高靜 閻建俠 劉博雅 李正 羅天俠 紀(jì)穎
1 天津市武清區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 (天津 301700)
2 天津市武清區(qū)人民醫(yī)院兒科 (天津 301700)
內(nèi)容提要: 目的:分析肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法與LAMP法用于肺炎支原體檢測(cè)的價(jià)值。方法:選取本院兒科2017年1月~2018年6月收治的疑似肺炎支原體肺炎患兒100例作為研究對(duì)象,分別給予肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法與LAMP法檢測(cè)肺炎支原體,同時(shí)與實(shí)時(shí)熒光定量PCR法做比對(duì),分析兩種檢測(cè)方法的實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間與陽(yáng)性率。結(jié)果:LAMP法檢測(cè)肺炎支原體的實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間短于肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法,陽(yáng)性率高于快速培養(yǎng)法,P<0.05。結(jié)論:LAMP法用于肺炎支原體檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間較短、陽(yáng)性率較高,有很好的應(yīng)用前景。未來(lái)應(yīng)加深對(duì)LAMP法檢測(cè)肺炎支原體的研究,克服檢測(cè)中的困難,擴(kuò)大LAMP法檢測(cè)肺炎支原體的應(yīng)用范圍。
肺炎支原體(Mycoplasma pneumoniae,MP)是人肺炎支原體肺炎的病原體。有研究表明,肺炎支原體有一定的傳染性,是引起兒童呼吸道感染的常見(jiàn)病原體之一。臨床表現(xiàn)具有多樣性,多為劇烈咳嗽、發(fā)熱、畏寒、頭痛、咽痛,以上呼吸道感染、支氣管肺炎最為常見(jiàn),一些患者由上呼吸道感染可發(fā)展至重癥肺炎[1]。肺炎支原體感染是支原體肺炎的重要表現(xiàn)因素,是急性呼吸道感染的常見(jiàn)病原體。近年來(lái),肺炎支原體感染的發(fā)病率呈增高趨勢(shì),因其臨床表現(xiàn)無(wú)特異性,易與細(xì)菌性和病毒性感冒混淆,故早期的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)對(duì)臨床診治具有重要意義[2]。本研究納入2017年1月~2018年6月本院兒科收治的疑似肺炎支原體患兒100例作為研究對(duì)象,同時(shí)給予肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法、LAMP法進(jìn)行檢測(cè),并與實(shí)時(shí)熒光PCR法比對(duì),現(xiàn)將具體資料及研究結(jié)果報(bào)告如下。
病歷來(lái)源為本院兒科2017年1月~2018年6月收治的疑似肺炎支原體肺炎患兒100例,其中男童62例,女童38例,年齡4個(gè)月~11歲,平均(5.04±1.44)歲。所有患兒家長(zhǎng)對(duì)本研究知情同意。
(1)納入標(biāo)準(zhǔn):具有發(fā)熱(體溫≥38°C),伴咳嗽或咽痛等呼吸道感染癥狀,病程在7d以內(nèi),以社區(qū)獲得性肺炎或肺炎支原體肺炎為主。
(2)排除標(biāo)準(zhǔn):患有肺結(jié)核、肺部腫瘤、非感染性肺間質(zhì)性疾病、肺水腫、肺不張、肺栓塞、肺嗜酸性粒細(xì)胞浸潤(rùn)癥及免疫功能低下等患兒。
1.3.1 樣品與試劑
MP陽(yáng)性質(zhì)粒、100例臨床標(biāo)本;
DNA提取試劑盒(德國(guó)凱杰生物公司);
FLUO-LAMP反應(yīng)液(Master Mix,弗羅朗生物科技有限公司);
MP引物(英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成);
