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寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀及其分子標(biāo)記分析

2019-03-06 04:24生祥
河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年2期
關(guān)鍵詞:面筋染色體性狀

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(1.寧夏大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,寧夏 銀川 750021; 2.寧夏農(nóng)林科學(xué)院 農(nóng)作物研究所,寧夏 銀川 750001)

小麥(TriticumaestivumL.)是一種適應(yīng)性強、分布廣泛的世界性糧食作物,為全球35%~40%人口提供主糧。我國是世界上最大的小麥生產(chǎn)國和消費國,小麥年生產(chǎn)總量和消耗總量占世界小麥年生產(chǎn)總量的17%和消費總量的16%,小麥生產(chǎn)的持續(xù)發(fā)展對保障國家糧食安全具有重要意義[1]。隨著人民生活水平的提高,對小麥品質(zhì)的要求也逐漸提高,而我國小麥蛋白質(zhì)含量平均為13.94%,面筋含量平均為30.40%,沉降值平均為32.10 mL,遠(yuǎn)不能滿足人們的需求[2]。其中,蛋白質(zhì)含量是小麥營養(yǎng)品質(zhì)最重要的一項指標(biāo),而蛋白質(zhì)質(zhì)量由面筋含量、沉降值、流變學(xué)特性等加工品質(zhì)決定[3]。因此,對于我國小麥品質(zhì)改良來說,不僅要提高籽粒的蛋白質(zhì)含量,更要改善和提高小麥加工品質(zhì)[4-5]。蛋白質(zhì)性狀為小麥品質(zhì)性狀中的代表性性狀,其貢獻率比較大[6-7]。SHEWRY等[8]認(rèn)為,表達(dá)的半胱氨酸肽酶基因數(shù)目與高分子質(zhì)量麥谷蛋白亞基(High molecular weight glutenin subunit,HMW-GS)總量存在劑量關(guān)系,即小麥品質(zhì)的改良可通過增加HMW-GS數(shù)目來實現(xiàn);而低分子質(zhì)量谷蛋白亞基(Low molecular weight glutenin subunit,LMW-GS)數(shù)量及HMW-GS、LMW-GS組合也對品質(zhì)性狀有重大影響[9]。另外,HMW-GS的1、2*、17+18、5+10亞基和LMW-GS的GluA3f、GluB3b、GluB3g亞基與面團形成時間和穩(wěn)定時間均呈顯著正相關(guān),HMW-GS的N、1、14+15、17+18、7+8、2+12、3+12、4+12亞基和LMW-GS的GluB3d、GluB3f、GluB3h、GluB3g亞基與蛋白質(zhì)和濕面筋含量均呈顯著正相關(guān)[10]。因此,HMW-GS、LMW-GS的數(shù)目及組合形式直接決定小麥品質(zhì)的優(yōu)劣。

DNA分子標(biāo)記和QTL定位技術(shù)的發(fā)展為小麥品質(zhì)性狀的分子檢測提供了有效的方法。目前,利用分子標(biāo)記對小麥不同群體的蛋白質(zhì)含量、沉降值、淀粉含量等品質(zhì)性狀進行了大量研究[11-14]。同時,在QTL發(fā)掘方面,孫海艷等[15]共發(fā)現(xiàn)了15個分布在1D、3B、6D染色體上的蛋白質(zhì)品質(zhì)性狀QTL。解樹斌[16]發(fā)掘了涉及籽粒蛋白質(zhì)含量的33個QTL,分布在1A、1B、4A、4B、6A染色體上,單個QTL的表型貢獻率為6.69%~15.52%,LOD值最大為7.3,同時,檢測到涉及沉淀值的33個QTL,分布在1A、1B、4B、5B、5D、6A、6D染色體上,單個QTL表型貢獻率為4.62%~18.73%,LOD值最大為13.6。李紅民[17]檢測到1個控制小麥籽粒硬度的主效QTL,LOD值為10。郭利建等[18]檢測到33個與品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL,其中,11個為粗蛋白含量QTL,分布在1A、3A、5A、6A、2B、4B染色體上,表型貢獻率為0.69%~2.48%;12個為濕面筋含量QTL,分布在1A、3A、5A、6A、2B、3B、4B染色體上,表型貢獻率為0.58%~2.37%;3個為沉降值QTL,分布在3A、1B、3B染色體上,表型貢獻率為2.72%~11.31%。雖然小麥品質(zhì)相關(guān)性狀的QTL研究已有許多報道,但在育種上有利用價值的相關(guān)QTL還有待研究和應(yīng)用。本研究針對寧夏回族自治區(qū)主栽小麥品種寧春4號綜合農(nóng)藝性狀、適應(yīng)性好,但品質(zhì)一般,而育成于山西運城的河?xùn)|烏麥籽粒蛋白質(zhì)含量、面筋含量、沉降值均較高,在前期對2個小麥品種遺傳性狀與分子標(biāo)記分析的基礎(chǔ)上[19],構(gòu)建了雜交組合群體,對其F2進行品質(zhì)性狀及其分子標(biāo)記分析,以期為寧夏回族自治區(qū)小麥品質(zhì)性狀改良發(fā)掘可供利用的育種中間材料和QTL。

