王 儉,謝旺凱,李 婷,呂詩(shī)卉,倪 超,薛向陽(yáng),陳向敏,陳 俊△
(溫州醫(yī)科大學(xué):1.第一臨床醫(yī)學(xué)院;2.第二臨床醫(yī)學(xué)院;3.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;4.檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院/生命科學(xué)院,浙江溫州 325035)
宮頸癌是一種嚴(yán)重危害女性健康的惡性腫瘤,位于女性惡性腫瘤的第二位[1]。研究已證實(shí),幾乎所有宮頸癌都是由人乳頭瘤病毒(HPV)尤其是高危型 HPV感染引發(fā),因此高危型HPV檢測(cè)逐漸成為宮頸癌篩查的研究熱點(diǎn)[2]。目前,HPV研究主要針對(duì)HPV基因組進(jìn)行。HPV基因組可分為早期區(qū)、晚期區(qū)及上游調(diào)節(jié)區(qū)(URR)或長(zhǎng)控制區(qū)(LCR)或非編碼區(qū)(NCR)。早期區(qū)編碼E6、E7、E1(E8)、E2 、E4 (E3)、E5等5~8個(gè)基因,晚期區(qū)編碼L1和L2病毒結(jié)構(gòu)蛋白[3]。目前國(guó)內(nèi)外廣泛采用HPV通用引物定位在HPVL1基因上進(jìn)行檢測(cè)[4]。但是在高危型HPV感染過(guò)程中,其基因會(huì)整合到宿主細(xì)胞基因組中,這是引發(fā)宮頸細(xì)胞癌變發(fā)生的前提[5]。而高危型HPV DNA的整合過(guò)程往往會(huì)發(fā)生基因斷裂缺失,如E1/E2調(diào)控區(qū)和L1/L2衣殼蛋白基因的缺失,因此基于L1基因的檢測(cè)存在一定的漏診現(xiàn)象。然而,研究表明E6和E7基因在整合過(guò)程中卻可以保留完整,不易發(fā)生缺失,因此,E6/E7基因被認(rèn)為是檢測(cè)HPV最為理想的靶點(diǎn)[6]?;谝陨犀F(xiàn)象,本研究針對(duì)HPV E6/E7基因,設(shè)計(jì)我國(guó)感染率較高的7種高危型HPV特異性引物,包括HPV16、18、31、33、51、52、58,建立一種成本低廉、效率更高的檢測(cè)宮頸腫瘤、脫落細(xì)胞等組織高危型HPV感染的多重聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)檢測(cè)方法,并與現(xiàn)在臨床上主流的流式熒光雜交法進(jìn)行比較,評(píng)價(jià)其臨床意義。
1.1標(biāo)本來(lái)源
1.1.1宮頸腫瘤組織標(biāo)本 68份宮頸腫瘤組織標(biāo)本采自溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院婦產(chǎn)科68例手術(shù)患者,并經(jīng)病理檢查確診,其中宮頸上皮內(nèi)瘤變(CIN) 1級(jí)12例,CIN 2級(jí)19例,CIN 3級(jí)19例,宮頸鱗癌12例,宮頸腺癌2例,正常宮頸(內(nèi)膜透明細(xì)胞癌)4例,標(biāo)本離體后保存于液氮中?;颊吣挲g25~69歲,平均(42.4±1.1)歲。所有標(biāo)本收集均征得患者及或家屬的同意,并簽署知情同意書。
1.1.2宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本 150份宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本均取自溫州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院婦科門診患者?;颊吣挲g18~78歲,平均(43.1±11.6)歲。所有標(biāo)本收集均征得患者及或家屬的同意,并簽署知情同意書。HPV16陽(yáng)性的Siha細(xì)胞和HPV18陽(yáng)性的Hela細(xì)胞,購(gòu)自美國(guó)ATCC,并由實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2DNA提取 宮頸腫瘤組織標(biāo)本每份切取50 g病變區(qū)組織,碾碎后加入50 μL磷酸鹽緩沖液(PBS)中制成懸液備用;Siha、Hela細(xì)胞貼壁培養(yǎng)至長(zhǎng)滿50 mL培養(yǎng)瓶后,也制成懸液備用。制備的懸液采用DNA提取試劑盒[TIANGEN TIANamp Genomic DNA Kit(DP304)]提取DNA。將DNA模板統(tǒng)一稀釋至100 ng/μL。宮頸脫落細(xì)胞溶于細(xì)胞保存液中,取2 mL細(xì)胞溶液10 000 r/min離心1 min后去上清液,采用DNA提取試劑盒提取DNA。
