李陽(yáng)春, 王昭萍??, 劉 劍, 馬培振
(1. 海水養(yǎng)殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(中國(guó)海洋大學(xué)),山東 青島 266003;2. 煙臺(tái)海益苗業(yè)有限公司,山東 煙臺(tái) 264000)
三倍體貝類(lèi)具有生長(zhǎng)快、風(fēng)味好、育性差、夏季死亡率低等優(yōu)勢(shì)[1-3],自Stanley[4]利用細(xì)胞松弛素B(Cytochalasin B, CB)成功誘導(dǎo)美洲牡蠣(Crassostreavirginica)三倍體以來(lái),三倍體育種已相繼在三十余種貝類(lèi)中開(kāi)展了研究。目前采用的誘導(dǎo)方法主要有物理法(靜水壓[5]、冷/熱休克[6])、化學(xué)法(CB,6-二甲基氨基嘌呤[7],咖啡因[8])和生物法(二倍體和四倍體親本配合[9])。近年來(lái),王昭萍等[10]研究顯示,低鹽作為一種新的三倍體誘導(dǎo)方式,具有誘導(dǎo)效果好,成本低、操作便捷、安全無(wú)毒等優(yōu)點(diǎn),具有廣闊的推廣前景。
之前對(duì)于低鹽誘導(dǎo)三倍體的研究中,于瑞海[11]、孔靜[12]、陳宏發(fā)[13]等相繼給出了不同鹽度誘導(dǎo)條件下太平洋牡蠣(Crassostreagigas)受精卵的卵裂率、孵化率和三倍體率,同時(shí)應(yīng)用“孵化率×三倍體率”的值作為綜合評(píng)價(jià)指標(biāo),判斷三倍體的誘導(dǎo)效果,從而得出最佳的誘導(dǎo)條件。然而,為了給生產(chǎn)實(shí)踐提供更好的理論依據(jù),有必要對(duì)卵裂率和孵化率隨誘導(dǎo)鹽度的變化趨勢(shì)進(jìn)行進(jìn)一步分析,同時(shí)探索一種更為科學(xué)合理的綜合評(píng)價(jià)方法。
利用已有數(shù)據(jù)建立模型估測(cè)不同卵裂率、孵化率對(duì)應(yīng)的誘導(dǎo)鹽度,其原理與半數(shù)效量的估測(cè)類(lèi)似。半數(shù)效量廣泛應(yīng)用于評(píng)測(cè)外界脅迫的致死率[14]、致畸率[15]、致突變率[16](半數(shù)致死劑量,LD50),及評(píng)斷藥物的有效劑量[17](半數(shù)有效劑量,ED50),在貝類(lèi)中也被用來(lái)探究細(xì)菌感染、金屬沉積物等的危害[18-20]。統(tǒng)計(jì)學(xué)中可以通過(guò)概率單位加權(quán)回歸,得到脅迫程度(藥物劑量、細(xì)菌感染量等)和脅迫效果(有效率、死亡率等)之間的回歸曲線,從而反映不同脅迫條件下的致死效應(yīng)[21],該回歸可利用Probit回歸分析實(shí)現(xiàn)[15]。
主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是研究如何通過(guò)少數(shù)幾個(gè)主成分來(lái)解釋多個(gè)變量的分析方法。其通過(guò)正交變換將原變量進(jìn)行線性組合得到一組新變量(主成分),使它們盡可能多地保留原始變量的信息,且彼此不相關(guān),并選取少數(shù)幾個(gè)在變差總信息量中比例較大的主成分來(lái)進(jìn)行分析,從而達(dá)到減少變量的目的[22-23]。該方法十分適用于綜合分析多個(gè)因素,以探討三倍體的誘導(dǎo)效果。
本研究利用概率單位加權(quán)回歸法,分別得到了鹽度與卵裂率及鹽度與孵化率的回歸擬合,為估測(cè)特定卵裂率和孵化率對(duì)應(yīng)的誘導(dǎo)鹽度提供了模型,并應(yīng)用配對(duì)樣本T檢驗(yàn)對(duì)該模型的可信性進(jìn)行了驗(yàn)證;同時(shí)利用主成分分析法,對(duì)不同誘導(dǎo)鹽度下的卵裂率、孵化率和三倍體率進(jìn)行了降維,抽取了兩個(gè)分別代表卵裂、孵化率和三倍體率的主成分,分別計(jì)算了主成分的得分和不同誘導(dǎo)鹽度的綜合得分,為探究三倍體最佳誘導(dǎo)條件提供了一種更加全面科學(xué)的評(píng)價(jià)方法。
實(shí)驗(yàn)用2齡種貝(殼長(zhǎng)8~14 cm)取自煙臺(tái)海益苗業(yè)有限公司,經(jīng)升溫促熟培育后待用。
