国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

少孢節(jié)叢孢菌XJ-A1幾丁質(zhì)酶AO-483基因的克隆及生物學(xué)活性

2019-03-05 10:10貢莎莎孟慶玲鐘文強(qiáng)黃運(yùn)福張國武才學(xué)鵬
關(guān)鍵詞:孢菌線蟲質(zhì)粒

貢莎莎,孟慶玲,*,喬 軍,鐘文強(qiáng),黃運(yùn)福,張國武,陳 英,才學(xué)鵬

(1.石河子大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院,新疆 石河子 832003; 2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 蘭州獸醫(yī)研究所,甘肅 蘭州 730046)

捕食線蟲真菌(Nematophagousfung)一般分為捕食菌物、內(nèi)寄生菌物、機(jī)會(huì)菌物和產(chǎn)毒素菌物,能捕捉、寄生、定植和產(chǎn)生毒素,殺死線蟲,涉及到真菌界的壺菌門、接合菌門、子囊菌門、擔(dān)子菌門、有絲分裂菌類和假菌界的卵菌門[1-2],種類繁多,在生物防控線蟲方面擁有巨大的價(jià)值和潛力。

少孢節(jié)叢孢菌(Arthrobotrysoligospora)是一種典型的捕食線蟲真菌,能夠產(chǎn)生黏性菌網(wǎng)捕捉線蟲。在侵染線蟲過程中,少孢節(jié)叢孢菌可分泌蛋白酶、幾丁質(zhì)酶和膠原酶等胞外水解酶,與捕食結(jié)構(gòu)共同作用從而高效地完成線蟲的固定、角質(zhì)層的入侵以及宿主細(xì)胞的降解等過程[3-6]。2011年,Yang等[3]對(duì)經(jīng)線蟲誘導(dǎo)產(chǎn)生捕食器官的少孢節(jié)叢孢菌進(jìn)行基因組學(xué)分析,預(yù)測(cè)出16個(gè)具有糖苷水解酶18家族幾丁質(zhì)酶結(jié)構(gòu)特征的幾丁質(zhì)酶基因[4],發(fā)現(xiàn)這些幾丁質(zhì)酶在碳源缺乏或幾丁質(zhì)底物存在時(shí)表達(dá)量明顯上調(diào),提示幾丁質(zhì)酶在少孢節(jié)叢孢菌捕食線蟲的過程中可能發(fā)揮重要作用。然而,目前對(duì)少孢節(jié)叢孢菌的幾丁質(zhì)酶生物學(xué)功能及其作用機(jī)制尚不清楚。

本研究對(duì)少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株幾丁質(zhì)酶AO-483基因進(jìn)行克隆和分子特征分析,構(gòu)建原核表達(dá)載體,進(jìn)行原核表達(dá)重組融合蛋白;采用DNS還原糖法檢測(cè)通過Ni-NAT親和層析柱純化的重組幾丁質(zhì)酶活性,并將其作用于秀麗隱桿線蟲Ⅰ期和Ⅳ期幼蟲以驗(yàn)證其生物學(xué)活性,為進(jìn)一步揭示幾丁質(zhì)酶AO-483在少孢節(jié)叢孢菌捕食線蟲過程中的作用及機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 菌株、試劑及培養(yǎng)基

少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株(ArthrobotrysoligosporaXJ-A1)、大腸埃希菌(Escherichiacoli)DH5α菌株、大腸埃希菌BL21菌株(DE3)和pET32a(+)質(zhì)粒由石河子大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室保存;反轉(zhuǎn)錄試劑盒、pMD19-T載體、His融合蛋白純化柱購自日本TaKaRa公司;EZ柱式真菌RNA抽提試劑盒購自上海生物工程有限公司;透析袋購自廣州東盛生物科技有限公司;鼠抗His抗體、HRP標(biāo)記的羊抗鼠IgG購自北京全氏金生物技術(shù)有限公司;DNS試劑購自北京生東科技有限公司;幾丁質(zhì)購自上海瑞永生物科技有限公司;NGM培養(yǎng)基參考文獻(xiàn)[7]配制。