1 材料和方法

1.1 試驗材料

寧春4號為寧夏回族自治區(qū)主栽小麥品種,河?xùn)|烏麥由運城學(xué)院杜磊博士提供。2016年在寧夏大學(xué)教學(xué)試驗農(nóng)場對寧春4號與河?xùn)|烏麥進行正反交,同年將收獲的雜交種子在云南南繁加代,2017年將收獲種子種植于寧夏大學(xué)試驗農(nóng)場,單粒點播,每行10粒,行長1.1 m,行寬0.2 m,獲得含331個單株的F2群體,其中正交后代201株(編號001—007、013—206),反交后代130株(編號008—012、207—331)。

1.2 小麥品質(zhì)性狀的測定

用瑞典波通9200整粒谷物紅外線分析儀測定籽粒含水量、硬度、蛋白質(zhì)含量、沉降值、面筋含量[20],在國家小麥改良中心西北分中心進行。

1.3 小麥品質(zhì)性狀的分子標(biāo)記分析

基因組DNA的提取采用SDS法[21]。前期根據(jù)小麥的7個部分同源群設(shè)計了SSR標(biāo)記,本研究利用能夠在寧春4號與河?xùn)|烏麥間穩(wěn)定擴增的49個SSR標(biāo)記[19]進行分析,其中對本研究材料品質(zhì)性狀有明確QTL定位結(jié)果的5個SSR標(biāo)記的名稱及序列見表1。2個分別與HMW-GS數(shù)目和面粉核黃素含量相關(guān)的標(biāo)記Bx17、YP7A參照文獻[22-23],具體信息見表1。所有引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

表1 SSR標(biāo)記信息

PCR反應(yīng)體系:10×Reaction Buffer 1 μL,MgCl2(25 mmol/L)0.8 μL,dNTPs(2.5 mmol/L)0.8 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各0.2 μL,模板DNA 100 ng,TaqDNA聚合酶(5 U/μL)0.05 μL,加ddH2O至總體積10 μL。PCR擴增程序:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,56~58 ℃退火45 s,72 ℃延伸1 min,34個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。擴增產(chǎn)物檢測:采用8%聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,電泳時總電壓為180 V,電泳約1.5 h,經(jīng)銀染后觀察、照相,并統(tǒng)計擴增條帶。

1.4 數(shù)據(jù)分析

采用Excel 2013對品質(zhì)性狀和分子標(biāo)記結(jié)果進行統(tǒng)計;用SPSS 20進行方差、相關(guān)性和聚類分析;利用Origin 8.0對各品質(zhì)性狀的頻率分布進行作圖;采用Map Manager QTXb 20進行QTL定位,取概率值P<0.05的LOD值作為判斷QTL存在的閾值,利用Kosambi函數(shù)中單標(biāo)記回歸分析方法進行QTL分析,即檢測親本間有多態(tài)性的引物在F2群體中的分布,根據(jù)電泳譜帶結(jié)果建立SSR標(biāo)記數(shù)據(jù)庫:與母本相同的帶型記為B,與父本相同的帶型記為A,雜合帶型記為H,缺失記為-。將331個F2單株的分子標(biāo)記結(jié)果與品質(zhì)性狀數(shù)據(jù)相結(jié)合,運用Map Manager QTXb 20軟件檢測相關(guān)QTL位點,QTL命名方法為:小寫字母q+目標(biāo)性狀的大寫英文字母代稱+所在染色體號數(shù),QTL全稱通常用斜體表示,如在5B染色體上,與穗長相關(guān)的QTL位點命名為qSL5B。

