馬 晶,孫柳柳,馬文囡,陶義芬,陳 蘊,朱瑞宇,金 堅
(江南大學 藥學院,江蘇 無錫 214122)
小鼠骨肉瘤病毒癌基因同源物B(FBJmurine osteosarcoma viral oncogene homolog BFOSB或FOSB)是Fos轉錄因子家族的一員,與細胞的增殖、分化、轉化及腫瘤發(fā)生密切相關。Fos家族包括4種轉錄因子:FOS、FOSB、FOSL1和FOSL2, 這些基因能夠編碼亮氨酸拉鏈蛋白,與其它蛋白質形成同源或異源二聚體,二聚體與靶基因的堿性激活因子-1(Activatingprotein-1,AP-1)結合,以調節(jié)靶基因的表達[1]。FOSB基因的蛋白質產物除全長的FOSB外,還存在一個在C端比FOSB短101個氨基酸殘基的DeltaFOSB蛋白[2],它是一種FOSB的較短的剪切形式,但比FOSB更為穩(wěn)定,在治療慢性上癮癥狀中扮演著重要的角色[3-6]。而FOSB基因不僅與藥物成癮相關,也與乳腺癌和卵巢癌的發(fā)生有關,在誘導因子的作用下會引起三陰性乳腺癌細胞的死亡[7-9]。最近研究發(fā)現,FOSB基因有望成為血管內皮瘤細胞及胃癌細胞的有效生物標記物[10-11],而對FOSB基因蛋白表達調控機制的研究,很少報道。
真核生物中經典的翻譯機制是帽依賴型的翻譯起始機制,需要mRNA上的帽子結構和真核翻譯起始因子來招募核糖體進而起始翻譯。然而在病毒中,存在著另一種更為高效的翻譯起始機制,即非帽依賴型翻譯起始機制,其mRNA并沒有帽子結構,核糖體的40S小亞基直接通過識別mRNA序列結構或mRNA的5’非翻譯區(qū)(5’UTR)起始翻譯。其mRNA 5’UTR上核糖體能識別的序列稱為內部核糖體進入位點((internal ribosme entry site,IRES)[12]。事實上,在真核生物中,也已發(fā)現許多轉錄因子的mRNA具有IRES活性,而這些轉錄因子大多與細胞增殖、分化、凋亡以及細胞耐藥等有關,如血管內皮生長因子 (Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)[13]、NF-κB 抑 制 因 子 (NF-κB repressing factor,NRF)[14]、原癌基因 c-myc[15]、DNA 損傷結合蛋白 2(DNA damage-binding protein 2,DDB2)[16]、核糖體結合蛋白 1(Ribosome Binding Protein 1,RRBP1)[17]等。而已發(fā)現的IRES元件通常5’UTR偏長、GC含量豐富、二級結構復雜。FOSBmRNA 5’UTR符合上述IRES的基本特征,作者將FOSBmRNA 5’UTR的基因序列插入到研究IRES活性常用的雙熒光素酶報告質粒(pRL-FL)中,檢測其是否有IRES活性并初步探究其IRES的結構與功能。
在實驗室初期構建并保存真核表達載體即雙熒光素酶報告載體pRL-FL以及去啟動子載體pRL-FL△SV40;大腸桿菌DH5a:天根生化科技有限公司;DNA限制性內切酶NdeⅠ和EcoRⅠ:Fermantas公司;T4 DNA連接酶和prime STAR HS DNA聚合酶:TaKaRa公司;重組質粒pRL-FOSBFL:作者構建;重組質粒pRL-c-myc-FL:中美泰和購買,DMEM、RPMI1640培養(yǎng)基和胎牛血清:美國Gibco公司;人胚腎細胞HEK293、人卵巢癌細胞A2780/WT、人結腸癌細胞HCT-8/WT、人肝癌細胞Bel-7402/WT及宮頸癌細胞Hela/WT:均保存于作者所在實驗室的液氮罐中;紫杉醇,順鉑藥物:Sigma公司;LipofectamineTM 2000:美國Invitrogen公司;雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒(Dual?Luciferase Reporter Assay System):美國Promega公司;其他試劑均為分析純試劑。
