班美靜,滿 燕,潘立剛
(1.北京市農(nóng)林科學(xué)院/北京農(nóng)業(yè)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測(cè)技術(shù)研究中心/農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估實(shí)驗(yàn)室(北京)/農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境監(jiān)測(cè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100097;2.北京農(nóng)學(xué)院食品科學(xué)與工程學(xué)院,北京 102206)
沙門(mén)氏菌(Salmonella)是導(dǎo)致食源性疾病的主要原因之一,可引起胃腸炎和腹瀉疾病,還會(huì)引起動(dòng)物傷寒、副傷寒、霍亂等疾病發(fā)生。沙門(mén)氏菌廣泛存在于自然環(huán)境中,因此在新鮮農(nóng)產(chǎn)品和動(dòng)物飼料生產(chǎn)過(guò)程中的任何環(huán)節(jié)都可能發(fā)生沙門(mén)氏菌污染。在世界各國(guó)發(fā)生的細(xì)菌性食物中毒中,沙門(mén)氏菌常位列榜首。因此,為防止和減少沙門(mén)氏菌對(duì)人類健康造成危害,建立沙門(mén)氏菌快速檢測(cè)方法成為食品安全領(lǐng)域日益增長(zhǎng)的需求。
目前,沙門(mén)氏菌的檢測(cè)方法主要有:基于細(xì)菌理化差異的平板菌落計(jì)數(shù)(培養(yǎng))法、基于抗原與抗體免疫反應(yīng)的酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)、基于DNA擴(kuò)增的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)(常規(guī)PCR、定量PCR等)。平板菌落培養(yǎng)法是沙門(mén)氏菌檢測(cè)的最傳統(tǒng)、最常用檢測(cè)方法,但其勞動(dòng)強(qiáng)度大、耗時(shí)長(zhǎng),一般至少需要3~5 d,因此不能用于現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。ELISA具有特異性強(qiáng)、通量高、成本低等優(yōu)點(diǎn),在沙門(mén)氏菌檢測(cè)中得到廣泛應(yīng)用。然而,這是一種多相檢測(cè)方法,需要多次洗滌,可能會(huì)導(dǎo)致交叉污染和假陽(yáng)性,另外,其缺乏足夠的靈敏性,通常有一個(gè)低檢出限104CFU/mL[1]。PCR方法具有高的檢測(cè)靈敏度、時(shí)間短,但其需要復(fù)雜的DNA提取過(guò)程,對(duì)技術(shù)人員要求較高。
近年來(lái),生物傳感技術(shù)以及納米材料的迅速發(fā)展,推動(dòng)了基于抗原/抗體、核酸適配體、酶、細(xì)胞、仿生受體、噬菌體等傳感元件的光學(xué)、電化學(xué)、表面增強(qiáng)拉曼散射(Surface Eenhanced Raman Scattering,SERS)、石英晶體微量天平(Quartz Crystal Microbalance,QCM)等多種檢測(cè)食源性致病菌的快速、高靈敏檢測(cè)方法的迅速發(fā)展。其中,核酸適配體是一種短的核酸序列,具有特異性強(qiáng)、親和力高、合成速度快、重現(xiàn)性好、修飾方便等優(yōu)點(diǎn)?;诤怂徇m配體的生物傳感器被稱為核酸適配體傳感器,已被廣泛應(yīng)用于食源性致病菌的定量檢測(cè),且正在逐步取代以抗原/抗體為基礎(chǔ)的免疫生物傳感器。本文就核酸適配體生物傳感技術(shù)在沙門(mén)氏菌定量檢測(cè)中的應(yīng)用研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。
核酸適配體是利用指數(shù)富集配體系統(tǒng)進(jìn)化技 術(shù)(systematic evolution of ligandsby exponential enrichment,SELEX)從一種人工合成的寡核苷酸文庫(kù)中篩選得到的能與靶分子高親和性和高特異性性結(jié)合的單鏈寡核苷酸。近年來(lái),為提高篩選效率、簡(jiǎn)化篩選過(guò)程,開(kāi)發(fā)了多種SELEX新技術(shù),如親和層析SELEX、毛細(xì)管電泳SELEX、全細(xì)胞SELEX和加尾SELEX技術(shù)等,這些新型篩選技術(shù)極大促進(jìn)了核酸適配體在各個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展和應(yīng)用[2]。
