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調(diào)控植物種子發(fā)育的轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展

2019-02-20 04:50:07吳玉沈永寶史鋒厚
生物技術(shù)通報(bào) 2019年11期
關(guān)鍵詞:胚乳擬南芥家族

吳玉 沈永寶,2 史鋒厚,2

(1. 南京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,南京 210037;2.南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心 國(guó)家林業(yè)局南方林木種子檢驗(yàn)中心,南京 210037)

植物種子發(fā)育分為形態(tài)發(fā)育和種子成熟兩個(gè)階段[1],每個(gè)階段都由相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控和監(jiān)管[2]。轉(zhuǎn)錄因子包含DNA結(jié)合區(qū)(DNA-binding domain,DBD)、寡聚化位點(diǎn)區(qū)(Oligomerization site,OS)、核定位信號(hào)區(qū)(Nuclear location signal,NLS)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)(Transcription regulation domain,TRD)4個(gè)功能結(jié)構(gòu)域[3],通過(guò)這些結(jié)構(gòu)域與順式元件相互作用調(diào)控基因的表達(dá)。已知參與調(diào)控種子發(fā)育第一階段(形態(tài)發(fā)育)的轉(zhuǎn)錄因子有WOX(WUSCHEL-related homebox)、HAP3(Heme-activated protein3)等,參與調(diào)控種子發(fā)育第二階段(種子成熟)的轉(zhuǎn)錄因子有 B3(B3 superfamily)、bZIP(Basic region/leucine zipper motif)等,參與調(diào)控植物種子大小的轉(zhuǎn)錄因子 有 AP2/EREBP(APETALA2/ethylene-responsive element binding proteins)、bHLH(basic helix-loophelix protein)等。有的轉(zhuǎn)錄因子如HAP3(Hemeactivated protein3),全程參與種子發(fā)育的每個(gè)階段,而有的轉(zhuǎn)錄因子如MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog),則是種子發(fā)育過(guò)程中某個(gè)特定階段所獨(dú)有的。本文對(duì)植物種子發(fā)育過(guò)程中轉(zhuǎn)錄因子的種類(lèi)、結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行概述,解析其作用順序和分子調(diào)控機(jī)理,以期為植物種子品質(zhì)改良研究提供相關(guān)理論支持和技術(shù)參考。

1 調(diào)控種子發(fā)育第一階段(形態(tài)發(fā)育)過(guò)程中的轉(zhuǎn)錄因子家族及其功能

種子發(fā)育第一階段主要是胚、胚乳和種皮的形態(tài)發(fā)育,胚的發(fā)育始于胚囊中的卵細(xì)胞和精細(xì)胞形成的受精卵(合子),經(jīng)過(guò)一系列變化形成原胚,原胚經(jīng)細(xì)胞分裂與分化后,發(fā)育成為具有子葉、胚芽、胚軸和胚根的完整胚。胚乳在細(xì)胞增殖、區(qū)域化和細(xì)胞分化后,發(fā)育成為胚胎提供營(yíng)養(yǎng)的組織,胚乳的發(fā)育始終早于胚的發(fā)育。被子植物種子的胚乳由胚囊中的2個(gè)極核或次生核與1個(gè)精細(xì)胞受精發(fā)育而成,裸子植物種子的胚乳是由1個(gè)雌配子體細(xì)胞發(fā)育而成。種皮由胚珠的珠被發(fā)育而成,包圍在胚和胚乳外面起保護(hù)作用。已知調(diào)控胚和胚乳發(fā)育的的轉(zhuǎn)錄因子有WOX家族、HAP3家族、MADS-box、NAC家族和bHLH家族;調(diào)控種皮形態(tài)發(fā)育的轉(zhuǎn)錄因子有bHLH家族和MYB家族。

