王 勇,周 森,魏金旺*
(北京順鑫農(nóng)業(yè)股份有限公司 牛欄山酒廠,北京101301)
牛欄山二鍋頭屬于清香型白酒,憑借清香純正、口味甘冽、酒體醇厚等特點,逐漸成為我國北方清香型的代表性白酒之一,在國內(nèi)具有較高的知名度[1-2]。牛欄山二鍋頭主要以大曲作為糖化發(fā)酵劑,經(jīng)過糖化、發(fā)酵、蒸餾和儲存等步驟制得。大曲是二鍋頭釀造中的主要糖化劑,是富含微生物菌系、酶系和曲香物質(zhì)的微生態(tài)制品,具有糖化、發(fā)酵、生香等功能[3],是白酒中微生物的主要來源。然而傳統(tǒng)微生物分離方法對大曲中微生物的研究還有一定的缺陷,大曲中的微生物經(jīng)過長期的馴化,早已適應(yīng)了高溫、低含水量及不同pH值等特殊環(huán)境,而在人工培養(yǎng)模式下,由于培養(yǎng)條件難以完全模擬出大曲的制曲環(huán)境,往往會造成部分微生物無法正常生長,導(dǎo)致微生物可培養(yǎng)性不高等現(xiàn)象[4]。
目前,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展及運用,人們對大曲微生物菌系的研究逐漸由傳統(tǒng)微生物分離轉(zhuǎn)變?yōu)橐揽糠肿由飳W(xué)技術(shù)的免培養(yǎng)方法。近幾年來,以基因文庫、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)、高通量測序為主的分子生物學(xué)技術(shù)手段逐漸應(yīng)用于大曲微生物的研究中,有效解決了純培養(yǎng)技術(shù)在微生物分離種類和數(shù)量方面的不足[5-8],如羅惠波等[9]利用內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)基因文庫研究了清香型大曲真菌群落結(jié)構(gòu),確定出汾酒大曲真菌全部屬于酵母目和毛霉菌目,清茬、后火和紅心曲真菌群落結(jié)構(gòu)存在明顯差異;蘭玉倩等[10]利用PCR-DGEE技術(shù)解析清香型大曲生產(chǎn)過程中酵母群落結(jié)構(gòu),確定了清香型大曲制作過程中存在7個真菌分類屬,并介紹了各屬微生物的變化規(guī)律;喬曉梅等[11]采用高通量測序法分析了清香大曲真菌群落結(jié)構(gòu),確定了清香大曲主要真菌類群。這些研究方法可以避免在傳統(tǒng)培養(yǎng)過程中富集、培養(yǎng)及分離等步驟中所造成的微生物多樣性丟失、種群構(gòu)成發(fā)生變化等局限,能夠更直接可靠的反映樣品微生物的原始組成情況。
本研究采用高通量測序技術(shù),利用免培養(yǎng)方法,從牛欄山大曲中原核生物和真核生物兩個方面入手,系統(tǒng)分析牛欄山大曲菌系組成,同時根據(jù)不同微生物所占比例關(guān)系,確定出了牛欄山大曲中主體微生物,為牛欄山大曲質(zhì)量控制及制曲工藝提供一定的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),同時也為牛欄山大曲微生物分離純化等工作提供數(shù)據(jù)指導(dǎo)。
清香型釀酒生產(chǎn)大曲:取牛欄山不同釀酒班生產(chǎn)大曲,按“四分法”混合取樣[12],用無菌封口袋封裝,-80 ℃保藏備用;土壤基因組脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)提取試劑盒(FastDNA SPIN Kit for Soil):美國Mpbio公司;DNA引物:北京天跟生化科技有限公司;冰乙酸(分析純):北京化工廠;乙二胺四乙酸(ethylenediamine tetraacetic acid,EDTA)、三羥甲基氨基甲烷(Tris):上海生工生物工程有限公司。
JY600型基礎(chǔ)型電泳儀:鄭州博邦科貿(mào)有限公司;ChampGelTM全自動凝膠成像儀:北京賽智創(chuàng)業(yè)公司;1-14k高速冷凍離心機(jī):德國Eppendorf公司;Illumina MiSeq測序儀:北京奧維森基因科技有限公司;0.45 μm過濾膜:Milipore公司;Milli-Q IQ7000超純水系統(tǒng):美國Millipore公司;Fast-Prep-24 5G勻漿儀:美國MP Biomedicals公司。
1.3.1 大曲總DNA提取
從混合大曲樣品中隨機(jī)稱取6份(每份1 g),經(jīng)Fastprep處理后,采用土壤基因組DNA提取試劑盒(FastDNA SPIN Kit for SoiL)提取總DNA。
1.3.2 大曲高通量測序