在沙門(mén)氏菌核酸適配體的篩選(表1)方面,WANG等[3]利用全細(xì)胞SELEX技術(shù),篩選得到了鼠傷寒沙門(mén)氏菌的ssDNA核酸適配體,Kd值為6.33(±0.58)nmol/L。Lee等[4]利用傳統(tǒng)全細(xì)胞SELEX技術(shù)篩選得到鼠傷寒沙門(mén)氏菌的RNA適配體,這種RNA核酸適配體具有抗RNA酶的作用,其Kd值約為20 nmol/L。近年來(lái),Li等[5]建立了一種基于石英晶體微天平(QCM)的SELEX技術(shù),并篩選得到鼠傷寒沙門(mén)氏菌的ssDNA核酸適配體,Kd值為58.5 nmol/L。通過(guò)對(duì)比發(fā)現(xiàn),通過(guò)傳統(tǒng)的SELEX篩選技術(shù)得到的ssDNA核酸適配體的親和力要高于RNA核酸適配體;而通過(guò)新型基于QCM的SELEX技術(shù)得到的ssDNA核酸適配體的親和力要高于傳統(tǒng)SELEX篩選技術(shù),且新型篩選方法速度快、效率高、成本低。近年來(lái),利用上述SELEX篩選技術(shù)得到的核酸適配體,科學(xué)家們已經(jīng)建立了多種新型核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法,并將其應(yīng)用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)中。本文基于核酸適配體的生物傳感技術(shù)在沙門(mén)氏菌定量檢測(cè)中的應(yīng)用研究進(jìn)展進(jìn)行了詳細(xì)概述,并對(duì)這些檢測(cè)方法進(jìn)行詳細(xì)對(duì)比(表2)。
比色法(Colorimetry)是通過(guò)比較或測(cè)量有色物質(zhì)溶液顏色深度來(lái)確定待測(cè)組分含量的方法。作為一種最簡(jiǎn)單的傳感檢測(cè)方法,已被廣泛應(yīng)用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)。
表1 沙門(mén)氏菌核酸適配體篩選Table 1 Screening of Salmonella aptamer
表2 適配體生物傳感技術(shù)在沙門(mén)氏菌定量檢測(cè)中的應(yīng)用情況比較Table 2 Comparison of application of aptamer biosensor technology in the quantitative detection of Salmonella
2.1.1 鹽誘導(dǎo)金納米顆粒聚集 金納米顆粒(Gold nanoparticles,GNPs)在分散和聚集狀態(tài)下具有不同的外觀顏色,根據(jù)這一特性,科學(xué)家們建立了多種基于鹽誘導(dǎo)GNPs聚集的比色生物傳感檢測(cè)方法。如MA等[6]將沙門(mén)氏菌核酸適配體包被于GNPs表面,當(dāng)樣品中含有目標(biāo)分子沙門(mén)氏菌時(shí),適配體與沙門(mén)氏菌專一性結(jié)合,致使適配體從GNPs-適配體復(fù)合物的表面脫離,釋放出GNPs。當(dāng)加入NaCl時(shí),則會(huì)導(dǎo)致GNPs的聚集,GNPs溶液的顏色由紅色變成紫色甚至深藍(lán)色。該方法得到沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍為102~107CFU/mL,最低檢測(cè)限為56 CFU/mL。WU等[7]利用相同的檢測(cè)原理,實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌和大腸桿菌的定量檢測(cè),最低檢測(cè)限為105CFU/mL。該檢測(cè)方法具有簡(jiǎn)單、快速、成本低的優(yōu)點(diǎn),但其檢測(cè)靈敏度相對(duì)比較低。
2.1.2 銀還原放大比色信號(hào) 為進(jìn)一步提高靈敏度,Yuan等[8]提出了一種銀還原的比色生物傳感檢測(cè)方法。通過(guò)生物素親和素的相互作用,沙門(mén)氏菌的適配體被固定于微孔板;另外,巰基修飾的適配體被固定于GNPs。當(dāng)沙門(mén)氏菌存在于樣品中,形成適配體-沙門(mén)氏菌-適配體-GNPs三明治復(fù)合物;然后,利用銀放大溶液增強(qiáng)比色信號(hào),肉眼即可對(duì)沙門(mén)氏菌進(jìn)行定量檢測(cè),得到沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限為7 CFU/mL。這種銀還原放大比色信號(hào)的方法,可大大提高沙門(mén)氏菌的檢測(cè)靈敏度,具有簡(jiǎn)單、快速、無(wú)需檢測(cè)儀器的優(yōu)點(diǎn)。