1.3引物
1.3.1引物設(shè)計(jì) 在分析同源性的基礎(chǔ)上,針對(duì)我國(guó)流行的主要高危型HPV16、18、31、33、51、52、58及相應(yīng)HPV基因組的E6/E7基因,設(shè)計(jì)這7種HPV型別的引物。由北京六合華大基因科技有限公司合成[7]。引物序列見表1。將合成的引物稀釋成10 μmol/L,-20 ℃保存,待用。
表1 各型別HPV特異性引物序列
1.3.2引物特異性驗(yàn)證 為驗(yàn)證相應(yīng)HPV型別引物特異性,以明確HPV分型的宮頸腫瘤組織標(biāo)本和細(xì)胞株的DNA為模板,引物FP 10 μmol/L,引物RP 10 μmol/L,Taq Mix 12.5 μL[TIANGEN 2×Taq PCR MasterMix(KT201)]配制成25 μL反應(yīng)體系。退火溫度為63 ℃(16、18、31、33、51、58型),65 ℃(52型)。熱循環(huán)條件設(shè)置如下:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s;退火30 s;72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);最后72 ℃后延伸5 min。在Bio-Rad S1000 PCR儀上進(jìn)行反應(yīng)。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳,切膠回收,基因測(cè)序,并與已公布的各型別HPV基因序列比較。
1.3.3引物敏感性驗(yàn)證 為分析特異性引物敏感性, 以10.00、1.00、0.10、0.01 ng不同HPV型別陽(yáng)性的DNA作為模板進(jìn)行試驗(yàn),PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,并進(jìn)行敏感性分析。
1.4E6/E7多重PCR檢測(cè)方法的構(gòu)建 以7種明確HPV分型的宮頸腫瘤組織標(biāo)本為DNA模板,將HPV16、18、31、33、51、52、58型的特異性引物按濃度1∶1∶1∶1∶1∶1∶1的比例混合加入4 μL,RNase-free去離子水1 μL,Taq Mix 7.5 μL;Q-Solution+1.5 μL[QIAGEN Multiplex PCR kit(Cat.No.206143)]配制成15 μL體系。熱循環(huán)條件設(shè)置如下:95 ℃預(yù)變性15 min;94 ℃變性30 s;63 ℃退火90 s;72 ℃延伸45 s,35個(gè)循環(huán);最后68 ℃后延伸15 min。PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,對(duì)比各型別HPV的單一PCR產(chǎn)物電泳圖譜以確定多重PCR方法的特異性。在此基礎(chǔ)上,以10.00、1.00、0.10、0.01 ng不同HPV型別陽(yáng)性的DNA作為模板進(jìn)行試驗(yàn),PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,并進(jìn)行敏感性分析。同時(shí),為避免實(shí)驗(yàn)存在的偶然性,相隔一定量的時(shí)間后,同樣以新建立方法時(shí)所使用的7種高危型別陽(yáng)性標(biāo)本DNA作為模板,在相同條件下以同樣的參數(shù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證多重PCR方法的穩(wěn)定性。
1.5宮頸腫瘤組織標(biāo)本HPV感染型別檢測(cè) 對(duì)68份宮頸腫瘤組織標(biāo)本采用所構(gòu)建的多重PCR方法進(jìn)行檢測(cè)。同時(shí)對(duì)相同標(biāo)本采用流式熒光雜交法進(jìn)行平行檢測(cè),記錄并比較分析結(jié)果。
1.6宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本檢測(cè) 使用新建立的多重PCR方法對(duì)150份宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本進(jìn)行HPV感染情況檢測(cè),同時(shí)對(duì)相同的標(biāo)本采用流式熒光雜交法進(jìn)行平行檢測(cè),記錄并比較分析結(jié)果。
