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拮抗菌株XZQ-20的鑒定及對(duì)多種植物病原細(xì)菌的拮抗活性分析*

2020-02-12 06:57黃華毅于地美黃詠槐黃煥華田呈明
關(guān)鍵詞:濾液芽孢病原

黃華毅 于地美 黃詠槐 黃煥華 田呈明

(1.廣東省森林培育與保護(hù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣東省林業(yè)科學(xué)研究院,廣東 廣州 510520;2.中國國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局專利局專利審查合作中心,北京 100083;3.北京林業(yè)大學(xué)/省部共建森林培育與保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100083)

植物病原細(xì)菌是引起植物病害發(fā)生的重要病原菌之一,能引起多種植物病害且危害寄主廣泛[1]。歐美楊細(xì)菌性潰瘍病菌(Lonsdalea quercina)是一種破壞性極強(qiáng)的病原細(xì)菌,能導(dǎo)致楊樹側(cè)枝和主干發(fā)生潰瘍腐爛,嚴(yán)重的導(dǎo)致側(cè)枝甚至整株死亡[2]。丁香假單胞菌(Pseudomonassyringae)是獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病的病原菌,可引起獼猴桃莖干和藤形成潰瘍,阻斷植株養(yǎng)分的正常運(yùn)輸,最終導(dǎo)致植株整株枯死[3]。軟腐歐文氏菌(Erwiniacarotovora)是一種引起白菜發(fā)生軟腐病的病原菌[4]。核桃黃極毛桿菌(Xanthomonasjuglandis)引起的核桃細(xì)菌性褐斑病主要危害核桃的幼果、嫩梢和葉片,尤以幼果危害最為嚴(yán)重[5]。目前,控制植物病原細(xì)菌感染和傳播主要還是應(yīng)用化學(xué)藥劑,然而,長期且過度使用耐降解的化學(xué)藥劑會(huì)導(dǎo)致環(huán)境污染、生態(tài)破壞,同時(shí)會(huì)誘導(dǎo)植物病原菌產(chǎn)生抗性[6]。因此,開發(fā)和應(yīng)用環(huán)境友好型的替代防治方法以減少對(duì)化學(xué)藥劑的依賴一直是植物保護(hù)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。在眾多的替代防治方法當(dāng)中,生物防治無疑是一種富有前景的防治方法,使用拮抗微生物可以有效控制植物病原菌,同時(shí)對(duì)環(huán)境和生態(tài)也更加安全[7]。

菌株XZQ-20 是從黑楊(Populus nigra)根際土壤中分離得到的一株拮抗細(xì)菌,本研究測定了菌株XZQ-20 及其無菌培養(yǎng)濾液對(duì)4 種植物病原細(xì)菌的拮抗活性,并對(duì)其產(chǎn)生細(xì)胞壁裂解酶的特性進(jìn)行測定。最后,基于傳統(tǒng)方法和分子生物學(xué)的手段對(duì)菌株XZQ-20 進(jìn)行了鑒定。

1 材料與方法

1.1 供試菌株

供試拮抗細(xì)菌XZQ-20 菌株分離自黑楊根際土壤。供試4 種靶標(biāo)植物病原細(xì)菌菌株:歐美楊細(xì)菌性潰瘍病菌、丁香假單胞菌、軟腐歐文氏菌和核桃黃極毛桿菌,用于拮抗菌株XZQ-20 的拮抗活性的測定。

1.2 培養(yǎng)基

LB 培養(yǎng)基:用于細(xì)菌菌株的平板培養(yǎng)和斜面保存;LB 液體培養(yǎng)基:用于細(xì)菌菌株菌液的制備;MLM 培養(yǎng)基(葡萄糖20 g,酵母浸粉2 g,谷氨酸5 g,KH2PO42 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,NH4Cl 0.835 g,CuSO40.16 mg,(NH4)2SO41 g,NaNO21.077 g,NaCl 3.083 g,KCl 0.5 g,FeSO40.15 mg,MnSO4·H2O 0.45 mg,pH 7.0):用于拮抗細(xì)菌XZQ-20 的發(fā)酵培養(yǎng)。