1.1 WOX家族

WOX轉(zhuǎn)錄因子包含65個(gè)氨基酸殘基組成的同源異型結(jié)構(gòu)域,根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分為遠(yuǎn)古支、中間支和WUS支[4]。在雙子葉植物擬南芥中,中間支WOX2、WOX8和WOX9基因共同監(jiān)管早期胚的發(fā)育形成,第一次細(xì)胞分裂后,WOX2標(biāo)記頂端細(xì)胞,WOX8和WOX9標(biāo)記基底細(xì)胞。至典型八細(xì)胞期,WOX9和WOX2在形成下胚軸及部分根的中間區(qū)發(fā)揮作用,WOX8在胚柄細(xì)胞表達(dá),WOX8和WOX9作用于產(chǎn)生根分生組織的胚根處。Zhu等[5]研究發(fā)現(xiàn)在裸子植物挪威云杉(Picea abies)中,WOX基因和生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)基因參與胚胎的形成,中間支WOX2、WOX8和WOX9的同源基因PaWOX2和PaWOX8/9在原胚形成階段高度表達(dá),并且在完整胚的形成中擁有相似表達(dá)模式。WUS支的WOX2、WOX3以及WOX4基因在胚體、邊緣分生組織以及維管束系統(tǒng)中表達(dá)。Palovaara等[6]研究發(fā)現(xiàn)在擬南芥胚的發(fā)育過(guò)程中,WOX基因與激素互作,共同調(diào)控胚芽發(fā)育。此外,WOX轉(zhuǎn)錄因子還與其他轉(zhuǎn)錄因子相互作用,在胚的早期發(fā)育階段,WOX8和WOX9在受精卵、基部子細(xì)胞和下胚軸細(xì)胞中被WRKY2轉(zhuǎn)錄因子激活。由此可見(jiàn),WOX轉(zhuǎn)錄因子家族在植物種子胚形期發(fā)揮重要作用,促進(jìn)細(xì)胞分裂和阻止未成熟細(xì)胞的提前分化。

1.2 HAP3家族

HAP3轉(zhuǎn)錄因子包含不保守的A區(qū)、C區(qū)和保守的B區(qū)3個(gè)結(jié)構(gòu)域,根據(jù)B區(qū)氨基酸序列相似性將其分為L(zhǎng)EC1(LEAFY COTYLEDON1)型和非LEC1型,Kwong等[7]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中LEC1是胚胎發(fā)生早期和晚期正常發(fā)育所需的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,在營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞中誘導(dǎo)胚胎發(fā)育,編碼CCAAT結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的HAP3亞基,是調(diào)控胚形成的必要因子。Jo等[8]研究表明LEC1在擬南芥種子發(fā)育中的胚細(xì)胞和胚乳組織中表達(dá),是控制胚和胚乳發(fā)育的中心調(diào)節(jié)因子,可激活胚形態(tài)發(fā)生和細(xì)胞分化所需的基因轉(zhuǎn)錄。Pelletier等[9]研究發(fā)現(xiàn)LEC1在擬南芥和大豆種子不同的發(fā)育階段控制著不同的基因組,包括在種子發(fā)育早期和種子成熟過(guò)程中介導(dǎo)光合作用和葉綠體之間的基因組。Hu等[10]研究發(fā)現(xiàn) LEC1調(diào)節(jié)擬南芥和大豆胚形態(tài)發(fā)生基因的表達(dá),以及胚發(fā)育早期生長(zhǎng)素的合成。Boularda等[11]研究發(fā)現(xiàn)LEC1全程參與植物胚胎染色質(zhì)狀態(tài)的長(zhǎng)期重編程。Orlowska等[12]研究發(fā)現(xiàn)LEC1在胚胎形態(tài)發(fā)生中誘導(dǎo)體細(xì)胞胚發(fā)育。Huang 等[13]通過(guò)比較擬南芥野生型和lec1突變體之間毛狀體發(fā)育相關(guān)的基因表達(dá)發(fā)現(xiàn),LEC1在胚細(xì)胞發(fā)育后期起著決定性作用。由此可見(jiàn),HAP3轉(zhuǎn)錄因子家族是植物種子胚發(fā)生發(fā)育過(guò)程中的關(guān)鍵調(diào)控因子,控制著胚胎發(fā)育過(guò)程中的多個(gè)方面。

1.3 MADS-box家族

MADS-box的名稱(chēng)來(lái)自NCM1(釀酒酵母轉(zhuǎn)錄因子)、AGAMOUS(擬南芥花同源異型基因)、DEFICIENS(金魚(yú)草花同源異型基因)和SRF(人血清應(yīng)答因子)這4類(lèi)蛋白的首字母,均包含高度保守的由56-58個(gè)氨基酸組成的MADS-box結(jié)構(gòu)域[14]。A、B、C、D、E類(lèi)MADS-box基因是經(jīng)典植物花器官發(fā)育模型的主要基因,D類(lèi)基因主要負(fù)責(zé)調(diào)控胚珠的發(fā)育。Angenent等[15]研究發(fā)現(xiàn)矮牽牛的D類(lèi)基因FBP7和FBP11對(duì)胚座以及胚珠的發(fā)育進(jìn)行調(diào)控。Chen 等[16]研究發(fā)現(xiàn)蘭花中的D類(lèi)MADS-box基因調(diào)控了胚珠發(fā)育的分子機(jī)制。Suárez Baron 等[17]研究發(fā)現(xiàn)馬兜鈴花中的D類(lèi)同源基因AfimSTK是花藥和胚珠中孢子組織特性的關(guān)鍵因子。Ehlers 等[18]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥的D型同源基因SHP1、SHP2調(diào)控胚珠發(fā)育。由此可見(jiàn),MADS-box家族的D類(lèi)基因在調(diào)控胚珠發(fā)育中至關(guān)重要。