肺炎支原體(MP)核酸檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法,上海復(fù)興長(zhǎng)征醫(yī)學(xué)科學(xué)有限公司);
肺炎支原體快速培養(yǎng)法試劑盒(武漢菁華時(shí)間科技有限公司)。
1.3.2 儀器
恒溫?cái)U(kuò)增熒光PCR儀(FLUO-GENE,弗羅朗生物科技有限公司);
小型離心機(jī)(弗羅朗生物科技有限公司);
實(shí)時(shí)熒光PCR儀(LC480,羅氏)。
1.4.1 快速培養(yǎng)法。棉拭子吸附生理水在患兒喉深部捻轉(zhuǎn)數(shù)次,肺炎支原體對(duì)細(xì)菌表面有很強(qiáng)的親和力,應(yīng)盡可能收集到更多樣本。采用肺炎支原體的檢測(cè)試劑盒,按說(shuō)明書將呼吸道咽拭子放置于培養(yǎng)基瓶?jī)?nèi)攪動(dòng),靠瓶壁擠盡殘液,旋緊瓶蓋后放置于37°C溫箱培養(yǎng),6~12h內(nèi)觀察結(jié)果,試劑顏色由紅色變?yōu)榍辶咙S色則為陽(yáng)性,試劑顏色為紅色、淡紅色則為陰性[3]。
1.4.2 LAMP法。利用MP陽(yáng)性質(zhì)粒核酸,按10倍梯度稀釋,重復(fù)實(shí)驗(yàn),選擇可檢出的最低濃度;將引物濃度由原工作濃度逐漸增加,利用低濃度陽(yáng)性核酸重復(fù)實(shí)驗(yàn),選擇最佳引物濃度,優(yōu)化反應(yīng)效率。使用專用一次性咽拭子采集管進(jìn)行標(biāo)本收集,DNA提取采用專用MP-DNA提取試劑盒。LAMP檢測(cè)樣本,按以下條件進(jìn)行恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng):
反應(yīng)體系(25μL):F3 1μL,B3 1μL,F(xiàn)IP 1μL,BIP 1μL,LF1μL,LB 1μL,Master Mix 15μL,模板4μL。
反應(yīng)溫度:63~65°C,退火溫度(Anneal):98~80°C。每次反應(yīng)除檢測(cè)樣本外,同時(shí)設(shè)置質(zhì)控系統(tǒng),進(jìn)行陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。通過(guò)對(duì)比陽(yáng)性對(duì)照與陰性對(duì)照、觀察溶解曲線的峰值來(lái)確定反應(yīng)的準(zhǔn)確性。
1.4.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)樣本
參照MP核酸檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行反應(yīng),同時(shí)進(jìn)行陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。
采用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件SPSS 20.0進(jìn)行數(shù)據(jù)分析處理,計(jì)量資料以±s表示,進(jìn)行t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以(n,%)表示,采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
表1. 兩種方法檢測(cè)結(jié)果與實(shí)時(shí)熒光定量PCR法對(duì)比(例)
表2. 快速培養(yǎng)法與LAMP法檢測(cè)結(jié)果(例)
肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法的實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間為6~12h,平均(7.41±0.91)h;LAMP法的實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間為0.25~1h,平均(0.70±0.11)h;t=9.972,P<0.05。
使用兩種方法分別檢測(cè)100例標(biāo)本,同時(shí)與實(shí)時(shí)熒光定量PCR法比對(duì),檢測(cè)結(jié)果如表1所示。