1.2.1 精卵獲取及受精 實(shí)驗(yàn)所用海水均為過(guò)濾自然海水,鹽度為30,水溫為23~25 ℃,器械每次操作前均使用淡水殺死精子,避免精子污染。挑選性腺發(fā)育程度較好的親貝,洗刷干凈后開(kāi)殼,解剖針挑取適量性腺鏡檢,區(qū)分雌雄。雌性親貝取卵,卵液先用300目篩絹過(guò)濾去除組織碎屑,后用1 000目篩絹以過(guò)濾海水沖洗2~3遍去除混入的組織液消化液等,不同親貝的卵液置于不同的100 mL燒杯內(nèi),浸泡50 min促熟,鏡檢,選取卵子形狀近圓、卵內(nèi)物質(zhì)致密的卵液混合,濃縮卵液至700~800 mL,調(diào)整卵子密度為7 000~8 000個(gè)/mL[24]。受精前10 min解剖取精子,挑選精子活力高的精液,用300目篩絹過(guò)濾去除組織碎屑,以卵子∶精子=1∶5~1∶6的比例進(jìn)行受精[13]。
1.2.2 低鹽誘導(dǎo)處理及幼蟲(chóng)培養(yǎng) 40%~50%受精卵出現(xiàn)第一極體(PB1)時(shí)將受精卵液加入500 mL燒杯中,使得終鹽度分別為4,6,8,10,12,14,16和30,低鹽誘導(dǎo)15 min。后迅速轉(zhuǎn)入20 L桶中進(jìn)行培養(yǎng)。統(tǒng)計(jì)卵裂率、孵化率,24 h后收集D型幼蟲(chóng),利用流式細(xì)胞術(shù)測(cè)定三倍體率,染色劑為DAPI,流式細(xì)胞儀型號(hào)為FC500 MPL(Beckman Coulter, USA)。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.2.3 指標(biāo)測(cè)定
卵裂率 = 卵裂卵數(shù)/受精卵總數(shù)×100%。
孵化率 = D形幼蟲(chóng)數(shù)/受精卵總數(shù)×100%。
三倍體率 = 三倍體D形幼蟲(chóng)數(shù)/(三倍體D形幼蟲(chóng)數(shù)+二倍體D形幼蟲(chóng)數(shù))×100%。
數(shù)據(jù)表示方法:平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤(Mean±SE)。
1.3.1 概率單位加權(quán)回歸 采用SPSS 19.0中的Probit回歸對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行概率單位加權(quán)回歸,模型選擇概率模型,對(duì)回歸得到的結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化殘差分析,去除不適合進(jìn)行回歸直線擬合的數(shù)據(jù),對(duì)剩下的數(shù)據(jù)進(jìn)行第二次Probit回歸,得到最終模型。
1.3.2 模型驗(yàn)證 根據(jù)Probit回歸得到的模型選擇若干合適的鹽度,按照1.2中的方法測(cè)定這些鹽度處理?xiàng)l件下的卵裂率及孵化率,采用SPSS 19.0中配對(duì)樣本T檢驗(yàn)的方法與模型擬合的卵裂率和孵化率進(jìn)行比較。
采用SPSS 19.0對(duì)卵裂率、孵化率和三倍體率進(jìn)行主成分分析,參照王芳[22]、李艷雙[23]等的方法,以累計(jì)方差貢獻(xiàn)率≥85%作為主成分的選取標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)以下公式計(jì)算綜合得分:
綜合評(píng)價(jià)指數(shù)=主成分1得分×主成分2的方差貢獻(xiàn)率+主成分2得分×主成分1的方差貢獻(xiàn)率。
由圖1可知,隨著誘導(dǎo)鹽度的增加,受精卵的卵裂率、孵化率也隨之增加,而三倍體率呈現(xiàn)先升后降的趨勢(shì),且鹽度8時(shí)三倍體率最高,這與于瑞海、孔靜[11-12]等的結(jié)果一致。
圖1 不同鹽度誘導(dǎo)條件下的卵裂率、孵化率及三倍體率
Pearson擬合度檢驗(yàn)可用來(lái)判斷曲線的擬合效果,其卡方值越小,R2值越接近1,擬合效果越好,由表1可知,該擬合的R2接近0,遠(yuǎn)小于1,說(shuō)明有顯著偏離曲線的點(diǎn)對(duì)數(shù)據(jù)的回歸擬合造成了干擾,因此對(duì)所有數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化殘差分析,結(jié)果見(jiàn)圖2。其中,調(diào)整的R2值越接近1,P值越小,說(shuō)明殘差回歸效果越好,數(shù)據(jù)的殘差越接近正態(tài)分布,擬合效果越好。
表1 卵裂率及孵化率的Pearson擬合度檢驗(yàn)
注:CR即卵裂率(cleavage rate),HR即孵化率(hatching rate)。下同。
Note: CR refers to the cleavage rate, HR refers to the hatching rate. The same below.
