復(fù)蛋白1基因真核表達(dá)載體的構(gòu)建及其與microRNA-30b關(guān)系初探

2020-02-28 09:50周輝芳隗和儒馬士朝張超群王君平楊新英孫殿興
臨床肝膽病雜志 2020年2期
關(guān)鍵詞:真核質(zhì)粒克隆

周輝芳, 隗和儒, 馬士朝, 張超群, 王君平, 楊新英, 謝 英, 孫殿興

1 河北醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院, 石家莊 050017; 2 中國人民解放軍聯(lián)勤保障部隊(duì)第九八〇醫(yī)院全軍肝病中心, 石家莊 050082; 3 承德醫(yī)學(xué)院, 河北 承德067000;4 河北醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動物學(xué)部 河北省實(shí)驗(yàn)動物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,石家莊 050017

膠原三股螺旋重復(fù)蛋白1(collagen triple helix repeat containing 1,CTHRC1)是一種組織修復(fù)過程中分泌的外分泌蛋白,參與受損后的血管重塑修復(fù)過程。近年來的研究發(fā)現(xiàn)CTHRC1可以參與到多種實(shí)體腫瘤細(xì)胞的發(fā)生與進(jìn)展過程,如肝癌[1]、卵巢癌[2]、宮頸鱗狀細(xì)胞癌[3]、骨肉瘤[4]等,并與腫瘤的增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。microRNA(miRNA,簡寫為miR)是一類由18~25個核苷酸組成的非編碼RNA。這些核苷酸通過與目標(biāo)信使RNA(mRNA)的3′端非編碼區(qū)域結(jié)合來實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)基因的調(diào)節(jié)。在人類腫瘤中,miR-30b已被證實(shí)是一種在癌癥發(fā)病機(jī)制中起著重要作用的腫瘤抑制基因,但在少數(shù)情況下發(fā)揮類似致癌基因的作用[5-6]。為進(jìn)一步研究CTHRC1與miR-30b在人肝癌細(xì)胞的侵襲與轉(zhuǎn)移方面的作用,本研究首先構(gòu)建pCTHRC1-IRES2-EGFP真核表達(dá)載體,在此基礎(chǔ)上,驗(yàn)證了CTHRC1與miR-30b的關(guān)系,為下一步研究奠定了基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試劑 DMEM培養(yǎng)基及胎牛血清(FBS)購自美國Gibico公司;Q5@ PCR Master Mix (2X)購自英國NEB公司;Gene Ruler 1 kb DNA Ladder購自美國Thermo Scientific公司;T4連接酶、NheⅠ/XhoⅠ限制性內(nèi)切酶、DL2000 DNA Marker、DL15000 DNA Marker、感受態(tài)細(xì)胞E.coli Competent Cells購自大連TaKaRa公司;Lipofectamine 3000購自美國Invitrogen公司;真核表達(dá)載體pIRES2-EGFP為本實(shí)驗(yàn)室保存;膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒QIAprep Spin Miniprep Kit、miRNeasy Mini Kit和miScript PCR Starter Kit購自德國QIAGEN公司;引物由上海生工公司合成;has-miR-30b-5p mimic與Negative control由廣東銳博生物科技有限公司提供;兔抗人CTHRC1多克隆抗體購自美國Proteintech公司。

1.2 細(xì)胞和細(xì)胞培養(yǎng) 293T細(xì)胞、人肝癌細(xì)胞Huh7和HepG2均為本實(shí)驗(yàn)室保存。在含10%FBS的DMEM培養(yǎng)基中,于37 ℃、5% CO2的濕潤條件下培養(yǎng),細(xì)胞每隔2 d傳代1次。