2.1.3 磁納米顆粒對(duì)GNPs的高消光系數(shù)特性 磁納米顆粒(Magnetic Nanoparticles,MNPs)除具有較大的比表面積、豐富的功能基團(tuán)外,還具有良好的磁響應(yīng)強(qiáng)度及對(duì)GNPs的高消光系數(shù)等優(yōu)良特性[9]。根據(jù)這一特性,DUAN等[10]將巰基修飾適配體和生物素修飾適配體分別固定在于GNPs和MNPs表面;當(dāng)沙門(mén)氏菌目標(biāo)物存在于樣品中時(shí),適配體與沙門(mén)氏菌高專一性結(jié)合,形成GNPs-適配體-沙門(mén)氏菌-適配體-磁珠復(fù)合物;磁分離后,GNPs在懸浮液中的含量降低,因此懸浮液顏色變淺,相應(yīng)其UV吸光度也會(huì)降低。利用該方法得到沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍為25~105CFU/mL,最低檢測(cè)限為10 CFU/mL。與上述微孔板中銀還原方法相比,這種在磁納米顆粒上進(jìn)行核酸適配體的固定、磁納米復(fù)合物的分離純化等過(guò)程都相對(duì)比較簡(jiǎn)單、快速,且降低交叉污染的風(fēng)險(xiǎn)。
2.1.4 酶催化 MNPs除具有高消光系數(shù)的特性外,還具有酶催化活性。Park等[11]利用MNPs的催化活性以及無(wú)標(biāo)記核酸適配體,構(gòu)建了一種核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法。首先,表面帶負(fù)電荷的核酸適配體被吸附到表面帶正電荷的MNPs上,這種吸附作用會(huì)阻礙MNPs的催化活性;當(dāng)沙門(mén)氏菌目標(biāo)物存在時(shí),適配體從磁珠上脫離,MNPs的催化活性恢復(fù),導(dǎo)致底物四甲基聯(lián)苯胺(TMB)溶液顏色變成藍(lán)色,這種顏色變化可通過(guò)肉眼進(jìn)行觀察,最后得到沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限為7.5×105CFU/mL。這種檢測(cè)方法具有簡(jiǎn)單、快速的特點(diǎn),但靈敏度低。
為提高檢測(cè)靈敏度,一些具有酶催化活性的納米復(fù)合材料也被應(yīng)用于核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法的構(gòu)建。如Wu等[12]構(gòu)建了一種ZnFe2O4還原的氧化石墨烯(ZnFe2O4-rGO)納米結(jié)構(gòu),這種新型納米結(jié)構(gòu)具有過(guò)氧化氫酶的催化活性,可催化過(guò)氧化氫對(duì)TMB的氧化,產(chǎn)生藍(lán)色產(chǎn)物;利用修飾有ZnFe2O4-rGO的適配體作為信號(hào)探針,生物素修飾適配體被固定于微孔板,作為捕獲探針;當(dāng)沙門(mén)氏菌目標(biāo)物存在時(shí),形成微孔板-適配體-沙門(mén)氏菌-適配體-的ZnFe2O4-rGO復(fù)合物三明治結(jié)構(gòu);ZnFe2O4-rGO催化底物TMB產(chǎn)生顏色變化,最后得到沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限為11 CFU/mL,檢測(cè)范圍為 11~1.10×105CFU/mL。由此可見(jiàn),復(fù)合納米材料應(yīng)用于生物傳感檢測(cè)方法中,可大大提高沙門(mén)氏菌的檢測(cè)靈敏度。
2.1.5 過(guò)氧化氫還原Au3+Au3+可被過(guò)氧化氫還原成紅色非聚集Au原子。Zhu等[13]將沙門(mén)氏菌核酸適配體固定于微孔板,當(dāng)樣品中含有目標(biāo)物沙門(mén)氏菌時(shí),將會(huì)被核酸適配體捕獲;然后再次加入生物素修飾的適配體,形成雙適配體夾心結(jié)構(gòu);最后加入親和素修飾的過(guò)氧化氫酶后,過(guò)氧化氫酶催化過(guò)氧化氫的降解,因此,導(dǎo)致晶體生長(zhǎng)動(dòng)力學(xué)反應(yīng)減慢,形成聚集的納米顆粒,溶液顏色變成藍(lán)色;當(dāng)樣品中不含沙門(mén)氏菌時(shí),過(guò)氧化氫則不被降解,Au3+在高濃度過(guò)氧化氫條件下,被快速還原形成非聚集的球型納米顆粒,溶液變成紅色。利用該方法實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),檢測(cè)范圍為101~106CFU/mL,最低檢測(cè)限為10 CFU/mL。該方法具有快速、高靈敏度、低成本、高專一性以及高準(zhǔn)確性的優(yōu)點(diǎn)。