1.7統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料以例數(shù)或率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1引物設(shè)計(jì)結(jié)果 引物特異性實(shí)驗(yàn)表明7種高危型HPVE6/E7引物(HPV16、18、31、33、51、52、58)均具有特異性,見圖1。同時(shí)敏感性分析實(shí)驗(yàn)顯示:HPV16、18、33型DNA 模板量低至1 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段,HPV31型DNA模板量低至10 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段,HPV51型DNA模板量低至0.1 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段,HPV52、58型DNA模板量低至0.01 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段。
2.2E6/E7多重PCR檢測(cè)方法的建立 對(duì)已經(jīng)明確了HPV分型的宮頸腫瘤標(biāo)本和細(xì)胞株所提取的DNA進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示出現(xiàn)單一條帶,與使用單一型別引物進(jìn)行PCR的結(jié)果一致,提示所建立的多重PCR可特異檢測(cè)這7種HPV亞型,見圖2。且敏感性分析實(shí)驗(yàn)顯示:HPV16、18、31、33、58型DNA模板量低至10 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段,HPV51和52型DNA模板量低至0.1 ng仍能擴(kuò)增特異目的片段。
2.3宮頸腫瘤組織HPV檢測(cè)結(jié)果 以新建立的多重PCR方法檢測(cè)68份宮頸腫瘤組織標(biāo)本,見圖3,根據(jù)電泳條帶判斷68份宮頸腫瘤組織標(biāo)本HPV感染情況,檢測(cè)出HPV陽(yáng)性標(biāo)本48份(70.59%),其中HPV16陽(yáng)性36份(52.94%),HPV18陽(yáng)性3份(4.41%),HPV31陽(yáng)性4份(5.88%),HPV33陽(yáng)性7份(10.29%),HPV51陽(yáng)性2份(2.94%),HPV58陽(yáng)性3份(4.41%),多重感染6份(8.82%)。高于流式熒光雜交法檢測(cè)所顯示39.71%的感染率,2種方法檢測(cè)結(jié)果比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=11.43,P<0.05)。
注:M為D2000 DNA標(biāo)記物;1為HPV16陽(yáng)性標(biāo)本;2為HPV18陽(yáng)性標(biāo)本;3為HPV31陽(yáng)性標(biāo)本;4為HPV33陽(yáng)性標(biāo)本;5為 HPV51陽(yáng)性標(biāo)本;6為HPV52陽(yáng)性標(biāo)本;7為 HPV58陽(yáng)性標(biāo)本
圖1所設(shè)計(jì)的7種高危型別HPV E6/E7引物的特異性分析
注:A為HPV陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)條帶;B為HPV 7種亞型引物特異性分析;M1為D2000 DNA 標(biāo)記物;M2為陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)條帶;1為HPV16陽(yáng)性標(biāo)本;2為HPV18陽(yáng)性標(biāo)本;3為 HPV31陽(yáng)性標(biāo)本;4為HPV33陽(yáng)性標(biāo)本;5為HPV51陽(yáng)性標(biāo)本;6為HPV52陽(yáng)性標(biāo)本;7為HPV58陽(yáng)性標(biāo)本
圖2多重PCR法電泳結(jié)果分析
2.4宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果 150份宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本用新建立的多重PCR方法及流式熒光雜交法檢測(cè)的結(jié)果顯示7種高危型別(HPV16、18、31、33、51、52、58)檢出率比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.68,P>0.05),見表2。