1.3 CTHRC1目的基因克隆 在NCBI數(shù)據(jù)庫中查找CTHRC1 CDS+3′UTR區(qū)序列(登錄號: NM_001256099.2),委托上海生工公司合成克隆至pUC57載體。設(shè)計(jì)引物,上游引物F:5′-GACACGCTAGCATGTGGCCGCCAGGT-3′(含NheⅠ酶切位點(diǎn)),下游引物R:5′-GTGTCCTCGAGTTATTTAAAGATATTA-3′(含XhoⅠ酶切位點(diǎn)),產(chǎn)物長度為1095 bp。以含有CTHRC1 CDS+3′UTR區(qū)的合成序列為模板,用F/R特異性引物PCR擴(kuò)增,NheⅠ/Xho Ⅰ 雙酶切,回收純化,克隆至pIRES2-EGFP載體。

1.4 載體構(gòu)建 NheⅠ/XhoⅠ雙酶切載體pIRES2-EGFP和1095 bp的CTHRC1 PCR產(chǎn)物(見1.3),行1%瓊脂糖凝膠電泳分離目的片段,切膠回收載體及DNA片段。按照TakaRa DNA Ligation Kit Ver.2 .0試劑盒說明書配制連接體系, 將CTHRC1 DNA片段與pIRES2-EGFP真核表達(dá)載體進(jìn)行連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5α E.coli Competent Cell,37 ℃培養(yǎng)12 h后挑取陽性克隆。質(zhì)粒進(jìn)行小量制備,雙酶切鑒定并送上海生工公司測序。

1.5 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 分別將293T、Huh7和HepG2細(xì)胞接種于6孔板,每孔接種1×105細(xì)胞,待細(xì)胞匯合度約80%時(shí),用PBS洗滌2次,然后換上無血清無抗生素的DMEM培養(yǎng)基500 μl。將脂質(zhì)體Lipofectamine 3000與質(zhì)粒分別與250 μl無血清無抗生素的DMEM培養(yǎng)基混合,5 min后再將兩者混合,室溫孵育15 min后均勻加入待轉(zhuǎn)染細(xì)胞,培養(yǎng)48 h后換成DMEM完全培養(yǎng)基,計(jì)算轉(zhuǎn)染效率。取5個不同視野分別計(jì)數(shù)表達(dá)綠色熒光蛋白的細(xì)胞數(shù)和總細(xì)胞數(shù),按下列公式計(jì)算轉(zhuǎn)染效率:轉(zhuǎn)染效率=(熒光顯微鏡下細(xì)胞數(shù)/總細(xì)胞數(shù))×100%。

1.6 Western Blot檢測CTHRC1蛋白表達(dá) miR-30b mimic、control、pCTHRC1-IRES2-EGFP質(zhì)粒和pIRES2-EGFP質(zhì)粒,于轉(zhuǎn)染48 h后,收取轉(zhuǎn)染效率達(dá)85%以上的細(xì)胞制備蛋白,常規(guī)進(jìn)行Western Blot實(shí)驗(yàn),檢測CTHRC1蛋白表達(dá)水平的變化。

1.7 RNA提取和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測miR-30b表達(dá) 293T細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-30b mimic、control、pCTHRC1- IRES2- EGFP質(zhì)粒和pIRES2-EGFP質(zhì)粒,培養(yǎng)48 h后收取轉(zhuǎn)染效率達(dá)85%以上的細(xì)胞,使用miRNeasy Mini Kit(QIAGEN)從細(xì)胞中提取RNA,使用miScript PCR Starter Kit(QIAGEN)逆轉(zhuǎn)錄及定量檢測miR-30b表達(dá)水平,具體方法參照試劑說明書。has-miR-30b-5p引物由美國GeneCopoeia公司提供(Cat# HmiRQP0393);內(nèi)參U6引物由德國QIAGEN公司提供(Lot No.160026679)。以U6為內(nèi)參,2-ΔΔCt計(jì)算miR-30b相對表達(dá)量。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 使用SPSS21.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。計(jì)量資料兩組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 CTHRC1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及pIRES2-EGFP雙酶切產(chǎn)物 以CTHRC1 CDS+3′UTR合成序列為模板,用含有酶切位點(diǎn)的特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,1%瓊脂糖凝膠電泳,切膠回收,結(jié)果示回收片段約1100 bp;用NheⅠ、XhoⅠ雙酶切pIRES2-EGFP后,1%瓊脂糖凝膠電泳,切膠回收,回收約5300 bp的片段(圖1)。