由于方法學(xué)差異等原因,兩種檢測(cè)結(jié)果存在不一致。肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法與LAMP法檢測(cè)結(jié)果差異如表2所示。
快速培養(yǎng)法檢測(cè)肺炎支原體的陽(yáng)性例數(shù)為18例,陽(yáng)性率為18%;LAMP法檢測(cè)肺炎支原體的陽(yáng)性例數(shù)為34例,陽(yáng)性率為34%;χ2=8.775,P<0.05。
我們將實(shí)時(shí)熒光定量PCR法作為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比對(duì):LAMP法與實(shí)時(shí)熒光定量PCR法進(jìn)行檢測(cè),只有一個(gè)結(jié)果出現(xiàn)偏差;快速培養(yǎng)法檢測(cè)的陽(yáng)性例數(shù)較低,且陽(yáng)性的18例標(biāo)本中只有10例與LAMP法和實(shí)時(shí)熒光PCR法結(jié)果一致,這其中真菌和耐藥菌是快速培養(yǎng)法假陽(yáng)性最主要的因素。此外,標(biāo)本的采集、口腔中食物殘?jiān)八嵝燥嬃弦矔?huì)影響快速培養(yǎng)法的結(jié)果判定。肺炎支原體檢測(cè)試劑盒快速培養(yǎng)法檢測(cè)陰性,而LAMP法和實(shí)時(shí)熒光PCR法陽(yáng)性,主要是由于PCR的檢出率相對(duì)較高,猜測(cè)可能與標(biāo)本的采集、肺炎支原體的攜帶等有關(guān)。
肺炎支原體常存在于纖毛上皮細(xì)胞之間,不侵入肺實(shí)質(zhì),可通過(guò)細(xì)胞膜上神經(jīng)氨酸受體點(diǎn)位吸附于機(jī)體呼吸道上皮細(xì)胞表面,抑制纖毛活動(dòng)、破壞上皮細(xì)胞,繼而引發(fā)支氣管炎、肺炎等疾病[4]。肺炎支原體感染發(fā)病初期癥狀并無(wú)顯著特異性,更多表現(xiàn)為急性呼吸道感染、氣管支氣管炎等,有時(shí)合并其他并發(fā)癥,發(fā)病初期易因用藥不當(dāng)而延誤治療。肺炎支原體常見(jiàn)的實(shí)驗(yàn)室診斷方法有培養(yǎng)法、PCR檢測(cè)、肺炎支原體快速培養(yǎng)、血清抗體檢測(cè)法等?;诜窝字гw檢測(cè)試劑盒的肺炎支原體病原體培養(yǎng)檢測(cè)是目前肺炎支原體檢驗(yàn)的金標(biāo)準(zhǔn),其原理為在培養(yǎng)基中添加適合肺炎支原體自身的生長(zhǎng)因子刺激肺炎支原體大量增殖,對(duì)培養(yǎng)基中特異性代謝產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè),進(jìn)一步鑒別肺炎支原體。但這種方法實(shí)驗(yàn)條件苛刻、生長(zhǎng)緩慢、耗時(shí)較長(zhǎng)[5]。近年來(lái),肺炎支原體快速培養(yǎng)法不斷發(fā)展并在臨床中獲得廣泛應(yīng)用,其原理在于利用培養(yǎng)基中快速生長(zhǎng)因子進(jìn)行增殖分解糖類產(chǎn)生氫離子使培養(yǎng)基中pH值下降,然后觀察培養(yǎng)基中酚紅指示劑即可判斷肺炎支原體生長(zhǎng)情況。當(dāng)患者感染肺炎支原體后會(huì)刺激機(jī)體B細(xì)胞產(chǎn)生相應(yīng)IgM和IgG抗體,通過(guò)血清學(xué)檢測(cè)方法檢測(cè)肺炎支原體一般有冷凝集試驗(yàn)、酶聯(lián)免疫吸附反應(yīng)、補(bǔ)體結(jié)合試驗(yàn)、間接免疫熒光法、被動(dòng)顆粒凝集法、金標(biāo)法等幾種方式,但在肺炎支原體感染初期一般僅發(fā)生局部免疫,不伴隨體液免疫反應(yīng),故該方法不能在肺炎支原體感染初期起到檢測(cè)目的,在感染急性期作用較好[6]?;跓晒釶CR儀的PCR檢測(cè)即聚合酶鏈反應(yīng),是一種分子基因檢測(cè)方法,現(xiàn)在已廣泛用于肺炎支原體的檢測(cè)。常規(guī)PCR檢測(cè)選取患者的咽拭子、痰液、肺部灌洗液等作為樣本,并在瓊脂糖凝膠電泳中直觀分析結(jié)果。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化的一種方法,該方法與常規(guī)PCR方法相比較檢測(cè)特異性較好,自動(dòng)化程度較高,可對(duì)微量病原體進(jìn)行檢測(cè)。但PCR檢測(cè)設(shè)備昂貴,技術(shù)要求較高。