大曲樣品中微生物種類繁多,真核微生物和原核微生物共存,因此本研究對大曲樣品總DNA的ITS1區(qū)和16S rDNA V3/V4區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增引物及反應(yīng)條件見表1。
將6份大曲總DNA混合后,進(jìn)行ITS1區(qū)和16S rDNA V3/V4區(qū)片段擴(kuò)增,產(chǎn)物庫檢合格后,利用Illumina MiSeq PE300進(jìn)行細(xì)菌、真菌高通量測序(北京奧維森公司)。原始測序序列通過Fastqc進(jìn)行質(zhì)量檢測去除低質(zhì)量Reads(過濾標(biāo)準(zhǔn):Q20≥90%)。通過Cope軟件(Connecting Overlapped Pair-End,V1.2.3.3),進(jìn)行序列拼接及過濾后利用Mothur軟件以平均鄰近聚類算法(average neighbor clustering algorithm)在0.03(或97%的相似度)水平下對Clean Tags進(jìn)行操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)的聚類,統(tǒng)計各個樣品每個OTU中的豐度信息。選取分析數(shù)據(jù)中每個OTU中一個有代表性的序列,通過Blast比對,獲得每一個OTU種名。
表1 高通量測序引物序列Table 1 Primer sequences of high throughput sequencing
大曲總DNA經(jīng)電泳檢測合格后,利用Illumina MiSeq PE300進(jìn)行細(xì)菌、真菌高通量測序,根據(jù)97%相似度將不同測序序列進(jìn)行聚類分析。經(jīng)分析表明,從牛欄山大曲中共獲得真核OTU 69種,原核OTU 358種,說明牛欄山大曲中原核微生物多樣性遠(yuǎn)高于真核。
樣品中原核微生物358 種OTU 主要由放線菌門(Actinobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)4類組成,其具體分布見表2。
表2 大曲原核微生物分類Table 2 Classification of prokaryotic microorganism from Daqu
通過表2可以看出,大曲中厚壁菌門所占OTU數(shù)量最多,為46.65%,變形菌門和放線菌門分別為25.42%和21.79%,擬桿菌門數(shù)量最少,為6.15%。同時,對所獲得OTU進(jìn)一步進(jìn)行種屬分析,結(jié)果見圖1所示。
通過對358種原核OTU進(jìn)行種屬比對,挑選OTU數(shù)占原核總OTU數(shù)1%以上的序列進(jìn)行多樣性分析。如圖2所示,共有14種OTU占1%以上,其總和可占總OTU的83%,因此可以認(rèn)為14種OTU能夠代表大曲主體原核微生物。
圖1 大曲原核微生物種屬分布餅圖Fig. 1 Species distribution pie chart of prokaryotic microorganism from Daqu
14種OTU的菌屬主要可分為乳酸菌、放線菌、芽孢桿菌、葡萄球菌這4大類,其中乳酸菌種類較多,由7種組成,放線菌、芽孢桿菌和葡萄球菌種類較為接近,均為2~3種。在種屬分布上,乳酸菌所占比例較多,維斯氏菌(Weissella confusa)、耐酸乳桿菌(Lactobacillus acetotolerans)和戊糖片球菌(Pediococcuspentosaceus)分別占大曲總OTU的22.68%、16.54%和9.84%;放線菌(Kroppenstedtia eburnea)可在大曲中占14.78%;以地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)和沙福芽孢桿菌(Bacillus safensis)為主的芽孢桿菌僅占3.80%和2.14%。整體看來,牛欄山大曲中優(yōu)勢原核微生物較為明顯,乳酸菌類在牛欄山大曲中占據(jù)了主導(dǎo)地位,同時含有一定量的高溫放線菌,而芽孢桿菌則在大曲中含量較低。在牛欄山酒釀造過程中,大曲中的大量乳酸菌進(jìn)入到發(fā)酵過程中能夠為發(fā)酵微生物提供營養(yǎng)物質(zhì)并維持發(fā)酵的平衡。目前已有研究表明,乳酸菌自身可以合成一類具有活性的多肽和蛋白質(zhì)類物質(zhì),呈現(xiàn)不可逆的殺菌作用方式,有效地抑制酒醅中雜菌生長[14],另外當(dāng)乳酸菌和酵母菌共同發(fā)酵時,能夠有效地提高發(fā)酵樣品中的酸、醇、酯等風(fēng)味物質(zhì)產(chǎn)量;同時乳酸菌自溶所產(chǎn)生的營養(yǎng)物質(zhì)可供酵母所利用,自溶后產(chǎn)生的酶類、活性成分和多種酸性多糖磷酸質(zhì),具有一定的糖化作用,在一定程度上提高了酒醅其余微生物對淀粉的利用[15-16];并且其產(chǎn)生的多種有機(jī)酸是乳酸乙酯及其他香味成分合成的重要基礎(chǔ)物質(zhì)。