1.4 NAC家族

NAC的名稱(chēng)來(lái)自矮牽牛NAM(NO APICAL MERISTEM)基因和擬南芥ATAF1/2和CUC(CUPSHAPED COTYLEDON)基因的首字母,各成員的N 端均含有高度保守的 NAC 結(jié)構(gòu)域[19-21]。Tadashi等[22]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中的NARSl和NARS2基因負(fù)責(zé)調(diào)控胚珠珠被的生長(zhǎng)和退化,敲除掉突變體nars1和nars2后,出現(xiàn)珠被退化推遲和種子外形異常。野生型植株由雙突變體nars1和nars2授粉可生成具備正常外形的種子,反之種子外形出現(xiàn)異常。Christianson 等[23]從擬南芥中篩選出 NAC 轉(zhuǎn)錄因子ANAC102,qRT-PCR 試驗(yàn)結(jié)果顯示ANAC102受低氧脅迫的誘導(dǎo)而表達(dá),是水脅迫下參與種子萌發(fā)的重要調(diào)控因子。黃娟等[24]研究發(fā)現(xiàn)NAC轉(zhuǎn)錄因子負(fù)責(zé)調(diào)控水稻和小麥種子的發(fā)育、籽粒灌漿。朱娉等[25]研究發(fā)現(xiàn)小麥中的NAM基因能增加籽粒蛋白質(zhì)積累,并促進(jìn)鋅、鐵等微量元素吸收。Waters 等[26]研究發(fā)現(xiàn)NAC轉(zhuǎn)錄因子NAM-B1基因影響小麥中營(yíng)養(yǎng)物濃度的分配。Uauy等[27]研究發(fā)現(xiàn)NAC轉(zhuǎn)錄因子TtNAM-B1、TtNAM-A1和TtNAM-B2能不同程度地促進(jìn)籽粒中蛋白和鋅、鐵等微量元素的積累。吳丹等[28]研究發(fā)現(xiàn)中國(guó)春小麥中的NAM轉(zhuǎn)錄因子Gpc-1及Gpc-2參與調(diào)控籽粒中礦物元素的轉(zhuǎn)運(yùn)。胡喜貴等[29]研究發(fā)現(xiàn)野生二粒小麥中的NAM-B1基因可提高籽粒中蛋白質(zhì)、鐵、鋅等物質(zhì)的含量。由此可見(jiàn),NAC轉(zhuǎn)錄因子家族調(diào)控珠被生長(zhǎng)、蛋白質(zhì)和鐵、鋅等微量元素的積累。

1.5 bHLH家族

bHLH(basic helix loop helix)轉(zhuǎn)錄因子的名稱(chēng)源于其含有保守的bHLH 結(jié)構(gòu)域,通常以二聚體形式發(fā)揮作用,bHLH結(jié)構(gòu)域含有堿性區(qū)域和HLH區(qū)域[30-31]。Kondou等[32]研究發(fā)現(xiàn)在擬南芥的胚胎心形發(fā)育時(shí)期,胚乳中的bHLH轉(zhuǎn)錄因子RGE1基因在控制胚胎生長(zhǎng)中起重要作用。Feng等[33]研究發(fā)現(xiàn)bHLH轉(zhuǎn)錄因子ZmbHLH44(OPAQUE11)控制玉米胚乳中的貯藏營(yíng)養(yǎng)代謝。Tanabe等[34]研究發(fā)現(xiàn)玉米種子發(fā)育中ZmbHLH在胚乳和胚胎發(fā)育過(guò)程中高度表達(dá),參與了它們的發(fā)育。此外,還發(fā)現(xiàn)ZmbHLH87和ZmbHLH185在轉(zhuǎn)移細(xì)胞中特異性表達(dá),調(diào)節(jié)籽粒灌漿過(guò)程。Li等[35]研究發(fā)現(xiàn)蕓苔中的bHLH轉(zhuǎn)錄因子BrTT8主要負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)種皮中原花色素(PA)的積累。Gonzalez等[36]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥種子的棕色由原花色素(PA或縮合單寧)在其內(nèi)部種皮層中的沉積引起,TT2、TT8和TTG1組成的轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物控制PA生物合成基因的表達(dá),一起調(diào)控芽表皮中的毛狀體發(fā)育和外種皮層粘液產(chǎn)生細(xì)胞的分化。Padmaja等[37]研究發(fā)現(xiàn)TT8基因的突變是抑制芥菜黃種子突變體LBG轉(zhuǎn)錄所必需的,負(fù)責(zé)調(diào)控種皮顏色。由此可見(jiàn),bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族在調(diào)控胚胎、胚乳及種皮的發(fā)育過(guò)程中不可或缺。