FOSB 5’UTR cDNA 序列 (NM_001114171)由生工生物工程(上海)有限公司合成,合成序列含有NdeⅠ和EcoRⅠ酶切位點。FOSB5’UTR的全長基因序列和實驗所需的各截短基因序列均以重組質粒pRL-FOSB-FL為模板進行擴增,在SV40啟動子的載△pRL-FL上插入FOSB5’UTR的全長基因序列,構建△pRL-FOSB-FL;同時又載體pRL-FL上插入各截短片段,構建出的截短片段的重組質粒分別為 pRL-FOSB-J1-FL (-376 to-1)、pRL-FOSBJ2-FL(-592 to-217)、pRL-FOSB-J3-FL(-592 to-377)、pRL-FOSB-J4-FL (-188 to-1)、pRL-FOSBJ5-FL(-377 to-217)。將各重組質粒轉化到感受態(tài)大腸桿菌Escherichia coliDH 5a中,涂板搖菌后,將菌液送至生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序,質粒截短PCR所用引物見表1,其中下劃線是NdeI和EcoRI的酶切位點和保護堿基。引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
表1 構建截短質粒PCR所用引物序列Table 1 Oligonucleotide primers used in PCR for deletion plasmids construct
人胚腎細胞HEK293、人卵巢癌細胞A2780/WT、人宮頸癌細胞Hela/WT培養(yǎng)于DMEM完全培養(yǎng)基(加10%的血清),而肝癌細胞Bel-7402/WT和結腸癌細胞HCT-8/WT培養(yǎng)于RPMI 1640完全培養(yǎng)基(加10%的血清),待細胞長至80%~90%時,用胰酶消化傳代,待細胞再次長至80%~90%時,鋪細胞于24孔板,鋪板后第二天加入100 uL的opti-MEM,1 ug的質粒以及 2 uL的 LipofectamineTM 2000混勻,孵育25 min,加入已換好液的24孔板中,培養(yǎng) 18~24 h后將細胞用 1×PLB(Passive Lysis Buffer)裂解,收于-80℃待用。
在24孔板中鋪細胞(70%~80%),細胞貼壁后(16~24 h)將質粒轉染進細胞中,24 h后取出24孔板,用PBS洗兩遍,可輕微振蕩,并用槍頭將殘留PBS 吸干,加 100 uL 1×PLB(Passive Lysis Buffer)到每個孔中去裂解細胞,并在搖床上充分裂解15 min后,用槍頭吹打板底并收集細胞裂解液,將待檢樣置于-80℃中保存。對雙熒光素酶的活性檢測時,準備干凈的Corning Costar 96孔白板,先加入20 uL的細胞裂解液,接著將加過裂解液的孔板放在GloMaxTM_96孔板發(fā)光檢測儀上,然后加入100 uL的螢火蟲熒光素酶底物(LARⅡ),在充分混合后迅速地測定其熒光值,最后加入100 uL的反應終止液海腎熒光素酶底物(Stop&Glo?reagent),使之充分混勻后,再測其熒光值。IRES的活性以螢火蟲熒光素酶活性與海腎熒光素酶活性的比值表示(即Fluc/Rluc)。
本研究所有的數據均用GraphPad Prism 5.0軟件分析,統計數據采用SEM表示,組間比較采用Student t檢驗分析統計學差異。 *:P<0.05;**:P<0.005;***:P<0.000 5。
在NCBI里搜索FOSB序列發(fā)現,FOSB序列較長(592 bp)(見圖 1(a))且 GC 含量偏高(56.5%),在各種族間序列同源性較高達到55.74%(見圖1(b))。而用RNA Folding Form模擬其二級結構(見圖 1(c)),可以看出 FOSB 5′UTR 可以形成穩(wěn)定且復雜的二級莖環(huán)結構(ΔG=-202.87 kcal/mole),存在潛在的IRES元件。
FOSBmRNA 5’UTR是否含有 IRES活性,目前仍要借用工具質粒,而檢測mRNA是否有IRES元件,國際上較為通用的是雙順反子報告載體的方法,由帽依賴型機制來起始載體中的第一個順反子翻譯,在載體上游順反子的3’端和下游順反子的5’端間插入有潛力的IRES元件,來介導下游順反子的翻譯[18]。而本研究中用到的雙熒光素酶報告載體,上游是螢火蟲熒光素酶(FL),下游是海腎熒光素酶(RL)。如圖2(a)所示,在RL和FL之間有許多克隆位點,將基因目的片段克隆到I兩個酶切位點(NdeI和EcoR)之間,通過兩個熒光素酶活性比值的大小,來判斷目的基因是否具有IRES活性,如FL比RL的活性較高時,可初步認為該目的基因有潛在的IRES元件。作者將FOSB5’UTR序列和陽性對照c-myc 5’UTR序列分別插入到報告載體pRL-FL兩個閱讀框中間構建目的載體pRLFOSB-FL、pRL-c-myc-FL(圖 2(b)),其中陽性對照與陰性對照分別是pRL-c-myc-FL與pRL-FL。然后將這三種質粒分別轉染進人胚腎細胞HEK293中,收集細胞裂解液,24 h后,接著通過雙熒光素酶分析實驗得到Fluc/Rluc的值。結果pRL-FOSB-FL活性遠大于陰性質粒(***,P<0.000 5),且與陽性質粒pRL-c-myc-FL活性相似,初步確定FOSBmRNA 5’UTR中存在假定的IRES元件。