1.2 幾丁質(zhì)酶基因AO-483cDNA的克隆及序列分析

按照RNA提取試劑盒說明書提取少孢節(jié)叢孢菌XJ-A1分離株RNA,利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄成cDNA,進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。引物由Primer 5設(shè)計(jì),由北京六合華大基因科技股份有限公司合成。上游引物F: 5′-CCGGAATTCATGCCGCCAGTCCTCCC-3′;下游引物R: 5′-CGAGCGGCCGCTTATTCCTGGGCCTCTAAGCC-3′(下劃線部分分別為EcoRI和NotI酶切位點(diǎn))。反應(yīng)體系:PCR Mixture 8 μL,上下游引物各0.5 μL,cDNA模板2 μL,補(bǔ)足超純水至20 μL。反應(yīng)條件:95 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,63 ℃ 40 s,72 ℃ 70 s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,回收后與pMD19-T連接,轉(zhuǎn)化至大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽性克隆,提取重組質(zhì)粒pT-AO483進(jìn)行測(cè)序。利用在線生物分析軟件對(duì)AO-483基因及其編碼蛋白進(jìn)行序列分析。

1.3 原核表達(dá)質(zhì)粒pET32a-A0483的構(gòu)建

用EcoRI和NotI分別對(duì)pMD19-AO483和pET32a(+)質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,回收pET32a載體片段和AO-483目的片段,在T4 DNA 連接酶作用下16 ℃過夜連接后轉(zhuǎn)化入E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,經(jīng)氨芐青霉素抗性篩選和菌液PCR驗(yàn)證后獲得重組質(zhì)粒pET-A0483。

1.4 目的蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE和Western blot鑒定

將重組質(zhì)粒pET-AO483轉(zhuǎn)化入大腸埃希菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,取陽性克隆菌液200 μL接種于200 mL含氨芐青霉素抗性的LB培養(yǎng)液中,37 ℃,180 r·min-1過夜培養(yǎng)至D600為0.6~0.8,加入終濃度為1 mmol·L-1的誘導(dǎo)劑IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),6 h后收集菌體,進(jìn)行SDS-PAGE分析,并以小鼠抗少孢節(jié)叢孢菌多克隆血清抗體為一抗,HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG為二抗進(jìn)行Western blot鑒定。

1.5 重組幾丁質(zhì)酶AO-483的純化

將收集的菌體用細(xì)胞裂解液懸浮后反復(fù)凍融,離心收集沉淀,加10 mL 8 mol·L-1尿素后,于室溫放置2 h,用Ni-NTA親和層析柱進(jìn)行純化,然后將純化蛋白AO-483轉(zhuǎn)移至透析袋中,分別在6、4、2、1 mol·L-1尿素及去離子水中透析6~8 h,然后用蔗糖濃縮3 h后,收集透析袋中蛋白。

1.6 重組幾丁質(zhì)酶AO-483酶活性測(cè)定

1.6.1 N-乙酞葡萄糖胺(NAG)標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制

配制濃度為1 mg·mL-1的NAG標(biāo)準(zhǔn)液,準(zhǔn)確取0、0.1、0.2、0.4、0.6、0.8 mL分別加入到10 mL的試管中,并分別補(bǔ)加超純水至2 mL后加入3 mL DNS試劑。以NAG濃度為橫坐標(biāo)、不同濃度的NAG反應(yīng)液(3個(gè)重復(fù))在540 nm處吸光值為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。

1.6.2 重組幾丁質(zhì)酶AO-483活性測(cè)定

采用DNS(二硝基水楊酸)法測(cè)還原糖含量來測(cè)定重組酶活性,參照文獻(xiàn)[8]制備膠體幾丁質(zhì),參考文獻(xiàn)[9]以膠體幾丁質(zhì)為底物測(cè)定酶活性。取200 μL粗酶液和200 μL膠體幾丁質(zhì)混勻,37 ℃反應(yīng)30 min后加入600 μL DNS試劑反應(yīng),取上清200 μL于540 nm處測(cè)D值。在此反應(yīng)體系下每生成1 μg NAG所需的酶量定義為1個(gè)幾丁質(zhì)酶活力單位。

1.6.3 重組幾丁質(zhì)酶AO-483作用于秀麗隱桿線蟲幼蟲

將制備的秀麗隱桿線蟲Ⅰ期及Ⅳ期幼蟲懸液[7]分別與等量的重組幾丁質(zhì)酶AO-483混勻,對(duì)照組將幼蟲懸液分別與等量的PBS緩沖液混勻,置于37 ℃,作用0、0.5、1、6、12、24、36 h時(shí)分別取400 μL,利用 DNS試劑測(cè)定NAG含量,并通過顯微鏡觀察重組酶作用于幼蟲后其形態(tài)學(xué)變化,分析重組蛋白酶的生物學(xué)活性。