2 結(jié)果與分析

2.1 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀分析

2.1.1 品質(zhì)性狀變異分析 對寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2的331個單株的5個品質(zhì)性狀進行分析(圖1)發(fā)現(xiàn),5個品質(zhì)性狀在F2均出現(xiàn)較大分離,達(dá)到極顯著水平(P<0.01),均呈連續(xù)正態(tài)分布,符合多基因控制的數(shù)量性狀的遺傳特點,并且出現(xiàn)了許多具有超親性狀的單株。

對F2群體品質(zhì)性狀進行變異分析(表2)發(fā)現(xiàn),籽粒蛋白質(zhì)含量、硬度、面筋含量和沉降值的群體平均值均超過高親親本,含水量的群體平均值介于高親親本與低親親本之間。其中,含水量、蛋白質(zhì)含量、面筋含量、硬度、沉降值的超中親比例分別達(dá)77.78%、84.52%、92.46%、73.41%、99.60%,超高親比例分別達(dá)46.63%、82.94%、90.48%、66.27%、99.60%。5個品質(zhì)性狀的變異系數(shù)表現(xiàn)為沉降值(39.54%)>面筋含量(19.91%)>硬度(17.10%)>蛋白質(zhì)含量(12.63%)>含水量(3.87 %)。

圖1 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀頻率分布Fig.1 Frequency distribution of quality traits in F2 hybrids from Ningchun No.4 and Hedong black wheat

品質(zhì)性狀Quality traits寧春4號Ningchun No.4河?xùn)|烏麥Hedong black wheat變異幅度Variation range平均值Mean標(biāo)準(zhǔn)差Standard deviation變異系數(shù)/%Coefficient of variationF超中親比例/%Proportion ofultra-mid parent超高親比例/%Proportion of ultra-high parent含水量/%Water content 10.0110.759.59~11.8310.720.423.8729.533??77.7846.63蛋白質(zhì)含量/%Protein content 12.5612.7210.70~18.9014.711.8612.6344.511??84.5282.94面筋含量/%Gluten content22.6924.0616.93~52.5932.036.3819.91748.126??92.4690.48硬度/%Hardness48.6445.4116.41~72.2150.988.7217.10788.502??73.4166.27沉降值/mLSedimentation value17.8817.9610.40~68.4534.7713.7539.54996.946??99.6099.60

注:**表示在 0.01水平上的變異。

Note:** means variation degree at 0.01 level.

2.1.2 基于品質(zhì)性狀的聚類分析 基于籽粒含水量、蛋白質(zhì)含量、面筋含量、硬度和沉降值5個品質(zhì)性狀對F2群體進行聚類分析,在遺傳距離為10 cM時,F(xiàn)2群體被分成5個類群(圖2),其中,含水量表現(xiàn)為Ⅴ>Ⅳ>Ⅲ>Ⅱ>Ⅰ,蛋白質(zhì)含量表現(xiàn)為Ⅱ>Ⅰ>Ⅲ>Ⅳ>Ⅴ,面筋含量表現(xiàn)為Ⅱ>Ⅲ>Ⅳ>Ⅴ>Ⅰ,硬度表現(xiàn)為Ⅴ>Ⅳ>Ⅲ>Ⅰ>Ⅱ,沉降值表現(xiàn)為Ⅰ>Ⅱ>Ⅲ>Ⅳ>Ⅴ??傮w上,類群Ⅰ單株平均沉降值最大(60.13 mL),類群Ⅱ單株平均蛋白質(zhì)含量(17.26%)、面筋含量(38.78%)最高,類群Ⅲ單株平均蛋白質(zhì)含量、面筋含量、沉降值也較高,分別為16.42%、37.75%、48.24 mL;類群Ⅴ單株平均含水量(10.90%)、硬度(54.23%)最大。