1.6 MYB家族

MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)轉(zhuǎn)錄因子因含有Myb結(jié)構(gòu)域而得名,其N(xiāo)端由 1-3 個(gè)串聯(lián) R 結(jié)構(gòu)(R1、R2 和 R3)組成[38]。Matsui等[39]在擬南芥中通過(guò)嵌合AtMYB23阻遏物的表達(dá)發(fā)現(xiàn)MYB蛋白AtMYB23參與調(diào)控種皮發(fā)育。Luo等[40]研究發(fā)現(xiàn)將苦蕎中分離出的FtMYB15基因在擬南芥中異位過(guò)量表達(dá)后,種皮中色素沉著增加,且花青素積累水平提高。Herniter等[41]通過(guò)PCR標(biāo)記豇豆中的MYB113基因Vigun05g039500,發(fā)現(xiàn)其是豇豆黑色種皮顏色的候選基因。由此可見(jiàn),MYB轉(zhuǎn)錄因子家族主要調(diào)控種皮發(fā)育和種皮中色素的積累。

2 調(diào)控種子發(fā)育第二階段(種子成熟)過(guò)程中的轉(zhuǎn)錄因子家族及其功能

種子發(fā)育的第二階段包括器官增大和種子成熟[2],種子的大小由胚、胚乳和種皮三者的協(xié)調(diào)生長(zhǎng)決定,種子的成熟以淀粉、脂類(lèi)和蛋白質(zhì)等貯藏物合成積累的完成為標(biāo)志[42-43]。參與調(diào)控種子成熟和種子大小的轉(zhuǎn)錄因子有HAP家族、B3家族、Zinc finger家族、bZIP家族、AP2/EREBP家族、WRKY家族、IKU、MINI3、SHB1基因和KLU基因。

2.1 HAP家族

HAP3家族的LEC1轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控種子成熟,Kagaya等[44]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中LEC1通過(guò)調(diào) 節(jié)FUS3(FUSCA3) 和ABI3(ABSCISIC ACID INSENSITIVE3)來(lái)控制種子成熟過(guò)程中貯藏蛋白基因(SSP)的積累,LEC1異位表達(dá)能夠激活SSP基因表達(dá)和誘導(dǎo)FUS3、ABI3和LEC2的表達(dá)。Mu等[45]研究發(fā)現(xiàn)LEC1在脂肪酸合成環(huán)節(jié)發(fā)揮著重要的調(diào)控作用,在擬南芥中過(guò)表達(dá)LEC1會(huì)導(dǎo)致脂肪酸生物合成基因的全面增加的表達(dá)。Junker等[46]研究發(fā)現(xiàn)LEC1部分與脫落酸結(jié)合,影響生長(zhǎng)素合成,參與調(diào)節(jié)胚胎和胚胎外細(xì)胞的伸長(zhǎng)。Tan等[47]研究發(fā)現(xiàn)在甘藍(lán)型油菜中條件性表達(dá)LEC1同源基因BnLEC1和BnL1L導(dǎo)致脂肪酸水平增加。由此可見(jiàn),HAP3家族主要負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)胚胎伸長(zhǎng)、貯藏蛋白積累和脂肪酸合成。