1.3 種子液的制備

挑取活化后的菌株XZQ-20 或植物病原細(xì)菌的單菌落,接種至裝有100 mL 的LB 液體培養(yǎng)基的三角瓶(規(guī)格250 mL)中,于30°C,200 r·min-1的條件下震蕩培養(yǎng)24 h 獲得種子液,將種子液濃度調(diào)整為1.0 × 107cfu·mL-1后備用。

1.4 菌株XZQ-20 無菌培養(yǎng)濾液的制備

事先制備好菌株XZQ-20 的種子液,按照1%(v·v-1)的接種量接種至裝有100 mL MLM 培養(yǎng)基的三角瓶(規(guī)格500 mL)中,于30 °C、200 r·min-1條件下振蕩培養(yǎng)5 d。然后在4 °C、12 000 r·min-1的條件下離心30 min 后收集上清液,再用0.45 μm 微孔濾膜過濾,得到菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液。

1.5 菌株XZQ-20 對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性

事先制備好的植物病原細(xì)菌種子液,按1:10(v·v-1)的比例分別與加熱冷卻至45-50°C 的LB固體培養(yǎng)基混勻,倒平板(規(guī)格9 cm),待平板冷卻凝固后,挑取活化后的菌株XZQ-20 的單菌落接種于混合了植物病原細(xì)菌的LB 平板上,接種點(diǎn)距平板中心2.5 cm,每個(gè)培養(yǎng)皿均勻接種3 個(gè)點(diǎn),在30°C 培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3 d 后測量抑菌圈直徑。每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。

1.6 菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性

菌株XZQ-20 無菌培養(yǎng)濾液的拮抗活性的測定采用濾紙片法[8]。事先制備好的植物病原細(xì)菌種子液,按1:10(v·v-1)的比例分別與加熱冷卻至45-50°C 的LB 固體培養(yǎng)基混勻,倒平板(規(guī)格9 cm),待平板冷卻凝固后,將直徑為6 mm 的無菌濾紙片置于平板上,距平板中心2.5 cm,每個(gè)平板均勻放置3 個(gè)無菌濾紙片。采取逐滴滴加的方法往不同濾紙片上分別滴加40 μL 的無菌培養(yǎng)濾液,以滴加等量的無菌水作為對(duì)照組,在30°C培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3 d 后測量抑菌圈直徑。每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。

1.7 菌株XZQ-20 產(chǎn)細(xì)胞壁裂解酶特性測定

菌株XZQ-20 產(chǎn)β-1,3-葡聚糖酶、幾丁質(zhì)酶、纖維素酶、蛋白酶和脂酶的特性測定分別采用文獻(xiàn)[9-12]中的方法。

1.8 菌株XZQ-20 的鑒定

1.8.1 形態(tài)及生理生化指標(biāo)測定 參照文獻(xiàn)[6,12-13]的方法對(duì)菌株的形態(tài)和生理生化特征進(jìn)行測定,包括細(xì)菌形狀、大小、革蘭氏染色、接觸酶、淀粉水解、明膠液化等指標(biāo)。

1.8.2 系統(tǒng)發(fā)育分析 采用菌落PCR 法擴(kuò)增16S rDNA[14]:挑取單菌落至裝有500 μL 無菌去離子水的EP 管中,100 °C 煮沸10 min 后,12 000 r·min-1、2 min 離心取上清液,即為菌株的基因組DNA。以提取的菌株基因組DNA 為模板,利用引物fD1:5’-CCGAATTCGTCGACAACAGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’,rD1:5’-CCCGGGATCCAAG-CTTAAGGAGGTGATCCAGCC-3’[15],進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增體系為25 μL,含有2×ES Taq MasterMix 12.5 μL、引物fD1 和rD1 各1 μL、DNA 模 板1 μL,ddH2O 補(bǔ)足至25 μL。擴(kuò)增條件:94 °C 3 min;94 °C 1 min,52 °C 1 min,72 °C 2 min,30 個(gè)循環(huán);72 °C 10 min。引物合成和測序由英濰捷基(北京)貿(mào)易有限公司完成。采用BLAST 方法在GenBank 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相似性搜索和同源性比較,采用ClustalX 1.8 進(jìn)行序列匹配分析,通過MEGA 5.0 軟件,采用Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育,用Bootstrap (重復(fù)抽樣1 000 次)分析評(píng)估樹的穩(wěn)定性。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌株XZQ-20 對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性