圖2 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2 5個類群的品質(zhì)性狀

2.1.3 品質(zhì)性狀的相關(guān)性分析 對F2群體的5個品質(zhì)性狀進行相關(guān)性分析(表3)發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)含量與面筋含量(r為0.94)、沉降值(r為0.93)均呈極顯著正相關(guān),與含水量(r為-0.30)、硬度(r為-0.18)均呈極顯著負(fù)相關(guān);含水量與硬度(r為0.49)呈極顯著正相關(guān),與面筋含量(r為-0.29)、沉降值(r為-0.35)均呈極顯著負(fù)相關(guān);面筋含量與沉降值(r為0.89)呈極顯著正相關(guān);硬度與沉降值(r為-0.27)呈極顯著負(fù)相關(guān)。

表3 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀相關(guān)性分析

注: **表示在0.01水平上極顯著相關(guān)。

Note:** means significant correlation at 0.01 level.

2.2 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀分子標(biāo)記分析

2.2.1 品質(zhì)性狀相關(guān)分子標(biāo)記輔助選擇 利用在親本間有差異的2個分別與HMW-GS數(shù)目和面粉核黃素含量相關(guān)的標(biāo)記Bx17和YP7A,對其在F2群體中的分布情況進行檢測(圖3、表4)發(fā)現(xiàn),331個單株中,有233個單株攜帶Bx17基因,占群體總數(shù)的70.39%;有294個單株攜帶Psy-A1基因,占總數(shù)的88.82%;有206個單株同時攜帶Bx17和Psy-A1基因,占總數(shù)的62.24%。

M:DL2000;W:空白對照;P1:寧春4號;P2:河?xùn)|烏麥;1—331:F2單株M:DL2000;W:Blank control;P1:Ningchun No.4;P2:Hedong black wheat;1—331:F2 individual plants圖3 標(biāo)記Bx17在寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2中的擴增結(jié)果Fig.3 Amplification of Bx17 in F2 hybrids from Ningchun No.4 and Hedong black wheat

標(biāo)記名稱Marker name基因Genes性狀Traits株數(shù)Plant numberBx17Bx17HMW-GS數(shù)目233YP7APsy-A1面粉核黃素含量294Bx17/YP7ABx17/Psy-A1HMW-GS數(shù)目/面粉核黃素含量206

2.2.2 品質(zhì)性狀的QTL定位 利用能夠在寧春4號與河?xùn)|烏麥間穩(wěn)定擴增的49個SSR標(biāo)記對F2群體進行檢測,其中,5個標(biāo)記對品質(zhì)性狀有明確的QTL定位結(jié)果(表5),這5個標(biāo)記共檢測到8個與品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL,表型貢獻率為3%~5%,LOD值最大為9.40,涉及5A、1B、5B、7B、5D等5條染色體。其中,共檢測到2個蛋白質(zhì)含量QTL位點,分布在2條染色體上(1B、5D),加性效應(yīng)分別為-0.42、0.23,LOD值最大為7.60;共檢測到1個含水量QTL位點,分布在7B染色體上,加性效應(yīng)為-0.04,LOD值為7.20;共檢測到1個面筋含量QTL位點,分布在1B染色體上,加性效應(yīng)為-1.62,LOD值為9.40;共檢測到2個硬度QTL位點,分布在2條染色體上(5A、5B),加性效應(yīng)分別為-2.93、-1.95,LOD值最大為9.40;共檢測到2個沉降值QTL位點,分布在2條染色體上(1B、5D),加性效應(yīng)分別為-2.95、1.86,LOD值最大為7.50。綜上,1B染色體上檢測到蛋白質(zhì)含量、面筋含量和沉降值QTL,5D染色體上檢測到蛋白質(zhì)含量和沉降值QTL,這2條染色體存在不同品質(zhì)性狀的QTL富集區(qū)。