2.2 B3家族

B3超家族分為L(zhǎng)AV家族、ARF家族、RAV家族和REM家族,LAV家族又分為AFL(LEC2/FUS3/ ABI3)亞家族和HSI亞家族,兩個(gè)亞家族成員均參與種子成熟的調(diào)控。Baud等[48]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中種子成熟轉(zhuǎn)錄由LEC2、FUS3和ABI3調(diào)控,LEC1在LEC2和ABI3作用下增強(qiáng)了OLE1啟動(dòng)子的活化,擬南芥原生質(zhì)體中產(chǎn)生的重組LEC1和LEC2蛋白可在體外與NF-YC2形成調(diào)節(jié)性多蛋白復(fù)合物。Grimault等[49]研究發(fā)現(xiàn)AFL亞家族轉(zhuǎn)錄因子在玉米籽粒灌漿中發(fā)揮重要作用,鑒定出的LEC2、FUS3、ABI3的同源基因ZmAFL4、ZmAFL2和ZmAFL3 / ZmVp1可反式激活玉米油質(zhì)蛋白啟動(dòng)子,調(diào)控胚乳儲(chǔ)備物質(zhì)積累。Roscoe等[50]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥種子儲(chǔ)備定量由AFL調(diào)控,ABI3、FUS3和LEC2共同調(diào)節(jié)種子成熟的儲(chǔ)備,其中ABI3更大程度控制了儲(chǔ)存蛋白質(zhì)含量,F(xiàn)US3則更大程度地控制了脂質(zhì)含量。雖然ABI3控制整個(gè)胚胎的儲(chǔ)備含量,但LEC2和FUS3也參與調(diào)節(jié)不同胚胎區(qū)域的儲(chǔ)備。Fatihi 等[51]研究發(fā)現(xiàn),擬南芥中AFL對(duì)于實(shí)現(xiàn)種子成熟的儲(chǔ)存積累至關(guān)重要,LEC1是ABI3、FUS3 在上游發(fā)揮正調(diào)控作用的因子,對(duì)種子成熟行為進(jìn)行控制,諸如12S 貯藏蛋白基因的表達(dá)、葉綠素與花青素的積累等。此外,F(xiàn)US3和LEC1還負(fù)責(zé)調(diào)控種子內(nèi)ABI3蛋白的豐度。Kagaya等[52]研究發(fā)現(xiàn)LEC1通過(guò)調(diào)節(jié)FUS3和 ABI3來(lái)控制種子貯藏蛋白基因,LEC1的異位表達(dá)對(duì)FUS3和ABI3的表達(dá)具備誘導(dǎo)作用,基于LEC1、FUS3與ABI3 的多突變體狀況下,SSP這一種子貯藏蛋白的表達(dá)強(qiáng)度增強(qiáng)??梢?jiàn)LEC1對(duì)SSP基因表達(dá)的調(diào)控作用在一定程度上依賴(lài)于FUS3與ABI3。Boulard等[53]研究發(fā)現(xiàn)LAFL基因(LEC2、ABI3、FUS3、LEC1)編碼調(diào)節(jié)種子發(fā)育不同方面的轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控胚胎從早期到晚期儲(chǔ)存化合物的積累。這些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控胚胎發(fā)育和種子成熟之間的轉(zhuǎn)換、成熟種子和發(fā)芽之間的轉(zhuǎn)換。Boulard等[11]研究發(fā)現(xiàn)LEC1(NF-YB9)直接與LEC2相互作用以控制種子中的基因表達(dá),LEC1與LEC2兩者的互作并非表現(xiàn)為直接線(xiàn)性相關(guān),LEC1、ABI3和FUS3 在LEC2異位表達(dá)誘導(dǎo)后積累,此積累僅在激活種子特異蛋白后發(fā)生。由此可見(jiàn),LEC2可能聯(lián)合LEC1、ABI3 與FUS3一起對(duì)種子成熟期進(jìn)行調(diào)控,通過(guò)有序的互作行營(yíng)造滿(mǎn)足胚發(fā)育所需的細(xì)胞環(huán)境,對(duì)胚發(fā)育進(jìn)行調(diào)控。

