于平水

摘要：基因測序是腫瘤精準(zhǔn)治療實(shí)現(xiàn)必要環(huán)節(jié)，科研人員以及醫(yī)務(wù)工作者可以利用基因測序數(shù)據(jù)、個體病癥以及藥物分子信息等資料，從分子層面對疾病的發(fā)生機(jī)理進(jìn)行分析，進(jìn)而提高治療用藥的精準(zhǔn)性。精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)就是在現(xiàn)代醫(yī)藥科技的基礎(chǔ)上建立的，將相關(guān)理論應(yīng)用于腫瘤的臨床治療中，可以盡可能避免誤診和誤用藥的情況，進(jìn)而提高腫瘤的治愈率。針對于此本文就基因測序的工作方式和在腫瘤精準(zhǔn)治療中的具體應(yīng)用進(jìn)行了分析。

關(guān)鍵詞：基因測序 腫瘤精確治療 應(yīng)用

腫瘤精準(zhǔn)治療是在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)理念下，根據(jù)疾病產(chǎn)生的分子機(jī)理對其進(jìn)行分類和治療，相較于傳統(tǒng)依據(jù)癥狀分類的方式其準(zhǔn)確性更高，可以減少用藥失誤的出現(xiàn)。基因測序?yàn)槟[瘤基因組項(xiàng)目的實(shí)施創(chuàng)造了條件，促進(jìn)了腫瘤精準(zhǔn)治療的實(shí)現(xiàn)。目前基因測序已經(jīng)在遺傳性疾病診斷、腫瘤基因檢測等臨床領(lǐng)域得到了廣泛的實(shí)踐，并且取得了良好的成效。分析基因測序在腫瘤精準(zhǔn)治療中的應(yīng)用對于疾病的個性化治療和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)展都有積極的意義。

一、基因測序概述

不同科技企業(yè)所開發(fā)的基因測序平臺的原理、應(yīng)用方法和應(yīng)用范圍都存在一定的差異，常見的包括以焦磷酸測序?yàn)榛A(chǔ)的Roche 454測序儀、邊連接邊測序的SOLiD 平臺、基于橋式PCR擴(kuò)增模板片段的HiSeq平臺等。

基因測序的工作方式包括四種：一是人全基因組測序（whole genomic sequencing， WGS），該方法所得到的基因組信息最為全面，但是需要更多的時間和更高的成本;二是全外顯子組測序（whole exome sequencing， WES），該方法是對基因組中最容易發(fā)生的編碼蛋白序列信息進(jìn)行收集和分析，通過與基因數(shù)據(jù)庫中相關(guān)信息的比較判斷變異的具體位置，該方法在臨床醫(yī)學(xué)中具有較高的實(shí)用性;三是定向區(qū)域測序，就是根據(jù)實(shí)際的需求對基因組合中特定區(qū)域進(jìn)行測序，在測序前需要先采用雜交及PCR技術(shù)富集測序目標(biāo)區(qū)基因片段;四是RNA測序，區(qū)別于DNA的固定序列檢測，該方法是檢測細(xì)胞處于特定狀態(tài)下的轉(zhuǎn)錄體組合情況，該方法可以應(yīng)用于臨床腫瘤精準(zhǔn)治療中，對病變腫瘤細(xì)胞的基因突變、表達(dá)和融合信息進(jìn)行監(jiān)測，了解腫瘤的發(fā)生機(jī)制，從而為相關(guān)藥物的研發(fā)和使用提供依據(jù)。利用RNA測序可以檢測到實(shí)體腫瘤和血液系統(tǒng)腫瘤的融合基因、熒光原位雜交以及ncRNA分子等。