LAMP法,英文名為L(zhǎng)oop-mediated isothermal ampli fication,即環(huán)介導(dǎo)恒溫PCR。作為一種新的基因診斷技術(shù),LAMP法針對(duì)目標(biāo)基因DNA或cDNA在6個(gè)不同區(qū)域設(shè)計(jì)4條引物,利用恒溫聚合酶(BstDNA聚合酶),在60~65°C恒溫下完成擴(kuò)增。利用LAMP法1h內(nèi)即可完成擴(kuò)增109~1010個(gè)數(shù)量級(jí)。LAMP法檢測(cè)肺炎支原體的原理在于以核酸分子體外擴(kuò)增技術(shù)為基礎(chǔ),該方法與PCR技術(shù)相似,但不依賴昂貴的儀器設(shè)備,因此非常適合基層實(shí)驗(yàn)室病原微生物的檢測(cè)。與PCR技術(shù)相比較,LAMP法多2條引物。引物設(shè)計(jì)方面,LAMP法需保證在不同的6個(gè)區(qū)域結(jié)合目的DNA進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間通常為15~60min,一般30min內(nèi)即可完成,判斷結(jié)果時(shí)直接通過(guò)擴(kuò)增曲線和溶解曲線即可判斷。本組研究中快速培養(yǎng)法的平均實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間(7.41±0.91)h;LAMP法平均實(shí)驗(yàn)反應(yīng)時(shí)間為(0.70±0.11)h,P<0.05,表明LAMP法檢測(cè)肺炎支原體在實(shí)驗(yàn)時(shí)間方面更具優(yōu)勢(shì)。本組研究中LAMP法檢測(cè)肺炎支原體,以MP陽(yáng)性質(zhì)粒核酸為樣本,在選擇引物序列、提高引物濃度和反應(yīng)溫度等條件上進(jìn)行優(yōu)化,使反應(yīng)效率最佳。為了使檢測(cè)結(jié)果真實(shí)可靠,每次實(shí)驗(yàn)均設(shè)置質(zhì)量控制、陽(yáng)性對(duì)照、陰性對(duì)照以監(jiān)測(cè)反應(yīng)流程,避免出現(xiàn)假陰性和假陽(yáng)性結(jié)果。結(jié)果顯示,LAMP法檢測(cè)肺炎支原體陽(yáng)性率高于快速培養(yǎng)法。目前LAMP法廣泛用于人、動(dòng)物、植物的病原體檢測(cè),如禽流感、艾滋病、SARS等,且很多公司已合成出專業(yè)的試劑盒,可在短時(shí)間內(nèi)檢測(cè)出相關(guān)病原體。現(xiàn)階段在國(guó)外已有很多研究者利用LAMP法檢測(cè)肺炎支原體。盡管LAMP法檢測(cè)肺炎支原體發(fā)展時(shí)間較短,但技術(shù)特點(diǎn)鮮明,特異性高,總耗時(shí)長(zhǎng)短。
本課題所建立的方法在保證特異性強(qiáng)、靈敏度高的基礎(chǔ)上,操作更簡(jiǎn)便,對(duì)環(huán)境要求相對(duì)較低。在經(jīng)過(guò)優(yōu)化反應(yīng)并檢測(cè)樣本核酸后,發(fā)現(xiàn)樣本中核酸濃度高時(shí)(>=300cps/μL)本方法檢測(cè)時(shí)間只需20~30min,而樣本核酸濃度較低(<300cps/μL)本方法檢測(cè)時(shí)間需要1h才可完成,這是近期亟待解決的問(wèn)題之一。使用分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù),需要從樣本中提取核酸,有效的提取才能保證之后的成功檢驗(yàn)。因此,未來(lái)希望能實(shí)現(xiàn)核酸簡(jiǎn)單高效提取方法,甚至可以和擴(kuò)增反應(yīng)同時(shí)進(jìn)行。相信隨著臨床研究的深入以及檢測(cè)技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展,一定能夠更加準(zhǔn)確、快速地診斷并有效治療肺炎支原體感染。