注:M1為 D2000 DNA標(biāo)記物;M2為陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)條帶;1~68為宮頸腫瘤組織標(biāo)本
圖3 68份宮頸腫瘤組織多重PCR檢測(cè)結(jié)果分析
表2 150份宮頸脫落細(xì)胞不同檢測(cè)方法的HPV檢測(cè)結(jié)果(n=150)
高危型HPV持續(xù)感染是導(dǎo)致宮頸癌發(fā)生的重要原因。越來(lái)越多的研究表明HPV基因組檢測(cè)對(duì)宮頸病變預(yù)測(cè)和術(shù)后療效判斷有利,可以避免不必要的診斷和治療。因此,國(guó)內(nèi)外采用了很多種方法對(duì)HPV感染進(jìn)行檢測(cè),應(yīng)用于臨床宮頸癌篩查和防治。
現(xiàn)在臨床上采用較多的是基于L1衣殼蛋白基因的HPV檢測(cè)方法,如流式熒光雜交法[8]。但由于在HPV感染過(guò)程中,病毒 DNA通常會(huì)與宿主染色體整合,會(huì)改變整合位點(diǎn)及鄰近宿主基因的表達(dá),使部分HPV L1基因組發(fā)生斷裂丟失,最終導(dǎo)致HPV L1衣殼蛋白也表達(dá)缺失,所以基于L1基因序列的HPV檢測(cè)方法容易出現(xiàn)假陰性的結(jié)果,這也限制了其在臨床上的使用[9]。而早期蛋白基因E6/E7在腫瘤的發(fā)生過(guò)程中持續(xù)存在,且其表達(dá)的E6/E7早期蛋白在宮頸癌變過(guò)程中起著重要作用。惡性腫瘤病變時(shí),HPV DNA整合到宿主DNA當(dāng)中,通常導(dǎo)致E2基因中斷從而使E6/E7基因表達(dá)增強(qiáng)[10]。E6/E7蛋白分別抑制P53、Rb基因的活性,激活人細(xì)胞端粒酶的轉(zhuǎn)錄,引起細(xì)胞異常分化,導(dǎo)致正常細(xì)胞永生化,最終形成腫瘤[11]。因此,對(duì)HPV E6/E7基因進(jìn)行檢測(cè),能從根源上對(duì)宮頸病變進(jìn)行診斷和預(yù)防,是判斷HPV感染的更好選擇。然而,臨床上針對(duì)E6/E7的檢測(cè)方法不多,尤其是多重PCR的檢測(cè)方法幾乎沒有。為此本研究主要構(gòu)建了基于E6/E7的多重PCR方法檢測(cè)HPV的感染情況,在對(duì)HPV進(jìn)行同源性分析后證實(shí)各HPV亞型的E6/E7基因具有特異的保守片段,據(jù)此選擇設(shè)計(jì)并驗(yàn)證了中國(guó)人群感染率較高的7種高危型別HPV E6/E7的特異性引物,優(yōu)化條件后建立了一種基于E6/E7基因的HPV多重PCR分型檢測(cè)方法。對(duì)已明確型別的宮頸癌組織標(biāo)本及宮頸細(xì)胞的檢測(cè)陽(yáng)性標(biāo)本出現(xiàn)條帶,而陰性標(biāo)本未出現(xiàn)條帶證明其特異性好,而且實(shí)驗(yàn)還驗(yàn)證了該多重PCR技術(shù)檢測(cè)靈敏度能達(dá)到10.00 ng,技術(shù)穩(wěn)定性良好,滿足臨床標(biāo)本檢測(cè)方法的要求。
68份宮頸腫瘤組織標(biāo)本的HPV檢測(cè)結(jié)果顯示,所構(gòu)建的基于E6/E7多重PCR檢測(cè)陽(yáng)性率明顯高于基于L1基因的流式熒光雜交法檢測(cè),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。而對(duì)門診采集的150份宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果顯示7種高危型別檢出率與流式熒光雜交法檢出率并無(wú)差異,考慮到門診患者高危型別感染較少,樣本數(shù)不夠大,有待進(jìn)一步驗(yàn)證。
臨床上使用的基于L1基因的流式熒光雜交法檢測(cè)費(fèi)用較高,操作復(fù)雜,需要大型儀器設(shè)備支持,不利于在鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院開展。而本研究所建立的基于E6/E7多重PCR法不僅能夠一次檢測(cè)HPV16、18、31、33、51、52和58 7種高危型別,而且具有操作簡(jiǎn)便、成本低廉和所需儀器較少且較易獲得等優(yōu)勢(shì),同時(shí)研究結(jié)果也已表明兩種方法檢出率高度相近。因此,基于E6/E7多重PCR法在應(yīng)用中能極大彌補(bǔ)流式熒光雜交法在成本和技術(shù)等方面的不足,同時(shí)可以減少多次檢測(cè)帶來(lái)的交叉污染及高成本的問(wèn)題,適合在臨床大面積開展患者高危型HPV感染的早期篩查。