圖2 卵裂率數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化殘差回歸分析
圖2中顯示,鹽度4的試驗(yàn)點(diǎn),其標(biāo)準(zhǔn)化殘差小于-2,落在正態(tài)分布區(qū)間外,因此應(yīng)將其判定為異常試驗(yàn)點(diǎn),不參與回歸擬合。同時(shí),表2中顯示,將鹽度4及30的數(shù)據(jù)依次刪除之后,標(biāo)準(zhǔn)化殘差回歸的R2值增加至接近1,P值降低,表現(xiàn)為極顯著,說(shuō)明除鹽度4外,鹽度30亦為異常試驗(yàn)點(diǎn),將這兩組數(shù)據(jù)刪除后,數(shù)據(jù)的殘差符合正態(tài)分布,擬合出的曲線可信性較高。
將卵裂率和孵化率中鹽度4、30組數(shù)據(jù)均刪除之后,對(duì)剩余數(shù)據(jù)進(jìn)行第二次Probit回歸分析,協(xié)變量(鹽度)選擇不進(jìn)行轉(zhuǎn)換、進(jìn)行以10為底的對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換或自然對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換,進(jìn)行比較,結(jié)果如表1所示。由表1可知,對(duì)于卵裂率來(lái)說(shuō),對(duì)鹽度進(jìn)行以10為底的對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換和進(jìn)行自然對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換得到的結(jié)果相同(卡方=1.135,R2=0.951),且均優(yōu)于不對(duì)鹽度進(jìn)行轉(zhuǎn)換得到的結(jié)果(卡方=1.586,R2=0.903),因此隨機(jī)采用對(duì)鹽度進(jìn)行以10為底的對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換;對(duì)于孵化率來(lái)說(shuō),不對(duì)鹽度進(jìn)行轉(zhuǎn)換得到的結(jié)果優(yōu)于對(duì)鹽度進(jìn)行以10為底的對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換或自然對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換的結(jié)果,因此本次回歸未對(duì)鹽度進(jìn)行對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換。概率回歸結(jié)果見(jiàn)表3、4和5。其中卵裂率為50%的誘導(dǎo)鹽度估計(jì)值為5.648,孵化率為50%的誘導(dǎo)鹽度估計(jì)值為8.644。
表2 卵裂率和孵化率的標(biāo)準(zhǔn)化殘差回歸
表3 卵裂率及孵化率與誘導(dǎo)鹽度的PROBIT模型構(gòu)建
注:PROBIT 模型: PROBIT(p-CR) = -1.578 + 2.099×鹽度以10為底轉(zhuǎn)換后的對(duì)數(shù)值; PROBIT(p-HR) = -0.851 + 0.098×鹽度。
Note: Probit model: PROBIT(p-CR) = -1.578 + 2.099×Log10(Salinity);PROBIT (p-HR) = -0.851 + 0.098 × Salinity.
表4 卵裂率與誘導(dǎo)鹽度的PROBIT回歸
注:表中黑體數(shù)據(jù)為了突出顯示該組數(shù)據(jù),以方便讀者查閱,無(wú)特殊含義。下表同。
Note: Some data in the table are highlighted in boldface for convenience of reference only and shall not affect the construction or interpretation thereof. The same below.