雖然雙熒光素酶報告基因檢測系統已相對成熟,但如果插入的檢測序列中有內部啟動子,就會在細胞內形成含有下游螢火蟲熒光素酶的單順反子mRNA的存在,從而影響實驗結果的判斷。為了排除這種潛在的可能性,于是將載體pRL-FL中的SV40啟動子刪除,從而得到新的載體ΔpRL-FL(圖2(c)),接著仍將FOSBmRNA 5’ UTR 基因克隆到這個載體的兩個酶切位點(NdeI和EcoRI)之間,如FL有高表達,則目的基因中有隱含啟動子,反之沒有內部啟動子。將FOSB克隆到載體△pRL-FL上得到△pRL-FOSB-FL,分別將pRL-FOSB-FL與△pRL-FOSB-FL瞬轉染入人胚腎細胞HEK293中,24 h后收集細胞并充分裂解,通過1.5實驗步驟可得 Fluc/Rluc的值。如圖 2(d)所示,△pRL-FOSBFL的RL與FL值均遠小于pRL-FOSB-FL的值(***,P<0.000 5),所以FOSB不含有內部啟動子,進一步證明FOSBmRNA 5’UTR具有IRES活性。
圖1 FOSB mRNA 5’UTR序列與結構分析Fig.1 Sequence and structure analysis of FOSB mRNA 5’UTR
對FOSB 5’UTR IRES元件活性中心域的的探究,通過RNA Folding Form軟件來模擬FOSBmRNA 5’UTR全長序列的二級結構,并對其二級結構進行分析,分別構建了5個截短質粒:pRLFOSB-J1-FL(-376 to-1)、pRL-FOSB-J2-FL(-592 to-217)、pRL-FOSB-J3-FL (-592 to-377)、pRLFOSB-J4-FL(-188 to-1)、pRL-FOSB-J5-FL(-377 to-217)。將pRL-FOSB-FL以及各截短質粒瞬轉染入人胚腎細胞HEK293與肝癌細胞Bel-7402中,24 h后收集細胞裂解液用于測定Fluc/Rluc(見圖3(a)),兩種細胞的測活結果基本一致。首先從5’端開始截短,發(fā)現-376至-1活性僅降為全長活性的75%左右,說明5’端可能對其活性貢獻較大;繼續(xù)截短發(fā)現在-188至-1活性降為全長的21%~30%,猜測可能中間片段對其IRES活性貢獻更大;為了驗證其3’端的重要性,對3’端進行截短,發(fā)現-592至-377活性下降了75%左右,證明3’端對其IRES活性確實重要,但是截到-217(即-592至-217)時活性又增加到全長的60%左右,懷疑其活性中心序列可能是位于中間的-376至-217,并將該片段插入到雙順反子載體pRL-FL中。如圖3(b)所示,截短質粒-376至-217與全長活性相比,展現出為全長活性的70%~85%,從而判斷確定其IRES活性中心為-376至-217,即-376至-217對最高活性的貢獻較大。結果顯示FOSB mRNA 5’端非翻譯區(qū)-376至-217序列可能是其IRES活性重要活性區(qū)域,而其兩端序列可能抑制其IRES的活性。
圖2 FOSB mRNA 5'UTR IRES活性初步確定Fig.2 Activity of FOSB mRNA 5'UTR IRES preliminary determined
從上述實驗不難發(fā)現,FOSBmRNA 5’UTR在HEK293細胞與Bel-7402/WT細胞中IRES活性不同,其中在肝癌細胞Bel-7402/WT中活性較高。為了繼續(xù)探究其IRES活性在癌細胞中是否是異常表達,作者將重組質粒pRL-FOSB-FL轉染進另外3株癌細胞包括人卵巢癌細胞A2780/WT、人結腸癌細胞HCT-8/WT、人宮頸癌細胞Hela[19]。24 h后收集細胞裂解液,測定螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶的活性并計算其比值(Fluc/Rluc)。如圖4所示,在不同細胞中FOSBmRNA 5’UTR IRES活性有著明顯的區(qū)別,其中與HEK293細胞相比,A2780/WT中的活性較高(***,p<0.000 5),Hela 與 Bel-7402/WT細胞的活性也高于 HEK293 細胞(*,p<0.05;**,p<0.005)。而大多數文獻報道[20],IRES的活性與細胞中 IRES 結合蛋白(IRES trans-acting factors,ITAFs)的表達量有密切關系,可能在這些癌細胞中,其ITAFs表達量較高,這需要進行進一步的研究。