培養(yǎng)3 d 后,菌株XZQ-20 對(duì)4 種植物病原細(xì)菌均表現(xiàn)出了較好的拮抗活性,其抑制歐美楊細(xì)菌性潰瘍病菌、丁香假單胞菌、軟腐歐文氏菌和黃極毛桿菌形成的抑菌圈直徑分別達(dá)到(11.75±1.06)mm,(13.3±2.26)mm,(16.75±0.07)mm 和(7.55±1.06)mm(圖1)。菌株XZQ-20 已被保存于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心(保藏號(hào):CGMCC NO.12556)。

圖1 菌株XZQ-20 活菌體對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性Figure 1 Antagonistic activities of viable bacteria of strain XZQ-20 against plant pathogenic bacteria

2.2 菌株XZQ-20 無菌培養(yǎng)濾液對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性

不同種類的4 種植物病原細(xì)菌(L.quercina,P.syringae,E.carotovora和X.juglandis)用于測定菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液的拮抗活性,結(jié)果顯示培養(yǎng)3 d 后抑菌圈直徑分別達(dá)到(8.18±0.75)mm,(7.63±0.88)mm,(8.03±0.93)mm 和(8.60±0.53)mm(圖2)。

圖2 菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液對(duì)植物病原細(xì)菌的拮抗活性Figure 2 Antagonistic activities of sterile culture filtrate of strain XZQ-20 against plant pathogenic bacteria

2.3 菌株XZQ-20 產(chǎn)細(xì)胞壁裂解酶特性

菌株XZQ-20 產(chǎn)5 種細(xì)胞壁裂解酶特性測定結(jié)果表明,在培養(yǎng)了4 d 后,只有脫脂牛奶培養(yǎng)基平板上的XZQ-20 菌體周圍產(chǎn)生了透明圈(圖3),而其他裂解酶測定平板中菌體周圍未見透明圈或暈圈出現(xiàn),表明菌株XZQ-20 能產(chǎn)生蛋白酶。

圖3 菌株XZQ-20 產(chǎn)蛋白酶活性Figure 3 The protease activity of strain XZQ-20

2.4 菌株XZQ-20 的鑒定

2.4.1 形態(tài)學(xué)特征及生理生化特性 菌株XZQ-20在LB 平板上呈乳白色,不透明,菌落圓形、光滑,邊緣隆起、完整,菌體粘稠(圖 4 A)。菌體為桿狀,大小約0.80~2.03 μm×2.75~7.49 μm,有芽孢,具鞭毛,革蘭氏陽性菌(圖 4 B)。兼性厭氧型,能夠利用葡萄糖、D-木糖,甘露醇和檸檬酸鹽,能水解葡萄糖產(chǎn)氣,明膠液化,硝酸鹽還原、硫化氫反應(yīng)、氧化酶反應(yīng)、卵磷脂酶活性、淀粉水解均呈陽性,而Voges-Proskauer 反應(yīng),吲哚反應(yīng),甲基紅反應(yīng)和苯丙氨酸脫氨酶活性均呈陰性。菌株能在溫度范圍10~41°C,pH 范圍4~8和NaCl 濃度范圍0.2%~3%之間生長(表 1)。根據(jù)形態(tài)學(xué)特征和生理生化特性將菌株XZQ-20 初步鑒定為深層類芽孢桿菌(Paenibacillus profundus)。2.4.2 16S rDNA 序列測定及分析 菌株XZQ-20的16S rDNA PCR 擴(kuò)增得到一段大小為1 481 bp 的基因片段,系統(tǒng)發(fā)育分析(圖5)結(jié)果顯示,菌株XZQ-20 與P.profundusSl 79(AB712351)接近。綜合菌株XZQ-20 的形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性及16S rDNA 序列分析結(jié)果,最終將菌株XZQ-20鑒定為深層類芽孢桿菌。