表5 孵化率與誘導(dǎo)鹽度的PROBIT回歸
由于Probit回歸分析采用的鹽度范圍是6~18,因此驗(yàn)證鹽度的選擇范圍也應(yīng)為6~18,因此,根據(jù)表4和5的結(jié)果,卵裂率選擇的驗(yàn)證鹽度及其對(duì)應(yīng)估計(jì)百分比分別為:7.5/60%,10.0/70%,14.2/80%;孵化率選擇的驗(yàn)證鹽度及其對(duì)應(yīng)估計(jì)百分比分別為:6.1/40%,8.6/50%,11.2/60%,14.0/70%,17.2/80%。驗(yàn)證結(jié)果如表6所示。
表6 不同誘導(dǎo)鹽度下觀測(cè)值與回歸模型估計(jì)值的比較
由表6可得,所有組別的P值均大于0.05,說(shuō)明估計(jì)值和觀測(cè)值之間不存在顯著差異,即該模型對(duì)不同誘導(dǎo)鹽度下卵裂率和孵化率的估計(jì)較為可信。因此,生產(chǎn)實(shí)踐中可參考表4和5的結(jié)果,根據(jù)鹽度與卵裂率、孵化率的關(guān)系選擇更為合適的誘導(dǎo)鹽度。
前人的研究往往采用將孵化率與三倍體率的乘積作為綜合指標(biāo)來(lái)評(píng)價(jià)誘導(dǎo)效果,然而生產(chǎn)實(shí)踐中需考慮的評(píng)價(jià)因素不僅只有孵化率與三倍體率,卵裂率、附著變態(tài)率、生長(zhǎng)速度、抗逆性等因素都應(yīng)當(dāng)列入最優(yōu)誘導(dǎo)條件評(píng)價(jià)體系中,主成分分析作為一種能同時(shí)考慮多種影響因素的評(píng)價(jià)方法,對(duì)于誘導(dǎo)條件的選擇是很有意義的。
2.4.1 卵裂率、孵化率與鹽度的主成分分析 由于本實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)不存在量綱及數(shù)量級(jí)的區(qū)別,因此卵裂率、孵化率和三倍體率的數(shù)據(jù)無(wú)需進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,可直接進(jìn)行主成分分析。
主成分分析共抽取了三個(gè)主成分,其方差貢獻(xiàn)率分別是73.62%,26.16%和0.22%,為了能夠盡可能多地保留原始變量的信息,主成分的選取通常遵循“累計(jì)方差貢獻(xiàn)率≥85%”的標(biāo)準(zhǔn)。按照該標(biāo)準(zhǔn),我們選取了前兩個(gè)主成分用于綜合指數(shù)的計(jì)算,其累計(jì)方差貢獻(xiàn)率為99.78% (見(jiàn)表7)。對(duì)于主成分1,它在卵裂率與孵化率上的特征向量分別為0.936/0.986,而在三倍體率上的特征向量為負(fù)值(-0.600),說(shuō)明主成分1主要反映了卵裂率和孵化率這兩個(gè)原始變量;而主成分2在三倍體率上的特征向量(0.800)則顯著高于在卵裂、孵化率上的特征向量(0.348、0.157),說(shuō)明主成分2主要反映的是三倍體率這個(gè)原始變量,也就是說(shuō)主成分1和主成分2很好的反映了所有的原始變量,成功地達(dá)到了減少變量的目的。
表7 提取主成分的負(fù)荷及其方差貢獻(xiàn)率
2.4.2 綜合評(píng)價(jià)指數(shù) 根據(jù)這兩個(gè)主成分的特征值、特征向量及方差貢獻(xiàn)率得出的綜合評(píng)價(jià)指數(shù)見(jiàn)表8。結(jié)果顯示,隨著鹽度的增加,誘導(dǎo)的綜合評(píng)價(jià)指數(shù)先升后降,在鹽度為8時(shí)達(dá)到最大值(0.67),這與之前的研究結(jié)果一致,說(shuō)明鹽度8的確為適宜的誘導(dǎo)鹽度。然而通過(guò)該表格還可以看出,鹽度10的綜合評(píng)價(jià)指數(shù)也較高(0.54),與鹽度8相比,表現(xiàn)出更高的卵裂、孵化率(PC1: 0.04>-0.53)和較低的誘導(dǎo)效果(PC2: 0.72<1.09)。因此,生產(chǎn)實(shí)踐中可以根據(jù)實(shí)際需要選擇誘導(dǎo)鹽度為8(更高的誘導(dǎo)率)或10(更高的存活率)。當(dāng)然,僅根據(jù)卵裂率、孵化率和三倍體率得出的綜合評(píng)價(jià)指數(shù)是不全面的,需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)提供不同誘導(dǎo)鹽度條件下幼蟲(chóng)的存活、附著及后續(xù)的生長(zhǎng)數(shù)據(jù),以期得到更為完善的評(píng)價(jià)體系,為生產(chǎn)實(shí)踐提供科學(xué)的指導(dǎo)。
表8 不同誘導(dǎo)鹽度條件下的綜合評(píng)價(jià)指數(shù)
本研究通過(guò)對(duì)卵裂率、孵化率與鹽度進(jìn)行概率加權(quán)回歸擬合和主成分分析,為低鹽誘導(dǎo)太平洋牡蠣三倍體提供了可參考模型與更科學(xué)的綜合評(píng)價(jià)方法。Probit模型提供了不同誘導(dǎo)鹽度下卵裂率與孵化率的估計(jì)值,要達(dá)到50%卵裂率和50%孵化率的誘導(dǎo)鹽度應(yīng)分別大于5.648和8.644。主成分分析得出了各誘導(dǎo)鹽度的綜合評(píng)價(jià)指數(shù),其中鹽度8,10評(píng)價(jià)指數(shù)最高,鹽度8誘導(dǎo)率最高但存活率相對(duì)較低,鹽度10誘導(dǎo)率稍低但存活率較高,在生產(chǎn)實(shí)踐中根據(jù)具體需要,選擇更好的誘導(dǎo)效果或更高的存活率。