注:a,1為DL2000 DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物,2為NheⅠ、XhoⅠ雙酶切CTHRC1 PCR產(chǎn)物;b,1為1 kb DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物,2為載體pIRES2-EGFP,3為NheⅠ、XhoⅠ雙酶切pIRES2-EGFP。

圖1CTHRC1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及質(zhì)粒pIRES2-EGFP的雙酶切產(chǎn)物

2.2 重組質(zhì)粒載體構(gòu)建及鑒定結(jié)果 重組質(zhì)粒兩個條帶的大小分別為5300 bp和1100 bp,與預(yù)期結(jié)果一致, 均應(yīng)為陽性克隆(圖2)?;蛐蛄袦y定結(jié)果顯示序列與GeneBank公布序列完全一致。載體構(gòu)建完全正確,符合下一步實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)要求。

注:1,DL15000 DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物;2,載體pIRES2-EGFP;3,NheⅠ、Xho Ⅰ 雙酶切pIRES2-EGFP;4,重組質(zhì)粒pCTHRC1-IRES2-EGFP;5,Nhe Ⅰ、Xho Ⅰ 雙酶切pCTHRC1-IRES2-EGFP;6,DL2000 DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物。

圖2重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定

2.3 轉(zhuǎn)染效果評價(jià) 將2 μg和4 μg的pCTHRC1-IRES2-EGFP質(zhì)粒分別與6 μl和12 μl的Lipofectamine 3000混合轉(zhuǎn)染Huh7及HepG2細(xì)胞,48 h后于熒光顯微鏡下觀察,轉(zhuǎn)染效率分別為90%、89%和85%、83%。結(jié)果表明,2 μg質(zhì)粒和6 μl Lipofectamine 3000混合可達(dá)到最大的轉(zhuǎn)染效率(圖3)。

2.4 CTHRC1基因表達(dá)與miR-30b表達(dá)水平分析 與對照組比較,轉(zhuǎn)染miR-30b mimic及pCTHRC1-IRES2-EGFP質(zhì)粒明顯提高了miR-30b及CTHRC1水平(t值分別為9.960、25.238,P值均<0.05)(圖4a、d)。此外,過表達(dá)CTHRC1組中miR-30b水平下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-3.457,P<0.05)(圖4b);miR-30b組與對照組相比,CTHRC1表達(dá)水平明顯下降(t=-24.677,P<0.05)(圖4c)。

注:a,Huh7細(xì)胞白光拍攝;b,Huh7細(xì)胞熒光拍攝;c,HepG2細(xì)胞白光拍攝;d, HepG2細(xì)胞熒光拍攝。

圖3轉(zhuǎn)染效果驗(yàn)證(×100)

注:a,has-miR-30b-5p mimic (miR-30b)與Negative control (control)轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中miR-30b的表達(dá);b,pCTHRC1-IRES2-EGFP (CTHRC1)質(zhì)粒與pIRES2-EGFP (NC)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中miR-30b的表達(dá);c,miR-30b與control轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中CTHRC1的表達(dá);d, CTHRC1質(zhì)粒與NC質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中CTHRC1的表達(dá)。