2 結(jié)果與分析

2.1 少孢節(jié)叢孢菌AO-483基因的RT-PCR擴(kuò)增與克隆

利用特異性引物通過RT-PCR擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),目的基因AO-483大小為930 bp,與GenBank已公布的少孢節(jié)叢孢菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC 24927)AO-483 cDNA大小一致(圖1)。

2.2 少孢節(jié)叢孢菌幾丁質(zhì)酶AO-483基因及編碼蛋白分析

序列分析發(fā)現(xiàn)(圖2),AO-483基因全長930 bp,編碼309個(gè)氨基酸,與少孢節(jié)叢孢菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC 24927)幾丁質(zhì)酶AO-483基因序列同源性為96.88%,氨基酸序列同源性為97.73%。AO-483基因編碼蛋白具有1個(gè)Glyco-hydro-18結(jié)構(gòu)域(位于20~297位氨基酸);催化活性區(qū)域位于17~281位,其特征序列為第96~100位的GMLGG為底物結(jié)合位點(diǎn),第132~140位的LDGLDLDVE為水解酶催化活性位點(diǎn)。此外,還有5個(gè)CKⅡ磷酸化位點(diǎn)(位于66~69、107~110、185~188、213~216、253~256位氨基酸),4個(gè)N端 ?;稽c(diǎn)(位于96~101、209~214、239~244、266~271位氨基酸),1個(gè)PCK磷酸化位點(diǎn)(位于113~115位氨基酸)。SWISS-MODEL分析顯示(圖3),幾丁質(zhì)酶AO-483具有典型的GH18幾丁質(zhì)酶三磷酸異構(gòu)酶桶形結(jié)構(gòu)域。

M,DL2000 DNA marker;1~3,RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。M,DL2000 DNA marker;1-3,Amplification products of RT-PCR.圖1 AO-483基因RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 RT-PCR product of AO-483 gene

2.3 重組質(zhì)粒pET-AO483的雙酶切鑒定結(jié)果

用EcoR I和NotI對(duì)重組質(zhì)粒pET-AO483進(jìn)行雙酶切,獲得5 874 bp和930 bp大小的2條核酸條帶,與預(yù)期結(jié)果一致(圖4),證實(shí)重組質(zhì)粒pET-AO483構(gòu)建成功。

2.4 重組蛋白SDS-PAGE和Western blot分析

如圖5所示,表達(dá)產(chǎn)物經(jīng)SDS-PAGE分析后,在相對(duì)分子質(zhì)量約52 ku處可見特異性反應(yīng)條帶,分子量與預(yù)期值相同;用鎳柱純化的蛋白酶出現(xiàn)與預(yù)期大小一致的單一蛋白條帶。Western blot分析表明,表達(dá)的重組蛋白能與小鼠抗少孢節(jié)叢孢菌多克隆血清抗體發(fā)生特異性反應(yīng)。

2.5 重組幾丁質(zhì)酶AO-483酶活性研究

根據(jù)NAG標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算,以膠體幾丁質(zhì)為底物,檢測(cè)重組幾丁質(zhì)酶AO-483活性為223.31 U·mL-1。將重組幾丁質(zhì)酶液分別作用于Ⅰ期幼蟲和Ⅳ期幼蟲,利用DNS試劑測(cè)定該反應(yīng)過程中能否產(chǎn)生及能產(chǎn)生多少還原糖。結(jié)果發(fā)現(xiàn),對(duì)照組未檢測(cè)到還原糖產(chǎn)生,而試驗(yàn)組作用于Ⅰ期幼蟲6 h后,在反應(yīng)液中檢測(cè)到還原糖產(chǎn)生,隨著反應(yīng)時(shí)間的增長,產(chǎn)生的還原糖量越多,分別為154.08、188.69、189.46、191.77 μg。作用于Ⅳ期幼蟲12 h后,才能檢測(cè)到還原糖產(chǎn)生,還原糖量也隨著反應(yīng)時(shí)間的增長而增多,分別為151.00、165.62、181.77 μg。