二、基因測序的實(shí)際應(yīng)用

2.1腫瘤診斷中的應(yīng)用

細(xì)胞DNA惡性突變是腫瘤產(chǎn)生的主要原因，腫瘤具有遺傳相關(guān)性，通過對腫瘤細(xì)胞基因組的測序，并通過相關(guān)信息的解析和比對可以為腫瘤精準(zhǔn)治療提供重要的依據(jù)。利用基因測序技術(shù)可以對大部分腫瘤轉(zhuǎn)移灶來源進(jìn)行確定，盡管部分腫瘤的原發(fā)灶無法利用基因測序明確，但是仍然可以通過該技術(shù)判斷出病變細(xì)胞的發(fā)生具體的位置，并通過對細(xì)胞核酸特征的分析明確癌癥具體的類型，為后續(xù)治療方案的制定提供依據(jù)。在傳統(tǒng)的臨床醫(yī)學(xué)中腫瘤分類的依據(jù)是病理形態(tài)和免疫組化，在腫瘤精準(zhǔn)治療中可以利用基因測序技術(shù)對腫瘤分子進(jìn)行分類。在臨床實(shí)踐中常利用靜脈血作為基因測序的材料，液體活檢方法具有非侵入性的優(yōu)勢，利用該方法可以檢測到大多數(shù)的腫瘤基因突變情況包括乳腺癌、肺癌以及卵巢癌等等。

2.2腫瘤靶向藥物治療中的應(yīng)用

受到腫瘤類型差異和病患個體差異性的影響，靶向藥物并不是任何時候都適用的，利用基因測序技術(shù)可以在治療前對患者對靶向藥物的適用情況進(jìn)行判斷，從而提高用藥的合理性和治療的效果。目前醫(yī)學(xué)界已經(jīng)研究出了多組腫瘤相關(guān)基因，在臨床中也將驅(qū)動基因作為腫瘤精準(zhǔn)治療的靶點(diǎn)，在此基礎(chǔ)上開發(fā)的靶向藥物顯著提高腫瘤的治療效果?；驕y序的敏感性和準(zhǔn)確性都比較高。在基因測序技術(shù)的支持下，腫瘤精準(zhǔn)治療取得了巨大的進(jìn)展，在一定程度上提高了腫瘤患者的生存質(zhì)量和治療效果，但是受到靶向藥物療效和個體耐藥機(jī)制差異的影響，并不是所有患者都可以收益。因而利用基因測序技術(shù)對腫瘤精準(zhǔn)治療靶點(diǎn)新藥的療效和耐藥機(jī)制進(jìn)行預(yù)測成為臨床研究的重點(diǎn)。

2.3遺傳性腫瘤篩查中的應(yīng)用

近些年來基因測序的成本不斷降低，使得該技術(shù)在臨床腫瘤治療中推廣成為可能，可以應(yīng)用該技術(shù)對有腫瘤家族史人群的APC、BRCA1等相關(guān)腫瘤基因進(jìn)行檢測，實(shí)現(xiàn)遺傳性腫瘤的準(zhǔn)確篩查和提前治療。外科體檢以及影像學(xué)手段是診斷乳腺癌的主要方式，隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的不斷進(jìn)步，人們發(fā)現(xiàn)BRCA1/2等基因的變異狀況可以作為乳腺癌診斷和預(yù)防參考依據(jù)。利用基因測序技術(shù)可以分析出個體的患癌風(fēng)險(xiǎn)，以此為依據(jù)進(jìn)行提前的干預(yù)可以降低腫瘤的發(fā)生率，表1總結(jié)了一些突變基因可能導(dǎo)致乳腺癌和其他癌癥發(fā)生概率。目前已經(jīng)有一些商業(yè)性質(zhì)的機(jī)構(gòu)開始提供基因測序服務(wù)，為相關(guān)人群預(yù)防提供參考，為了規(guī)范醫(yī)療行業(yè)和市場確保基因測序質(zhì)量，國家也對基因測序機(jī)構(gòu)的資質(zhì)認(rèn)定進(jìn)行了明確的規(guī)定。

三、結(jié)束語

利用基因測序可以對腫瘤基因序列中的變異信息進(jìn)行解析，從而實(shí)現(xiàn)腫瘤的精準(zhǔn)治療，將其應(yīng)用于臨床中可以有效提高腫瘤診斷、治療等的準(zhǔn)確性，具有推廣的價值。作為一門新興技術(shù)，基因測序在應(yīng)用中還存在諸多待完善的地方，包括數(shù)據(jù)信息存儲不規(guī)范、專業(yè)技術(shù)人員缺乏等等。相信隨著生物科技的不斷進(jìn)步和相關(guān)政策體系的日漸完善，基因測序?qū)谀[瘤精準(zhǔn)治療中發(fā)揮越來越重要的作用。

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