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基于DNA條形碼技術(shù)的新疆民族藥材天山堇菜基原研究*

2019-07-05 07:09:54樊叢照趙亞琴王果平李曉瑾
關(guān)鍵詞:堇菜基原市售

樊叢照,朱 軍,趙亞琴,王果平,李曉瑾

(新疆維吾爾自治區(qū)中藥民族藥研究所,國(guó)家中醫(yī)藥管理局新疆中藥民族藥資源重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 烏魯木齊 830002)

民族藥材天山堇菜,又稱“比乃非謝”,系堇菜科多年生草本植物天山堇菜(西藏堇菜)Viola kunawarensis的干燥全草,具有清熱解毒、消炎退燒、潤(rùn)肺消腫、潤(rùn)肺止咳、通利二便等功效,是降熱比那甫西糖漿、益腦吾斯提庫(kù)都斯糖漿等4種民族藥成藥制劑的主要成分[1-3]。現(xiàn)市場(chǎng)流通的天山堇菜藥材基原不清,藥材形態(tài)各異,各執(zhí)一詞,難辨真?zhèn)?,?yán)重影響相關(guān)藥品質(zhì)量控制和應(yīng)用。然而,堇菜屬植物變異復(fù)雜,種間存在雜交,分類相當(dāng)困難,各學(xué)者對(duì)于堇菜屬屬下的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系意見并不統(tǒng)一[4-6],所以,僅采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法鑒定市售天山堇菜藥材的基原極為困難,制約了產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

準(zhǔn)確的基原鑒定是保障藥材質(zhì)量的根本,因各種原因,民族藥材質(zhì)量控制及監(jiān)管整體水平較低[7],雖然已制定了3部地方標(biāo)準(zhǔn),規(guī)定了200余種藥材的基原,但由于民族藥材的地域性、多外來種,基原不清仍然是制約藥材應(yīng)用與產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵,也使基于原植物特點(diǎn)的傳統(tǒng)特性形態(tài)與性狀鑒別相形見絀。DNA條形碼技術(shù),已被《中華人民共和國(guó)藥典》2015版收載,ITS2及psbA-trnH序列作為候選序列,具有通用性強(qiáng)、鑒定結(jié)果可靠、重復(fù)性良好的特點(diǎn),已應(yīng)用于多種民族藥材溯源研究[8-13]。本研究擬采用DNA條形碼ITS2序列,為明確天山堇菜藥材基原提供鑒定方法。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

本研究中所使用的126份堇菜屬植物樣本采自新疆不同地區(qū)(表1),憑證標(biāo)本保存于新疆大學(xué)標(biāo)本館(XJU)及新疆中藥民族藥研究所標(biāo)本館(新疆XTNM),“天山堇菜”藥材樣品采自新疆各地民族藥材市場(chǎng)(表2)。

1.1.1 試劑

PCR擴(kuò)增所用引物由上海生工生物工程有限公司合 成 ,ITS2 正 向 序 列 :5′-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3′,反向序列:5′-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3′[14];DNA 提取試劑盒(DP305-03)、2×Taq Master Mix等購(gòu)自天根生物。

表1 實(shí)驗(yàn)材料信息

1.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器

實(shí)驗(yàn)所使用的DNA提取研磨儀為GRINDER,型號(hào)GT-100;離心機(jī)為上海安亭科學(xué)儀器,型號(hào)Anker TGL-16C;PCR擴(kuò)增儀為An Analytik Jena company,型號(hào)070-851。

1.2 方法

1.2.1 DNA提取及檢測(cè)

稱取干燥樣品(莖葉)30 mg,DNA提取研磨儀1000 r·min-1研磨2 min,植物DNA提取試劑盒提取總DNA,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA的質(zhì)量。

表2 天山堇菜藥材樣品信息

表3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

1.2.2 PCR擴(kuò)增及測(cè)序

反應(yīng)體積25 μL,dNTP 0.4 μL(10 mmol·L-1),PCR緩沖液2.5 μL(10×),引物各1.0 μL(2.5 μmol·L-1),聚合酶1.0 U,總DNA 1 μL(約30 ng)。引物ITS2擴(kuò)增程序:94℃,變性5 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸45 s(40個(gè)循環(huán));72℃延伸10 min[14]。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖電泳檢測(cè)并純化后,使用ABI 3730 XL(Applied Biosystems Co.,USA)測(cè)序儀由美吉生物測(cè)序公司進(jìn)行雙向測(cè)序。

1.3 數(shù)據(jù)處理

使用 CodonCode Aligner V 4.0.4(CodonCode Co.,USA)校對(duì)拼接測(cè)序結(jié)果,去除引物區(qū)。使用軟件MEGA5.0(molecular evolutionary genetics analysis)分析比對(duì)結(jié)果[15],基于隱馬爾可夫模型的HMMer注釋方法,去除ITS2序列兩端5.8S和28S區(qū)段獲得間隔區(qū)序列[16],用鄰接(NJ)構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹,使用bootstrap(1000次重復(fù))檢驗(yàn)各分支的支持率[17].