2.6 重組幾丁質(zhì)酶AO-483對(duì)秀麗隱桿線蟲幼蟲的降解作用

重組幾丁質(zhì)酶液作用Ⅰ期和Ⅳ期幼蟲后,發(fā)現(xiàn)試驗(yàn)組Ⅰ期幼蟲在6 h時(shí)全部死亡,蟲體體壁皺縮破裂,至12 h時(shí)體壁組織發(fā)生降解,36 h時(shí)大部分體壁組織發(fā)生降解;對(duì)照組Ⅰ期幼蟲初期未見異常,蟲體繼續(xù)發(fā)育,后期蟲體活力下降,運(yùn)動(dòng)緩慢,但體壁完整(圖6)。與Ⅰ期幼蟲的對(duì)照組幼蟲類似,試驗(yàn)組Ⅳ期幼蟲在6 h時(shí)表現(xiàn)為活力下降,運(yùn)動(dòng)緩慢,至12 h時(shí)全部死亡,蟲體體壁部分發(fā)生降解,至36 h時(shí)大部分體壁組織發(fā)生降解;對(duì)照組Ⅳ期幼蟲初期未見異常,蟲體繼續(xù)發(fā)育,后期蟲體僵直,活力下降,但體壁完整(圖7)。

圖2 AO-483基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)域模式圖Fig.2 Domains of AO-483 gene encoding protein

圖3 AO-483基因編碼蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig.3 Prediction of tertiary structure of AO-483 gene encoded protein

M,DL 5 000 DNA marker;1,雙酶切pET-AO483重組質(zhì)粒;2,pET-AO483重組質(zhì)粒。M,DL 2 000 DNA marker;1,Double enzyme digestion for identification of recombinant of pET-AO483;2,Recombinant of pET-AO483.圖4 重組質(zhì)粒 pET-A0483雙酶切鑒定Fig.4 Restriction enzyme analysis of the recombinant plasmid pET-AO483

M,融合蛋白表達(dá)量; 1,pET32a空載體SDS-PAGE分析結(jié)果;2~4,重組載體pET-AO483誘導(dǎo)6 h SDS-PAGE分析結(jié)果;5,純化的重組酶AO-483 SDS-PAGE分析結(jié)果;6,未純化的重組酶AO-483 Western blot分析結(jié)果;7,純化的重組酶AO-483 Western blot分析結(jié)果。M,Expression of fusion protein;1,SDS-PAGE analysis results of pET32a no load induced protein expression;2-4,SDS-PAGE analysis results of expression of pET-AO483 recombinant was induced for 6 h;5,SDS-PAGE analysis results of purified recombinant enzyme AO-483;6,Western blot analysis results of unpurified recombinant enzyme AO-483;7,Western blot analysis results of purified recombinant enzyme AO-483.圖5 重組蛋白AO-483 SDS-PAGE和Western blot分析結(jié)果Fig.5 SDS-PAGE and Western blot analysis of recombinant protein AO-483

3 討論

已有研究表明,作為線蟲的自然天敵,捕食線蟲性真菌分泌的胞外水解酶絲氨酸蛋白酶和幾丁質(zhì)酶在其捕食線蟲過程中可能發(fā)揮著降解蛋白質(zhì)和幾丁質(zhì)的重要作用。目前,已經(jīng)從捕食線蟲性真菌少孢節(jié)叢孢菌中分離鑒定的絲氨酸蛋白酶如PⅡ、Aoz1、P186等[10-11],并且對(duì)其理化性質(zhì)、作用底物及降解線蟲活性開展了研究,證實(shí)了在捕食線蟲的過程中絲氨酸蛋白酶對(duì)角質(zhì)層的侵入、宿主細(xì)胞的降解有重要的生物學(xué)作用。然而,目前對(duì)于捕食線蟲性真菌幾丁質(zhì)酶的研究還較少。已有研究發(fā)現(xiàn),通過基因組序列分析鑒定少孢節(jié)叢孢菌中有16個(gè)幾丁質(zhì)酶(AO-379、AO-406、AO-486、AO-492、AO-576、AO-587、AO-190、AO-483、AO-59、AO-342、AO-427、AO-31、AO-14、AO-223、AO-229和AO-801),但其結(jié)構(gòu)與功能尚不清楚[4]。