2.2.1 傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料 WANG等[14]利用適配體修飾的NaYF4:Ce/Tb納米顆粒和一個(gè)熒光DNA標(biāo)簽,構(gòu)建了一種均一的時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌的檢測(cè)。其中,適配體功能化的NaYF4:Ce/Tb納米顆粒作為能量供體,標(biāo)記有羧基熒光素(5-Carboxyfluorescein,F(xiàn)AM)的互補(bǔ)寡核苷酸(cDNA)作為受體。當(dāng)樣品中不存在沙門(mén)氏菌時(shí),適配體與cDNA雜交,光子能量從NaYF4:Ce/Tb納米顆粒轉(zhuǎn)移到FAM。通過(guò)這種方法得到沙門(mén)氏菌的線性檢測(cè)范圍為102~106CFU/mL,最低檢測(cè)限為25 CFU/mL。Duan等[15]通過(guò)抗-ε-亞基抗體-生物素-親和素-生物素-核酸適配體連接臂,將鼠傷寒沙門(mén)氏菌的核酸適配體與色素細(xì)胞中的F0F1-ATP酶的“旋轉(zhuǎn)子”ε-亞基偶聯(lián),F(xiàn)-DHPE熒光探針標(biāo)記于色素細(xì)胞的表面,建立了一種新型核酸適配體生物傳感器,實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),其線性檢測(cè)范圍為10~104CFU/mL,最低檢測(cè)限為10 CFU/mL。盡管這些方法具有高的檢測(cè)靈敏度,但其操作比較繁瑣、耗時(shí)。
近年來(lái),微流控芯片技術(shù)作為一種極具潛力的分析平臺(tái),具有集成化、微型化、高通量及自動(dòng)化檢測(cè)的特點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于食源性致病菌的定量檢測(cè)中。如ZHANG等[16]建立了一種微芯片毛細(xì)管電泳耦合激光誘導(dǎo)熒光技術(shù)(MCELIF),SYBR Gold標(biāo)記的核酸適配體與沙門(mén)氏菌專一性結(jié)合后,利用核酸適配體-沙門(mén)氏菌復(fù)合物與核酸適配體的質(zhì)荷比的不同,通過(guò)MCE將復(fù)合物與核酸適配體分離開(kāi),實(shí)現(xiàn)了牛奶樣品中沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),得到了沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限為3.37×102CFU/mL。這種微流控芯片檢測(cè)方法具有高度的集成化、操作簡(jiǎn)便的優(yōu)點(diǎn)。
盡管上述基于傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料的檢測(cè)方法具有較高的檢測(cè)靈敏度,但這些傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料的熒光強(qiáng)度相對(duì)較低,易漂白,對(duì)環(huán)境變化靈敏度高。為克服這些問(wèn)題,一些具有高熒光強(qiáng)度、高穩(wěn)定性的熒光納米發(fā)光材料,如量 子 點(diǎn)(Quantum Dot,QDs)、 碳 點(diǎn)(Carbon Dots,CDs)、上轉(zhuǎn)換納米發(fā)光材料(Up-conversion Nanoparticles,UCNPs)等作為傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料的替代標(biāo)簽,被用于新型核酸適配體熒光生物傳感器的構(gòu)建中。
2.2.2 量子點(diǎn)(QDs) QDs具有寬的激發(fā)波長(zhǎng)范圍、窄的發(fā)射峰、寬大的斯托克斯位移、高熒光強(qiáng)度及光穩(wěn)定性,已成為最最理想的熒光替代標(biāo)簽[17]。Hamula等[18]利用發(fā)射波長(zhǎng)分別在535、585 nm處的QDs作為光學(xué)標(biāo)簽,并將其分別與副溶血性弧菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌的適配體偶聯(lián),建立了一種雙色流式細(xì)胞傳感分析方法,最終得到副溶血性弧菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限為5×103CFU/mL。Xu等[19]首先分別利用修飾有大腸桿菌0157:H7、金黃色葡萄球菌、單增李斯特菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌抗體的免疫磁珠從食品樣本中分離出4種目標(biāo)菌,然后利用發(fā)射波長(zhǎng)不同的4種量子點(diǎn)(528、572、621、668 nm)分別標(biāo)記4種食源性致病菌的適配體,利用該標(biāo)記的適配體專一性識(shí)別磁珠上的捕獲的目標(biāo)菌。