表5 寧春4號與河?xùn)|烏麥雜交F2品質(zhì)性狀QTL分析

3 結(jié)論與討論

長期以來,高產(chǎn)作為小麥育種的基本目標(biāo),要求親本具有較高產(chǎn)量水平[24]。高蛋白質(zhì)含量是品種選育的另一要求。親本選配時要求雙親之一的蛋白質(zhì)含量高,而另一親本在這方面不應(yīng)過低[25-27];蛋白質(zhì)含量的遺傳力較高,變異受環(huán)境影響較小,應(yīng)從早期世代開始進行選擇[28-31]。F2群體是早期世代選擇的理想群體,各遺傳性狀處于高度分離狀態(tài),能夠提供最大的數(shù)量遺傳信息。本研究表明,5個品質(zhì)性狀在F2群體中均出現(xiàn)較大分離,達(dá)到極顯著水平,均呈連續(xù)正態(tài)分布;蛋白質(zhì)含量、面筋含量、硬度、沉降值的群體平均值均超過高親親本,超高親比例分別達(dá)82.94%、90.48%、66.27%、99.60%,含水量的群體平均值介于高親親本與低親親本之間,超中親比例達(dá)77.78%,超高親比例達(dá)46.63%;類群Ⅱ、類群Ⅲ的蛋白質(zhì)含量、面筋含量和沉降值均較高,為優(yōu)質(zhì)類群;蛋白質(zhì)含量與面筋含量和沉降值、含水量與硬度、面筋含量與沉降值均呈極顯著正相關(guān),而蛋白質(zhì)含量與含水量和硬度、含水量與面筋含量和沉降值、硬度與沉降值均呈極顯著負(fù)相關(guān)。育種實踐中,產(chǎn)量、品質(zhì)性狀、抗病性之間往往存在負(fù)相關(guān)性,品質(zhì)性狀各指標(biāo)間也存在或多或少的負(fù)相關(guān)性,很難做到各個性狀都達(dá)到設(shè)定的育種目標(biāo),為此在擇優(yōu)選擇的同時,還要保持各性狀間的協(xié)調(diào)性。今后還需進一步分析不同世代的品質(zhì)性狀及遺傳特性,以便更準(zhǔn)確地掌握品質(zhì)性狀的變異規(guī)律。

DNA分子標(biāo)記技術(shù)是根據(jù)基因組DNA存在豐富的多態(tài)性而發(fā)展起來的,可直接反映生物個體在DNA水平上的差異。分子標(biāo)記為小麥品質(zhì)性狀分析提供了新的遺傳標(biāo)記類型。近年來,利用分子標(biāo)記輔助選擇小麥蛋白質(zhì)相關(guān)基因的研究已取得了一定進展[22-23,32-33]。本研究利用2個品質(zhì)性狀相關(guān)標(biāo)記Bx17和YP7A對F2331個單株進行檢測發(fā)現(xiàn), 233個單株攜帶Bx17基因,294個單株攜帶Psy-A1基因,206個單株同時攜帶Bx17和Psy-A1基因。同時,利用新開發(fā)的5個SSR標(biāo)記共檢測到8個不同品質(zhì)性狀QTL位點,涉及5A、1B、5B、7B、5D等5條染色體,加性效應(yīng)為-2.93~1.86,表型貢獻率為3%~5%,LOD值最大為9.40。同時,1B染色體上檢測到蛋白質(zhì)含量、面筋含量和沉降值3個性狀的QTL,5D染色體上檢測到蛋白質(zhì)含量和沉降值2個性狀的QTL,這2條染色體存在品質(zhì)性狀的QTL富集區(qū),可作為進一步研究的重點。本研究共檢測到蛋白質(zhì)含量QTL 2個,分布于1B、5D染色體上,表型貢獻率均為4%;含水量QTL 1個,分布于7B染色體上,表型貢獻率為4%;面筋含量QTL 1個,分布于1B染色體上,表型貢獻率為5%;硬度QTL 2個,分布于5A、5B染色體上,表型貢獻率分別為5%、4%;沉降值QTL 2個,分布在1B、5D染色體上,表型貢獻率分別為3%、4%。在今后研究中,還需進一步開發(fā)高效的分子標(biāo)記,通過構(gòu)建高密度的物理圖譜,進而使得與品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL(尤其是主效QTL)得以精細(xì)定位,為小麥重要品質(zhì)性狀QTL發(fā)掘、研究、應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

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