表1 菌株XZQ-20 的生理生化特性Table 1 Physiology-biochemical characteristics of strain XZQ-20

圖4 菌株XZQ-20 的菌落形態(tài)(A)和革蘭氏染色(B)Figure 4 Colony morphology (A) and gram staining (B) of strain XZQ-20

圖5 菌株XZQ-20 16S rDNA 序列的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 5 Phylogenetic tree of strain XZQ-20 based on 16S rDNA sequence analysis

3 結(jié)論與討論

類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)是最為重要的生物防治菌株資源之一,能廣泛且有效地拮抗植物病原真菌和植物病原細(xì)菌。從辣椒(Capsicum annuum)田土壤中分離得到一株愛媛類芽孢桿菌(P.ehimensis)KWN38 能有效抑制立枯絲核菌(Rhizoctonia solani)、尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)和辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)的生長[7]。多粘類芽孢桿菌(P.polymyxa)CF05 對(duì)引起鐵皮石斛(dendrobium officinalis)葉斑病的萎蔫短小桿菌(Curtobacterium flaccumfaciens)具有較高的拮抗活性[16]。在本研究中,分離自黑楊根際土壤中的菌株XZQ-20 被鑒定為深層類芽孢桿菌(P.profundus),其對(duì)歐美楊細(xì)菌性潰瘍病菌、丁香假單胞菌、軟腐歐文氏菌和黃極毛桿菌均表現(xiàn)出了較好的拮抗活性。由此看出,菌株XZQ-20具有開發(fā)成控制植物病原細(xì)菌引起的植物病害的生防菌劑的潛力。

大量的研究報(bào)道表明類芽孢桿菌屬的細(xì)菌能產(chǎn)生不同種類的拮抗活性物質(zhì),包括脂肽類、蛋白類和揮發(fā)性氣體等,這些拮抗活性物質(zhì)具有較廣的抑菌譜。從愛媛類芽孢桿菌KWN38 的無菌培養(yǎng)濾液中提取的粗蛋白和丁醇提取物均能破壞立枯絲核菌、尖孢鐮刀菌和辣椒疫霉菌的菌絲,此外,菌株KWN38 產(chǎn)生的揮發(fā)性氣體也具有拮抗活性,同時(shí)還具有較強(qiáng)的幾丁質(zhì)酶、纖維素酶、葡聚糖酶和蛋白酶活性[7]。多粘類芽孢桿菌HKA-15 產(chǎn)生的抑菌脂肽能有效抑制野油菜黃單胞菌(Xanthomonas campestris) M-5 的生長[17]。多粘類芽孢桿菌JSa-9 產(chǎn)生的拮抗蛋白表現(xiàn)出了較廣的拮抗細(xì)菌和真菌的活性[18]。在本研究中,菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液表現(xiàn)出了較強(qiáng)的拮抗活性,這說明在菌株XZQ-20 的無菌培養(yǎng)濾液中存在著拮抗活性物質(zhì)。此外,還發(fā)現(xiàn)菌株XZQ-20 能產(chǎn)蛋白酶,而產(chǎn)生的蛋白酶可能會(huì)破壞病原細(xì)菌的細(xì)胞壁結(jié)構(gòu),這也有可能是菌株XZQ-20 對(duì)不同種類的植物病原細(xì)菌均表現(xiàn)出拮抗活性的原因之一。

本研究結(jié)果表明菌株XZQ-20 是一株具有較強(qiáng)拮抗活性的細(xì)菌菌株,其活菌體和無菌培養(yǎng)濾液均能有效抑制多種病原細(xì)菌的生長。此外XZQ-20 還能產(chǎn)生蛋白酶。最后,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性和16S rDNA 序列分析,將拮抗菌株XZQ-20 鑒定為深層類芽孢桿菌。綜上所述,拮抗菌株XZQ-20 是一株潛在的植物病原細(xì)菌的生防菌劑。

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