利用該方法得到大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、單增李斯特菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌純菌樣的最低檢測(cè)限分別為80、100、47、160 CFU/mL;得到牛肉樣品中4種菌的最低檢測(cè)限分別為320、350、110、750 CFU/mL。與傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料相比,這些基于QDs的核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法改善了熒光淬滅現(xiàn)象,具有更高的檢測(cè)靈敏度;此外,還能同時(shí)實(shí)現(xiàn)多種食源性致病菌的高通量檢測(cè)。除這些優(yōu)勢(shì)外,由于QDs的激發(fā)光仍然在紫外-可見(jiàn)光區(qū),因此,被測(cè)生物樣品同樣會(huì)被激發(fā),熒光背景值偏高,檢測(cè)靈敏度仍會(huì)受到一定程度影響。
2.2.3 碳點(diǎn)(CDs) CDs是指粒徑小于10 nm的碳納米顆粒,是一類新型的光致發(fā)光納米材料。CDs具有熒光量子產(chǎn)率高、合成簡(jiǎn)單、毒性低、原材料來(lái)源廣泛、生物相容性好、熒光性能優(yōu)等優(yōu)點(diǎn),受到科學(xué)家們的廣泛關(guān)注[20]。近年來(lái),Wang等[21]以檸檬酸為碳源,采用水熱法,成功合成了CDs,并利用該CDs建立了一種基于aptamer-CDs的核酸適配體生物傳感器,實(shí)現(xiàn)了蛋殼和自來(lái)水中的鼠傷寒沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),得到沙門(mén)氏菌的線性范圍為103~105CFU/mL,最低檢測(cè)限為50 CFU/mL。該方法具有簡(jiǎn)單、快速、高靈敏的特點(diǎn),可用于其他食源性致病菌的定量檢測(cè)。
2.2.4 上轉(zhuǎn)換納米發(fā)光材料(UCNPs) UCNPs具有高的化學(xué)穩(wěn)定性,不易被光漂白,不受外界環(huán)境(如濕度、酸度等)和被測(cè)物樣品的影響的優(yōu)點(diǎn),此外,其使用近紅外光(980、880 nm)作為激發(fā)光源,發(fā)射光在可見(jiàn)光區(qū)域分布,且具有單激發(fā)多譜帶發(fā)射,具有低的熒光背景值的優(yōu)異特性,特別適合作為復(fù)雜生物樣本中的熒光標(biāo)記物[22]。因此,UCNPs為核酸適配體熒光生物傳感方法的構(gòu)建提供了新的領(lǐng)域。Wu等[23]利用藍(lán)、綠、紅3種UCNPs分別作為金黃色葡萄球菌、副溶血性弧菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌核酸適配體的熒光標(biāo)記,同時(shí)利用互補(bǔ)鏈功能化的磁珠進(jìn)行分離純化,建立了一種基于多色UCNPs的熒光傳感器,實(shí)現(xiàn)了3種食源性致病菌的多重檢測(cè),得到金黃色葡萄球菌、副溶血性弧菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌的最低檢測(cè)限分別為25、10、15 CFU/mL。這種基于UCNPs的核酸適配體熒光生物傳感檢測(cè)方法具有高靈敏、簡(jiǎn)單、高通量檢測(cè)的優(yōu)點(diǎn)。
2.2.5 無(wú)標(biāo)記熒光核酸適配體傳感器 以上描述的熒光標(biāo)記核酸適配體傳感器,都需要熒光基團(tuán)或熒光納米材料對(duì)核酸適配體進(jìn)行熒光標(biāo)記,因此,需要對(duì)標(biāo)記后的分子進(jìn)行復(fù)雜的分離和純化,所以這種標(biāo)記方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力、成本昂貴。因此,開(kāi)發(fā)方便、無(wú)需標(biāo)記的核酸適配體熒光傳感器,實(shí)現(xiàn)沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)非常有研究意義。