幾丁質(zhì)酶廣泛存在于微生物、植物、動(dòng)物中,典型的GH18幾丁質(zhì)酶家族一般都含有信號(hào)肽、幾丁質(zhì)酶催化域、幾丁質(zhì)結(jié)合域及1個(gè)短的C端區(qū)域結(jié)構(gòu),部分幾丁質(zhì)酶還含有幾丁質(zhì)酶插入結(jié)構(gòu)域[12-19]。本研究通過對(duì)具有強(qiáng)捕食活性的少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株XJ-A1的幾丁質(zhì)酶AO-483基因進(jìn)行分子特征分析發(fā)現(xiàn),AO-483屬于糖苷水解酶18家族,其含有幾丁質(zhì)底物結(jié)合位點(diǎn)GMLGG和幾丁質(zhì)酶催化活性位點(diǎn)LDGLDLDVE,與其他典型的GH18幾丁質(zhì)酶不完全相同。

圖6 重組幾丁質(zhì)酶AO-483作用秀麗隱桿線蟲Ⅰ期幼蟲后蟲體形態(tài)學(xué)觀察Fig.6 Morphological observation of Caenorhabditis elegans larvae stage 1 treated by recombinant AO-483

圖7 重組幾丁質(zhì)酶AO-483作用秀麗隱桿線蟲Ⅳ期幼蟲后蟲體形態(tài)學(xué)觀察Fig.7 Morphological observation of Caenorhabditis elegans larvae stage 4 treated by recombinant AO-483

幾丁質(zhì)是線蟲的體壁和蟲卵外殼的重要組成成分,能發(fā)揮屏障保護(hù)作用,使蟲卵及線蟲抵御外界不良環(huán)境。Waller等[20]認(rèn)為,捕食線蟲性真菌對(duì)Ⅲ期幼蟲的捕獲能力更強(qiáng);Grant等[21]認(rèn)為,捕食線蟲性真菌分泌的GH18幾丁質(zhì)酶能夠降解根結(jié)線蟲Ⅰ期幼蟲的角質(zhì)層從而抑制其生長。本研究中,將重組AO-483酶液作用于秀麗隱桿線蟲幼蟲,利用DNS試劑在反應(yīng)6 h的Ⅰ期幼蟲反應(yīng)液以及反應(yīng)12 h的Ⅳ期幼蟲反應(yīng)液中檢測(cè)到還原糖產(chǎn)生,表明重組酶AO-483對(duì)于線蟲的幾丁質(zhì)成分具有降解作用。同時(shí),通過對(duì)Ⅰ期幼蟲以及Ⅳ期幼蟲的形態(tài)學(xué)觀察也發(fā)現(xiàn),重組酶對(duì)Ⅰ期幼蟲降解能力強(qiáng)于Ⅳ期幼蟲。本研究結(jié)果提示,少孢節(jié)叢孢菌幾丁質(zhì)酶AO-483在降解線蟲過程中發(fā)揮了重要的作用,為進(jìn)一步研發(fā)動(dòng)物消化道線蟲病新型生物防控制劑提供了科學(xué)依據(jù)。

猜你喜歡
孢菌線蟲質(zhì)粒
夏季蔬菜換茬期線蟲防治要注意
農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法中的“Ti質(zhì)粒轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng)”的簡介
——一道江蘇高考題的奧秘解讀和拓展
全基因組測(cè)序后質(zhì)粒的組裝與鑒定研究進(jìn)展*
251份大豆品種(系)對(duì)大豆疫霉及多種鐮孢菌的抗性評(píng)價(jià)
大蒜鱗莖浸提液對(duì)花生根腐病菌的抑制作用
化學(xué)合成殺線蟲劑的分類概述
mcr-1陽性類噬菌體質(zhì)粒與F33∶A-∶B-質(zhì)粒共整合形成的融合質(zhì)粒的生物學(xué)特性分析
基于培養(yǎng)池陣列微流控芯片的單線蟲并行分離條件考察
綿馬貫眾素對(duì)馬鈴薯干腐病菌的抑菌活性研究
線蟲液體培養(yǎng)和監(jiān)測(cè)過程關(guān)鍵參數(shù)的實(shí)驗(yàn)研究
红安县| 崇礼县| 涞源县| 金门县| 德江县| 长葛市| 门头沟区| 佛冈县| 同德县| 祁阳县| 尼木县| 兴化市| 扬州市| 桦南县| 抚远县| 邮箱| 台北县| 宽甸| 阜城县| 望都县| 会泽县| 舞钢市| 中超| 巴东县| 彭水| 四会市| 买车| 烟台市| 德江县| 潞城市| 长沙市| 乌兰县| 辽源市| 句容市| 石城县| 胶南市| 竹溪县| 扶沟县| 泰兴市| 民丰县| 信宜市|