2.3 Zinc finger家族

Dof家族屬于Zinc finger超家族,包含DNA結(jié)合域與特異轉(zhuǎn)錄調(diào)控域,主要調(diào)控種子的胚乳發(fā)育、貯藏蛋白的合成及脂肪含量的變化[54]。Kushwaha等[55]研究發(fā)現(xiàn)Dof轉(zhuǎn)錄因子PBFs在種子的發(fā)育階段激活醇溶蛋白啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄,玉米ZmPBF、水稻PBF和小麥WPBF通過(guò)識(shí)別胚乳表達(dá)基因醇溶蛋白對(duì)應(yīng)啟動(dòng)子中的 TGTAAAG 序列來(lái)激活其表達(dá)。除了醇溶蛋白基因以外,其他的胚乳表達(dá)基因如LKR基因,也被PBFs和Opaque-2共同調(diào)節(jié)。Gupta等[56]研究發(fā)現(xiàn)EcDof基因參與小米谷粒灌漿期間蛋白質(zhì)的積累。王志坤等[57]研究發(fā)現(xiàn)在大豆中過(guò)量表達(dá)GmDof11,可觀察到種子含油量升高,而蛋白質(zhì)含量降低。Zhang等[58]最新研究表明,水稻中OsDof24和OsDof25能夠調(diào)節(jié)種子貯藏蛋白谷蛋白GluB-1基因的表達(dá)。由此可見(jiàn),Dof 轉(zhuǎn)錄因子家族在種子發(fā)育成熟過(guò)程中發(fā)揮著非常重要的作用。

2.4 bZIP家族

bZIP(Basic leucine zipper)轉(zhuǎn)錄因子是真核生物轉(zhuǎn)錄因子中最具保守性且分布最廣泛的一類(lèi)蛋白,由亮氨酸拉鏈區(qū)域和DNA結(jié)合堿性結(jié)構(gòu)域組成[59]。Jakoby等[60]將擬南芥的bZIP轉(zhuǎn)錄因子分為了A、B、C、D、E、F、G、H、I和S10個(gè)亞族,不同亞家族發(fā)揮不同作用。Finkelstein等[61]研究發(fā)現(xiàn)C亞族bZIP 蛋白參與油菜中種子貯藏基因表達(dá),Lara等[62]在擬南芥中通過(guò)原位雜交分析表明bZIP 轉(zhuǎn)錄因子AtbZIP10和AtbZIP25的表達(dá)從種子中的mRNA發(fā)育的早期階段開(kāi)始,在成熟時(shí)達(dá)到峰值,在種子發(fā)育后期開(kāi)始下降,在時(shí)間和空間上匹配編碼2S白蛋白和十字花科蛋白的種子貯藏蛋白基因。此外,通過(guò)酵母雙雜交系統(tǒng)分析發(fā)現(xiàn)AtbZIP10/25與ABI3的共表達(dá)導(dǎo)致At2S1啟動(dòng)子的活化能力顯著增加,表明它們是參與種子特異性表達(dá)的調(diào)節(jié)復(fù)合物的一部分。Gacek等[63]研究發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)菜豆內(nèi)G亞族bZIP蛋白R(shí)OM1和ROM2通過(guò)調(diào)節(jié)儲(chǔ)存蛋白質(zhì)基因的表達(dá)來(lái)調(diào)控種子成熟。由此可見(jiàn),bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族調(diào)控種子發(fā)育成熟過(guò)程中貯藏蛋白的積累。

2.5 AP2/EREBP家族

AP2/EREBP超家族包含60-70個(gè)氨基酸殘基的AP2/ERF結(jié)構(gòu)域,分成EREBP亞族和AP2亞族,EREBP亞族分為ERF、DREB和Soloist,AP2亞族分為 AP2、RAV[64-65]。Irish 等[66]研究發(fā)現(xiàn) AP2 在控制擬南芥種子大小方面發(fā)揮重要作用。Wang等[67]研究證實(shí)AP2亞族參與調(diào)控種子的體積、重量、蛋白和油類(lèi)的積累。Jiang等[68]研究發(fā)現(xiàn)APETALA2轉(zhuǎn)錄因子SNB(SUPERNUMERARY BRACT)調(diào)控水稻種子大小,其增加的穎片縱向細(xì)胞伸長(zhǎng)導(dǎo)致ssh1突變體產(chǎn)生比野生型體積更大、粒重更高的種子。Ohto 等[69]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中AP2調(diào)控胚珠和種皮的發(fā)育,對(duì)等位基因ap2突變的分析表明 AP2活性直接影響種子質(zhì)量,導(dǎo)致種子發(fā)育過(guò)程中己糖與蔗糖的比例發(fā)生變化;相互交叉實(shí)驗(yàn)表明AP2對(duì)種子質(zhì)量的母體效應(yīng)涉及胚細(xì)胞數(shù)和細(xì)胞大小的調(diào)節(jié)。Zhao等[70]研究發(fā)現(xiàn)AP2轉(zhuǎn)錄因子AtAP2同源基因OsAP2-1在水稻花與種子的發(fā)育中至關(guān)重要。Ohto等[71]研究發(fā)現(xiàn)AP2對(duì)胚胎、胚乳和種皮發(fā)育的影響決定了擬南芥的種子大小,AP2控制母系的種子質(zhì)量,ap2突變體產(chǎn)生比野生型更大的種子。Cernac等[72]研究證實(shí)擬南芥內(nèi)AP2/ EREBP 轉(zhuǎn)錄因子WRI(WRINKLED)與種子貯藏物新陳代謝行為相關(guān),WRI表達(dá)水平減弱后種子無(wú)法有效完成蔗糖向三酯酰甘油的轉(zhuǎn)化,導(dǎo)致油類(lèi)物質(zhì)在種子內(nèi)積累量減少,WRI過(guò)度表達(dá)則可導(dǎo)致種子與幼苗所含三酯酰甘油量升高。Penfield等[73]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中DREB類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子ABI4是胚內(nèi)ABA(脫落酸)作用的關(guān)鍵接受因子,具備抑制胚中脂質(zhì)降解的功能,經(jīng)由與ABI3、ABI5互作,對(duì)ABA的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)施加影響。Lasserre等[74]研究發(fā)現(xiàn)AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子AtERF38(At2g35700)基因?qū)M南芥種子次生壁產(chǎn)生具備正向調(diào)節(jié)作用,對(duì)擬南芥成熟種子實(shí)施GUS染色,借助RT-PCR法發(fā)現(xiàn),AtERF38基因的表達(dá)量和次生壁增厚正向相關(guān)。由此可見(jiàn),AP2/EREBP超家族在調(diào)控種子大小、種子貯藏物質(zhì)積累和種子質(zhì)量方面至關(guān)重要。