圖4CTHRC1與miR-30b的表達(dá)分析

3 討論

CTHRC1是一種28 kD的細(xì)胞外基質(zhì)糖蛋白,含有作用細(xì)胞外分泌的NH2末端信號肽,36個氨基酸的短膠原三螺旋重復(fù)序列和COOH末端球狀結(jié)構(gòu)域[7]。最近的研究表明,CTHRC1在多種侵襲性腫瘤中上調(diào),包括胃癌[8]、結(jié)直腸癌[9]以及胰腺癌[10]。這些研究表明,CTHRC1是腫瘤微環(huán)境中腫瘤發(fā)展、轉(zhuǎn)移和侵襲的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[11],但其在肝癌中的研究較少。miR-30b在多種腫瘤中表達(dá)異常,近年來,在多種腫瘤中發(fā)現(xiàn)miR-30b表達(dá)下調(diào),如肝癌[12]、非小細(xì)胞肺癌[13]、結(jié)直腸癌[14]、胃癌[15]、食管癌[16]、乳腺癌[17]、喉癌[18]和神經(jīng)膠質(zhì)瘤[19],但其在肝癌進(jìn)程中的機(jī)制尚不清楚。為進(jìn)一步研究CTHRC1是否為miR-30b的靶標(biāo),并對人肝癌細(xì)胞的侵襲與轉(zhuǎn)移方面的作用,本研究構(gòu)建pCTHRC1-IRES2-EGFP 真核表達(dá)載體,然后分別將miR-30b mimic、control、pCTHRC1-IRES2-EGFP質(zhì)粒和pIRES2-EGFP質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中,48 h后檢測CTHRC1蛋白及miR-30b的表達(dá)水平,結(jié)果顯示過表達(dá)CTHRC1組中miR-30b的表達(dá)水平下降(P<0.05);miR-30b表達(dá)升高則導(dǎo)致CTHRC1表達(dá)下降(P<0.05),這些數(shù)據(jù)提示CTHRC1基因表達(dá)與miR-30b的水平呈負(fù)相關(guān)。需進(jìn)一步研究明確CTHRC1可能為miR-30b的靶基因,并為下一步研究奠定基礎(chǔ)。

脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染通過靜電作用與被轉(zhuǎn)染的目的片段相結(jié)合,便于攜帶外源基因入細(xì)胞, 而且進(jìn)入細(xì)胞后可被細(xì)胞降解, 無明顯毒副作用和免疫反應(yīng)產(chǎn)生[20];且脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染操作簡單。miRNA是通過作用于基因的3′非編碼區(qū)域結(jié)合來實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)基因的調(diào)節(jié),故本實(shí)驗(yàn)采用特異性引物PCR擴(kuò)增含有CTHRC1 CDS+3′UTR區(qū)序列的pUC57載體,擴(kuò)增產(chǎn)物雙酶切、回收克隆至pIRES2-EGFP真核表達(dá)載體,脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染入人肝癌細(xì)胞。

本實(shí)驗(yàn)中所構(gòu)建的載體pIRES2-EGFP除具備真核表達(dá)載體的一般特征外,還具備以下特點(diǎn):EGFP基因編碼區(qū)可表達(dá)EGFP,EGFP較野生型的GFP熒光更強(qiáng),在哺乳動物細(xì)胞中有更高的表達(dá),通過熒光顯微鏡觀察轉(zhuǎn)染效率,還可以通過流式細(xì)胞儀對陽性細(xì)胞進(jìn)行分選;在多克隆位點(diǎn)與EGFP基因區(qū)之間存在IRES區(qū),可以使外源基因和EGFP基因同步表達(dá)。因此, 本實(shí)驗(yàn)選取該載體構(gòu)建真核表達(dá)載體用于人肝癌細(xì)胞的進(jìn)一步研究。

筆者根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中的CTHRC1 CDS+3′UTR區(qū)合成序列為模板,采用特異性引物PCR擴(kuò)增并成功將其克隆至pIRES2-EGFP載體中,并對目的片段進(jìn)行測序,以確保重組載體的質(zhì)量。重組體被整合到宿主細(xì)胞基因組后,通過抗性輔助篩選單克隆細(xì)胞,并初步驗(yàn)證了CTHRC1與miR-30b的關(guān)系,為下一步檢測CTHRC1與miR-30b的相互作用及其在人肝癌細(xì)胞的侵襲與轉(zhuǎn)移方面的作用,進(jìn)而對以CTHRC1為靶點(diǎn)的人肝癌細(xì)胞的侵襲與轉(zhuǎn)移的基因治療提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

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