杜權(quán) 董曉巧 俞文華 朱強 車志豪 王昊 楊定博 沈永鋒 江力
腦膠質(zhì)瘤是中樞神經(jīng)系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率高,預后不佳[1-3]。晝夜節(jié)律紊亂與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[4-5]。時鐘基因編碼的蛋白質(zhì)可以調(diào)節(jié)晝夜節(jié)律[6-7]。研究表明,時鐘基因啟動子區(qū)甲基化可以改變目的基因表達狀態(tài),從而影響腦膠質(zhì)瘤的生長[8-10]。NPAS2時鐘基因?qū)儆谝职┗?,其蛋白表達低水平與結(jié)直腸癌預后不良相關(guān)[11],也預示著腦膠質(zhì)瘤患者生存期縮短[12]。NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化可以降低基因相關(guān)蛋白表達,參與帕金森病的發(fā)生、發(fā)展[13]。本研究通過檢測腦膠質(zhì)瘤NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài),進而分析其與患者臨床特征及預后的關(guān)系,現(xiàn)將結(jié)果報道如下。
1.1 對象 選取2005年6月至2010年6月本院行手術(shù)治療的102例初發(fā)腦膠質(zhì)瘤患者為研究對象。其中男63例,女39例;年齡>60歲42例,≤60歲60例;WHO分級:Ⅰ~Ⅱ級49例,Ⅲ~Ⅳ級53例;腫瘤部位:幕上86例,幕下16例;腫瘤全切除72例;術(shù)后輔助化療56例;術(shù)后輔助放療77例;腫瘤類型:星形細胞瘤68例,其他34例;腫瘤直徑>5cm 32例,≤5cm 70例;術(shù)前卡氏評分(KPS)<80分60例,≥80分42例。所有患者均為漢族人,均未合并其他惡性腫瘤,其直系親屬均無膠質(zhì)瘤病史。
1.2 指標檢測 術(shù)中獲取腦膠質(zhì)瘤組織及癌旁正常組織,采用甲基化特異性PCR檢測NPAS2時鐘基因啟動子甲基化狀態(tài)。使用DNA組織提取試劑盒(規(guī)格250次,批號Z3105,美國Promega公司)提取基因組DNA,使用甲基化特異性PCR試劑盒(規(guī)格60次,批號EM101,美國Millipore公司)對基因組DNA進行亞硫酸氫鈉修飾,修飾后的DNA進行PCR擴增。時鐘基因的引物參照文獻[13],產(chǎn)物于4%瓊脂糖凝膠上進行電泳,在紫外儀下觀察并記錄結(jié)果。為了確定甲基化特異性PCR檢測結(jié)果,以甲基轉(zhuǎn)移酶處理的基因組DNA作為陽性對照,未經(jīng)處理的基因組DNA作為陰性對照。
1.3 統(tǒng)計學處理 應用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件。計數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗。利用Kaplan-Meier法繪制生存曲線并計算患者5年總生存期,生存期以表示,采用log-rank檢驗分析生存差異;采用Cox比例風險回歸模型分析影響5年總生存期的獨立危險因素。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 腦膠質(zhì)瘤組織與癌旁正常組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化頻率比較 腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化頻率為19.6%(20/102),與其癌旁正常組織甲基化頻率5.9%(6/102)比較,差異有統(tǒng)計學意義(χ2=8.64,P<0.05)。
2.2 腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與臨床特征的關(guān)系 腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與患者性別、年齡、腫瘤部位、腫瘤類型、腫瘤直徑、術(shù)前KPS、腫瘤全切除、術(shù)后輔助放化療等均無關(guān)(均P>0.05);但與WHO分級有關(guān),Ⅲ~Ⅳ級腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化頻率明顯高于Ⅰ~Ⅱ級腦膠質(zhì)瘤組織,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表 1。
表1 腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與臨床特征的關(guān)系[例(%)]