雖然SYBR、PicoGreen和AccuBlue等傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料具有弱的熒光強(qiáng)度,但與雙鏈DNA(dsDNA)結(jié)合后,會(huì)產(chǎn)生高的熒光強(qiáng)度,而與ssDNA結(jié)合后,卻沒(méi)有明顯熒光強(qiáng)度變化。DUAN等[24]利用這一特性,建立了一種基于AccuBlue染料的無(wú)標(biāo)記適配體熒光傳感器,實(shí)現(xiàn)了鼠傷寒沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)。其檢測(cè)原理為:當(dāng)沙門(mén)氏菌目標(biāo)物存在于樣本中,核酸適配體與沙門(mén)氏菌專一性結(jié)合,導(dǎo)致cDNA從cDNA-aptamer雙鏈中脫離,因而導(dǎo)致AccuBlue的釋放,熒光強(qiáng)度降低。利用該方法得到了沙門(mén)氏菌的線性檢測(cè)范圍為50~106CFU/mL,最低檢測(cè)限為25 CFU/mL。近年來(lái),Srinivasan等[25]也利用相同的實(shí)驗(yàn)原理,利用SYBR Green I作為熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)了鼠傷寒沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),最低檢出限為733 CFU/mL。此外,Srinivasan等[25]也建立了另外一種檢測(cè)鼠傷寒沙門(mén)氏菌的無(wú)標(biāo)記熒光核酸適配體傳感檢測(cè)方法,該方法利用羅丹明B(Rhodamine B,RB)和GNPs之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(Fluorescence Rresonance Eenergy Transfer,F(xiàn)RET)進(jìn)行沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)。其檢測(cè)原理為:當(dāng)適配體與GNPs與RB混合后,由于FRET,RB熒光被大大淬滅;當(dāng)核酸適配體被吸附到GNPs的表面,以保護(hù)GNPs受鹽誘導(dǎo)發(fā)生聚集現(xiàn)象,而這時(shí)存在的GNPs會(huì)導(dǎo)致RB熒光猝滅。當(dāng)沙門(mén)氏菌目標(biāo)物存在時(shí),適配體與目標(biāo)物專一性結(jié)合,導(dǎo)致GNPs不穩(wěn)定,發(fā)生鹽誘導(dǎo)聚集,進(jìn)而導(dǎo)致淬滅的RB熒光的恢復(fù)。利用這種方法實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),檢測(cè)范圍為1 530~96 938 CFU/mL,最低檢出限為464 CFU/mL。此外,Zhang等[26]建立了一種基于三重觸發(fā)序列可再生鏈取代放大-驅(qū)動(dòng)熒光Ag納米團(tuán)簇的聚集的新型無(wú)標(biāo)記、無(wú)修飾、無(wú)DNA萃取的熒光檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了鼠傷寒沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),線性檢測(cè)范圍為102~107CFU/mL,最低檢測(cè)限為50 CFU/mL。上述這些無(wú)標(biāo)記熒光核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法,不需對(duì)標(biāo)記的復(fù)合物進(jìn)行分離純化,其構(gòu)建過(guò)程相對(duì)簡(jiǎn)單、快速,大大降低了檢測(cè)成本。
SERS已被廣泛應(yīng)用于環(huán)境監(jiān)測(cè)、醫(yī)學(xué)診斷、食品安全等多個(gè)研究領(lǐng)域。SERS技術(shù)具有快速、高靈敏檢測(cè)食源性致病菌的潛力,可為食品安全提供保障。常見(jiàn)的表面增強(qiáng)拉曼散射基質(zhì)有銀納米粒子(AgNPs)、GNPs等重金屬納米材料[27-29]。ZHANG等[30]建立了一種GNPs增強(qiáng)的SERS核酸適配體生物傳感器,實(shí)現(xiàn)了金黃色葡萄球菌和鼠傷寒沙門(mén)氏菌的同時(shí)檢測(cè)。修飾有拉曼分子4-巰基苯甲酸(p-MBA)、5,5’-二硫基(2-硝基苯甲酸)和適配體的GNPs作為信號(hào)探針;固定有沙門(mén)氏菌和葡萄球菌適配體的Fe3O4磁性金納米顆粒(Magnetic Gold Nanoparticles, MGNPs)作為捕獲探針。沙門(mén)氏菌和葡萄球菌目標(biāo)物加入到反應(yīng)體系后,被捕獲探針和信號(hào)探針上的適配體所捕獲,形成三明治結(jié)構(gòu)。最終得到沙門(mén)氏菌和葡萄球菌的的最低檢測(cè)限分別為15、35 CFU/mL。該檢測(cè)方法利用MGNPs進(jìn)行分離純化,因此簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)過(guò)程,且具有高靈敏、高專一性的優(yōu)點(diǎn);但該方法約需3 h才能實(shí)現(xiàn)沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè),因此檢測(cè)時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng)。