2.6 WRKY家族

WRKY家族各基因的N末端均包含“WRKYGQK”七肽序列的保守結(jié)構(gòu)域,其名稱(chēng)來(lái)自縮寫(xiě)“WRKY”[75]。Garcia等[76]研究發(fā)現(xiàn) WRKY 轉(zhuǎn)錄因子TTG2(TRANSPARENT TESTA GLABRA2)負(fù)責(zé)調(diào)控種子體積,對(duì)于胚乳生長(zhǎng)發(fā)育進(jìn)行空間層面的直接限制,主要在胚乳和珠被中表達(dá),TTG2在調(diào)控種子體積上高度遵循孢子體母本效應(yīng),ttg2突變體受到胚乳細(xì)胞化提前的影響后種子胚乳變小,珠被細(xì)胞變短,種子由此變得圓且小。Gonzalez等[36]研究發(fā)現(xiàn)TTG2通過(guò)調(diào)節(jié)原花青素途徑中的液泡轉(zhuǎn)運(yùn)步驟來(lái)控制擬南芥中種皮單寧的發(fā)育調(diào)控。Johnson等[77]研究擬南芥ttg2突變體發(fā)現(xiàn),其種皮內(nèi)縮合單寧的合成以及黏液質(zhì)的累積受到抑制后種皮表現(xiàn)為淺黃色,大量縮合單寧合成渠道的中間產(chǎn)物集中于ttg2突變體的種子內(nèi),導(dǎo)致其細(xì)胞伸長(zhǎng)的反應(yīng)能力異常。Amato等[78]研究發(fā)現(xiàn)葡萄樹(shù)WRKY轉(zhuǎn)錄因子TTG2同源基因VvWRKY26參與調(diào)節(jié)液泡運(yùn)輸和類(lèi)黃酮生物合成,在空泡pH調(diào)節(jié)中實(shí)現(xiàn)PH3功能并恢復(fù)野生型色素沉著表型。然而此家族內(nèi)MINI3則經(jīng)由IKU-MINI3-SHB1途徑對(duì)種子大小進(jìn)行控制,在作用機(jī)制上完全不同于TTG2。由此可見(jiàn),WRKY家族主要調(diào)控種子體積、胚乳的生長(zhǎng)發(fā)育和種皮顏色。