2.3 腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與5年總生存期的關(guān)系 腦膠質(zhì)瘤患者5年總生存期為(30.4±2.0)個月,生存曲線見圖1?;颊?年總生存期與其腫瘤直徑、術(shù)前KPS、WHO分級、腫瘤全切除、術(shù)后輔助放化療、腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)均有關(guān)(均P<0.05),與性別、年齡、腫瘤部位、腫瘤類型均無關(guān)(均P>0.05),見表2。
2.4 影響5年總生存期的因素 經(jīng)Cox比例風險回歸模型分析,腫瘤全切除與否(HR=0.585,95%CI:0.353~0.969,P<0.05)、腫瘤直徑(HR=1.970,95%CI:1.196~3.243,P<0.05)、WHO 分級(HR=1.786,95%CI:1.110~2.874,P<0.05)、腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)(HR=2.115,95%CI:1.223~3.656,P<0.05)是影響患者5年總生存期的獨立危險因素。
圖1 腦膠質(zhì)瘤患者的生存曲線
表2 腦膠質(zhì)瘤患者5年總生存期比較
晝夜節(jié)律是一種普遍的自然現(xiàn)象,它的存在使生物體的生理、生化、行為等生命現(xiàn)象表現(xiàn)為以24h為周期的振蕩。晝夜節(jié)律發(fā)生的物質(zhì)基礎是分子計時器,即晝夜節(jié)律生物鐘。它是由一組特異的核心元件組成,包括Clock、Bmal1、Pers、Crys、Tim 等基因及其相關(guān)蛋白產(chǎn)物。生物節(jié)律的基本分子機制是這些核心元件構(gòu)成的轉(zhuǎn)錄-翻譯負反饋環(huán)。這個機制本質(zhì)上是內(nèi)源性的,但同時會受環(huán)境信號的導引,尤其是光信號。哺乳動物的主生物鐘被定位在下丘腦視交叉上核,當它受到異常刺激后,機體的晝夜節(jié)律可發(fā)生改變,嚴重時會引發(fā)疾病。到目前為止,維持生物鐘運行的確切分子調(diào)控過程尚未清楚[4-7]。
腫瘤的發(fā)生、發(fā)展與晝夜節(jié)律系統(tǒng)的紊亂密切相關(guān),時鐘基因可能通過復雜的網(wǎng)絡調(diào)節(jié)系統(tǒng)來影響腫瘤細胞的增生或凋亡[8-12]?;騿幼訁^(qū)甲基化是時鐘基因蛋白表達功能改變的重要方式[13]。Per1、Per2、Cry1、Cry2、Clock、Bmal1和NPAS2等時鐘基因的甲基化與胃癌、肝癌和乳腺癌等惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[14-16]。關(guān)于時鐘基因甲基化的研究是目前腫瘤研究的熱點,明確某些時鐘基因的甲基化狀態(tài)有助于研究個體化的治療手段,從而提高惡性腫瘤的治愈率。
NPAS2是晝夜節(jié)律系統(tǒng)中重要的時鐘基因,是腫瘤抑制基因[11]。NPAS2蛋白可以抑制體外培養(yǎng)的癌細胞生長,NPAS2的表達水平與結(jié)直腸癌病理分級和預后密切相關(guān)[11]。高級別膠質(zhì)瘤NPAS2表達明顯下降,NPAS2高表達膠質(zhì)瘤患者生存期明顯延長[12]。本研究發(fā)現(xiàn),膠質(zhì)瘤組織和癌旁正常組織NPAS2基因啟動子區(qū)均有甲基化,而膠質(zhì)瘤組織甲基化頻率明顯升高。本研究進一步分析發(fā)現(xiàn),NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與患者性別、年齡、腫瘤部位、腫瘤類型、腫瘤全切除、術(shù)后輔助放化療、腫瘤直徑、術(shù)前KPS等均無關(guān),但與WHO分級有關(guān),膠質(zhì)瘤組織WHO分級越高,NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化頻率越高。生存分析結(jié)果提示,除腫瘤全切除、WHO分級、腫瘤直徑外,NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化也是影響腦膠質(zhì)瘤患者5年總生存期的獨立危險因素??紤]原因是NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化可能會使NPAS2蛋白表達減少,從而解除對腦膠質(zhì)瘤生長的抑制,促進腦膠質(zhì)瘤的發(fā)展,最終影響患者的臨床預后。
綜上所述,NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化可能參與腦膠質(zhì)瘤的發(fā)生、發(fā)展,其甲基化程度與腦膠質(zhì)瘤惡性程度呈正相關(guān),也是影響患者長期生存的危險因素。臨床檢測腦膠質(zhì)瘤組織NPAS2時鐘基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài),有利于分析和預測患者的臨床預后,同時協(xié)助腦膠質(zhì)瘤惡性程度分級,指導臨床進一步治療。