近年來(lái),Ma等[31]構(gòu)建了一種基于多刺狀金納米顆粒(Spiny Gold Nanoparticles, SGNPs)的SERS核酸適配體傳感檢測(cè)方法。SGNPs依次經(jīng)4-巰基苯甲酸(p-MBA)和巰基化修飾適配體(SH-Aptamer)進(jìn)行功能化修飾,其中p-MBA作為拉曼信號(hào)分子,巰基修飾的適配體作為SERS探針。此外,被固定在孔板上的生物素修飾的適配體用以專一性識(shí)別和捕獲沙門(mén)氏菌。該方法得到了沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍為101~105CFU/mL,最低檢測(cè)限為4 CFU/mL,檢測(cè)時(shí)間約1 h。該檢測(cè)方法具有超高的檢測(cè)靈敏度和選擇性,還具有低成本、快速、簡(jiǎn)易操作等優(yōu)點(diǎn),且檢測(cè)時(shí)間相對(duì)較短。
Xu等[32]利用DNA組裝的金納米二聚體(Gold Nanodimer,GNDs),建立了一種SERS適配體傳感檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)。其中,適配體(ssDNA1)功能化的35 nm的GNPs作為捕獲探針;Cy3修飾的互補(bǔ)鏈(ssDNA2)功能化的15 nm的GNPs作為信號(hào)探針。拉曼信號(hào)探針與捕獲探針經(jīng)互補(bǔ)的ssDNAs的雜交,形成不對(duì)稱的GNDs。沙門(mén)氏菌目標(biāo)物加入后與適配體專一性結(jié)合,從二聚體復(fù)合物中解離,因此,拉曼信號(hào)強(qiáng)度下降。最后得到沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍在102~107CFU/mL,最低檢測(cè)限為35 CFU/mL。該檢測(cè)方法具有高靈敏、穩(wěn)定、均一的優(yōu)點(diǎn),且其檢測(cè)時(shí)間也相對(duì)較短。
電化學(xué)生物傳感器具有操作簡(jiǎn)單、靈敏度高、攜帶方便、成本低廉等優(yōu)點(diǎn),已成為一種潛在的POCT分析平臺(tái),被廣泛應(yīng)用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)中。其中,電化學(xué)阻抗法可用于檢測(cè)分析物與固定在電極表面的探針?lè)肿酉嗷プ饔煤箅姌O界面性質(zhì)變化,可提供一種快速、靈敏和無(wú)損的分析平臺(tái)。近年來(lái),出現(xiàn)了多種利用電化學(xué)阻抗法檢測(cè)沙門(mén)氏菌的研究報(bào)道。GE等[33]通過(guò)結(jié)合誘導(dǎo)GNPs表面核酸適配體的取代以及滾環(huán)擴(kuò)增(Rolling Circle Amplification, RCA),建立了一種超高靈敏的電化學(xué)阻傳感檢測(cè)方法,并將其用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)中。沙門(mén)氏菌與核酸適配體的異質(zhì)識(shí)別和特異性結(jié)合,會(huì)釋放引物結(jié)合部分,導(dǎo)致在核酸適配體傳感器表面錨定多個(gè)圓形模板;RCA反應(yīng)產(chǎn)生具有多個(gè)串聯(lián)重復(fù)序列的長(zhǎng)DNA分子產(chǎn)物,這些產(chǎn)物可以與適配體傳感器表面的生物素化的檢測(cè)探針雜交,以輸出酶放大的電化學(xué)信號(hào)。該方法得到沙門(mén)氏菌的線性檢測(cè)范圍為2×101~2×108CFU/mL,最低檢測(cè)限為16 CFU/mL。該檢測(cè)方法不需要精密的溫度循環(huán)儀器,具有快速、穩(wěn)健、低成本、高靈敏、高專一性的優(yōu)點(diǎn)。