2 結(jié)果

2.1 PCR擴(kuò)增及測(cè)序結(jié)果

從126份植物樣本及18份藥材樣本中均成功提取了基因組DNA,PCR擴(kuò)增及測(cè)序結(jié)果表明所有實(shí)驗(yàn)樣本擴(kuò)增成功,擴(kuò)增結(jié)果質(zhì)量滿足測(cè)序要求,并獲得了有效的雙向測(cè)序結(jié)果。

2.2 基原植物及同屬近緣種DNA條形碼鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)的建立

使用基原植物天山堇菜及其同屬17種植物的37條ITS2單倍型序列建立DNA條形碼鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)(表3),數(shù)據(jù)庫(kù)中的ITS2序列特征如表4所示,天山堇菜15個(gè)樣本為1個(gè)單倍型,ITS2序列長(zhǎng)度為210 bp,GC含量為67.6%。天山堇菜近緣種17種植物36條ITS2序列單倍型長(zhǎng)度為210-222 bp,GC含量變化范圍為60.6%-67.1%(平均64.4%),共有72個(gè)變異位點(diǎn),種間平均K2P距離為0.115(0-0.229)。

2.3 市售藥材鑒定結(jié)果

從市場(chǎng)中獲得的民族藥材天山堇菜ITS2序列為210-236 bp,GC含量變化為62.2%-69.1%(平均66.3%),序列間存在109個(gè)變異位點(diǎn),源于多種植物?;贗TS2序構(gòu)建的NJ鑒別樹表明(圖1),不同來源的天山堇菜藥材樣品分別聚為5類,其中編號(hào)為YCT03008、YCT03016、YCT03018的藥材樣品與天山

堇菜聚為一支,藥材YCT03005-06、YCT03010與香堇菜聚為一支,YCT03003與YCT03004聚為一支,YCT03001-02、YCT03007與 YCT03017聚為一支,YCT03009單獨(dú)為一支。

表4 天山堇菜基原植物、近緣種及藥材樣本的ITS2序列特征

圖1 基于ITS2序列的單倍型NJ鑒別樹,在圖中顯示分支支持率(≥50%,bootstrap 1000次重復(fù))

18份不同來源的民族藥材天山堇菜鑒定結(jié)果(圖2),市售藥材有8份為天山堇菜(占44.4%);3份為香堇菜(占16.7%);6份未在數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出有效結(jié)果,由兩種植物組成(占33.3%),與堇菜屬植物相似度較高,為堇菜屬植物;另有1份為非堇菜屬植物(占5.6%)。

3 討論

3.1 天山堇菜DNA條形碼鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)的可靠性

本研究首次采用DNA條形碼技術(shù)建立民族藥材“天山堇菜”的鑒定體系。研究中使用的18種126份天山堇菜及其近緣種植物憑證標(biāo)本由新疆不同分類專家鑒定,保證了鑒定數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。通過建立126份堇菜屬憑證標(biāo)本樣品的ITS2序列數(shù)據(jù)庫(kù),分析了種內(nèi)種間變異,結(jié)果表明堇菜屬不同種植物種間變異遠(yuǎn)大于種內(nèi)變異;NJ樹鑒別鑒定結(jié)果表明,不同植物均各自聚為一支,ITS2序列可將天山堇菜與其近緣種植物區(qū)分,因此ITS2序列在天山堇菜藥材鑒定中具有很大的潛力。

3.2 市售藥材天山堇菜的植物基原混亂

圖2 市售民族藥材天山堇菜植物來源

本研究建立的ITS2體系成功應(yīng)用于不同植物來源的天山堇菜藥材鑒定。通過將18份不同批次的市售“天山堇菜”藥材ITS2序列與鑒定數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),結(jié)果表明,目前天山堇菜的臨床用藥與現(xiàn)有標(biāo)準(zhǔn)存在很大差距,市售藥材至少來源于5種植物,包括天山堇菜、香堇菜、堇菜屬2種未知植物及薄荷屬植物。藥材在流通過程中以同屬植物作為替代品的現(xiàn)象很常見[18,19],目前《中華人民共和國(guó)藥品標(biāo)準(zhǔn)(維藥分冊(cè))》及《新疆民族自治區(qū)中藥民族藥飲片炮制規(guī)范》等地方標(biāo)準(zhǔn)中收載的天山堇菜藥材唯一基原為天山堇菜V.kunawarensis,根據(jù)藥材管理辦法,未被收載的同屬植物均為偽品。本研究中正品藥材天山堇菜僅占44.4%,天山堇菜用藥安全存在很大的隱患,其同屬數(shù)種植物作為偽品流入市場(chǎng),它們是否與天山堇菜具有相同的功效,還需要結(jié)合化學(xué)成分和藥理作用進(jìn)行深入研究。

3.3 DNA條形碼在藥材監(jiān)管領(lǐng)域的應(yīng)用前景

天山堇菜為新疆地產(chǎn)藥材,其在民族藥制劑中的使用量較大,由于資源有限,近年來主要依賴于進(jìn)口,導(dǎo)致混偽品藥材流入市場(chǎng)。DNA條形碼技術(shù)近年來已經(jīng)廣泛應(yīng)用于食品安全和中藥材真?zhèn)舞b定等領(lǐng)域,本研究結(jié)果可在進(jìn)出口海關(guān)檢查過程及藥品安全監(jiān)測(cè)中可發(fā)揮重要作用,可從源頭上杜絕偽品藥材進(jìn)入市場(chǎng),為監(jiān)管機(jī)構(gòu)提供一種優(yōu)良的檢測(cè)手段,在民族藥材基原控制領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。

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