在本研究中,共獲得真核微生物OTU 69種,共分為9個目,其具體組成見表3。
通過表3可以看出,牛欄山大曲中酵母目OTU所占比例最多,達(dá)到了56.52%,其次為散囊菌目15.94%,毛霉菌目8.70%,其余類別所占比例相對較低。對所獲得OTU數(shù)據(jù)進(jìn)一步進(jìn)行種屬分析。通過對69種OTU進(jìn)行種屬比對,挑選OTU數(shù)量前10的OTU進(jìn)行系統(tǒng)分析,如圖2所示。
表3 大曲真核微生物分類Table 3 Classification of eukaryotic microorganism from Daqu
圖2 大曲真核微生物種屬分布餅圖Fig. 2 Species distribution pie chart of eukaryotic microorganism from Daqu
由圖2可知,在大曲真菌OTU中,前10種OTU總和可占大曲真菌總OTU的99.25%,因此可以認(rèn)為這10種OTU能夠真實反映大曲中真菌的種屬分布情況。在大曲真菌種屬組成中,扣囊覆膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)數(shù)量最多,可占大曲真菌總量的73%,其次為庫氏畢赤酵母(Pichia kudriavzevii)可占21%,兩種真菌共占大曲總量的94%,因此可以認(rèn)為這兩種菌是牛欄山大曲的主體真菌,而其余真菌,如假絲酵母(Candida tropicalis)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、橫梗霉(Lichtheimia corymbifera)以及異常維克漢姆酵母(Wickerhamomyces anomalus)等,雖然在大曲高通量中能夠檢測到,但所占比例較低,僅在1%以下,在大曲真菌中并不占優(yōu)勢。扣囊覆膜酵母被認(rèn)為是清香型大曲制曲前期的主要微生物,雖然其產(chǎn)酒精能力不強(qiáng),但香味濃郁,可使白酒風(fēng)味更加豐富,同時已有研究表明,扣囊覆膜酵母能產(chǎn)α-淀粉酶,能分解生料和熟料淀粉,也能產(chǎn)生糖化酶,將淀粉分解為葡萄糖[17-18],說明扣囊覆膜酵母在制曲過程中可以利用生料淀粉產(chǎn)生糖化酶、淀粉酶,將原料中的淀粉轉(zhuǎn)化為葡萄糖,為大曲的正常制作提供多種糖類物質(zhì),同時也是成品曲中酶類的重要產(chǎn)生菌;庫氏畢赤酵母屬于生香酵母類,在產(chǎn)酯產(chǎn)香方面具有較強(qiáng)能力,能夠利用發(fā)酵環(huán)境中的糖類、氨基酸、蛋白質(zhì)及醇類物質(zhì),在發(fā)酵前期生成大量以乙酸乙酯為主體的酯類及少量酸類、酚類等化合物,起到為基酒增香的重要作用[19-20]。
本研究利用高通量測序技術(shù),從分類學(xué)角度系統(tǒng)研究了牛欄山大曲真核和原核微生物多樣性分布,確定了大曲中菌系組成。結(jié)果表明原核生物在大曲中多樣性遠(yuǎn)高于真核,共獲得358種原核OTU,而真核僅為69種。微生物種屬分布表明,大曲中原核微生物主要可分為乳酸菌類群、放線菌類群、芽孢桿菌類群和葡萄球菌類群,其中乳酸菌類群所占比例較高,維斯氏菌(W.confuse)、耐酸乳桿菌(L. acetotolerans)和戊糖片球菌(P. pentosaceus)3種乳酸菌總和可占大曲原核總OTU的49.06%,同時大曲中還存在一定量的高溫放線菌(K.eburnea);在真核微生物組中,扣囊覆膜酵母(S.fibuligera)和庫氏畢赤酵母(P.kudriavzevii)是牛欄山大曲中的主要微生物,橫梗霉(L.corymbifera)、釀酒酵母(S.cerevisiae)及異常維克漢姆酵母(W.anomalus)、假絲酵母(C.tropicalis)所占比例較低。
大曲制作過程繁雜,培養(yǎng)周期長,在開放的環(huán)境中,其所包含的微生物種類十分豐富,制曲原料、器具、空氣均是大曲微生物的主要來源。牛欄山大曲采用了低溫制曲工藝,制曲溫度最高不超過40~50 ℃,適宜的溫度、制曲工藝及獨特菌群環(huán)境形成了牛欄山大曲特有的菌群結(jié)構(gòu)。因此,對牛欄山大曲進(jìn)行系統(tǒng)研究,將有助于解析出二鍋頭酒口味甘洌、酒體醇厚的原因,同時也可以為今后大曲的質(zhì)控及強(qiáng)化制曲等提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支撐。