Muniandy等[34]建立了一種基于還原的氧化石墨烯二氧化鈦(Reduced Graphene Oxide Titanium Dioxider,GO-TiO2)納米復(fù)合材料的適配體傳感器,并將其用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)。通過(guò)靜電作用,無(wú)標(biāo)記的適配體被固定于rGO-TiO2納米復(fù)合材料表面,當(dāng)DNA適配體與沙門(mén)氏菌細(xì)胞結(jié)合后,會(huì)對(duì)電極表面電子的轉(zhuǎn)移產(chǎn)生阻礙;電極表面電導(dǎo)率的改變通過(guò)電分析方法進(jìn)行表征;最后得到沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍為101~108CFU/mL,檢測(cè)時(shí)間約1 h。該方法具有高靈敏、高選擇性、快速、穩(wěn)健的優(yōu)點(diǎn)。
另外,Ranjbar等[35]建立了一種基于納米多孔金(Nano-porous Gold, NPG)作為底物的新型鼠傷寒沙門(mén)氏菌電化學(xué)傳感檢測(cè)方法。采用金銅合金,通過(guò)電化學(xué)方法在Au/GCE表面合成NPG;硫醇功能化適配體通過(guò)自組裝被有效的連接到NPG/Au/GCE表面;最后得到鼠傷寒沙門(mén)氏菌的線性檢測(cè)范圍為6.5×102~6.5×108CFU/mL,定量限檢測(cè)限為65 CFU/mL,最低檢測(cè)限為1 CFU/mL。該適配體生物傳感器具有高靈敏、高選擇性、高重現(xiàn)性的優(yōu)點(diǎn),該方法具有可區(qū)分活菌細(xì)胞和死菌細(xì)胞的重要優(yōu)勢(shì)。
此外,無(wú)標(biāo)記的方法也被應(yīng)用于電化學(xué)核酸適配體生物傳感方法的構(gòu)建中。如Sheikhzadeh等[36]研制了一種基于聚[吡咯-3-羧基-吡咯]共聚物和適配體的無(wú)標(biāo)記電化學(xué)阻抗生物傳感器,并用于鼠傷寒沙門(mén)氏菌的檢測(cè)。適配體與沙門(mén)氏菌的相互作用對(duì)聚[吡咯-3-羧基吡咯]共聚物內(nèi)在的共軛及其隨后的電性能的影響,通過(guò)阻抗進(jìn)行測(cè)定。該方法得到沙門(mén)氏菌的檢測(cè)范圍為102~108CFU/mL,定量檢測(cè)限為100 CFU/mL,最低檢測(cè)限為3 CFU/mL。該無(wú)標(biāo)記電化學(xué)核酸適配體生物傳感檢測(cè)方法,簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)過(guò)程,具有簡(jiǎn)單、快速(約45 min)、低成本、高靈敏的優(yōu)點(diǎn)。
綜上所述,基于比色、熒光、SERS、電化學(xué)等的適配體生物傳感技術(shù)已經(jīng)引起人們的極大關(guān)注,并已被廣泛應(yīng)用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)中。與沙門(mén)氏菌傳統(tǒng)檢測(cè)方法比較,適配體生物傳感技術(shù)具有高靈敏、高專一性、快速等優(yōu)點(diǎn)。目前,比色和熒光檢測(cè)法是適配體生物傳感檢測(cè)中應(yīng)用最廣泛的方法。在熒光傳感檢測(cè)方法中,多種新型納米材料,如量子點(diǎn)、碳點(diǎn)、上轉(zhuǎn)換熒光納米粒子等,都被廣泛應(yīng)用于沙門(mén)氏菌的定量檢測(cè)中。其中,不同發(fā)射波長(zhǎng)的量子點(diǎn)還被用于多種食源性致病菌的高通量檢測(cè)中。雖然這些方法具有特異優(yōu)勢(shì),但也存在需要對(duì)適配體進(jìn)行標(biāo)記的弊端。因而,又出現(xiàn)了多種免標(biāo)記適配體傳感檢測(cè)方法的建立。
核酸適配體生物傳感技術(shù)在沙門(mén)氏菌定量檢測(cè)中存在著巨大挑戰(zhàn)。首先,樣品基質(zhì)的復(fù)雜性。目標(biāo)物的提取和純化相對(duì)比較復(fù)雜繁瑣,且適配體會(huì)非特異性地與樣品基質(zhì)結(jié)合,導(dǎo)致錯(cuò)誤或不精確的結(jié)果的出現(xiàn)。其次,食源性致病菌的多樣性。樣品基質(zhì)中往往會(huì)存在多種食源性致病菌,而目前現(xiàn)有的適配體生物傳感檢測(cè)方法的檢測(cè)對(duì)象還比較單一,因此高通量檢測(cè)也是目前的一大挑戰(zhàn)。最后,目前應(yīng)用于沙門(mén)氏菌定量檢測(cè)的核酸適配體生物傳感技術(shù),還僅限于實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行檢測(cè),不能實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)實(shí)地的快速檢測(cè)。因此,開(kāi)發(fā)與這些生物傳感技術(shù)相匹配的便攜式檢測(cè)儀器,實(shí)現(xiàn)沙門(mén)氏菌的實(shí)時(shí)實(shí)地快速檢測(cè)是另一重大挑戰(zhàn)。