2.7 IKU、MINI3和SHB1 基因

IKU-MINI3-SHB1調(diào)控途徑涉及HAIKU1(IKU1)、富含亮氨酸的重復(fù)激酶HAIKU2(IKU2)、WRKY轉(zhuǎn) 錄 因 子MINISEED3(MINI3) 和 上 游的調(diào)節(jié)因子SHORT HYPOCOTYL UNDER BIUE1(SHB1)[79]。Wang 等[80]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥胚乳和種子大小的發(fā)育受IKU途徑調(diào)節(jié),包括IKU1、IKU2和MINI3。Zhou等[81]確定SHB1基因是擬南芥種子發(fā)育的正調(diào)節(jié)因子,shb1-D突變體種子大小的增加與胚乳細(xì)胞化、合點(diǎn)胚乳增大和胚胎發(fā)育有關(guān)。SHB1在擬南芥體內(nèi)與MINI3和IKU2的啟動(dòng)子結(jié)合,在種子發(fā)育的早期階段促進(jìn)種腔和胚乳生長(zhǎng)。Xiao等[82]研究SHB1是種子發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)節(jié)基因,在油菜中過(guò)量表達(dá)SHB1,較強(qiáng)的MINI3啟動(dòng)子調(diào)控SHB1、MINI3和IKU2的直系同源物,最終導(dǎo)致種子質(zhì)量顯著增加。Meng等[83]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中通過(guò)AN3-MINI3基因級(jí)聯(lián)調(diào)節(jié)種子胚胎發(fā)育,SHB1與MINI3的啟動(dòng)子結(jié)合調(diào)節(jié)胚胎細(xì)胞增殖(細(xì)胞分裂和伸長(zhǎng))。由此可見(jiàn),IKU途徑是植物種子胚乳早期生長(zhǎng)階段的重要調(diào)控機(jī)制,主要調(diào)控種子大小、種子質(zhì)量、胚乳生長(zhǎng)和胚胎發(fā)育。

2.8 KLU基因

Anastasiou等[84]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥中細(xì)胞色素基因KLU(P450 KLUH/CYP78A5)負(fù)責(zé)對(duì)種子大小進(jìn)行調(diào)控,Zhang等[85]研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子SOD7通過(guò)直接抑制擬南芥中的KLU表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)種子大小,SOD7通過(guò)限制胚珠和發(fā)育種子的分布中的細(xì)胞增殖來(lái)調(diào)節(jié)種子大小。Zhao等[86]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥KLU同源基因GmCYP78A72調(diào)控大豆種子大小,在擬南芥中和大豆中的過(guò)量表達(dá)GmCYP78A72均導(dǎo)致種子增大。Adamski等[87]研究發(fā)現(xiàn)KLU調(diào)控胚珠和種子大小,KLU在內(nèi)珠被中過(guò)表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞增殖和種皮生長(zhǎng),此外,KLU誘導(dǎo)種子體積增加提升了種子中的相對(duì)含油量。由此可見(jiàn),KLU基因主要在調(diào)控種子大小和種子相對(duì)含油量。

3 展望

近年來(lái),隨著越來(lái)越多植物基因組測(cè)序的完成和植物轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建,以及各類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子基因分離與功能鑒定新方法的開(kāi)發(fā)極大推進(jìn)了種子發(fā)育轉(zhuǎn)錄因子及其分子調(diào)控機(jī)理等方面的研究進(jìn)展[88]。目前,已開(kāi)發(fā)的各類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子基因分離與功能鑒定方法有:利用生物信息學(xué)已建立的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子保守結(jié)構(gòu)域分析、轉(zhuǎn)錄因子亞細(xì)胞定位分析等;通過(guò)瞬間轉(zhuǎn)化法(基因槍法、電轉(zhuǎn)化法、PGE處理法及農(nóng)桿菌介導(dǎo)法等)和突變體表型法(基因過(guò)量表達(dá)法和基因功能缺失突變體法)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子基因功能鑒定;通過(guò)轉(zhuǎn)座子標(biāo)記、同源序列法、T-DNA 激活標(biāo)簽法、圖位克隆法、酵母單雜交法實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子基因分離。此外,還有酵母雜交法、染色體免疫共沉淀法(ChIP)、嵌合轉(zhuǎn)錄因子法等[89]。這些不斷進(jìn)步的技術(shù)和方法被運(yùn)用到了種子發(fā)育轉(zhuǎn)錄因子的研究中,如通過(guò)瞬間表達(dá)法可以有效地鑒定出參與種子發(fā)育的目標(biāo)基因[90];借助突變體研究與分子遺傳學(xué)技術(shù)已成功鑒定了部分影響胚乳發(fā)育的基因[54];借助ChIP 技術(shù)測(cè)定了種子發(fā)育中成熟基因的表達(dá)[91]。由此可以預(yù)測(cè),技術(shù)的進(jìn)步將促使人類(lèi)從新的角度更全面地探索控制種子發(fā)育的遺傳機(jī)制,從而更加有效地進(jìn)行作物種質(zhì)資源的遺傳改良。

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