圖3 重組質粒pRL-FOSB-FL及其截短轉染細胞的IRES的相對活性Fig.3 Relative IRES activities of cells transfected with recombinant plasmids pRL-FOSB-FL and its deletions
將重組質粒pRL-FOSB-FL轉染進肝癌細胞Bel-7402/WT中24 h以后,分別用藥物紫杉醇(PTX)和順鉑(DDP)處理細胞,PTX 的使用質量濃度分別為 0、0.25、0.5 ug/mL,DDP 的使用質量濃度為 0、0.5、1 ug/ml),加藥培養(yǎng) 18 h,在兩種藥物中,隨著藥物質量濃度的增加,其IRES活性均呈現逐漸上升的趨勢,見圖5。說明IRES作為一種應激翻譯起始機制,在藥物刺激下FOSBIRES活性會增加,另外在紫杉醇刺激下比順鉑更為明顯 (*,p<0.05;**,p<0.005),可能與藥物不同的作用機制相關。
圖4 重組質粒pRL-FOSB-FL轉染各個細胞的熒光素酶的相對活性Fig.4 Rletive luciferase activity of pRL-FOSB-FL in various cell lines.(*,p <0.05;**,p <0.005;***,p <0.000 5;student t test).The expression data are presented asthemean + SEM oftriplicate samples
圖5 細胞壓力條件對Bel-7402細胞中FOSB IRES活性的影響Fig.5 FOSB IRES activity in Bel-7402 cells during different cell stress (*,p<0.05;**,p<0.005;***,p<0.000 5;student t test).The expression data are presented asthemean + SEM oftriplicate samples
在真核生物內環(huán)境穩(wěn)定狀態(tài)下大多以帽依賴型機制進行翻譯,而真核細胞處于細胞壓力條件(低氧、饑餓、藥物刺激),此時細胞的生長、分化及凋亡會使細胞的穩(wěn)態(tài)迅速打亂。這時帽依賴的翻譯效率會降低,而此時IRES介導的翻譯卻會增加,進而使細胞繼續(xù)維持穩(wěn)態(tài)環(huán)境。FOSB作為立早基因中的一員,在多種刺激后會立即表達,從而產生不同的轉錄因子,進而調控其他基因的轉錄與表達來維持細胞的生長、發(fā)育和分化[21]。最新的報道顯示,FOSB基因在抗癌藥物的刺激下在細胞增殖速率增加[22],故作者在研究FOSBmRNA 5'UTR活性的同時,對其進行加藥刺激,發(fā)現其不僅具有IRES活性,并且其在抗癌藥物(紫杉醇和順鉑)刺激下IRES活性增加,這或許與IRES是一種應激翻譯機制,能夠維持IRES在細胞壓力條件下的基本表達密切相關。另外FOSB/ΔFOSB作為慢性成癮的關鍵分子轉換機制,在成癮藥物慢性刺激后出現累積現象,并表現出獨特的高度穩(wěn)定性[23],這暗示著FOSBmRNA 5'UTR的IRES活性可能與其在藥物刺激下的穩(wěn)定表達有關。
據文獻報道,具有IRES活性的RNA有以下特征:1)富含 GC 堿基;2)較長的 5'UTR;3)二級結構較復雜。決定IRES功能的因素是IRES元件的序列結構以及其反式作用因子(ITAFs),故IRES元件研究的熱門總是去尋找其序列結構抑或者機制上的共性。而作者通過截短分析發(fā)現了FOSBmRNA 5'UTR IRES活性中心位于其5'UTR的-376至-217之間,并通過將該片段連接到雙順反子載體再次驗證-376至-217的IRES活性。相較于國內外已報道的細胞內的IRES元件,FOSBIRES元件在序列與結構上相似度均不高,但是通過在NCBI里面進行序列搜索,并在DNAMAN中對其物種間同源性進行比對,發(fā)現種族間相似性達55%以上,其同源性位置包括其活性中心,IRES的活性序列位于FOS基因種族保守序列中,這間接說明了FOSBIRES序列的保守性,暗示IRES元件在Fos家族中具有相對穩(wěn)定性。
FOSB/Delta FOSB與藥物成癮的機制研究較多,而其與腫瘤形成的機制鮮少提到,其實FOSB與乳腺癌和卵巢癌的形成密切相關,而目前的研究顯示,在FOSB基因在乳腺癌、卵巢癌、胃癌及肺癌等多種癌細胞中發(fā)揮重要的作用,這或使FOSB基因成為某些腫瘤的診斷標志物,用于腫瘤的預防。而本研究中選用不同的癌細胞測其IRES活性,發(fā)現FOSBIRES活性在不同的癌細胞中明顯不同,在卵巢癌細胞中活性較高,這為其成為腫瘤診斷標志物提供了另一種思路。